More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPF_1971 on replicon NC_008261
Organism: Clostridium perfringens ATCC 13124



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008261  CPF_1971  radical SAM domain-containing protein  100 
 
 		 357 aa  723    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.144867  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1689  radical SAM domain-containing protein  98.88 
 
 		 357 aa  716    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0776794  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1719  radical SAM domain-containing protein  49.58 
 
 		 354 aa  330  2e-89  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.219309  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0688  Radical SAM domain protein  44.13 
 
 		 336 aa  294  2e-78  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0930  radical SAM family protein  46.04 
 
 		 338 aa  285  8e-76  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000118017  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0660  Radical SAM domain protein  45.73 
 
 		 359 aa  284  2.0000000000000002e-75  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.142353  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1160  Radical SAM domain protein  40 
 
 		 341 aa  249  5e-65  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.276403  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0774  ELP3 component of the RNA polymerase II complex  38.11 
 
 		 362 aa  243  3e-63  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00000160735  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1501  radical SAM domain-containing protein  33.53 
 
 		 341 aa  238  1e-61  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.166226  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2227  radical SAM domain-containing protein  38.28 
 
 		 342 aa  220  1.9999999999999999e-56  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.775407  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3202  Radical SAM domain protein  32.01 
 
 		 342 aa  214  9.999999999999999e-55  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00235958  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1061  Radical SAM domain protein  32.36 
 
 		 343 aa  214  2.9999999999999995e-54  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.8315700000000001e-19 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2316  radical SAM family protein  32.56 
 
 		 346 aa  212  7e-54  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3151  radical SAM domain-containing protein  37.63 
 
 		 351 aa  209  8e-53  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0207208  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1944  Radical SAM domain protein  35.07 
 
 		 374 aa  206  6e-52  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0450295  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1404  radical SAM protein, putative histone acetyltransferase  32.6 
 
 		 345 aa  201  1.9999999999999998e-50  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.00000266579  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0875  radical SAM domain-containing protein  35.76 
 
 		 359 aa  201  1.9999999999999998e-50  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1777  radical SAM domain-containing protein  34.47 
 
 		 352 aa  198  1.0000000000000001e-49  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.112435  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2238  Radical SAM domain protein  31.25 
 
 		 354 aa  197  2.0000000000000003e-49  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1179  radical SAM domain-containing protein  40.14 
 
 		 314 aa  186  4e-46  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0787  radical SAM domain-containing protein  37.05 
 
 		 317 aa  176  6e-43  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1713  radical SAM domain-containing protein  37.59 
 
 		 317 aa  172  9e-42  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1640  radical SAM domain-containing protein  37.59 
 
 		 317 aa  167  4e-40  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2540  radical SAM domain-containing protein  28.52 
 
 		 340 aa  157  3e-37  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.093156 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1562  Radical SAM domain protein  28.4 
 
 		 401 aa  154  2e-36  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2966  Radical SAM domain protein  27.35 
 
 		 344 aa  152  8e-36  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0294152  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0515  Elongator protein 3/MiaB/NifB  29.19 
 
 		 309 aa  151  1e-35  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.84475  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0182  Radical SAM domain protein  28.52 
 
 		 401 aa  144  2e-33  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.534223  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1832  ELP3 family histone acetyltransferase  30.89 
 
 		 541 aa  107  4e-22  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0824  ELP3 family histone acetyltransferase  30.27 
 
 		 541 aa  105  1e-21  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.318054  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1093  ELP3 family histone acetyltransferase  30.27 
 
 		 541 aa  105  1e-21  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.108771  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1460  histone acetyltransferase, ELP3 family  24.84 
 
 		 473 aa  105  2e-21  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1085  histone acetyltransferase, ELP3 family  28.96 
 
 		 514 aa  105  2e-21  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.707697  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0889  ELP3 family histone acetyltransferase  29.25 
 
 		 541 aa  103  4e-21  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1318  ELP3 family histone acetyltransferase  27.42 
 
 		 510 aa  102  1e-20  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.340377 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0122  radical SAM domain-containing protein  27.27 
 
 		 483 aa  100  4e-20  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0088  radical SAM domain-containing protein  26.97 
 
 		 477 aa  99.8  7e-20  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0202426 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0579  ELP3 family histone acetyltransferase  25.58 
 
 		 527 aa  96.3  8e-19  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1167  radical SAM domain-containing protein  26.99 
 
 		 469 aa  96.3  8e-19  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.413437  normal  0.627812 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0279  ELP3 family histone acetyltransferase  27.82 
 
 		 563 aa  94  4e-18  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0612  ELP3 family histone acetyltransferase  27.78 
 
 		 459 aa  92  1e-17  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.125099  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0898  ELP3 family histone acetyltransferase  26.59 
 
 		 512 aa  92.4  1e-17  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.589047  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_551  radical SAM superfamily  27.35 
 
 		 459 aa  89.4  8e-17  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0398241  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0586  ELP3 family histone acetyltransferase  27.35 
 
 		 459 aa  89  1e-16  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0000912711  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2046  ELP3 family histone acetyltransferase  25.16 
 
 		 530 aa  87.4  3e-16  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1133  ELP3 family histone acetyltransferase  25.67 
 
 		 522 aa  84  0.000000000000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1755  ELP3 family histone acetyltransferase  25.83 
 
 		 547 aa  83.2  0.000000000000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.668163  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1956  ELP3 family histone acetyltransferase  26.21 
 
 		 526 aa  82.8  0.000000000000008  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.724461 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1293  putative radical SAM protein  32.18 
 
 		 341 aa  81.6  0.00000000000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0952  histone acetyltransferase, ELP3 family  24.76 
 
 		 526 aa  81.3  0.00000000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_50848  predicted protein  25.38 
 
 		 544 aa  79.7  0.00000000000006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.104715  n/a   
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_27329  predicted protein  24.24 
 
 		 555 aa  79  0.0000000000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.072078  hitchhiker  0.00552121 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0347  putative radical SAM protein  29.39 
 
 		 293 aa  77  0.0000000000005  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2706  histone acetyltransferase, ELP3 family  24.21 
 
 		 553 aa  75.9  0.000000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1736  hypothetical protein  25.4 
 
 		 317 aa  75.1  0.000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2930  histone acetyltransferase, ELP3 family  24.65 
 
 		 554 aa  74.3  0.000000000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.281817  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1565  putative radical SAM protein  28.63 
 
 		 300 aa  74.3  0.000000000003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.705687  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_42410  predicted protein  24.05 
 
 		 558 aa  74.3  0.000000000003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02294  histone acetyltransferase, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G06140)  25.1 
 
 		 574 aa  73.9  0.000000000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1179  radical SAM family protein  27.75 
 
 		 332 aa  73.6  0.000000000005  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.808864  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1418  conserved hypothetical radical SAM protein  32.21 
 
 		 312 aa  73.6  0.000000000005  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0739  radical SAM family protein  30.72 
 
 		 332 aa  73.2  0.000000000006  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.974352  normal  0.805342 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1358  putative radical SAM protein  25.37 
 
 		 318 aa  73.2  0.000000000007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.161503  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0082  radical SAM family protein  26.87 
 
 		 332 aa  72.8  0.000000000008  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0872  histone acetyltransferase, ELP3 family  24.56 
 
 		 556 aa  72  0.00000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0804  putative radical SAM protein  26.82 
 
 		 334 aa  72  0.00000000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.768446  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0572  conserved hypothetical radical SAM protein  27.83 
 
 		 325 aa  71.6  0.00000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08040  histone acetyltransferase  30.22 
 
 		 598 aa  70.9  0.00000000004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.584733  hitchhiker  0.0000000843356 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2881  coproporphyrinogen III oxidase  25 
 
 		 494 aa  69.3  0.0000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.969668  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11040  histone acetyltransferase  24.34 
 
 		 666 aa  68.2  0.0000000002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.142131  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1480  histone acetyltransferase, ELP3 family  29.01 
 
 		 585 aa  68.2  0.0000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.761791  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0407  putative radical SAM protein  25.38 
 
 		 303 aa  67.8  0.0000000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.145155  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0422  putative radical SAM protein  25.38 
 
 		 303 aa  67.8  0.0000000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2192  histone acetyltransferase, ELP3 family  28.68 
 
 		 576 aa  67.8  0.0000000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2936  hypothetical protein  30.25 
 
 		 319 aa  66.6  0.0000000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.971153  hitchhiker  0.00000000000000717489 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0906  Histone acetyltransferase  27.51 
 
 		 617 aa  66.2  0.0000000008  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.301086  normal  0.526584 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0260  conserved hypothetical radical SAM protein  25.41 
 
 		 307 aa  66.2  0.0000000009  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1304  hypothetical protein  25.75 
 
 		 520 aa  65.5  0.000000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0760  putative radical SAM protein  30.88 
 
 		 304 aa  65.1  0.000000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.992819  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00929  Fe-S oxidoreductase  26.28 
 
 		 314 aa  64.3  0.000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006680  CNK00950  Pol II transcription elongation factor, putative  21.97 
 
 		 557 aa  63.9  0.000000004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.110026  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0370  putative radical SAM protein  25.82 
 
 		 313 aa  63.9  0.000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3655  putative radical SAM protein  28.36 
 
 		 328 aa  63.9  0.000000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0760029 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1989  ELP3 family histone acetyltransferase  26.67 
 
 		 548 aa  63.5  0.000000006  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1341  coproporphyrinogen III oxidase  25 
 
 		 505 aa  62  0.00000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.996503  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004465  hypothetical protein  25.55 
 
 		 319 aa  62  0.00000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3651  coproporphyrinogen III oxidase, anaerobic  29.88 
 
 		 400 aa  61.2  0.00000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0750  Radical SAM domain protein  29.96 
 
 		 405 aa  61.6  0.00000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0586  radical SAM family protein  30.23 
 
 		 319 aa  60.8  0.00000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3661  putative radical SAM protein  29.19 
 
 		 319 aa  60.8  0.00000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0664  hypothetical protein  27.91 
 
 		 318 aa  60.1  0.00000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.08613e-26 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0103  putative radical SAM protein  22.79 
 
 		 304 aa  60.1  0.00000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0139654 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3134  hypothetical protein  27.94 
 
 		 309 aa  60.1  0.00000006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000932261  normal  0.614838 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0315  coproporphyrinogen III oxidase  25.3 
 
 		 438 aa  59.7  0.00000007  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1901  coproporphyrinogen III oxidase  28.29 
 
 		 480 aa  59.7  0.00000007  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1156  putative radical SAM protein  24.39 
 
 		 307 aa  59.7  0.00000007  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0308267  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2374  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  25.66 
 
 		 448 aa  59.7  0.00000008  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2952  putative radical SAM protein  27.21 
 
 		 309 aa  59.7  0.00000008  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.432245  normal  0.157754 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3507  radical SAM family protein  25.37 
 
 		 309 aa  59.3  0.0000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2187  hypothetical protein  27.11 
 
 		 316 aa  58.9  0.0000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000345504 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>