198 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spea_0453 on replicon NC_009901
Organism: Shewanella pealeana ATCC 700345



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009901  Spea_0453  radical SAM domain-containing protein  100 
 
 		 294 aa  608  1e-173  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0530  radical SAM domain-containing protein  80.95 
 
 		 295 aa  506  9.999999999999999e-143  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3501  radical SAM domain-containing protein  80.95 
 
 		 295 aa  506  9.999999999999999e-143  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0486  radical SAM domain-containing protein  80.61 
 
 		 295 aa  504  1e-141  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3965  radical SAM domain-containing protein  80.27 
 
 		 295 aa  501  1e-141  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0528  hypothetical protein  78.91 
 
 		 295 aa  493  9.999999999999999e-139  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0456  radical SAM domain-containing protein  78.5 
 
 		 309 aa  489  1e-137  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4516  radical SAM domain-containing protein  79.18 
 
 		 293 aa  488  1e-137  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.193684 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3076  radical SAM family protein  75.85 
 
 		 292 aa  461  1e-129  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0110421  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0407  hypothetical protein  72.79 
 
 		 294 aa  452  1.0000000000000001e-126  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3395  radical SAM domain-containing protein  75.17 
 
 		 292 aa  451  1.0000000000000001e-126  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00495336  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1360  radical SAM domain-containing protein  67.68 
 
 		 300 aa  391  1e-108  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.397431  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3411  Elongator protein 3/MiaB/NifB  72.97 
 
 		 257 aa  385  1e-106  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1640  radical SAM domain-containing protein  61.43 
 
 		 297 aa  367  1e-101  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.387627  normal  0.955096 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1475  radical SAM domain-containing protein  59.04 
 
 		 298 aa  363  2e-99  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0640288  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25810  hypothetical protein  59.39 
 
 		 298 aa  355  3.9999999999999996e-97  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.723648  normal  0.254703 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2205  hypothetical protein  59.04 
 
 		 298 aa  353  2.9999999999999997e-96  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.42445  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1884  radical SAM family protein  54.76 
 
 		 296 aa  325  5e-88  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.295187  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3838  radical SAM domain-containing protein  76.22 
 
 		 156 aa  222  6e-57  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2142  Radical SAM domain protein  38.83 
 
 		 291 aa  216  2.9999999999999998e-55  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.608518  decreased coverage  0.00173745 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1151  Radical SAM domain protein  38.91 
 
 		 291 aa  214  1.9999999999999998e-54  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.388903 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0919  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase, Fe-S oxidoreductase  38.78 
 
 		 292 aa  210  2e-53  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3059  radical SAM domain-containing protein  41.22 
 
 		 293 aa  206  3e-52  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0717  radical SAM domain-containing protein  38.57 
 
 		 292 aa  206  3e-52  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3668  radical SAM domain-containing protein  40.86 
 
 		 293 aa  205  7e-52  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000789266  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0201  radical SAM domain-containing protein  36.82 
 
 		 293 aa  204  2e-51  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2529  radical SAM domain-containing protein  40.89 
 
 		 296 aa  203  3e-51  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.496911  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2654  Radical SAM domain protein  38.14 
 
 		 291 aa  198  7e-50  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000344406  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2265  Radical SAM domain protein  42.16 
 
 		 293 aa  198  1.0000000000000001e-49  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0423  radical SAM family protein  38.95 
 
 		 293 aa  197  2.0000000000000003e-49  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3100  Radical SAM domain protein  40.5 
 
 		 295 aa  196  3e-49  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.358776  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1162  Radical SAM domain protein  39.43 
 
 		 295 aa  195  8.000000000000001e-49  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0199468 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2989  radical SAM domain-containing protein  39.3 
 
 		 293 aa  194  2e-48  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000144866  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3046  radical SAM family protein  38.05 
 
 		 293 aa  193  3e-48  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2963  radical SAM domain-containing protein  38 
 
 		 293 aa  191  2e-47  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.854509 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0365  radical SAM domain-containing protein  36.86 
 
 		 289 aa  190  2.9999999999999997e-47  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00570597  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0173  radical SAM domain-containing protein  36.05 
 
 		 292 aa  185  9e-46  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000741532  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3790  Radical SAM domain protein  39.55 
 
 		 338 aa  185  1.0000000000000001e-45  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.135303  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0443  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase, putative  36.24 
 
 		 291 aa  176  6e-43  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3617  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase, Fe-S oxidoreductase  36.6 
 
 		 293 aa  168  1e-40  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0657  Radical SAM domain protein  37.31 
 
 		 292 aa  166  2.9999999999999998e-40  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26860  Fe-S oxidoreductase  35.13 
 
 		 291 aa  160  2e-38  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_13790  Fe-S oxidoreductase  35.47 
 
 		 297 aa  160  3e-38  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02260  Fe-S oxidoreductase  33.45 
 
 		 293 aa  157  2e-37  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04170  Fe-S oxidoreductase  34.58 
 
 		 293 aa  149  4e-35  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.63469 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0066  Radical SAM domain protein  31.36 
 
 		 293 aa  146  5e-34  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.628263  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1505  radical SAM domain-containing protein  30.42 
 
 		 292 aa  145  6e-34  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00044584 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1744  radical SAM domain-containing protein  27.89 
 
 		 380 aa  140  1.9999999999999998e-32  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00743194  decreased coverage  0.000183859 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25530  Fe-S oxidoreductase  30.56 
 
 		 308 aa  139  3.9999999999999997e-32  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.261112  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_24530  Fe-S oxidoreductase  35.14 
 
 		 293 aa  140  3.9999999999999997e-32  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2061  radical SAM domain-containing protein  31.31 
 
 		 294 aa  139  7e-32  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.952171  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2999  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase putative  29.02 
 
 		 388 aa  137  2e-31  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3023  radical SAM domain-containing protein  28.62 
 
 		 386 aa  135  7.000000000000001e-31  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2640  putative oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  27.65 
 
 		 296 aa  131  1.0000000000000001e-29  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2726  Radical SAM domain protein  28.57 
 
 		 399 aa  131  2.0000000000000002e-29  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1410  Radical SAM domain protein  27.84 
 
 		 377 aa  127  3e-28  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0622  radical SAM domain-containing protein  29.72 
 
 		 311 aa  126  5e-28  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.044899  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25380  Fe-S oxidoreductase  34.69 
 
 		 300 aa  118  9.999999999999999e-26  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.76381  normal  0.564969 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2870  Radical SAM domain protein  26.8 
 
 		 373 aa  118  9.999999999999999e-26  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.578576 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00660  Fe-S oxidoreductase  30.25 
 
 		 321 aa  114  1.0000000000000001e-24  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16730  Fe-S oxidoreductase  31.27 
 
 		 332 aa  106  4e-22  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.359613 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1019  Radical SAM domain protein  30.43 
 
 		 390 aa  103  4e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1372  radical SAM domain-containing protein  30.2 
 
 		 402 aa  100  2e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.798772 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3579  radical SAM domain-containing protein  30.05 
 
 		 409 aa  98.6  1e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.630491  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3496  hypothetical protein  86.49 
 
 		 38 aa  78.6  0.0000000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.871156  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3102  radical SAM domain-containing protein  29.87 
 
 		 487 aa  61.2  0.00000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0100  radical SAM domain-containing protein  28.05 
 
 		 705 aa  58.9  0.00000009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0253265  normal  0.373771 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1705  cobalamin B12-binding/radical SAM family protein  29.14 
 
 		 472 aa  58.2  0.0000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.900478  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2393  radical SAM domain-containing protein  26.4 
 
 		 490 aa  57.8  0.0000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.386797  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2873  radical SAM domain-containing protein  26.94 
 
 		 520 aa  57  0.0000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000297506  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2319  radical SAM family Fe-S protein  25.56 
 
 		 501 aa  55.8  0.0000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.518236  normal  0.0137531 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0671  Radical SAM domain protein  23.11 
 
 		 468 aa  54.7  0.000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3593  radical SAM domain-containing protein  28 
 
 		 472 aa  54.7  0.000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000974767  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3415  radical SAM domain/B12 binding domain-containing protein  27.43 
 
 		 472 aa  53.9  0.000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0050  radical SAM domain-containing protein  24 
 
 		 707 aa  53.9  0.000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0070  Radical SAM domain protein  23.43 
 
 		 635 aa  54.3  0.000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4199  cobalamin B12-binding:radical SAM family protein  28.03 
 
 		 548 aa  53.5  0.000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.122489 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2185  Radical SAM domain protein  28.16 
 
 		 473 aa  53.5  0.000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000424629  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1501  radical SAM domain-containing protein  26.15 
 
 		 341 aa  53.1  0.000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.166226  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2496  radical SAM family protein  25.97 
 
 		 502 aa  53.1  0.000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.442433  normal  0.964674 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1944  Radical SAM domain protein  26.39 
 
 		 374 aa  53.1  0.000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0450295  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4370  radical SAM domain-containing protein  24 
 
 		 634 aa  53.1  0.000006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1775  radical SAM family protein  27.46 
 
 		 392 aa  52.8  0.000007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.391718 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0270  Radical SAM domain protein  24.16 
 
 		 929 aa  52.4  0.000009  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.669686  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1855  radical SAM family protein  27.37 
 
 		 638 aa  52  0.00001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.357803 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3165  Fe-S oxidoreductase  25.38 
 
 		 459 aa  52  0.00001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00148517 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0246  radical SAM domain-containing protein  25.7 
 
 		 647 aa  52  0.00001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3370  cobalamin B12-binding  26.29 
 
 		 618 aa  51.2  0.00002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.818313  normal  0.0333946 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1009  hopanoid biosynthesis associated radical SAM protein HpnJ  24.26 
 
 		 479 aa  51.2  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1038  hopanoid biosynthesis associated radical SAM protein HpnJ  24.26 
 
 		 479 aa  51.2  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000337224 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1713  radical SAM domain-containing protein  27.75 
 
 		 317 aa  51.2  0.00002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0944  Radical SAM domain protein  28.57 
 
 		 488 aa  51.6  0.00002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000117321 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3304  Radical SAM domain protein  28.57 
 
 		 487 aa  50.8  0.00003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.542811  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1423  radical SAM/B12 binding domain protein  26.67 
 
 		 715 aa  50.8  0.00003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.623089  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0689  Radical SAM domain protein  26.04 
 
 		 459 aa  50.8  0.00003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2521  radical SAM domain-containing protein  24.87 
 
 		 531 aa  50.4  0.00004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0155875  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1626  Radical SAM domain protein  26.67 
 
 		 444 aa  50.1  0.00004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.105485 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0089  Radical SAM domain protein  24.58 
 
 		 643 aa  50.4  0.00004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3373  radical SAM domain-containing protein  30.61 
 
 		 503 aa  50.1  0.00004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.319005 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0213  radical SAM domain-containing protein  25.48 
 
 		 429 aa  49.7  0.00005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.25181  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>