More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MmarC6_1093 on replicon NC_009975
Organism: Methanococcus maripaludis C6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009635  Maeo_0279  ELP3 family histone acetyltransferase  71.19 
 
 
563 aa  825    Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1093  ELP3 family histone acetyltransferase  100 
 
 
541 aa  1111    Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.108771  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0889  ELP3 family histone acetyltransferase  79.48 
 
 
541 aa  911    Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1832  ELP3 family histone acetyltransferase  96.12 
 
 
541 aa  1069    Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0824  ELP3 family histone acetyltransferase  95.75 
 
 
541 aa  1070    Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.318054  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1085  histone acetyltransferase, ELP3 family  50.98 
 
 
514 aa  527  1e-148  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.707697  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1755  ELP3 family histone acetyltransferase  47.4 
 
 
547 aa  507  9.999999999999999e-143  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.668163  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1989  ELP3 family histone acetyltransferase  50 
 
 
548 aa  506  9.999999999999999e-143  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2046  ELP3 family histone acetyltransferase  44.34 
 
 
530 aa  480  1e-134  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1460  histone acetyltransferase, ELP3 family  49.68 
 
 
473 aa  460  9.999999999999999e-129  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2930  histone acetyltransferase, ELP3 family  45.9 
 
 
554 aa  458  1e-127  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.281817  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0872  histone acetyltransferase, ELP3 family  44.42 
 
 
556 aa  452  1.0000000000000001e-126  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2192  histone acetyltransferase, ELP3 family  45.03 
 
 
576 aa  454  1.0000000000000001e-126  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0898  ELP3 family histone acetyltransferase  45.49 
 
 
512 aa  452  1.0000000000000001e-126  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.589047  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2706  histone acetyltransferase, ELP3 family  44.03 
 
 
553 aa  447  1.0000000000000001e-124  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0579  ELP3 family histone acetyltransferase  43.64 
 
 
527 aa  441  9.999999999999999e-123  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0952  histone acetyltransferase, ELP3 family  44.04 
 
 
526 aa  440  9.999999999999999e-123  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1480  histone acetyltransferase, ELP3 family  43.51 
 
 
585 aa  436  1e-121  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.761791  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1956  ELP3 family histone acetyltransferase  45.44 
 
 
526 aa  432  1e-120  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.724461 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1133  ELP3 family histone acetyltransferase  44.99 
 
 
522 aa  430  1e-119  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1304  hypothetical protein  44.92 
 
 
520 aa  431  1e-119  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1318  ELP3 family histone acetyltransferase  45.38 
 
 
510 aa  428  1e-118  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.340377 
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_50848  predicted protein  42.66 
 
 
544 aa  428  1e-118  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.104715  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_42410  predicted protein  41.28 
 
 
558 aa  423  1e-117  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_27329  predicted protein  40.78 
 
 
555 aa  424  1e-117  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.072078  hitchhiker  0.00552121 
 
 
-
 
NC_002936  DET0612  ELP3 family histone acetyltransferase  47.97 
 
 
459 aa  421  1e-116  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.125099  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0586  ELP3 family histone acetyltransferase  47.97 
 
 
459 aa  417  9.999999999999999e-116  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0000912711  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_551  radical SAM superfamily  46.91 
 
 
459 aa  409  1e-113  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0398241  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02294  histone acetyltransferase, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G06140)  39.93 
 
 
574 aa  405  1e-111  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0088  radical SAM domain-containing protein  43.64 
 
 
477 aa  393  1e-108  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0202426 
 
 
-
 
NC_006680  CNK00950  Pol II transcription elongation factor, putative  40.04 
 
 
557 aa  391  1e-107  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.110026  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1167  radical SAM domain-containing protein  43.01 
 
 
469 aa  390  1e-107  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.413437  normal  0.627812 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0122  radical SAM domain-containing protein  42.43 
 
 
483 aa  379  1e-104  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11040  histone acetyltransferase  34.47 
 
 
666 aa  191  2e-47  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.142131  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0906  Histone acetyltransferase  32.89 
 
 
617 aa  181  4e-44  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.301086  normal  0.526584 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08040  histone acetyltransferase  30.05 
 
 
598 aa  176  9.999999999999999e-43  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.584733  hitchhiker  0.0000000843356 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1404  radical SAM protein, putative histone acetyltransferase  33.33 
 
 
345 aa  111  3e-23  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.00000266579  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1971  radical SAM domain-containing protein  30.27 
 
 
357 aa  105  2e-21  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.144867  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1689  radical SAM domain-containing protein  30.59 
 
 
357 aa  105  2e-21  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0776794  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1160  Radical SAM domain protein  35.12 
 
 
341 aa  105  2e-21  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.276403  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3151  radical SAM domain-containing protein  27.67 
 
 
351 aa  97.4  5e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0207208  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0515  Elongator protein 3/MiaB/NifB  28.57 
 
 
309 aa  95.9  2e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.84475  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0660  Radical SAM domain protein  29.72 
 
 
359 aa  95.5  2e-18  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.142353  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1713  radical SAM domain-containing protein  32 
 
 
317 aa  94.7  4e-18  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1562  Radical SAM domain protein  27.05 
 
 
401 aa  94  6e-18  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2227  radical SAM domain-containing protein  28.06 
 
 
342 aa  93.6  8e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.775407  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2316  radical SAM family protein  28.63 
 
 
346 aa  93.2  1e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0774  ELP3 component of the RNA polymerase II complex  29.19 
 
 
362 aa  91.7  3e-17  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00000160735  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0930  radical SAM family protein  31.52 
 
 
338 aa  91.7  3e-17  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000118017  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2238  Radical SAM domain protein  25.1 
 
 
354 aa  90.9  5e-17  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0182  Radical SAM domain protein  28.64 
 
 
401 aa  90.1  9e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.534223  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1501  radical SAM domain-containing protein  27.91 
 
 
341 aa  89.7  1e-16  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.166226  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0688  Radical SAM domain protein  29.95 
 
 
336 aa  89.7  1e-16  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2966  Radical SAM domain protein  28.95 
 
 
344 aa  87  8e-16  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0294152  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0261  Radical SAM domain protein  31.55 
 
 
564 aa  86.3  0.000000000000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1061  Radical SAM domain protein  27.35 
 
 
343 aa  86.7  0.000000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.8315700000000001e-19 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3202  Radical SAM domain protein  26.94 
 
 
342 aa  86.3  0.000000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00235958  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1640  radical SAM domain-containing protein  30.29 
 
 
317 aa  86.3  0.000000000000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1719  radical SAM domain-containing protein  30.66 
 
 
354 aa  85.1  0.000000000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.219309  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1777  radical SAM domain-containing protein  26.63 
 
 
352 aa  84.3  0.000000000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.112435  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0760  putative radical SAM protein  31.6 
 
 
304 aa  83.6  0.000000000000009  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.992819  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0787  radical SAM domain-containing protein  33.59 
 
 
317 aa  82.4  0.00000000000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1179  radical SAM domain-containing protein  30.99 
 
 
314 aa  81.6  0.00000000000003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0997  hypothetical protein  33.33 
 
 
368 aa  80.5  0.00000000000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.961706  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2540  radical SAM domain-containing protein  28.03 
 
 
340 aa  79.7  0.0000000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.093156 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0875  radical SAM domain-containing protein  27.07 
 
 
359 aa  79  0.0000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1944  Radical SAM domain protein  26.2 
 
 
374 aa  75.9  0.000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0450295  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1872  hypothetical protein  25.43 
 
 
319 aa  75.5  0.000000000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.22126  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2960  Fe-S oxidoreductase  31.01 
 
 
306 aa  74.7  0.000000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.392137  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3477  putative radical SAM protein  25.91 
 
 
313 aa  73.6  0.000000000008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.143192  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0804  putative radical SAM protein  30.38 
 
 
334 aa  73.6  0.000000000009  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.768446  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0038  conserved hypothetical radical SAM protein  26.56 
 
 
318 aa  72.8  0.00000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0175  hypothetical protein  28.4 
 
 
317 aa  73.6  0.00000000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.46847  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0586  radical SAM family protein  25 
 
 
319 aa  72.8  0.00000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2936  hypothetical protein  23.04 
 
 
319 aa  72.4  0.00000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.971153  hitchhiker  0.00000000000000717489 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2080  hypothetical protein  29.41 
 
 
316 aa  70.9  0.00000000005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0754  Radical SAM domain protein  29.81 
 
 
319 aa  69.3  0.0000000001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.00145958  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0569  coproporphyrinogen III oxidase  26.87 
 
 
397 aa  69.7  0.0000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1179  radical SAM family protein  28.48 
 
 
332 aa  69.3  0.0000000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.808864  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0739  radical SAM family protein  27.85 
 
 
332 aa  69.3  0.0000000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.974352  normal  0.805342 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0082  radical SAM family protein  28.48 
 
 
332 aa  69.3  0.0000000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2882  radical SAM family protein  28.92 
 
 
311 aa  68.2  0.0000000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2563  radical SAM family protein  28.92 
 
 
311 aa  68.2  0.0000000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1177  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  27.61 
 
 
372 aa  68.2  0.0000000004  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1293  putative radical SAM protein  28.12 
 
 
341 aa  68.2  0.0000000004  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3655  putative radical SAM protein  33.33 
 
 
328 aa  67.8  0.0000000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0760029 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3661  putative radical SAM protein  24.08 
 
 
319 aa  68.2  0.0000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2603  radical SAM superfamily protein  25.45 
 
 
313 aa  68.2  0.0000000004  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00929  Fe-S oxidoreductase  29.03 
 
 
314 aa  67.4  0.0000000006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2183  putative radical SAM protein  27.46 
 
 
351 aa  66.6  0.000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1127  radical SAM family protein  29.66 
 
 
327 aa  65.5  0.000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2063  coproporphyrinogen III oxidase  25.71 
 
 
384 aa  65.9  0.000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1170  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  27.61 
 
 
369 aa  65.9  0.000000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0347  putative radical SAM protein  31.9 
 
 
293 aa  65.9  0.000000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1033  putative radical SAM protein  29.68 
 
 
330 aa  65.9  0.000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.247016  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1326  hypothetical protein  31.5 
 
 
309 aa  65.5  0.000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3507  radical SAM family protein  27.59 
 
 
309 aa  64.7  0.000000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3559  radical SAM protein, TIGR01212 family  27.6 
 
 
309 aa  64.3  0.000000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2819  conserved hypothetical radical SAM protein  29.2 
 
 
372 aa  64.3  0.000000005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0489  putative radical SAM protein  27.59 
 
 
320 aa  64.3  0.000000006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.577174 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>