139 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shel_02260 on replicon NC_013165
Organism: Slackia heliotrinireducens DSM 20476



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013165  Shel_02260  Fe-S oxidoreductase  100 
 
 		 293 aa  611  9.999999999999999e-175  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1505  radical SAM domain-containing protein  41.3 
 
 		 292 aa  244  9.999999999999999e-64  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00044584 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26860  Fe-S oxidoreductase  38.91 
 
 		 291 aa  218  7.999999999999999e-56  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04170  Fe-S oxidoreductase  37.72 
 
 		 293 aa  207  2e-52  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.63469 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_13790  Fe-S oxidoreductase  36.71 
 
 		 297 aa  206  3e-52  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2061  radical SAM domain-containing protein  38.19 
 
 		 294 aa  195  8.000000000000001e-49  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.952171  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_24530  Fe-S oxidoreductase  39.45 
 
 		 293 aa  186  5e-46  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2529  radical SAM domain-containing protein  32.35 
 
 		 296 aa  179  7e-44  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.496911  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0365  radical SAM domain-containing protein  33.7 
 
 		 289 aa  172  5e-42  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00570597  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2142  Radical SAM domain protein  30.18 
 
 		 291 aa  172  7.999999999999999e-42  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.608518  decreased coverage  0.00173745 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0717  radical SAM domain-containing protein  31.9 
 
 		 292 aa  167  2e-40  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0066  Radical SAM domain protein  32.62 
 
 		 293 aa  167  2.9999999999999998e-40  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.628263  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2654  Radical SAM domain protein  31.9 
 
 		 291 aa  164  1.0000000000000001e-39  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000344406  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3790  Radical SAM domain protein  31.1 
 
 		 338 aa  164  1.0000000000000001e-39  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.135303  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1151  Radical SAM domain protein  31.21 
 
 		 291 aa  164  1.0000000000000001e-39  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.388903 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0443  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase, putative  31.94 
 
 		 291 aa  162  6e-39  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25530  Fe-S oxidoreductase  34.46 
 
 		 308 aa  158  1e-37  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.261112  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0453  radical SAM domain-containing protein  33.45 
 
 		 294 aa  157  2e-37  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4516  radical SAM domain-containing protein  33.09 
 
 		 293 aa  157  2e-37  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.193684 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0456  radical SAM domain-containing protein  32.37 
 
 		 309 aa  153  2.9999999999999998e-36  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0919  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase, Fe-S oxidoreductase  31.36 
 
 		 292 aa  152  4e-36  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3076  radical SAM family protein  34.04 
 
 		 292 aa  152  5.9999999999999996e-36  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0110421  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3617  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase, Fe-S oxidoreductase  31.06 
 
 		 293 aa  152  7e-36  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0407  hypothetical protein  34.16 
 
 		 294 aa  149  5e-35  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0201  radical SAM domain-containing protein  28.93 
 
 		 293 aa  149  5e-35  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0622  radical SAM domain-containing protein  29.75 
 
 		 311 aa  148  8e-35  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.044899  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0530  radical SAM domain-containing protein  31.65 
 
 		 295 aa  147  2.0000000000000003e-34  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3501  radical SAM domain-containing protein  31.65 
 
 		 295 aa  147  2.0000000000000003e-34  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2640  putative oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  31.1 
 
 		 296 aa  147  3e-34  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0528  hypothetical protein  31.65 
 
 		 295 aa  146  4.0000000000000006e-34  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3668  radical SAM domain-containing protein  31.03 
 
 		 293 aa  144  1e-33  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000789266  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3059  radical SAM domain-containing protein  31.85 
 
 		 293 aa  143  3e-33  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25810  hypothetical protein  32.38 
 
 		 298 aa  143  3e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.723648  normal  0.254703 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2205  hypothetical protein  32.74 
 
 		 298 aa  143  3e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.42445  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1475  radical SAM domain-containing protein  29.64 
 
 		 298 aa  141  1.9999999999999998e-32  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0640288  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0486  radical SAM domain-containing protein  31.29 
 
 		 295 aa  140  1.9999999999999998e-32  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3965  radical SAM domain-containing protein  31.65 
 
 		 295 aa  140  1.9999999999999998e-32  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0423  radical SAM family protein  30 
 
 		 293 aa  139  3.9999999999999997e-32  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0173  radical SAM domain-containing protein  28.88 
 
 		 292 aa  139  7e-32  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000741532  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1640  radical SAM domain-containing protein  30.15 
 
 		 297 aa  138  8.999999999999999e-32  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.387627  normal  0.955096 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1884  radical SAM family protein  30.39 
 
 		 296 aa  137  2e-31  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.295187  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3395  radical SAM domain-containing protein  31.8 
 
 		 292 aa  137  2e-31  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00495336  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2963  radical SAM domain-containing protein  30.22 
 
 		 293 aa  136  4e-31  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.854509 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3023  radical SAM domain-containing protein  27.69 
 
 		 386 aa  136  4e-31  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3046  radical SAM family protein  32.71 
 
 		 293 aa  135  7.000000000000001e-31  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1744  radical SAM domain-containing protein  27.8 
 
 		 380 aa  134  9.999999999999999e-31  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00743194  decreased coverage  0.000183859 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00660  Fe-S oxidoreductase  33.48 
 
 		 321 aa  135  9.999999999999999e-31  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2265  Radical SAM domain protein  32.12 
 
 		 293 aa  134  1.9999999999999998e-30  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2870  Radical SAM domain protein  28.81 
 
 		 373 aa  133  3.9999999999999996e-30  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.578576 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2726  Radical SAM domain protein  25 
 
 		 399 aa  130  2.0000000000000002e-29  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2989  radical SAM domain-containing protein  29.6 
 
 		 293 aa  130  3e-29  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000144866  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1360  radical SAM domain-containing protein  27.33 
 
 		 300 aa  128  9.000000000000001e-29  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.397431  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1410  Radical SAM domain protein  28.14 
 
 		 377 aa  127  2.0000000000000002e-28  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1162  Radical SAM domain protein  30.77 
 
 		 295 aa  126  5e-28  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0199468 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3100  Radical SAM domain protein  30.43 
 
 		 295 aa  124  1e-27  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.358776  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3411  Elongator protein 3/MiaB/NifB  30.8 
 
 		 257 aa  122  7e-27  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16730  Fe-S oxidoreductase  31.46 
 
 		 332 aa  119  3.9999999999999996e-26  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.359613 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0657  Radical SAM domain protein  27.92 
 
 		 292 aa  117  1.9999999999999998e-25  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25380  Fe-S oxidoreductase  28.24 
 
 		 300 aa  112  6e-24  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.76381  normal  0.564969 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2999  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase putative  26.18 
 
 		 388 aa  111  1.0000000000000001e-23  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1019  Radical SAM domain protein  27.57 
 
 		 390 aa  93.2  5e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1372  radical SAM domain-containing protein  25.62 
 
 		 402 aa  79.3  0.00000000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.798772 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3579  radical SAM domain-containing protein  26.98 
 
 		 409 aa  77  0.0000000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.630491  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0353  magnesium-protoporphyrin IX monomethyl ester (oxidative) cyclase  24.64 
 
 		 485 aa  60.8  0.00000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.90319 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0319  putative oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  26.34 
 
 		 497 aa  55.8  0.0000009  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.470107  normal  0.297438 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0504  radical SAM domain-containing protein  25.17 
 
 		 471 aa  53.1  0.000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0154  Elongator protein 3/MiaB/NifB  27.27 
 
 		 479 aa  51.6  0.00001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.000374319  normal  0.695654 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3233  radical SAM domain-containing protein  25.21 
 
 		 531 aa  51.2  0.00002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0052  coproporphyrinogen III oxidase, anaerobic  24.55 
 
 		 390 aa  51.2  0.00002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0403831  normal  0.42577 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3614  radical SAM domain-containing protein  27.27 
 
 		 451 aa  50.8  0.00002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2374  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  25.94 
 
 		 448 aa  48.5  0.0001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0582  coproporphyrinogen III oxidase, anaerobic  26.84 
 
 		 388 aa  48.9  0.0001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0100  radical SAM domain-containing protein  25.36 
 
 		 705 aa  48.5  0.0001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0253265  normal  0.373771 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3838  radical SAM domain-containing protein  27.27 
 
 		 156 aa  48.1  0.0002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0475  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase, putative  24.77 
 
 		 376 aa  47.4  0.0003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3401  Radical SAM domain protein  24.72 
 
 		 484 aa  47  0.0004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0384  coproporphyrinogen III oxidase  27.4 
 
 		 452 aa  46.6  0.0005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1649  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  22.97 
 
 		 374 aa  46.6  0.0005  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2989  Radical SAM domain protein  26.29 
 
 		 500 aa  46.6  0.0005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3390  magnesium-protoporphyrin IX monomethyl ester (oxidative) cyclase  25.82 
 
 		 485 aa  46.6  0.0006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0878  hopanoid biosynthesis associated radical SAM protein HpnJ  38.89 
 
 		 473 aa  46.6  0.0006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.858521  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1150  oxidative cyclase-related protein  27.43 
 
 		 475 aa  45.8  0.0008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1323  Radical SAM domain protein  27.17 
 
 		 360 aa  45.8  0.0008  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0931  radical SAM domain-containing protein  22.99 
 
 		 369 aa  45.8  0.0009  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.297129  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2416  radical SAM family protein  30 
 
 		 475 aa  45.1  0.001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000000137144  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2963  radical SAM domain-containing protein  23.43 
 
 		 476 aa  45.4  0.001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.0000286011  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20660  MoaA, NifB, PqqE, radical SAM superfamily protein  25.93 
 
 		 470 aa  45.4  0.001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2440  coproporphyrinogen III oxidase  26.62 
 
 		 382 aa  45.4  0.001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000264436  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2413  coproporphyrinogen III oxidase  24.55 
 
 		 486 aa  45.4  0.001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0030  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase, putative  22.75 
 
 		 385 aa  44.7  0.002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.949331  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0832  Radical SAM domain protein  25 
 
 		 527 aa  44.7  0.002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.170506 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3382  hopanoid biosynthesis associated radical SAM protein HpnJ  37.5 
 
 		 473 aa  45.1  0.002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0643  Radical SAM domain protein  24.34 
 
 		 489 aa  44.7  0.002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.83222  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2133  hopanoid biosynthesis associated radical SAM protein HpnJ  25 
 
 		 473 aa  44.7  0.002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0273985  normal  0.585786 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3320  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  20.47 
 
 		 357 aa  44.7  0.002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00918826  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2316  radical SAM family protein  27.39 
 
 		 346 aa  44.3  0.003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0874  radical SAM family Fe-S protein  28 
 
 		 501 aa  44.3  0.003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0692  radical SAM family protein  25 
 
 		 473 aa  44.3  0.003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.346694  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2393  radical SAM domain-containing protein  28.87 
 
 		 490 aa  44.3  0.003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.386797  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2065  Radical SAM domain protein  25 
 
 		 530 aa  44.3  0.003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>