More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Glov_1944 on replicon NC_010814
Organism: Geobacter lovleyi SZ



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010814  Glov_1944  Radical SAM domain protein  100 
 
 		 374 aa  759    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0450295  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1777  radical SAM domain-containing protein  48.71 
 
 		 352 aa  330  3e-89  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.112435  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2316  radical SAM family protein  46.88 
 
 		 346 aa  294  1e-78  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2227  radical SAM domain-containing protein  45.19 
 
 		 342 aa  287  2e-76  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.775407  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3151  radical SAM domain-containing protein  42.61 
 
 		 351 aa  277  3e-73  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0207208  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1061  Radical SAM domain protein  42.53 
 
 		 343 aa  268  1e-70  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.8315700000000001e-19 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3202  Radical SAM domain protein  43 
 
 		 342 aa  259  7e-68  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00235958  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1501  radical SAM domain-containing protein  41.25 
 
 		 341 aa  246  3e-64  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.166226  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1719  radical SAM domain-containing protein  36.06 
 
 		 354 aa  239  8e-62  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.219309  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0930  radical SAM family protein  36.34 
 
 		 338 aa  238  2e-61  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000118017  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0774  ELP3 component of the RNA polymerase II complex  39.29 
 
 		 362 aa  229  5e-59  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00000160735  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0688  Radical SAM domain protein  38.61 
 
 		 336 aa  226  3e-58  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1160  Radical SAM domain protein  36.33 
 
 		 341 aa  227  3e-58  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.276403  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0875  radical SAM domain-containing protein  39.05 
 
 		 359 aa  219  5e-56  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1404  radical SAM protein, putative histone acetyltransferase  38.81 
 
 		 345 aa  219  6e-56  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.00000266579  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1689  radical SAM domain-containing protein  35.07 
 
 		 357 aa  206  4e-52  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0776794  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1971  radical SAM domain-containing protein  35.07 
 
 		 357 aa  206  6e-52  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.144867  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2238  Radical SAM domain protein  36.72 
 
 		 354 aa  195  9e-49  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0660  Radical SAM domain protein  34.41 
 
 		 359 aa  195  9e-49  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.142353  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1179  radical SAM domain-containing protein  35.64 
 
 		 314 aa  184  2.0000000000000003e-45  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1640  radical SAM domain-containing protein  35.29 
 
 		 317 aa  170  3e-41  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0787  radical SAM domain-containing protein  32.07 
 
 		 317 aa  170  4e-41  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1713  radical SAM domain-containing protein  35.63 
 
 		 317 aa  166  5e-40  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1562  Radical SAM domain protein  34.17 
 
 		 401 aa  164  2.0000000000000002e-39  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2966  Radical SAM domain protein  37.26 
 
 		 344 aa  162  1e-38  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0294152  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2540  radical SAM domain-containing protein  40.07 
 
 		 340 aa  160  2e-38  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.093156 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0182  Radical SAM domain protein  34.31 
 
 		 401 aa  155  1e-36  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.534223  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0515  Elongator protein 3/MiaB/NifB  33.44 
 
 		 309 aa  147  2.0000000000000003e-34  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.84475  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0261  Radical SAM domain protein  30.29 
 
 		 564 aa  110  5e-23  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0088  radical SAM domain-containing protein  30.71 
 
 		 477 aa  98.6  2e-19  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0202426 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0579  ELP3 family histone acetyltransferase  27 
 
 		 527 aa  96.7  6e-19  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0122  radical SAM domain-containing protein  29.75 
 
 		 483 aa  92.8  8e-18  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1358  putative radical SAM protein  24.54 
 
 		 318 aa  92.8  8e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.161503  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1167  radical SAM domain-containing protein  28.99 
 
 		 469 aa  92.8  9e-18  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.413437  normal  0.627812 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3661  putative radical SAM protein  29.58 
 
 		 319 aa  92.4  1e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1085  histone acetyltransferase, ELP3 family  26 
 
 		 514 aa  91.7  2e-17  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.707697  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2706  histone acetyltransferase, ELP3 family  28.3 
 
 		 553 aa  91.7  2e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1222  putative radical SAM protein  28.43 
 
 		 312 aa  90.1  5e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.101192  normal  0.0468931 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0664  hypothetical protein  27.45 
 
 		 318 aa  89  1e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.08613e-26 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0872  histone acetyltransferase, ELP3 family  28.3 
 
 		 556 aa  87.8  3e-16  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0651  conserved hypothetical radical SAM protein  27.45 
 
 		 318 aa  87  4e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0306  hypothetical protein  30.2 
 
 		 309 aa  86.7  6e-16  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.216797  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1326  hypothetical protein  30.3 
 
 		 309 aa  86.7  6e-16  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1033  putative radical SAM protein  30.1 
 
 		 330 aa  86.3  7e-16  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.247016  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0300  hypothetical protein  30.2 
 
 		 309 aa  85.9  0.000000000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.558235  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0572  conserved hypothetical radical SAM protein  27 
 
 		 325 aa  85.1  0.000000000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2870  putative radical SAM protein  28.79 
 
 		 309 aa  85.1  0.000000000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00453128  normal  0.0632795 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2952  putative radical SAM protein  28.79 
 
 		 309 aa  85.1  0.000000000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.432245  normal  0.157754 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3048  putative radical SAM protein  28.79 
 
 		 309 aa  85.1  0.000000000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0315161  normal  0.32107 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2022  hypothetical protein  31.22 
 
 		 338 aa  84.7  0.000000000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1087  radical SAM family protein  26.84 
 
 		 311 aa  84.3  0.000000000000003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.447962 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2936  hypothetical protein  30.46 
 
 		 319 aa  84.3  0.000000000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.971153  hitchhiker  0.00000000000000717489 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3477  putative radical SAM protein  26.76 
 
 		 313 aa  84  0.000000000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.143192  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3790  hypothetical protein  30.33 
 
 		 314 aa  84  0.000000000000005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0994894  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1318  ELP3 family histone acetyltransferase  26.14 
 
 		 510 aa  83.2  0.000000000000007  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.340377 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0279  ELP3 family histone acetyltransferase  25.31 
 
 		 563 aa  82.8  0.000000000000008  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0103  putative radical SAM protein  29.2 
 
 		 304 aa  82.4  0.00000000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0139654 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2187  hypothetical protein  28.57 
 
 		 316 aa  81.6  0.00000000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000345504 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4117  hypothetical protein  29.17 
 
 		 334 aa  81.6  0.00000000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2950  putative radical SAM protein  27.88 
 
 		 322 aa  81.3  0.00000000000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.474173  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2192  histone acetyltransferase, ELP3 family  26.19 
 
 		 576 aa  80.5  0.00000000000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17330  coproporphyrinogen III oxidase, anaerobic  27.52 
 
 		 389 aa  80.1  0.00000000000005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.395345  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1127  putative radical SAM protein  26.84 
 
 		 308 aa  80.1  0.00000000000006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0121319  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3632  hypothetical protein  28.91 
 
 		 317 aa  80.1  0.00000000000006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.197622  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1133  ELP3 family histone acetyltransferase  35.34 
 
 		 522 aa  79.7  0.00000000000007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1480  histone acetyltransferase, ELP3 family  30.52 
 
 		 585 aa  79.7  0.00000000000008  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.761791  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11990  radical SAM protein, TIGR01212 family  23.43 
 
 		 318 aa  79.7  0.00000000000008  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000013437  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1755  ELP3 family histone acetyltransferase  34.78 
 
 		 547 aa  79  0.0000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.668163  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3655  putative radical SAM protein  27.49 
 
 		 328 aa  78.6  0.0000000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0760029 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1989  ELP3 family histone acetyltransferase  31.88 
 
 		 548 aa  78.2  0.0000000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1156  putative radical SAM protein  27.88 
 
 		 307 aa  78.2  0.0000000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0308267  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004465  hypothetical protein  26.98 
 
 		 319 aa  78.2  0.0000000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1179  putative radical SAM protein  27.5 
 
 		 309 aa  78.6  0.0000000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0586  radical SAM family protein  33.56 
 
 		 319 aa  77.8  0.0000000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3507  radical SAM family protein  26.54 
 
 		 309 aa  77.4  0.0000000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03076  predicted Fe-S oxidoreductase  26.54 
 
 		 309 aa  77.4  0.0000000000004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.709944  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0496  conserved hypothetical protein  26.54 
 
 		 309 aa  77.4  0.0000000000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3404  radical SAM family protein  26.54 
 
 		 309 aa  77.4  0.0000000000004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4534  radical SAM protein, TIGR01212 family  26.54 
 
 		 309 aa  77.4  0.0000000000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03027  hypothetical protein  26.54 
 
 		 309 aa  77.4  0.0000000000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.828625  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0468  radical SAM family protein  29.63 
 
 		 307 aa  77.4  0.0000000000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3699  radical SAM family protein  26.54 
 
 		 309 aa  77.4  0.0000000000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3559  radical SAM protein, TIGR01212 family  27.98 
 
 		 309 aa  77  0.0000000000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1127  radical SAM family protein  29.63 
 
 		 327 aa  77  0.0000000000005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3134  hypothetical protein  27 
 
 		 309 aa  77  0.0000000000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000932261  normal  0.614838 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0531  putative radical SAM protein  28.33 
 
 		 329 aa  77  0.0000000000005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.233315  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0489  putative radical SAM protein  26.54 
 
 		 320 aa  77  0.0000000000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.577174 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2183  putative radical SAM protein  34.58 
 
 		 351 aa  77  0.0000000000005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0612  ELP3 family histone acetyltransferase  33.33 
 
 		 459 aa  76.6  0.0000000000006  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.125099  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0347  putative radical SAM protein  25.24 
 
 		 293 aa  76.6  0.0000000000006  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0038  conserved hypothetical radical SAM protein  29.22 
 
 		 318 aa  76.6  0.0000000000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1223  putative radical SAM protein  26.5 
 
 		 309 aa  76.6  0.0000000000007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.784754  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1137  putative radical SAM protein  26.5 
 
 		 309 aa  76.6  0.0000000000007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00496914  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_551  radical SAM superfamily  33.33 
 
 		 459 aa  76.3  0.0000000000007  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0398241  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1460  histone acetyltransferase, ELP3 family  23.99 
 
 		 473 aa  76.3  0.0000000000008  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1014  putative radical SAM protein  28.21 
 
 		 309 aa  76.3  0.0000000000008  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.531424  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0175  hypothetical protein  34.43 
 
 		 317 aa  76.3  0.0000000000009  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.46847  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3520  radical SAM protein, TIGR01212 family  27.46 
 
 		 309 aa  75.9  0.000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1950  hypothetical protein  26.98 
 
 		 316 aa  75.9  0.000000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3689  hypothetical protein  27.46 
 
 		 309 aa  75.9  0.000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>