More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GSU2227 on replicon NC_002939
Organism: Geobacter sulfurreducens PCA



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU2227  radical SAM domain-containing protein  100 
 
 		 342 aa  679    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.775407  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2316  radical SAM family protein  63.19 
 
 		 346 aa  419  1e-116  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1061  Radical SAM domain protein  56.6 
 
 		 343 aa  372  1e-102  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.8315700000000001e-19 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3151  radical SAM domain-containing protein  53.62 
 
 		 351 aa  363  2e-99  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0207208  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3202  Radical SAM domain protein  55.59 
 
 		 342 aa  359  4e-98  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00235958  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1777  radical SAM domain-containing protein  48.41 
 
 		 352 aa  305  6e-82  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.112435  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1944  Radical SAM domain protein  45.19 
 
 		 374 aa  287  2e-76  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0450295  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0930  radical SAM family protein  39.43 
 
 		 338 aa  263  2e-69  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000118017  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0774  ELP3 component of the RNA polymerase II complex  40.9 
 
 		 362 aa  255  8e-67  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00000160735  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1719  radical SAM domain-containing protein  36.44 
 
 		 354 aa  248  8e-65  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.219309  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1404  radical SAM protein, putative histone acetyltransferase  43.93 
 
 		 345 aa  241  1e-62  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.00000266579  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0688  Radical SAM domain protein  37.5 
 
 		 336 aa  240  2.9999999999999997e-62  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1501  radical SAM domain-containing protein  39.94 
 
 		 341 aa  235  6e-61  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.166226  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1689  radical SAM domain-containing protein  38.28 
 
 		 357 aa  222  8e-57  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0776794  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1971  radical SAM domain-containing protein  38.28 
 
 		 357 aa  220  1.9999999999999999e-56  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.144867  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1160  Radical SAM domain protein  36.93 
 
 		 341 aa  215  9.999999999999999e-55  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.276403  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0660  Radical SAM domain protein  33.76 
 
 		 359 aa  209  4e-53  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.142353  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1179  radical SAM domain-containing protein  34.93 
 
 		 314 aa  192  6e-48  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0787  radical SAM domain-containing protein  34.08 
 
 		 317 aa  182  5.0000000000000004e-45  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0875  radical SAM domain-containing protein  41.33 
 
 		 359 aa  182  8.000000000000001e-45  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1713  radical SAM domain-containing protein  36.57 
 
 		 317 aa  180  2.9999999999999997e-44  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2238  Radical SAM domain protein  36.22 
 
 		 354 aa  179  4.999999999999999e-44  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1640  radical SAM domain-containing protein  35.82 
 
 		 317 aa  178  1e-43  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1562  Radical SAM domain protein  39.33 
 
 		 401 aa  159  5e-38  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0515  Elongator protein 3/MiaB/NifB  41.71 
 
 		 309 aa  157  3e-37  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.84475  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2966  Radical SAM domain protein  39.75 
 
 		 344 aa  155  1e-36  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0294152  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0182  Radical SAM domain protein  34.05 
 
 		 401 aa  152  5.9999999999999996e-36  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.534223  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2540  radical SAM domain-containing protein  40.45 
 
 		 340 aa  152  5.9999999999999996e-36  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.093156 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1167  radical SAM domain-containing protein  33.45 
 
 		 469 aa  115  6.9999999999999995e-25  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.413437  normal  0.627812 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1085  histone acetyltransferase, ELP3 family  28.87 
 
 		 514 aa  115  1.0000000000000001e-24  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.707697  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0122  radical SAM domain-containing protein  32.01 
 
 		 483 aa  114  3e-24  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1318  ELP3 family histone acetyltransferase  31.77 
 
 		 510 aa  112  6e-24  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.340377 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0579  ELP3 family histone acetyltransferase  25.77 
 
 		 527 aa  110  2.0000000000000002e-23  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2046  ELP3 family histone acetyltransferase  38.07 
 
 		 530 aa  107  3e-22  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0088  radical SAM domain-containing protein  31.38 
 
 		 477 aa  107  3e-22  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0202426 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0898  ELP3 family histone acetyltransferase  31.51 
 
 		 512 aa  106  7e-22  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.589047  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1755  ELP3 family histone acetyltransferase  37.76 
 
 		 547 aa  105  1e-21  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.668163  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0872  histone acetyltransferase, ELP3 family  33.17 
 
 		 556 aa  104  2e-21  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0952  histone acetyltransferase, ELP3 family  32.47 
 
 		 526 aa  104  2e-21  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1133  ELP3 family histone acetyltransferase  33.97 
 
 		 522 aa  104  3e-21  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0279  ELP3 family histone acetyltransferase  27.27 
 
 		 563 aa  103  6e-21  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1304  hypothetical protein  37.43 
 
 		 520 aa  102  8e-21  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2706  histone acetyltransferase, ELP3 family  28.48 
 
 		 553 aa  101  2e-20  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1956  ELP3 family histone acetyltransferase  30.36 
 
 		 526 aa  101  2e-20  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.724461 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1989  ELP3 family histone acetyltransferase  34.64 
 
 		 548 aa  99  9e-20  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1460  histone acetyltransferase, ELP3 family  26.92 
 
 		 473 aa  98.2  2e-19  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1480  histone acetyltransferase, ELP3 family  29.95 
 
 		 585 aa  95.9  1e-18  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.761791  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0586  ELP3 family histone acetyltransferase  39.55 
 
 		 459 aa  94.7  2e-18  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0000912711  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1832  ELP3 family histone acetyltransferase  28.46 
 
 		 541 aa  94.7  2e-18  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0612  ELP3 family histone acetyltransferase  35.59 
 
 		 459 aa  94.4  3e-18  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.125099  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_551  radical SAM superfamily  39.55 
 
 		 459 aa  94  3e-18  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0398241  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0824  ELP3 family histone acetyltransferase  28.06 
 
 		 541 aa  93.6  4e-18  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.318054  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1093  ELP3 family histone acetyltransferase  28.06 
 
 		 541 aa  93.6  4e-18  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.108771  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08040  histone acetyltransferase  32.37 
 
 		 598 aa  93.6  5e-18  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.584733  hitchhiker  0.0000000843356 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2192  histone acetyltransferase, ELP3 family  28.25 
 
 		 576 aa  91.3  2e-17  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0889  ELP3 family histone acetyltransferase  25.48 
 
 		 541 aa  90.5  4e-17  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11040  histone acetyltransferase  31.1 
 
 		 666 aa  89.7  6e-17  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.142131  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0664  hypothetical protein  28.36 
 
 		 318 aa  89  1e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.08613e-26 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0906  Histone acetyltransferase  31.25 
 
 		 617 aa  86.7  5e-16  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.301086  normal  0.526584 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2936  hypothetical protein  29.6 
 
 		 319 aa  86.7  5e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.971153  hitchhiker  0.00000000000000717489 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0261  Radical SAM domain protein  28.24 
 
 		 564 aa  86.3  6e-16  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0586  radical SAM family protein  35 
 
 		 319 aa  85.5  0.000000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3661  putative radical SAM protein  28 
 
 		 319 aa  85.5  0.000000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02294  histone acetyltransferase, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G06140)  32.8 
 
 		 574 aa  84.7  0.000000000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0651  conserved hypothetical radical SAM protein  26.74 
 
 		 318 aa  84.3  0.000000000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1304  putative oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  32.31 
 
 		 381 aa  84.3  0.000000000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2487  Fe-S oxidoreductase  31.91 
 
 		 609 aa  83.6  0.000000000000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_50848  predicted protein  30.53 
 
 		 544 aa  83.2  0.000000000000006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.104715  n/a   
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_27329  predicted protein  30.84 
 
 		 555 aa  83.2  0.000000000000006  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.072078  hitchhiker  0.00552121 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0804  putative radical SAM protein  28.65 
 
 		 334 aa  82  0.00000000000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.768446  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2930  histone acetyltransferase, ELP3 family  26.81 
 
 		 554 aa  81.6  0.00000000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.281817  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1179  radical SAM family protein  30.59 
 
 		 332 aa  80.9  0.00000000000003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.808864  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0082  radical SAM family protein  30.18 
 
 		 332 aa  80.9  0.00000000000003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_42410  predicted protein  26.98 
 
 		 558 aa  80.1  0.00000000000004  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1293  putative radical SAM protein  30.5 
 
 		 341 aa  78.6  0.0000000000001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2881  coproporphyrinogen III oxidase  27.62 
 
 		 494 aa  79  0.0000000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.969668  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0093  Radical SAM domain protein  32.26 
 
 		 490 aa  79.3  0.0000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0584264  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2183  putative radical SAM protein  29.96 
 
 		 351 aa  78.6  0.0000000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0739  radical SAM family protein  30.59 
 
 		 332 aa  79  0.0000000000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.974352  normal  0.805342 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2187  hypothetical protein  30.97 
 
 		 316 aa  78.2  0.0000000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000345504 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0076  Radical SAM domain protein  32.26 
 
 		 616 aa  77.8  0.0000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  1.3742100000000001e-34 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0944  putative oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  24.4 
 
 		 375 aa  77.4  0.0000000000003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006680  CNK00950  Pol II transcription elongation factor, putative  28.11 
 
 		 557 aa  77.4  0.0000000000003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.110026  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4269  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  28.64 
 
 		 401 aa  77.4  0.0000000000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.281837  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1335  hypothetical protein  26.87 
 
 		 328 aa  76.6  0.0000000000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0087579  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4462  coproporphyrinogen III oxidase  28.84 
 
 		 435 aa  76.6  0.0000000000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3853  coproporphyrinogen III oxidase  28.97 
 
 		 399 aa  76.3  0.0000000000007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.800608  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1736  hypothetical protein  24.36 
 
 		 317 aa  75.5  0.000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3522  radical SAM protein, TIGR01212 family  26.58 
 
 		 309 aa  75.1  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.998452  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3591  hypothetical protein  26.58 
 
 		 309 aa  74.3  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3689  hypothetical protein  26.58 
 
 		 309 aa  74.3  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3520  radical SAM protein, TIGR01212 family  26.58 
 
 		 309 aa  73.9  0.000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3627  hypothetical protein  26.58 
 
 		 309 aa  73.9  0.000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.672413 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0572  conserved hypothetical radical SAM protein  24.11 
 
 		 325 aa  72.8  0.000000000009  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1222  putative radical SAM protein  26.03 
 
 		 312 aa  72.8  0.000000000009  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.101192  normal  0.0468931 
 
 
-
 
NC_002950  PG1087  radical SAM family protein  25 
 
 		 311 aa  72.4  0.00000000001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.447962 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0489  putative radical SAM protein  26.13 
 
 		 320 aa  72  0.00000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.577174 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0038  conserved hypothetical radical SAM protein  29.26 
 
 		 318 aa  72.4  0.00000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3477  putative radical SAM protein  26.26 
 
 		 313 aa  72.4  0.00000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.143192  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4306  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  29.29 
 
 		 375 aa  72  0.00000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0329595  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>