272 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lcho_4370 on replicon NC_010524
Organism: Leptothrix cholodnii SP-6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009901  Spea_2276  radical SAM domain-containing protein  54.42 
 
 		 642 aa  718    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.315011  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0089  Radical SAM domain protein  75.59 
 
 		 643 aa  959    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0105  radical SAM domain-containing protein  77.25 
 
 		 636 aa  1003    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1855  radical SAM family protein  74.8 
 
 		 638 aa  956    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.357803 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0050  radical SAM domain-containing protein  77.02 
 
 		 707 aa  991    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4370  radical SAM domain-containing protein  100 
 
 		 634 aa  1294    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0070  Radical SAM domain protein  77.13 
 
 		 635 aa  996    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3586  Radical SAM domain protein  51.99 
 
 		 732 aa  678    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00751133 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0246  radical SAM domain-containing protein  56.94 
 
 		 647 aa  746    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1420  radical SAM domain-containing protein  71.9 
 
 		 632 aa  949    Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2787  Radical SAM domain protein  52.39 
 
 		 732 aa  665    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.231637  normal  0.0637853 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1155  radical SAM family protein  54.59 
 
 		 658 aa  725    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4972  radical SAM domain-containing protein  50.08 
 
 		 738 aa  679    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.991033  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3504  radical SAM domain-containing protein  55.09 
 
 		 646 aa  722    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.596547 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1777  Radical SAM domain protein  53.71 
 
 		 737 aa  682    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.54513 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0112  Fe-S oxidoreductase  51.86 
 
 		 726 aa  655    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.702038 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3570  radical SAM domain-containing protein  55.16 
 
 		 658 aa  729    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.370781  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1481  radical SAM family protein  54.73 
 
 		 644 aa  726    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.177835  normal  0.151823 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0533  radical SAM domain protein  78.64 
 
 		 138 aa  182  2e-44  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2450  radical SAM domain-containing protein  30.85 
 
 		 590 aa  166  9e-40  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.271447 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1423  radical SAM/B12 binding domain protein  29.09 
 
 		 715 aa  150  5e-35  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.623089  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0098  radical SAM domain-containing protein  28.87 
 
 		 716 aa  113  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.21534  normal  0.126108 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0100  radical SAM domain-containing protein  33.47 
 
 		 705 aa  111  3e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0253265  normal  0.373771 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2989  Radical SAM domain protein  26.05 
 
 		 500 aa  108  3e-22  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0213  radical SAM domain-containing protein  30.43 
 
 		 429 aa  101  3e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.25181  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0245  radical SAM family protein  26.3 
 
 		 502 aa  100  1e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000162793  hitchhiker  0.0000142762 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2210  radical SAM domain-containing protein  26.92 
 
 		 565 aa  99.8  1e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.362097 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2521  radical SAM domain-containing protein  26.22 
 
 		 531 aa  97.8  6e-19  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0155875  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2019  Radical SAM domain protein  23.22 
 
 		 525 aa  97.4  8e-19  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0788272  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3373  radical SAM domain-containing protein  24.24 
 
 		 503 aa  93.6  1e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.319005 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0689  Radical SAM domain protein  22.81 
 
 		 459 aa  89.7  1e-16  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3552  Radical SAM domain protein  25.38 
 
 		 488 aa  82.8  0.00000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2873  radical SAM domain-containing protein  23.75 
 
 		 520 aa  80.9  0.00000000000006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000297506  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6404  Mg-protoporphyrin IX monomethyl ester oxidative cyclase 66kD subunit  25.15 
 
 		 534 aa  79.7  0.0000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3058  radical SAM domain-containing protein  23.92 
 
 		 529 aa  78.2  0.0000000000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.111955  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2158  magnesium-protoporphyrin IX monomethyl ester anaerobic oxidative cyclase  25.14 
 
 		 546 aa  77.8  0.0000000000006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.1157  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1863  radical SAM family protein  25.17 
 
 		 486 aa  74.3  0.000000000007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.300057  normal  0.908691 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0279  radical SAM domain-containing protein  22.4 
 
 		 494 aa  73.9  0.000000000007  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0512  Radical SAM domain protein  23.65 
 
 		 486 aa  73.2  0.00000000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0108  radical SAM domain-containing protein  22.96 
 
 		 494 aa  73.6  0.00000000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2315  magnesium-protoporphyrin IX monomethyl ester anaerobic oxidative cyclase  24.57 
 
 		 546 aa  73.2  0.00000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.03087  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0944  Radical SAM domain protein  27.74 
 
 		 488 aa  72  0.00000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000117321 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0316  magnesium-protoporphyrin IX monomethyl ester anaerobic oxidative cyclase  25.07 
 
 		 567 aa  72  0.00000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2379  Radical SAM domain protein  22.03 
 
 		 623 aa  72  0.00000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1584  magnesium-protoporphyrin IX monomethyl ester anaerobic oxidative cyclase  24.76 
 
 		 527 aa  71.6  0.00000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1742  radical SAM domain-containing protein  24.84 
 
 		 521 aa  71.2  0.00000000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0879  radical SAM family Fe-S protein  24.43 
 
 		 488 aa  70.9  0.00000000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.293304  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1705  cobalamin B12-binding/radical SAM family protein  23.44 
 
 		 472 aa  70.1  0.0000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.900478  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2209  magnesium-protoporphyrin IX monomethyl ester anaerobic oxidative cyclase  24.46 
 
 		 546 aa  70.1  0.0000000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.561885  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3165  Fe-S oxidoreductase  21.41 
 
 		 459 aa  69.7  0.0000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00148517 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3338  glycosyl transferase family protein  28.82 
 
 		 1250 aa  68.9  0.0000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4199  cobalamin B12-binding:radical SAM family protein  25.91 
 
 		 548 aa  68.6  0.0000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.122489 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0942  magnesium-protoporphyrin IX monomethyl ester anaerobic oxidative cyclase  25.08 
 
 		 528 aa  68.9  0.0000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.00162998  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0504  radical SAM domain-containing protein  22.52 
 
 		 471 aa  68.9  0.0000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2434  radical SAM domain-containing protein  25 
 
 		 520 aa  68.6  0.0000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2894  radical SAM family protein  28.35 
 
 		 613 aa  68.6  0.0000000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.80419 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1125  Fe-S oxidoreductase  24.23 
 
 		 555 aa  68.2  0.0000000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1100  radical SAM domain-containing protein  21.97 
 
 		 470 aa  67.8  0.0000000005  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3304  Radical SAM domain protein  26.52 
 
 		 487 aa  67.8  0.0000000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.542811  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2585  magnesium-protoporphyrin IX monomethyl ester anaerobic oxidative cyclase  23.34 
 
 		 546 aa  67.8  0.0000000006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.908643  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2435  radical SAM domain-containing protein  22.8 
 
 		 524 aa  67.4  0.0000000007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000772503  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1625  magnesium-protoporphyrin IX monomethyl ester anaerobic oxidative cyclase  24.13 
 
 		 558 aa  67.4  0.0000000007  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1976  magnesium-protoporphyrin IX monomethyl ester anaerobic oxidative cyclase  24.77 
 
 		 546 aa  67  0.000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.175578  normal  0.725626 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1626  Radical SAM domain protein  28.93 
 
 		 444 aa  67  0.000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.105485 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3574  radical SAM domain-containing protein  22.64 
 
 		 461 aa  65.9  0.000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0762  Fe-S oxidoreductase  24.26 
 
 		 484 aa  66.2  0.000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.151938  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1487  magnesium-protoporphyrin IX monomethyl ester anaerobic oxidative cyclase  26.44 
 
 		 567 aa  65.9  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3057  Radical SAM domain protein  22.96 
 
 		 518 aa  66.2  0.000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00748759  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2566  radical SAM domain-containing protein  24.71 
 
 		 426 aa  65.1  0.000000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.162584  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2433  radical SAM domain-containing protein  24.25 
 
 		 502 aa  65.1  0.000000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1171  radical SAM family protein  24.57 
 
 		 563 aa  64.7  0.000000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000834486  normal  0.0316133 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2523  Radical SAM domain protein  27.13 
 
 		 424 aa  64.7  0.000000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0388324 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1699  Radical SAM domain protein  26.6 
 
 		 424 aa  64.3  0.000000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.0000206113  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2292  radical SAM domain-containing protein  24.57 
 
 		 634 aa  64.3  0.000000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.727503  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2638  magnesium-protoporphyrin IX monomethyl ester (oxidative) cyclase  23.6 
 
 		 512 aa  63.9  0.000000008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2393  radical SAM domain-containing protein  23.84 
 
 		 490 aa  63.9  0.000000009  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.386797  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1535  radical SAM domain/B12 binding domain-containing protein  21.65 
 
 		 651 aa  63.2  0.00000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3548  magnesium-protoporphyrin IX monomethyl ester anaerobic oxidative cyclase  23.38 
 
 		 535 aa  63.5  0.00000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1338  radical SAM/B12 binding domain protein  21.43 
 
 		 494 aa  63.5  0.00000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_101  radical SAM/B12 binding domain protein  21.43 
 
 		 494 aa  63.5  0.00000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0033  B12-binding/radical SAM domain-containing protein  21.28 
 
 		 647 aa  62.4  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2351  Radical SAM domain protein  26.06 
 
 		 426 aa  63.2  0.00000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0047  Fe-S oxidoreductase  21.28 
 
 		 647 aa  62.8  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.982872  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2416  radical SAM domain-containing protein  23.02 
 
 		 469 aa  62.8  0.00000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2387  cobalamin B12-binding domain protein  22.22 
 
 		 545 aa  62.8  0.00000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1119  radical SAM domain-containing protein  24.63 
 
 		 525 aa  63.2  0.00000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0138505  normal  0.560391 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2195  Radical SAM domain protein  23.61 
 
 		 460 aa  62  0.00000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.565929  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1537  Elongator protein 3/MiaB/NifB  24.05 
 
 		 462 aa  61.6  0.00000004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.537529  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0968  Radical SAM domain protein  22.25 
 
 		 630 aa  61.6  0.00000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1460  radical SAM domain/B12 binding domain-containing protein  21.36 
 
 		 651 aa  61.2  0.00000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0027  radical SAM domain/B12 binding domain-containing protein  21.36 
 
 		 651 aa  61.2  0.00000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1180  radical SAM domain/B12 binding domain-containing protein  21.36 
 
 		 647 aa  61.6  0.00000005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0033  radical SAM domain/B12 binding domain-containing protein  21.36 
 
 		 647 aa  61.6  0.00000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3614  radical SAM domain-containing protein  23.32 
 
 		 451 aa  61.2  0.00000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0871  radical SAM domain/B12 binding domain-containing protein  22.26 
 
 		 554 aa  60.5  0.00000009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1168  radical SAM family protein  20.98 
 
 		 566 aa  60.5  0.0000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1602  radical SAM family Fe-S protein  19.89 
 
 		 487 aa  60.5  0.0000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0876  radical SAM family Fe-S protein  26.06 
 
 		 461 aa  60.1  0.0000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.430138  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3585  magnesium-protoporphyrin IX monomethyl ester anaerobic oxidative cyclase  24.65 
 
 		 548 aa  59.7  0.0000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0670454 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0909  magnesium-protoporphyrin IX monomethyl ester (oxidative) cyclase  24.32 
 
 		 681 aa  60.1  0.0000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>