195 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hlac_1480 on replicon NC_012029
Organism: Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012029  Hlac_1480  histone acetyltransferase, ELP3 family  100 
 
 
585 aa  1205    Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.761791  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2706  histone acetyltransferase, ELP3 family  73.56 
 
 
553 aa  842    Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0872  histone acetyltransferase, ELP3 family  75.31 
 
 
556 aa  868    Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2192  histone acetyltransferase, ELP3 family  73.19 
 
 
576 aa  847    Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2930  histone acetyltransferase, ELP3 family  71.6 
 
 
554 aa  811    Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.281817  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1755  ELP3 family histone acetyltransferase  52.23 
 
 
547 aa  561  1e-158  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.668163  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1989  ELP3 family histone acetyltransferase  49.65 
 
 
548 aa  545  1e-153  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0898  ELP3 family histone acetyltransferase  48.17 
 
 
512 aa  493  9.999999999999999e-139  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.589047  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2046  ELP3 family histone acetyltransferase  49.53 
 
 
530 aa  482  1e-135  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1133  ELP3 family histone acetyltransferase  46.74 
 
 
522 aa  463  1e-129  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1085  histone acetyltransferase, ELP3 family  45.2 
 
 
514 aa  461  9.999999999999999e-129  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.707697  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1956  ELP3 family histone acetyltransferase  46.45 
 
 
526 aa  453  1.0000000000000001e-126  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.724461 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1304  hypothetical protein  45.93 
 
 
520 aa  451  1e-125  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0952  histone acetyltransferase, ELP3 family  46.98 
 
 
526 aa  442  1e-123  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0824  ELP3 family histone acetyltransferase  43.89 
 
 
541 aa  442  9.999999999999999e-123  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.318054  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1093  ELP3 family histone acetyltransferase  43.51 
 
 
541 aa  436  1e-121  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.108771  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1832  ELP3 family histone acetyltransferase  42.57 
 
 
541 aa  437  1e-121  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0279  ELP3 family histone acetyltransferase  43.05 
 
 
563 aa  426  1e-118  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0889  ELP3 family histone acetyltransferase  42.75 
 
 
541 aa  422  1e-117  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1460  histone acetyltransferase, ELP3 family  44.71 
 
 
473 aa  410  1e-113  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_50848  predicted protein  40.04 
 
 
544 aa  408  1.0000000000000001e-112  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.104715  n/a   
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_27329  predicted protein  40.68 
 
 
555 aa  401  9.999999999999999e-111  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.072078  hitchhiker  0.00552121 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0579  ELP3 family histone acetyltransferase  38.06 
 
 
527 aa  400  9.999999999999999e-111  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_42410  predicted protein  38.41 
 
 
558 aa  396  1e-109  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02294  histone acetyltransferase, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G06140)  38.1 
 
 
574 aa  372  1e-101  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006680  CNK00950  Pol II transcription elongation factor, putative  39.49 
 
 
557 aa  366  1e-100  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.110026  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1318  ELP3 family histone acetyltransferase  39.1 
 
 
510 aa  350  3e-95  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.340377 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0088  radical SAM domain-containing protein  39.84 
 
 
477 aa  337  5e-91  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0202426 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0122  radical SAM domain-containing protein  39.39 
 
 
483 aa  335  1e-90  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1167  radical SAM domain-containing protein  39.55 
 
 
469 aa  328  2.0000000000000001e-88  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.413437  normal  0.627812 
 
 
-
 
NC_002936  DET0612  ELP3 family histone acetyltransferase  40.52 
 
 
459 aa  324  4e-87  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.125099  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0586  ELP3 family histone acetyltransferase  40.73 
 
 
459 aa  322  1.9999999999999998e-86  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0000912711  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_551  radical SAM superfamily  40.32 
 
 
459 aa  318  1e-85  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0398241  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11040  histone acetyltransferase  33.15 
 
 
666 aa  270  7e-71  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.142131  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0906  Histone acetyltransferase  30.5 
 
 
617 aa  267  4e-70  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.301086  normal  0.526584 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08040  histone acetyltransferase  33.27 
 
 
598 aa  258  1e-67  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.584733  hitchhiker  0.0000000843356 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1404  radical SAM protein, putative histone acetyltransferase  36.84 
 
 
345 aa  111  5e-23  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.00000266579  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2227  radical SAM domain-containing protein  29.95 
 
 
342 aa  95.5  3e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.775407  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3151  radical SAM domain-containing protein  31.93 
 
 
351 aa  95.1  3e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0207208  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0688  Radical SAM domain protein  26.77 
 
 
336 aa  91.7  4e-17  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2316  radical SAM family protein  28.97 
 
 
346 aa  87.4  6e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2603  radical SAM superfamily protein  29.76 
 
 
313 aa  86.7  0.000000000000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0930  radical SAM family protein  27.35 
 
 
338 aa  85.9  0.000000000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000118017  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1611  radical SAM superfamily protein  29.83 
 
 
314 aa  82.8  0.00000000000001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.586759  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1719  radical SAM domain-containing protein  26.09 
 
 
354 aa  80.1  0.0000000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.219309  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1944  Radical SAM domain protein  30.52 
 
 
374 aa  79.3  0.0000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0450295  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0875  radical SAM domain-containing protein  33.09 
 
 
359 aa  79.3  0.0000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1160  Radical SAM domain protein  29.73 
 
 
341 aa  79.3  0.0000000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.276403  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1401  hypothetical protein  27.62 
 
 
311 aa  79  0.0000000000003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1501  radical SAM domain-containing protein  33.58 
 
 
341 aa  78.6  0.0000000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.166226  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3202  Radical SAM domain protein  26.9 
 
 
342 aa  77  0.0000000000008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00235958  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1061  Radical SAM domain protein  26.32 
 
 
343 aa  76.3  0.000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.8315700000000001e-19 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0182  Radical SAM domain protein  28.32 
 
 
401 aa  74.7  0.000000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.534223  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1179  radical SAM domain-containing protein  24.46 
 
 
314 aa  73.9  0.000000000007  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1640  radical SAM domain-containing protein  25.25 
 
 
317 aa  73.9  0.000000000008  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0774  ELP3 component of the RNA polymerase II complex  29.46 
 
 
362 aa  72.4  0.00000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00000160735  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2238  Radical SAM domain protein  23.89 
 
 
354 aa  72.4  0.00000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1713  radical SAM domain-containing protein  25.25 
 
 
317 aa  72  0.00000000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1777  radical SAM domain-containing protein  26.58 
 
 
352 aa  71.2  0.00000000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.112435  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0515  Elongator protein 3/MiaB/NifB  27.32 
 
 
309 aa  70.1  0.0000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.84475  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1689  radical SAM domain-containing protein  29.01 
 
 
357 aa  69.3  0.0000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0776794  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1562  Radical SAM domain protein  30.43 
 
 
401 aa  68.9  0.0000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0376  hypothetical protein TIGR01212  25.77 
 
 
319 aa  69.3  0.0000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4861  conserved hypothetical protein TIGR01212  25.77 
 
 
319 aa  68.2  0.0000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4579  putative radical SAM protein  25.77 
 
 
319 aa  68.2  0.0000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4646  hypothetical protein  27.18 
 
 
319 aa  67.8  0.0000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5001  hypothetical protein  27.18 
 
 
319 aa  67.8  0.0000000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1971  radical SAM domain-containing protein  29.01 
 
 
357 aa  68.2  0.0000000005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.144867  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4871  conserved hypothetical protein TIGR01212  27.18 
 
 
319 aa  67.4  0.0000000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4481  Fe-S oxidoreductase  27.18 
 
 
319 aa  67.4  0.0000000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0165  hypothetical protein  25.97 
 
 
347 aa  67.4  0.0000000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.375388  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4885  conserved hypothetical protein TIGR01212  27.18 
 
 
319 aa  67.4  0.0000000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4499  Fe-S oxidoreductase  26.67 
 
 
319 aa  66.6  0.000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2960  Fe-S oxidoreductase  25.75 
 
 
306 aa  66.6  0.000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.392137  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1033  putative radical SAM protein  29.22 
 
 
330 aa  65.5  0.000000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.247016  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0660  Radical SAM domain protein  23.26 
 
 
359 aa  65.1  0.000000003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.142353  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2819  conserved hypothetical radical SAM protein  26.74 
 
 
372 aa  64.7  0.000000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2882  radical SAM family protein  25.13 
 
 
311 aa  64.7  0.000000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2563  radical SAM family protein  25.13 
 
 
311 aa  64.7  0.000000004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4892  hypothetical protein  24.23 
 
 
319 aa  63.2  0.00000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2022  hypothetical protein  26.88 
 
 
338 aa  63.2  0.00000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1320  hypothetical protein  22.68 
 
 
317 aa  62.8  0.00000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2966  Radical SAM domain protein  28.35 
 
 
344 aa  62.4  0.00000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0294152  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3477  putative radical SAM protein  25.15 
 
 
313 aa  62.8  0.00000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.143192  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2540  radical SAM domain-containing protein  30.97 
 
 
340 aa  62.4  0.00000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.093156 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0739  radical SAM family protein  25.61 
 
 
332 aa  62.8  0.00000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.974352  normal  0.805342 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3422  putative radical SAM protein  24.23 
 
 
319 aa  62.8  0.00000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2952  putative radical SAM protein  29.11 
 
 
309 aa  61.6  0.00000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.432245  normal  0.157754 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1179  radical SAM family protein  25 
 
 
332 aa  62  0.00000003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.808864  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0082  radical SAM family protein  23.68 
 
 
332 aa  62  0.00000003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2187  hypothetical protein  24.48 
 
 
316 aa  61.6  0.00000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  unclonable  0.000000345504 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1872  hypothetical protein  23.35 
 
 
319 aa  61.2  0.00000005  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.22126  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0408  putative radical SAM protein  21.59 
 
 
313 aa  61.2  0.00000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2080  hypothetical protein  22.94 
 
 
316 aa  61.2  0.00000005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3048  putative radical SAM protein  29.11 
 
 
309 aa  60.8  0.00000006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0315161  normal  0.32107 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2769  hypothetical protein  24.12 
 
 
320 aa  60.8  0.00000007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0254774  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2936  hypothetical protein  23.56 
 
 
319 aa  60.1  0.0000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.971153  hitchhiker  0.00000000000000717489 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2183  putative radical SAM protein  24.6 
 
 
351 aa  60.1  0.0000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1335  hypothetical protein  26.39 
 
 
328 aa  60.1  0.0000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0087579  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4343  putative radical SAM protein  23.39 
 
 
312 aa  59.7  0.0000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.122173 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>