143 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nther_2726 on replicon NC_010718
Organism: Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010718  Nther_2726  Radical SAM domain protein  100 
 
 
399 aa  820    Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1744  radical SAM domain-containing protein  36.48 
 
 
380 aa  286  4e-76  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00743194  decreased coverage  0.000183859 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3023  radical SAM domain-containing protein  35.29 
 
 
386 aa  269  5e-71  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2870  Radical SAM domain protein  38.24 
 
 
373 aa  266  5.999999999999999e-70  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.578576 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1410  Radical SAM domain protein  37.4 
 
 
377 aa  256  7e-67  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2999  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase putative  34.38 
 
 
388 aa  241  1e-62  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0443  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase, putative  31.04 
 
 
291 aa  169  8e-41  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2529  radical SAM domain-containing protein  30.63 
 
 
296 aa  166  5e-40  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.496911  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3790  Radical SAM domain protein  31.55 
 
 
338 aa  156  6e-37  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.135303  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2142  Radical SAM domain protein  30.03 
 
 
291 aa  154  2e-36  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.608518  decreased coverage  0.00173745 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1151  Radical SAM domain protein  28.83 
 
 
291 aa  151  2e-35  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.388903 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2654  Radical SAM domain protein  29.97 
 
 
291 aa  149  6e-35  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000344406  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3059  radical SAM domain-containing protein  29.36 
 
 
293 aa  147  2.0000000000000003e-34  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0201  radical SAM domain-containing protein  29.69 
 
 
293 aa  145  1e-33  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3076  radical SAM family protein  29.79 
 
 
292 aa  144  2e-33  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0110421  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2989  radical SAM domain-containing protein  31.38 
 
 
293 aa  145  2e-33  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000144866  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0365  radical SAM domain-containing protein  30.75 
 
 
289 aa  142  9.999999999999999e-33  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00570597  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0717  radical SAM domain-containing protein  29.72 
 
 
292 aa  141  1.9999999999999998e-32  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0919  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase, Fe-S oxidoreductase  28.62 
 
 
292 aa  140  4.999999999999999e-32  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0657  Radical SAM domain protein  29.49 
 
 
292 aa  140  4.999999999999999e-32  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4516  radical SAM domain-containing protein  29.14 
 
 
293 aa  140  4.999999999999999e-32  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.193684 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3668  radical SAM domain-containing protein  29.06 
 
 
293 aa  139  7e-32  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000789266  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3100  Radical SAM domain protein  28.05 
 
 
295 aa  138  2e-31  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.358776  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0423  radical SAM family protein  30.03 
 
 
293 aa  137  3.0000000000000003e-31  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1475  radical SAM domain-containing protein  28.62 
 
 
298 aa  136  8e-31  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0640288  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1162  Radical SAM domain protein  27.64 
 
 
295 aa  135  1.9999999999999998e-30  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0199468 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0456  radical SAM domain-containing protein  27.12 
 
 
309 aa  133  3.9999999999999996e-30  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2205  hypothetical protein  29.41 
 
 
298 aa  132  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.42445  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1640  radical SAM domain-containing protein  29.24 
 
 
297 aa  130  3e-29  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.387627  normal  0.955096 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02260  Fe-S oxidoreductase  25 
 
 
293 aa  130  3e-29  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0453  radical SAM domain-containing protein  28.57 
 
 
294 aa  131  3e-29  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0530  radical SAM domain-containing protein  28.45 
 
 
295 aa  130  4.0000000000000003e-29  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3501  radical SAM domain-containing protein  28.45 
 
 
295 aa  130  4.0000000000000003e-29  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1884  radical SAM family protein  30.58 
 
 
296 aa  129  1.0000000000000001e-28  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.295187  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0486  radical SAM domain-containing protein  28.12 
 
 
295 aa  128  1.0000000000000001e-28  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3617  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase, Fe-S oxidoreductase  27.03 
 
 
293 aa  128  2.0000000000000002e-28  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2265  Radical SAM domain protein  28.57 
 
 
293 aa  127  3e-28  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0528  hypothetical protein  27.57 
 
 
295 aa  127  4.0000000000000003e-28  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25810  hypothetical protein  28.48 
 
 
298 aa  127  5e-28  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.723648  normal  0.254703 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3965  radical SAM domain-containing protein  27.99 
 
 
295 aa  126  5e-28  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0173  radical SAM domain-containing protein  28.17 
 
 
292 aa  125  1e-27  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000741532  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_13790  Fe-S oxidoreductase  25.48 
 
 
297 aa  124  4e-27  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2963  radical SAM domain-containing protein  26.61 
 
 
293 aa  122  9.999999999999999e-27  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.854509 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0407  hypothetical protein  28.26 
 
 
294 aa  120  6e-26  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1360  radical SAM domain-containing protein  28.82 
 
 
300 aa  118  1.9999999999999998e-25  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.397431  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3411  Elongator protein 3/MiaB/NifB  32 
 
 
257 aa  117  3e-25  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3395  radical SAM domain-containing protein  26.27 
 
 
292 aa  115  2.0000000000000002e-24  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00495336  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3046  radical SAM family protein  26.5 
 
 
293 aa  110  4.0000000000000004e-23  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25530  Fe-S oxidoreductase  26.02 
 
 
308 aa  107  3e-22  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.261112  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0066  Radical SAM domain protein  22.6 
 
 
293 aa  99.4  9e-20  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.628263  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26860  Fe-S oxidoreductase  23.26 
 
 
291 aa  96.7  6e-19  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04170  Fe-S oxidoreductase  26.26 
 
 
293 aa  93.6  5e-18  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.63469 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0622  radical SAM domain-containing protein  23.44 
 
 
311 aa  92.8  8e-18  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.044899  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2061  radical SAM domain-containing protein  22.68 
 
 
294 aa  92.4  1e-17  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.952171  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1372  radical SAM domain-containing protein  23.3 
 
 
402 aa  91.7  2e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.798772 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16730  Fe-S oxidoreductase  25 
 
 
332 aa  87.8  3e-16  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.359613 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1019  Radical SAM domain protein  22.97 
 
 
390 aa  86.3  8e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG1505  radical SAM domain-containing protein  28.64 
 
 
292 aa  85.9  0.000000000000001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00044584 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_24530  Fe-S oxidoreductase  23.94 
 
 
293 aa  82  0.00000000000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25380  Fe-S oxidoreductase  21.16 
 
 
300 aa  79  0.0000000000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.76381  normal  0.564969 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3579  radical SAM domain-containing protein  22.15 
 
 
409 aa  78.2  0.0000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.630491  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00660  Fe-S oxidoreductase  21.64 
 
 
321 aa  75.5  0.000000000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2640  putative oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  19.4 
 
 
296 aa  70.5  0.00000000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0835  coproporphyrinogen III oxidase  28.98 
 
 
410 aa  64.3  0.000000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1713  radical SAM domain-containing protein  27.33 
 
 
317 aa  59.3  0.0000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3151  radical SAM domain-containing protein  29.46 
 
 
351 aa  55.8  0.000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0207208  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0367  radical SAM family protein  21.56 
 
 
305 aa  55.5  0.000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0395363  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2963  radical SAM domain-containing protein  28.44 
 
 
476 aa  55.1  0.000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.0000286011  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1165  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  27.33 
 
 
415 aa  54.3  0.000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.77099  normal  0.634386 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3382  hopanoid biosynthesis associated radical SAM protein HpnJ  30.63 
 
 
473 aa  54.3  0.000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0878  hopanoid biosynthesis associated radical SAM protein HpnJ  29.91 
 
 
473 aa  53.9  0.000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.858521  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1150  oxidative cyclase-related protein  28.44 
 
 
475 aa  52.8  0.00001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2416  radical SAM family protein  28.44 
 
 
475 aa  52.4  0.00001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000000137144  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1640  radical SAM domain-containing protein  26 
 
 
317 aa  52.4  0.00002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7063  coproporphyrinogen III oxidase  22.77 
 
 
408 aa  52  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.405832  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3838  radical SAM domain-containing protein  30.09 
 
 
156 aa  51.2  0.00003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1148  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  23.76 
 
 
403 aa  50.1  0.00006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.61254 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3090  hopanoid biosynthesis associated radical SAM protein HpnJ  27.52 
 
 
476 aa  50.1  0.00007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000038537  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2010  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  26.49 
 
 
371 aa  49.7  0.00008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2960  Fe-S oxidoreductase  22.11 
 
 
306 aa  49.3  0.0001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.392137  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0697  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  23.03 
 
 
410 aa  49.3  0.0001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.504316 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3058  radical SAM domain-containing protein  28.45 
 
 
529 aa  48.9  0.0001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.111955  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1160  Radical SAM domain protein  27.5 
 
 
341 aa  48.9  0.0002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.276403  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0889  ELP3 family histone acetyltransferase  18.66 
 
 
541 aa  48.9  0.0002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1177  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  26.55 
 
 
372 aa  48.5  0.0002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3355  hypothetical protein  24.61 
 
 
317 aa  47.8  0.0003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.378299  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2316  radical SAM family protein  23.84 
 
 
346 aa  47.8  0.0003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0781  coproporphyrinogen III oxidase, anaerobic  23.64 
 
 
400 aa  47.8  0.0003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.41975  normal  0.123732 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2393  radical SAM domain-containing protein  23.4 
 
 
490 aa  48.1  0.0003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.386797  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0038  conserved hypothetical radical SAM protein  20.13 
 
 
318 aa  48.1  0.0003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2929  radical SAM domain-containing protein  26.95 
 
 
497 aa  47.4  0.0004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.43282  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1093  ELP3 family histone acetyltransferase  23.42 
 
 
541 aa  47  0.0006  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.108771  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0110  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase, putative  24.26 
 
 
393 aa  46.6  0.0007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000543862  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2825  radical SAM domain-containing protein  25.69 
 
 
476 aa  46.6  0.0007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000393045  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17330  coproporphyrinogen III oxidase, anaerobic  21.89 
 
 
389 aa  45.8  0.001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.395345  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4964  radical SAM family protein  29.25 
 
 
476 aa  45.8  0.001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.576294  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1565  putative radical SAM protein  26.4 
 
 
300 aa  46.2  0.001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.705687  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1001  putative oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  23.73 
 
 
424 aa  46.2  0.001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3790  hypothetical protein  26.77 
 
 
314 aa  46.2  0.001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0994894  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1038  hopanoid biosynthesis associated radical SAM protein HpnJ  26.32 
 
 
479 aa  45.8  0.001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000337224 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>