136 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_3632 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009664  Krad_3632  Radical SAM domain protein  100 
 
 		 430 aa  845    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0687937  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2519  FO synthase  65.26 
 
 		 871 aa  509  1e-143  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.391262  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0946  FO synthase  64.72 
 
 		 860 aa  506  9.999999999999999e-143  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0888  FO synthase  64.82 
 
 		 836 aa  504  1e-141  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0248143 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0746  radical SAM domain-containing protein  67.26 
 
 		 881 aa  504  1e-141  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.331413 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8766  FO synthase  63.22 
 
 		 857 aa  499  1e-140  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.977085  normal  0.875781 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3771  7,8-didemethyl-8-hydroxy-5-deazariboflavin synthase, CofH subunit  66.17 
 
 		 875 aa  495  1e-139  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1376  FO synthase  65.48 
 
 		 867 aa  496  1e-139  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0863  FO synthase  65.08 
 
 		 852 aa  493  9.999999999999999e-139  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.241376  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4075  Radical SAM domain protein  64.38 
 
 		 859 aa  491  9.999999999999999e-139  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3324  7,8-didemethyl-8-hydroxy-5-deazariboflavin synthase, CofG subunit  63.39 
 
 		 416 aa  479  1e-134  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1148  7,8-didemethyl-8-hydroxy-5-deazariboflavin synthase, CofH subunit  59.4 
 
 		 863 aa  472  1e-132  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.064662  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1483  7,8-didemethyl-8-hydroxy-5-deazariboflavin synthase, CofH subunit  61.52 
 
 		 872 aa  468  9.999999999999999e-131  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4032  FO synthase  58.89 
 
 		 859 aa  466  9.999999999999999e-131  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.249392  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0769  FO synthase  63.71 
 
 		 884 aa  466  9.999999999999999e-131  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0435943  normal  0.470763 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4107  FO synthase  58.89 
 
 		 859 aa  466  9.999999999999999e-131  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13970  FO synthase subunit 1 /FO synthase subunit 2  60.1 
 
 		 811 aa  464  1e-129  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.256326  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4533  FO synthase  61.25 
 
 		 859 aa  461  1e-129  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.434673  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4262  FO synthase  58.43 
 
 		 859 aa  463  1e-129  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0918112 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11198  FO synthase  56.52 
 
 		 856 aa  463  1e-129  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.152769  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0814  FO synthase  59.52 
 
 		 842 aa  457  1e-127  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.333048  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6472  FO synthase  62.94 
 
 		 838 aa  454  1e-127  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5865  FO synthase  64.12 
 
 		 944 aa  456  1e-127  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.342546  normal  0.564684 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3619  FO synthase  62.03 
 
 		 841 aa  451  1.0000000000000001e-126  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2167  FO synthase  58.2 
 
 		 859 aa  446  1.0000000000000001e-124  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0462649 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0745  FO synthase  62.18 
 
 		 899 aa  442  1e-123  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0717  FO synthase  56.51 
 
 		 779 aa  375  1e-103  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00851827 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0975  FO synthase  54.12 
 
 		 792 aa  361  1e-98  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.156535  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2623  Radical SAM domain protein  51.21 
 
 		 800 aa  355  1e-96  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  decreased coverage  0.000614503  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4262  Radical SAM domain protein  54.47 
 
 		 826 aa  347  3e-94  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.296294  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4423  FO synthase  51.01 
 
 		 820 aa  337  2.9999999999999997e-91  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.308289  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4049  FO synthase subunit 1  46.31 
 
 		 392 aa  331  1e-89  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4251  FO synthase subunit 1  49.15 
 
 		 386 aa  322  9.000000000000001e-87  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0115249  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1114  FO synthase subunit 1  45.68 
 
 		 380 aa  293  4e-78  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.785548  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0900  Radical SAM domain protein  50.14 
 
 		 757 aa  283  5.000000000000001e-75  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.180074  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0593  radical SAM domain-containing protein  40.71 
 
 		 390 aa  276  6e-73  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0684  FO synthase subunit 1  40.24 
 
 		 352 aa  266  7e-70  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.46158  n/a   
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_51122  predicted protein  45.05 
 
 		 841 aa  265  1e-69  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.0345053 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0911  FO synthase subunit 1  39.81 
 
 		 380 aa  262  6.999999999999999e-69  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.143979  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0124  FO synthase subunit 1  39.82 
 
 		 352 aa  260  3e-68  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.785163  normal  0.654692 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1779  FO synthase subunit 1  39.02 
 
 		 352 aa  260  3e-68  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.431297  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2201  radical SAM domain-containing protein  41.81 
 
 		 329 aa  257  4e-67  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.524494 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0058  7,8-didemethyl-8-hydroxy-5-deazariboflavin synthase, CofG subunit  44.21 
 
 		 419 aa  256  8e-67  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.161997 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0044  FO synthase subunit 1  37.95 
 
 		 351 aa  255  1.0000000000000001e-66  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3415  FO synthase subunit 1  42.31 
 
 		 325 aa  247  4e-64  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.678705  normal  0.642517 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1838  radical SAM domain-containing protein  43.04 
 
 		 331 aa  236  8e-61  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.162234  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1253  phosphoribosylaminoimidazole-succinocarboxamide synthase  42.49 
 
 		 565 aa  235  1.0000000000000001e-60  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0348661  normal  0.248456 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1302  FO synthase subunit 1  39.23 
 
 		 330 aa  233  6e-60  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1894  FO synthase subunit 1  45.31 
 
 		 387 aa  233  6e-60  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.373224 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0642  7,8-didemethyl-8-hydroxy-5-deazariboflavin synthase, CofG subunit  43.17 
 
 		 393 aa  227  4e-58  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0976  Radical SAM domain protein  38.53 
 
 		 327 aa  226  5.0000000000000005e-58  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.401774  normal  0.977803 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1304  FO synthase subunit 1  43.06 
 
 		 368 aa  226  9e-58  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.366684  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2633  7,8-didemethyl-8-hydroxy-5-deazariboflavin synthase, CofG subunit  41.74 
 
 		 389 aa  226  9e-58  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0537539  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1590  hypothetical protein  38.3 
 
 		 321 aa  225  1e-57  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.00904391  hitchhiker  0.000759826 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0221  FO synthase subunit 1  40.25 
 
 		 326 aa  208  1e-52  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.906705  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1415  FO synthase subunit 1  42.04 
 
 		 372 aa  205  2e-51  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.499362  normal  0.994987 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4165  7,8-didemethyl-8-hydroxy-5-deazariboflavin synthase, CofH subunit  37.65 
 
 		 741 aa  179  7e-44  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.358903  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4147  7,8-didemethyl-8-hydroxy-5-deazariboflavin synthase, CofH subunit  35.4 
 
 		 737 aa  157  5.0000000000000005e-37  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.280737  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4090  7,8-didemethyl-8-hydroxy-5-deazariboflavin synthase, CofH subunit  34.51 
 
 		 737 aa  155  1e-36  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0388859 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0173  FO synthase subunit 1  31.33 
 
 		 319 aa  145  1e-33  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.580114 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0892  FO synthase subunit 1  33.33 
 
 		 336 aa  145  2e-33  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000147702  decreased coverage  0.000138874 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1598  FO synthase subunit 1  31.55 
 
 		 340 aa  134  3e-30  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000000217734  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0367  FO synthase subunit 1  31.85 
 
 		 307 aa  132  9e-30  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0829  FO synthase subunit 1  32.05 
 
 		 321 aa  129  7.000000000000001e-29  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.241986 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3749  FO synthase subunit 1  30.54 
 
 		 318 aa  124  4e-27  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.499333 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3695  FO synthase subunit 1  31.53 
 
 		 318 aa  123  5e-27  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0829  7,8-didemethyl-8-hydroxy-5-deazariboflavin synthase, CofG subunit  32.17 
 
 		 325 aa  120  3.9999999999999996e-26  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0678132  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0371  hypothetical protein  27.3 
 
 		 626 aa  72  0.00000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.541832  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4207  radical SAM domain-containing protein  28.35 
 
 		 625 aa  69.7  0.00000000009  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.428604  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0399  Radical SAM domain protein  27.3 
 
 		 626 aa  68.6  0.0000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0400  Radical SAM domain protein  27.3 
 
 		 626 aa  68.9  0.0000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.184942  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8059  Radical SAM domain protein  27.7 
 
 		 404 aa  67.8  0.0000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0533  hypothetical protein  25.88 
 
 		 395 aa  67.4  0.0000000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.271829  normal  0.131592 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0048  radical SAM domain-containing protein  24.67 
 
 		 367 aa  65.5  0.000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1584  biotin synthetase  27.12 
 
 		 329 aa  63.5  0.000000007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.120717  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6099  radical SAM domain-containing protein  24.54 
 
 		 515 aa  62  0.00000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.61579  normal  0.0270865 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0050  Radical SAM domain protein  24.42 
 
 		 365 aa  61.2  0.00000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0040  radical SAM domain-containing protein  23.94 
 
 		 362 aa  58.5  0.0000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4467  radical SAM domain-containing protein  23.12 
 
 		 396 aa  58.2  0.0000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.82006  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4068  radical SAM domain-containing protein  23.12 
 
 		 394 aa  55.5  0.000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.18733 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1258  Radical SAM domain-containing protein  23.55 
 
 		 385 aa  54.7  0.000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.616603 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0550  radical SAM domain-containing protein  25.66 
 
 		 375 aa  53.9  0.000006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0244585  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0411  Radical SAM domain protein  25.34 
 
 		 364 aa  52.8  0.00001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0320  hypothetical protein  26.67 
 
 		 355 aa  52.4  0.00002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000157308  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1844  hypothetical protein  24.84 
 
 		 360 aa  52.4  0.00002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2881  hypothetical protein  23.03 
 
 		 348 aa  51.6  0.00002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2193  radical SAM domain-containing protein  23.58 
 
 		 355 aa  51.2  0.00003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0059  7,8-didemethyl-8-hydroxy-5-deazariboflavin synthase, CofH subunit  24.17 
 
 		 453 aa  51.2  0.00003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.17333 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1091  radical SAM domain-containing protein  23.95 
 
 		 356 aa  51.6  0.00003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3416  FO synthase subunit 2  23.29 
 
 		 376 aa  50.8  0.00004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.90673  normal  0.237046 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0217  radical SAM domain-containing protein  23.05 
 
 		 353 aa  50.8  0.00004  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.896474  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0826  biotin synthase  27.73 
 
 		 341 aa  50.8  0.00005  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.247996  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1722  biotin synthase  22.5 
 
 		 348 aa  50.4  0.00006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000337366  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0263  hypothetical protein  35.04 
 
 		 380 aa  50.4  0.00006  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1131  biotin synthase  23.15 
 
 		 341 aa  50.4  0.00006  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0740  radical SAM domain-containing protein  22.77 
 
 		 347 aa  49.7  0.00009  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00000523159 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1552  biotin synthase  25.52 
 
 		 341 aa  49.7  0.0001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0038  radical SAM domain-containing protein  24.33 
 
 		 362 aa  48.5  0.0002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1531  biotin synthase  27.05 
 
 		 388 aa  48.9  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1175  biotin synthase  23.85 
 
 		 328 aa  48.1  0.0003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0717742  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>