266 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daud_1089 on replicon NC_010424
Organism: Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010424  Daud_1089  radical SAM domain-containing protein  100 
 
 		 368 aa  746    Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2195  radical SAM domain-containing protein  62.94 
 
 		 367 aa  506  9.999999999999999e-143  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1643  Radical SAM domain protein  63.76 
 
 		 367 aa  496  1e-139  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000555203  hitchhiker  0.00000328368 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1450  Radical SAM domain protein  59.94 
 
 		 368 aa  450  1e-125  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000839661  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1846  hypothetical protein  61.97 
 
 		 373 aa  431  1e-119  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4284  radical SAM domain-containing protein  55.97 
 
 		 360 aa  429  1e-119  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0234  Radical SAM domain protein  55.4 
 
 		 358 aa  422  1e-117  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0218  Radical SAM domain protein  54.83 
 
 		 358 aa  422  1e-117  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0441  radical SAM domain-containing protein  56.62 
 
 		 361 aa  411  1e-114  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3391  hypothetical protein  56.62 
 
 		 360 aa  414  1e-114  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.352496  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1271  radical SAM domain-containing protein  54.92 
 
 		 367 aa  414  1e-114  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3578  radical SAM domain-containing protein  54.13 
 
 		 359 aa  405  1.0000000000000001e-112  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0625  Radical SAM domain protein  54.21 
 
 		 359 aa  397  1e-109  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.834734  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1157  radical SAM domain-containing protein  53.2 
 
 		 359 aa  396  1e-109  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.423135  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1499  Radical SAM domain protein  50.7 
 
 		 373 aa  382  1e-105  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0372  hypothetical protein  51.81 
 
 		 388 aa  382  1e-105  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.153227  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4206  radical SAM domain-containing protein  52.92 
 
 		 387 aa  383  1e-105  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0400  Radical SAM domain protein  51.25 
 
 		 388 aa  379  1e-104  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3089  radical SAM domain-containing protein  51.4 
 
 		 373 aa  380  1e-104  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.185999  hitchhiker  0.000152785 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2163  radical SAM domain-containing protein  50.71 
 
 		 367 aa  378  1e-104  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0401  Radical SAM domain protein  51.25 
 
 		 388 aa  378  1e-103  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.575372  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0319  hypothetical protein  55.4 
 
 		 362 aa  375  1e-103  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000596234  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0787  Radical SAM domain-containing protein  49.44 
 
 		 391 aa  369  1e-101  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.464244  normal  0.667055 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0097  Radical SAM domain protein  51.11 
 
 		 386 aa  365  1e-100  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0551  radical SAM domain-containing protein  50.28 
 
 		 372 aa  367  1e-100  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0260021  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0798  hypothetical protein  50 
 
 		 371 aa  362  8e-99  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.22786  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1188  Radical SAM domain protein  50 
 
 		 387 aa  359  3e-98  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.12301 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0810  Radical SAM domain protein  45.81 
 
 		 364 aa  358  9e-98  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0537641  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2097  hypothetical protein  48.61 
 
 		 376 aa  354  1e-96  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0332172  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1525  Radical SAM domain protein  46.47 
 
 		 396 aa  352  7e-96  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.155468  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1279  Radical SAM domain protein  46.54 
 
 		 380 aa  340  2e-92  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0149  Radical SAM domain protein  47.77 
 
 		 358 aa  336  3.9999999999999995e-91  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00717785  normal  0.324103 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2962  Radical SAM domain protein  45 
 
 		 360 aa  330  2e-89  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0300282  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8066  Radical SAM domain protein  45.81 
 
 		 386 aa  322  5e-87  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.437454  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0315  Radical SAM domain protein  44.48 
 
 		 360 aa  319  3.9999999999999996e-86  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2193  radical SAM domain-containing protein  44.97 
 
 		 355 aa  318  9e-86  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0259  hypothetical protein  46.94 
 
 		 384 aa  315  6e-85  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.341096  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0587  Radical SAM domain-containing protein  45.56 
 
 		 390 aa  315  8e-85  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.888096  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6111  radical SAM domain-containing protein  46.07 
 
 		 392 aa  314  9.999999999999999e-85  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0611343  normal  0.194203 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1880  Radical SAM domain protein  44.04 
 
 		 397 aa  315  9.999999999999999e-85  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1686  Radical SAM domain protein  43.3 
 
 		 354 aa  315  9.999999999999999e-85  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0671  Radical SAM domain protein  46.37 
 
 		 355 aa  313  1.9999999999999998e-84  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4713  Radical SAM domain protein  43.53 
 
 		 393 aa  313  2.9999999999999996e-84  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0317853  normal  0.0266117 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1844  hypothetical protein  47.32 
 
 		 360 aa  312  4.999999999999999e-84  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0519  hypothetical protein  46.24 
 
 		 382 aa  312  5.999999999999999e-84  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.520088 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0832  hypothetical protein  41.26 
 
 		 353 aa  311  1e-83  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.709091  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1645  Radical SAM domain protein  45.43 
 
 		 358 aa  309  4e-83  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.000000004914  hitchhiker  0.00000000624327 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1475  hypothetical protein  38.51 
 
 		 350 aa  307  2.0000000000000002e-82  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.904959  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0584  hypothetical protein  39.2 
 
 		 360 aa  307  2.0000000000000002e-82  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1091  radical SAM domain-containing protein  49.3 
 
 		 356 aa  306  5.0000000000000004e-82  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4085  radical SAM domain-containing protein  44.72 
 
 		 389 aa  305  9.000000000000001e-82  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.181055 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1189  Radical SAM domain protein  44.79 
 
 		 386 aa  304  2.0000000000000002e-81  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.355638 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1483  hypothetical protein  41.26 
 
 		 353 aa  303  4.0000000000000003e-81  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4505  radical SAM domain-containing protein  45 
 
 		 389 aa  302  6.000000000000001e-81  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.325974  normal  0.0287993 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0797  hypothetical protein  43.75 
 
 		 371 aa  301  1e-80  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.106816  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3088  radical SAM domain-containing protein  45.35 
 
 		 354 aa  301  1e-80  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.675437  unclonable  0.0000126154 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0427  hypothetical protein  38.59 
 
 		 354 aa  298  7e-80  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0550  radical SAM domain-containing protein  43.42 
 
 		 375 aa  298  1e-79  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0244585  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1272  radical SAM domain-containing protein  44.13 
 
 		 355 aa  297  2e-79  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1370  hypothetical protein  39.15 
 
 		 354 aa  293  3e-78  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0320  hypothetical protein  45.1 
 
 		 355 aa  288  8e-77  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000157308  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1560  hypothetical protein  38.03 
 
 		 354 aa  288  9e-77  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0282  hypothetical protein  38.31 
 
 		 354 aa  288  1e-76  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0220  hypothetical protein  40.06 
 
 		 353 aa  287  2e-76  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0742  radical SAM domain-containing protein  41.38 
 
 		 365 aa  283  3.0000000000000004e-75  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.547138 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8059  Radical SAM domain protein  39.18 
 
 		 404 aa  281  9e-75  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0801  hypothetical protein  39.13 
 
 		 348 aa  281  1e-74  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000463089  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3417  FO synthase subunit 2  42.2 
 
 		 384 aa  280  2e-74  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.1497 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1159  hypothetical protein  40.74 
 
 		 356 aa  280  2e-74  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.34532  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1007  Radical SAM domain protein  42.53 
 
 		 369 aa  280  4e-74  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.0379726 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1280  Radical SAM domain protein  41.91 
 
 		 381 aa  280  4e-74  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3416  FO synthase subunit 2  42.03 
 
 		 376 aa  279  7e-74  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.90673  normal  0.237046 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1407  Radical SAM domain protein  39.6 
 
 		 352 aa  278  7e-74  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0533  hypothetical protein  38.67 
 
 		 395 aa  274  2.0000000000000002e-72  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.271829  normal  0.131592 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1029  hypothetical protein  37.68 
 
 		 359 aa  273  3e-72  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.148113  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2881  hypothetical protein  42.73 
 
 		 348 aa  273  4.0000000000000004e-72  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1528  hypothetical protein  37.71 
 
 		 363 aa  272  8.000000000000001e-72  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1735  Radical SAM domain protein  42.03 
 
 		 345 aa  271  1e-71  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  decreased coverage  0.00136048  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0850  Radical SAM domain protein  37.78 
 
 		 350 aa  270  2e-71  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.0000000345291  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0235  Radical SAM domain protein  41.31 
 
 		 357 aa  270  2.9999999999999997e-71  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.568527  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4467  radical SAM domain-containing protein  38.38 
 
 		 396 aa  270  4e-71  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.82006  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1115  radical SAM domain-containing protein  40.17 
 
 		 418 aa  269  5e-71  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1619  hypothetical protein  37.57 
 
 		 348 aa  269  5.9999999999999995e-71  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.320855  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0442  radical SAM domain-containing protein  40.46 
 
 		 354 aa  268  8.999999999999999e-71  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1303  FO synthase subunit 2  41.16 
 
 		 356 aa  268  1e-70  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0404  hypothetical protein  37.32 
 
 		 349 aa  267  2e-70  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0222  radical SAM domain-containing protein  41.79 
 
 		 353 aa  267  2.9999999999999995e-70  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.255233  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0219  Radical SAM domain protein  40.34 
 
 		 357 aa  267  2.9999999999999995e-70  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4707  radical SAM domain-containing protein  38.38 
 
 		 399 aa  266  2.9999999999999995e-70  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0048  radical SAM domain-containing protein  40.5 
 
 		 367 aa  266  2.9999999999999995e-70  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3618  radical SAM domain-containing protein  41.45 
 
 		 357 aa  266  4e-70  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4285  radical SAM domain-containing protein  39.28 
 
 		 364 aa  265  8.999999999999999e-70  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3390  hypothetical protein  39.22 
 
 		 353 aa  264  1e-69  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0223  radical SAM domain-containing protein  41.39 
 
 		 364 aa  265  1e-69  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.772616  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4048  hypothetical protein  37.64 
 
 		 429 aa  263  3e-69  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.129032  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0263  hypothetical protein  40.8 
 
 		 380 aa  263  4e-69  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1258  Radical SAM domain-containing protein  37.9 
 
 		 385 aa  261  1e-68  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.616603 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4068  radical SAM domain-containing protein  37.9 
 
 		 394 aa  261  2e-68  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.18733 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1324  radical SAM domain-containing protein  38.67 
 
 		 348 aa  260  3e-68  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.161004  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6099  radical SAM domain-containing protein  38.9 
 
 		 515 aa  259  4e-68  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.61579  normal  0.0270865 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>