167 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shel_08040 on replicon NC_013165
Organism: Slackia heliotrinireducens DSM 20476



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013165  Shel_08040  histone acetyltransferase  100 
 
 		 598 aa  1253    Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.584733  hitchhiker  0.0000000843356 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0906  Histone acetyltransferase  53.76 
 
 		 617 aa  687    Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.301086  normal  0.526584 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11040  histone acetyltransferase  51 
 
 		 666 aa  632  1e-180  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.142131  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0088  radical SAM domain-containing protein  33.4 
 
 		 477 aa  294  3e-78  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0202426 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2046  ELP3 family histone acetyltransferase  31.93 
 
 		 530 aa  287  4e-76  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1956  ELP3 family histone acetyltransferase  32.39 
 
 		 526 aa  283  6.000000000000001e-75  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.724461 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1133  ELP3 family histone acetyltransferase  32.28 
 
 		 522 aa  274  3e-72  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0122  radical SAM domain-containing protein  31.65 
 
 		 483 aa  274  3e-72  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1755  ELP3 family histone acetyltransferase  31.41 
 
 		 547 aa  269  8.999999999999999e-71  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.668163  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1167  radical SAM domain-containing protein  32.03 
 
 		 469 aa  267  4e-70  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.413437  normal  0.627812 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1304  hypothetical protein  30.83 
 
 		 520 aa  265  3e-69  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0952  histone acetyltransferase, ELP3 family  31.49 
 
 		 526 aa  259  1e-67  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1480  histone acetyltransferase, ELP3 family  33.27 
 
 		 585 aa  258  2e-67  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.761791  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0872  histone acetyltransferase, ELP3 family  31.41 
 
 		 556 aa  251  3e-65  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1318  ELP3 family histone acetyltransferase  30.47 
 
 		 510 aa  250  5e-65  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.340377 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2706  histone acetyltransferase, ELP3 family  30.96 
 
 		 553 aa  249  1e-64  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1989  ELP3 family histone acetyltransferase  30.4 
 
 		 548 aa  246  6e-64  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2192  histone acetyltransferase, ELP3 family  31.4 
 
 		 576 aa  243  7e-63  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2930  histone acetyltransferase, ELP3 family  30.63 
 
 		 554 aa  238  2e-61  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.281817  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0612  ELP3 family histone acetyltransferase  31.91 
 
 		 459 aa  221  3.9999999999999997e-56  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.125099  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0579  ELP3 family histone acetyltransferase  34.69 
 
 		 527 aa  204  5e-51  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1085  histone acetyltransferase, ELP3 family  35.67 
 
 		 514 aa  203  7e-51  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.707697  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0898  ELP3 family histone acetyltransferase  34.72 
 
 		 512 aa  201  5e-50  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.589047  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1460  histone acetyltransferase, ELP3 family  33.24 
 
 		 473 aa  200  7e-50  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_551  radical SAM superfamily  29.64 
 
 		 459 aa  198  2.0000000000000003e-49  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0398241  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0586  ELP3 family histone acetyltransferase  37.15 
 
 		 459 aa  198  2.0000000000000003e-49  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0000912711  n/a   
 
 
-
 
NC_006680  CNK00950  Pol II transcription elongation factor, putative  27.27 
 
 		 557 aa  182  1e-44  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.110026  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0279  ELP3 family histone acetyltransferase  27.83 
 
 		 563 aa  182  2e-44  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_27329  predicted protein  29.02 
 
 		 555 aa  181  4e-44  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.072078  hitchhiker  0.00552121 
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_50848  predicted protein  27.02 
 
 		 544 aa  180  7e-44  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.104715  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1093  ELP3 family histone acetyltransferase  30.05 
 
 		 541 aa  176  9.999999999999999e-43  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.108771  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_42410  predicted protein  26.32 
 
 		 558 aa  169  1e-40  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1832  ELP3 family histone acetyltransferase  30.24 
 
 		 541 aa  169  1e-40  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0824  ELP3 family histone acetyltransferase  29.41 
 
 		 541 aa  169  1e-40  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.318054  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0889  ELP3 family histone acetyltransferase  30.26 
 
 		 541 aa  163  9e-39  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02294  histone acetyltransferase, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G06140)  26.55 
 
 		 574 aa  161  3e-38  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2227  radical SAM domain-containing protein  32.37 
 
 		 342 aa  93.6  9e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.775407  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1160  Radical SAM domain protein  31.16 
 
 		 341 aa  85.9  0.000000000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.276403  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0930  radical SAM family protein  30.92 
 
 		 338 aa  85.1  0.000000000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000118017  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0774  ELP3 component of the RNA polymerase II complex  29.08 
 
 		 362 aa  84.3  0.000000000000005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00000160735  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1179  radical SAM domain-containing protein  28.64 
 
 		 314 aa  80.9  0.00000000000006  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1061  Radical SAM domain protein  27.53 
 
 		 343 aa  80.9  0.00000000000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.8315700000000001e-19 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1719  radical SAM domain-containing protein  29.28 
 
 		 354 aa  75.5  0.000000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.219309  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0688  Radical SAM domain protein  30.98 
 
 		 336 aa  75.5  0.000000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1404  radical SAM protein, putative histone acetyltransferase  27.03 
 
 		 345 aa  75.1  0.000000000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.00000266579  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2966  Radical SAM domain protein  33.33 
 
 		 344 aa  73.9  0.000000000008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0294152  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3151  radical SAM domain-containing protein  28.65 
 
 		 351 aa  73.2  0.00000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0207208  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1713  radical SAM domain-containing protein  29.46 
 
 		 317 aa  72.8  0.00000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1689  radical SAM domain-containing protein  30.22 
 
 		 357 aa  71.2  0.00000000006  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0776794  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1971  radical SAM domain-containing protein  30.22 
 
 		 357 aa  70.9  0.00000000007  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.144867  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1640  radical SAM domain-containing protein  29.46 
 
 		 317 aa  70.5  0.00000000009  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3202  Radical SAM domain protein  26.55 
 
 		 342 aa  69.7  0.0000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00235958  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1501  radical SAM domain-containing protein  31.4 
 
 		 341 aa  69.7  0.0000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.166226  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1562  Radical SAM domain protein  26.83 
 
 		 401 aa  67.8  0.0000000006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0515  Elongator protein 3/MiaB/NifB  27.78 
 
 		 309 aa  66.2  0.000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.84475  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1872  hypothetical protein  25.31 
 
 		 319 aa  63.9  0.000000009  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.22126  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0787  radical SAM domain-containing protein  22.78 
 
 		 317 aa  63.2  0.00000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0660  Radical SAM domain protein  27.37 
 
 		 359 aa  63.5  0.00000001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.142353  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0182  Radical SAM domain protein  25.93 
 
 		 401 aa  63.2  0.00000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.534223  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1944  Radical SAM domain protein  29.05 
 
 		 374 aa  60.8  0.00000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0450295  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2316  radical SAM family protein  25.14 
 
 		 346 aa  60.5  0.0000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2238  Radical SAM domain protein  26 
 
 		 354 aa  59.3  0.0000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0038  conserved hypothetical radical SAM protein  29.28 
 
 		 318 aa  59.3  0.0000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0875  radical SAM domain-containing protein  28.91 
 
 		 359 aa  58.2  0.0000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2187  hypothetical protein  27.65 
 
 		 316 aa  56.6  0.000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000345504 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1173  coproporphyrinogen III oxidase  27.98 
 
 		 445 aa  56.2  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.75222  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0175  hypothetical protein  28.57 
 
 		 317 aa  56.2  0.000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.46847  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2540  radical SAM domain-containing protein  26.19 
 
 		 340 aa  56.2  0.000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.093156 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3508  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  30.16 
 
 		 381 aa  55.5  0.000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.230764  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0347  putative radical SAM protein  25.44 
 
 		 293 aa  55.1  0.000004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2882  radical SAM family protein  28.65 
 
 		 311 aa  54.7  0.000005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2563  radical SAM family protein  28.65 
 
 		 311 aa  54.7  0.000005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3018  putative oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  30.15 
 
 		 393 aa  54.3  0.000006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0582  coproporphyrinogen III oxidase, anaerobic  31.48 
 
 		 388 aa  54.3  0.000007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2936  hypothetical protein  27.1 
 
 		 319 aa  53.1  0.00001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.971153  hitchhiker  0.00000000000000717489 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1360  putative oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  27.56 
 
 		 371 aa  52.8  0.00002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.716239  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3477  putative radical SAM protein  27.21 
 
 		 313 aa  52.8  0.00002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.143192  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0697  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  28.24 
 
 		 410 aa  52.8  0.00002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.504316 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1777  radical SAM domain-containing protein  27.84 
 
 		 352 aa  52.4  0.00003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.112435  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3236  Coproporphyrinogen dehydrogenase  29.71 
 
 		 486 aa  52  0.00003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0363144  normal  0.0797924 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0664  hypothetical protein  25.58 
 
 		 318 aa  52  0.00003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.08613e-26 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0835  coproporphyrinogen III oxidase  27.48 
 
 		 410 aa  51.6  0.00004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3790  hypothetical protein  26.47 
 
 		 314 aa  51.6  0.00004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0994894  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4306  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  28.44 
 
 		 375 aa  51.6  0.00004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0329595  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3535  coproporphyrinogen III oxidase, anaerobic  28.95 
 
 		 383 aa  50.8  0.00006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000160096  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3661  putative radical SAM protein  26.45 
 
 		 319 aa  51.2  0.00006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1179  radical SAM family protein  25.62 
 
 		 332 aa  50.8  0.00006  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.808864  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2239  coproporphyrinogen III oxidase  25.42 
 
 		 409 aa  50.4  0.00008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.167009  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3577  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  28.07 
 
 		 381 aa  50.4  0.00008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0739  coproporphyrinogen III oxidase  27.97 
 
 		 447 aa  50.1  0.0001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0545  Coproporphyrinogen dehydrogenase  28.81 
 
 		 404 aa  49.7  0.0001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.693751  normal  0.412237 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1109  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  28.79 
 
 		 377 aa  50.1  0.0001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.298913  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1363  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  27.59 
 
 		 389 aa  50.1  0.0001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1976  coproporphyrinogen III oxidase  25.42 
 
 		 409 aa  50.1  0.0001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000234846 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1950  hypothetical protein  23.21 
 
 		 316 aa  50.1  0.0001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3632  hypothetical protein  24.89 
 
 		 317 aa  50.1  0.0001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.197622  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2183  putative radical SAM protein  24.47 
 
 		 351 aa  49.3  0.0002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1341  coproporphyrinogen III oxidase  36.49 
 
 		 505 aa  48.9  0.0002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.996503  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1293  putative radical SAM protein  22.99 
 
 		 341 aa  49.7  0.0002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3838  putative oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  28.79 
 
 		 407 aa  48.5  0.0003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.584028  hitchhiker  0.00877773 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>