More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_0875 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008554  Sfum_0875  radical SAM domain-containing protein  100 
 
 		 359 aa  720    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0774  ELP3 component of the RNA polymerase II complex  40.12 
 
 		 362 aa  238  2e-61  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00000160735  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1061  Radical SAM domain protein  40.52 
 
 		 343 aa  236  4e-61  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.8315700000000001e-19 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0930  radical SAM family protein  38.41 
 
 		 338 aa  236  5.0000000000000005e-61  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000118017  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1501  radical SAM domain-containing protein  40.3 
 
 		 341 aa  233  3e-60  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.166226  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1719  radical SAM domain-containing protein  36.12 
 
 		 354 aa  230  3e-59  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.219309  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3151  radical SAM domain-containing protein  41.92 
 
 		 351 aa  230  3e-59  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0207208  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3202  Radical SAM domain protein  39.94 
 
 		 342 aa  224  2e-57  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00235958  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1944  Radical SAM domain protein  39.05 
 
 		 374 aa  219  3.9999999999999997e-56  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0450295  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2316  radical SAM family protein  41.9 
 
 		 346 aa  216  5.9999999999999996e-55  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0688  Radical SAM domain protein  34.12 
 
 		 336 aa  207  3e-52  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1160  Radical SAM domain protein  35.33 
 
 		 341 aa  206  7e-52  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.276403  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1404  radical SAM protein, putative histone acetyltransferase  39.44 
 
 		 345 aa  204  2e-51  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.00000266579  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1689  radical SAM domain-containing protein  35.45 
 
 		 357 aa  202  6e-51  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0776794  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1971  radical SAM domain-containing protein  35.76 
 
 		 357 aa  201  1.9999999999999998e-50  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.144867  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1777  radical SAM domain-containing protein  37.42 
 
 		 352 aa  196  6e-49  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.112435  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2238  Radical SAM domain protein  37.43 
 
 		 354 aa  195  1e-48  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0660  Radical SAM domain protein  31.98 
 
 		 359 aa  188  1e-46  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.142353  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1179  radical SAM domain-containing protein  36.4 
 
 		 314 aa  182  5.0000000000000004e-45  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2227  radical SAM domain-containing protein  41.33 
 
 		 342 aa  182  9.000000000000001e-45  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.775407  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2966  Radical SAM domain protein  40 
 
 		 344 aa  170  3e-41  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0294152  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0787  radical SAM domain-containing protein  35.19 
 
 		 317 aa  167  2e-40  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0182  Radical SAM domain protein  37.99 
 
 		 401 aa  168  2e-40  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.534223  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1640  radical SAM domain-containing protein  36.88 
 
 		 317 aa  166  5e-40  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1713  radical SAM domain-containing protein  38.2 
 
 		 317 aa  164  3e-39  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1562  Radical SAM domain protein  37.91 
 
 		 401 aa  161  2e-38  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0515  Elongator protein 3/MiaB/NifB  41.07 
 
 		 309 aa  148  1.0000000000000001e-34  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.84475  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2540  radical SAM domain-containing protein  38.04 
 
 		 340 aa  134  3e-30  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.093156 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1085  histone acetyltransferase, ELP3 family  27.42 
 
 		 514 aa  90.1  5e-17  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.707697  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1755  ELP3 family histone acetyltransferase  37.04 
 
 		 547 aa  89  1e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.668163  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1358  putative radical SAM protein  25.21 
 
 		 318 aa  86.3  8e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.161503  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1989  ELP3 family histone acetyltransferase  34.75 
 
 		 548 aa  85.9  9e-16  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2706  histone acetyltransferase, ELP3 family  32.09 
 
 		 553 aa  85.5  0.000000000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0872  histone acetyltransferase, ELP3 family  26.18 
 
 		 556 aa  85.5  0.000000000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0088  radical SAM domain-containing protein  28.29 
 
 		 477 aa  85.9  0.000000000000001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0202426 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0279  ELP3 family histone acetyltransferase  27.23 
 
 		 563 aa  85.1  0.000000000000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0898  ELP3 family histone acetyltransferase  29.17 
 
 		 512 aa  84.7  0.000000000000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.589047  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0122  radical SAM domain-containing protein  27.91 
 
 		 483 aa  83.6  0.000000000000005  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0858  hypothetical protein  32.35 
 
 		 317 aa  82.4  0.00000000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.104064  normal  0.132523 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2819  conserved hypothetical radical SAM protein  33.06 
 
 		 372 aa  82.4  0.00000000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0586  radical SAM family protein  32.41 
 
 		 319 aa  81.6  0.00000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1167  radical SAM domain-containing protein  27.91 
 
 		 469 aa  81.6  0.00000000000002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.413437  normal  0.627812 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2936  hypothetical protein  29.86 
 
 		 319 aa  80.1  0.00000000000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.971153  hitchhiker  0.00000000000000717489 
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_27329  predicted protein  32.11 
 
 		 555 aa  80.1  0.00000000000005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.072078  hitchhiker  0.00552121 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1318  ELP3 family histone acetyltransferase  25.1 
 
 		 510 aa  80.5  0.00000000000005  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.340377 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2192  histone acetyltransferase, ELP3 family  32.82 
 
 		 576 aa  80.1  0.00000000000006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0586  ELP3 family histone acetyltransferase  28.27 
 
 		 459 aa  79.7  0.00000000000007  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0000912711  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0579  ELP3 family histone acetyltransferase  26.02 
 
 		 527 aa  79.7  0.00000000000007  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1480  histone acetyltransferase, ELP3 family  33.09 
 
 		 585 aa  79.7  0.00000000000007  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.761791  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0612  ELP3 family histone acetyltransferase  28.45 
 
 		 459 aa  79  0.0000000000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.125099  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1093  ELP3 family histone acetyltransferase  27.07 
 
 		 541 aa  79  0.0000000000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.108771  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3477  putative radical SAM protein  30.91 
 
 		 313 aa  79  0.0000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.143192  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_551  radical SAM superfamily  28.27 
 
 		 459 aa  78.2  0.0000000000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0398241  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2950  putative radical SAM protein  25.3 
 
 		 322 aa  77.8  0.0000000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.474173  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1832  ELP3 family histone acetyltransferase  27.07 
 
 		 541 aa  78.2  0.0000000000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3655  putative radical SAM protein  27 
 
 		 328 aa  77.4  0.0000000000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0760029 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_42410  predicted protein  31.25 
 
 		 558 aa  76.6  0.0000000000006  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0952  histone acetyltransferase, ELP3 family  28.7 
 
 		 526 aa  76.6  0.0000000000007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0306  hypothetical protein  27.71 
 
 		 309 aa  76.3  0.0000000000008  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.216797  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1736  hypothetical protein  23.33 
 
 		 317 aa  75.9  0.000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3632  hypothetical protein  27.16 
 
 		 317 aa  75.5  0.000000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.197622  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1133  ELP3 family histone acetyltransferase  29.19 
 
 		 522 aa  75.9  0.000000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0261  Radical SAM domain protein  26.46 
 
 		 564 aa  75.1  0.000000000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1127  putative radical SAM protein  26.91 
 
 		 308 aa  74.7  0.000000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0121319  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0824  ELP3 family histone acetyltransferase  25.97 
 
 		 541 aa  75.1  0.000000000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.318054  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2183  putative radical SAM protein  35.19 
 
 		 351 aa  75.1  0.000000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2930  histone acetyltransferase, ELP3 family  30.06 
 
 		 554 aa  74.3  0.000000000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.281817  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1222  putative radical SAM protein  27.15 
 
 		 312 aa  74.3  0.000000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.101192  normal  0.0468931 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2187  hypothetical protein  29.75 
 
 		 316 aa  74.3  0.000000000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000345504 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3355  hypothetical protein  27.63 
 
 		 317 aa  74.3  0.000000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.378299  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2870  putative radical SAM protein  28.77 
 
 		 309 aa  74.7  0.000000000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00453128  normal  0.0632795 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2952  putative radical SAM protein  30.88 
 
 		 309 aa  74.7  0.000000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.432245  normal  0.157754 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0572  conserved hypothetical radical SAM protein  22.9 
 
 		 325 aa  73.6  0.000000000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0468  radical SAM family protein  27.68 
 
 		 307 aa  73.6  0.000000000005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3790  hypothetical protein  27.16 
 
 		 314 aa  73.2  0.000000000006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0994894  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1014  putative radical SAM protein  27.16 
 
 		 309 aa  73.2  0.000000000006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.531424  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00929  Fe-S oxidoreductase  26.38 
 
 		 314 aa  73.2  0.000000000006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0300  hypothetical protein  26.8 
 
 		 309 aa  73.2  0.000000000006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.558235  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0531  putative radical SAM protein  27.68 
 
 		 329 aa  73.2  0.000000000007  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.233315  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3048  putative radical SAM protein  30.88 
 
 		 309 aa  73.2  0.000000000007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0315161  normal  0.32107 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1033  putative radical SAM protein  25.91 
 
 		 330 aa  73.2  0.000000000007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.247016  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2603  radical SAM superfamily protein  26.91 
 
 		 313 aa  72.8  0.000000000008  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4343  putative radical SAM protein  25.7 
 
 		 312 aa  72.8  0.000000000009  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.122173 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3134  hypothetical protein  30.94 
 
 		 309 aa  72.8  0.000000000009  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000932261  normal  0.614838 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1335  hypothetical protein  27.43 
 
 		 328 aa  72  0.00000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0087579  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0103  putative radical SAM protein  29.09 
 
 		 304 aa  72.4  0.00000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0139654 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3522  radical SAM protein, TIGR01212 family  26.88 
 
 		 309 aa  72.4  0.00000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.998452  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03076  predicted Fe-S oxidoreductase  27.5 
 
 		 309 aa  72  0.00000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.709944  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0367  radical SAM family protein  32.02 
 
 		 305 aa  71.6  0.00000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0395363  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1956  ELP3 family histone acetyltransferase  26.89 
 
 		 526 aa  71.6  0.00000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.724461 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0489  putative radical SAM protein  27.5 
 
 		 320 aa  71.6  0.00000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.577174 
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_50848  predicted protein  31.62 
 
 		 544 aa  71.2  0.00000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.104715  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3699  radical SAM family protein  27.5 
 
 		 309 aa  72  0.00000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1156  putative radical SAM protein  34.07 
 
 		 307 aa  71.6  0.00000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0308267  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3507  radical SAM family protein  27.5 
 
 		 309 aa  71.6  0.00000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0175  hypothetical protein  27.95 
 
 		 317 aa  72  0.00000000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.46847  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3404  radical SAM family protein  27.5 
 
 		 309 aa  72  0.00000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4534  radical SAM protein, TIGR01212 family  27.5 
 
 		 309 aa  72  0.00000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03027  hypothetical protein  27.5 
 
 		 309 aa  72  0.00000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.828625  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004465  hypothetical protein  27.78 
 
 		 319 aa  71.2  0.00000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>