More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swol_0919 on replicon NC_008346
Organism: Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008346  Swol_0919  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase, Fe-S oxidoreductase  100 
 
 		 292 aa  594  1e-169  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0173  radical SAM domain-containing protein  52.4 
 
 		 292 aa  325  4.0000000000000003e-88  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000741532  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2654  Radical SAM domain protein  49.66 
 
 		 291 aa  299  4e-80  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000344406  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1151  Radical SAM domain protein  46.92 
 
 		 291 aa  293  2e-78  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.388903 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2142  Radical SAM domain protein  45.21 
 
 		 291 aa  279  4e-74  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.608518  decreased coverage  0.00173745 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3617  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase, Fe-S oxidoreductase  46.21 
 
 		 293 aa  278  1e-73  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0365  radical SAM domain-containing protein  45.21 
 
 		 289 aa  271  1e-71  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00570597  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0717  radical SAM domain-containing protein  45.55 
 
 		 292 aa  268  1e-70  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3790  Radical SAM domain protein  45.05 
 
 		 338 aa  249  6e-65  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.135303  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0443  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase, putative  42.36 
 
 		 291 aa  244  9.999999999999999e-64  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2529  radical SAM domain-containing protein  47.73 
 
 		 296 aa  243  3e-63  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.496911  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1475  radical SAM domain-containing protein  43.75 
 
 		 298 aa  238  9e-62  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0640288  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0201  radical SAM domain-containing protein  41.02 
 
 		 293 aa  224  9e-58  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3059  radical SAM domain-containing protein  43.22 
 
 		 293 aa  219  3e-56  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2265  Radical SAM domain protein  43.12 
 
 		 293 aa  213  2.9999999999999995e-54  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3100  Radical SAM domain protein  40.83 
 
 		 295 aa  213  3.9999999999999995e-54  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.358776  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1162  Radical SAM domain protein  41.11 
 
 		 295 aa  210  2e-53  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0199468 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0453  radical SAM domain-containing protein  38.78 
 
 		 294 aa  210  2e-53  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4516  radical SAM domain-containing protein  39.46 
 
 		 293 aa  207  1e-52  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.193684 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2989  radical SAM domain-containing protein  41.01 
 
 		 293 aa  207  1e-52  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000144866  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0456  radical SAM domain-containing protein  38.44 
 
 		 309 aa  206  5e-52  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0530  radical SAM domain-containing protein  38.78 
 
 		 295 aa  205  7e-52  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3501  radical SAM domain-containing protein  38.78 
 
 		 295 aa  205  7e-52  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0423  radical SAM family protein  40.91 
 
 		 293 aa  204  1e-51  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1884  radical SAM family protein  39.32 
 
 		 296 aa  203  2e-51  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.295187  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0486  radical SAM domain-containing protein  39.12 
 
 		 295 aa  203  2e-51  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3668  radical SAM domain-containing protein  42.09 
 
 		 293 aa  204  2e-51  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000789266  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3965  radical SAM domain-containing protein  38.78 
 
 		 295 aa  202  4e-51  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3046  radical SAM family protein  37.76 
 
 		 293 aa  199  3e-50  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0528  hypothetical protein  37.41 
 
 		 295 aa  197  2.0000000000000003e-49  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1640  radical SAM domain-containing protein  37.8 
 
 		 297 aa  197  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.387627  normal  0.955096 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0407  hypothetical protein  37.92 
 
 		 294 aa  196  4.0000000000000005e-49  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3076  radical SAM family protein  38.89 
 
 		 292 aa  196  4.0000000000000005e-49  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0110421  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2963  radical SAM domain-containing protein  37.97 
 
 		 293 aa  193  3e-48  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.854509 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25810  hypothetical protein  37.95 
 
 		 298 aa  191  2e-47  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.723648  normal  0.254703 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2205  hypothetical protein  38.28 
 
 		 298 aa  190  2.9999999999999997e-47  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.42445  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3395  radical SAM domain-containing protein  38.1 
 
 		 292 aa  180  2e-44  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00495336  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1505  radical SAM domain-containing protein  33.33 
 
 		 292 aa  174  1.9999999999999998e-42  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00044584 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_13790  Fe-S oxidoreductase  35.02 
 
 		 297 aa  173  3.9999999999999995e-42  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0657  Radical SAM domain protein  36.54 
 
 		 292 aa  171  2e-41  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1360  radical SAM domain-containing protein  35.31 
 
 		 300 aa  166  5e-40  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.397431  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0066  Radical SAM domain protein  35.87 
 
 		 293 aa  164  1.0000000000000001e-39  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.628263  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2999  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase putative  30.86 
 
 		 388 aa  160  2e-38  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26860  Fe-S oxidoreductase  35.69 
 
 		 291 aa  158  1e-37  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2061  radical SAM domain-containing protein  34.49 
 
 		 294 aa  154  1e-36  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.952171  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25530  Fe-S oxidoreductase  33 
 
 		 308 aa  154  2e-36  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.261112  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0622  radical SAM domain-containing protein  33.09 
 
 		 311 aa  154  2e-36  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.044899  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2870  Radical SAM domain protein  32.2 
 
 		 373 aa  154  2e-36  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.578576 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02260  Fe-S oxidoreductase  31.36 
 
 		 293 aa  152  4e-36  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1410  Radical SAM domain protein  31.19 
 
 		 377 aa  149  5e-35  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1744  radical SAM domain-containing protein  28.98 
 
 		 380 aa  147  3e-34  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00743194  decreased coverage  0.000183859 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3411  Elongator protein 3/MiaB/NifB  36.32 
 
 		 257 aa  146  4.0000000000000006e-34  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3023  radical SAM domain-containing protein  29.65 
 
 		 386 aa  145  9e-34  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2726  Radical SAM domain protein  28.62 
 
 		 399 aa  140  3e-32  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_24530  Fe-S oxidoreductase  33.94 
 
 		 293 aa  136  5e-31  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04170  Fe-S oxidoreductase  30.28 
 
 		 293 aa  131  1.0000000000000001e-29  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.63469 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16730  Fe-S oxidoreductase  32.16 
 
 		 332 aa  131  1.0000000000000001e-29  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.359613 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25380  Fe-S oxidoreductase  32 
 
 		 300 aa  116  3.9999999999999997e-25  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.76381  normal  0.564969 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2640  putative oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  26.33 
 
 		 296 aa  108  8.000000000000001e-23  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00660  Fe-S oxidoreductase  29.43 
 
 		 321 aa  106  4e-22  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3579  radical SAM domain-containing protein  33.16 
 
 		 409 aa  103  5e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.630491  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1019  Radical SAM domain protein  27.87 
 
 		 390 aa  99  9e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1372  radical SAM domain-containing protein  31.05 
 
 		 402 aa  91.7  1e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.798772 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3838  radical SAM domain-containing protein  37.23 
 
 		 156 aa  87  4e-16  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2319  radical SAM family Fe-S protein  27.08 
 
 		 501 aa  81.6  0.00000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.518236  normal  0.0137531 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3058  radical SAM domain-containing protein  31.61 
 
 		 529 aa  76.6  0.0000000000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.111955  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1836  radical SAM domain-containing protein  27.27 
 
 		 474 aa  74.3  0.000000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3127  radical SAM domain-containing protein  27.49 
 
 		 475 aa  74.3  0.000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.543412  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1292  hopanoid biosynthesis associated radical SAM protein HpnJ  27.07 
 
 		 474 aa  73.9  0.000000000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.118878  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20660  MoaA, NifB, PqqE, radical SAM superfamily protein  29.38 
 
 		 470 aa  73.2  0.000000000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0516  radical SAM domain-containing protein  24.21 
 
 		 501 aa  72.4  0.000000000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4901  radical SAM family protein  28.35 
 
 		 474 aa  71.6  0.00000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.413487  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3569  hopanoid biosynthesis associated radical SAM protein HpnJ  25.77 
 
 		 478 aa  70.9  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.663184 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2393  radical SAM domain-containing protein  23.77 
 
 		 490 aa  70.9  0.00000000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.386797  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1151  coproporphyrinogen III oxidase  25.42 
 
 		 374 aa  70.1  0.00000000004  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1179  hopanoid biosynthesis associated radical SAM protein HpnJ  26.8 
 
 		 474 aa  69.7  0.00000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.846685  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2133  hopanoid biosynthesis associated radical SAM protein HpnJ  27.09 
 
 		 473 aa  69.7  0.00000000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0273985  normal  0.585786 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2852  radical SAM domain-containing protein  26.8 
 
 		 481 aa  69.3  0.00000000007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2737  radical SAM domain-containing protein  26.8 
 
 		 481 aa  69.3  0.00000000007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2796  radical SAM domain-containing protein  26.8 
 
 		 481 aa  69.3  0.00000000007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0536346  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0577  radical SAM domain-containing protein  26.8 
 
 		 473 aa  69.3  0.00000000007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2859  Fe-S oxidoreductase  26.8 
 
 		 473 aa  69.3  0.00000000007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1767  radical SAM domain-containing protein  26.8 
 
 		 503 aa  69.3  0.00000000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.580532  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1750  radical SAM domain-containing protein  26.8 
 
 		 473 aa  69.3  0.00000000007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.499976  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2888  B12 binding /radical SAM domain-containing protein  25.59 
 
 		 503 aa  68.9  0.00000000009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00308859  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2201  hopanoid biosynthesis associated radical SAM protein HpnJ  27.32 
 
 		 473 aa  68.2  0.0000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2062  putative methyltransferase, or Fe-S oxidoreductase  27.32 
 
 		 473 aa  68.2  0.0000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.6809  normal  0.16843 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0385  hypothetical protein  27.32 
 
 		 473 aa  68.2  0.0000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3533  Radical SAM domain protein  26.98 
 
 		 506 aa  68.2  0.0000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0692  radical SAM family protein  26.6 
 
 		 473 aa  68.2  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.346694  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1171  radical SAM domain-containing protein  26.6 
 
 		 473 aa  68.2  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.397655  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1147  hopanoid biosynthesis associated radical SAM protein HpnJ  26.6 
 
 		 473 aa  68.2  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.125383  normal  0.546782 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3467  Radical SAM domain protein  26.51 
 
 		 506 aa  67  0.0000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3408  radical SAM family protein  27.84 
 
 		 473 aa  67.4  0.0000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1010  coproporphyrinogen III oxidase  26.19 
 
 		 379 aa  67  0.0000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1165  Radical SAM domain protein  26.51 
 
 		 506 aa  67.4  0.0000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1053  hopanoid biosynthesis associated radical SAM protein HpnJ  26.11 
 
 		 473 aa  66.6  0.0000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4283  radical SAM family protein  26.11 
 
 		 480 aa  66.6  0.0000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.419045  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1050  radical SAM domain-containing protein  26.11 
 
 		 473 aa  66.6  0.0000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0795903  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2566  radical SAM family protein  31.12 
 
 		 441 aa  66.2  0.0000000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>