More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ddes_0182 on replicon NC_011883
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011883  Ddes_0182  Radical SAM domain protein  100 
 
 		 401 aa  786    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.534223  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1562  Radical SAM domain protein  46.59 
 
 		 401 aa  256  6e-67  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2238  Radical SAM domain protein  37.18 
 
 		 354 aa  209  5e-53  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2540  radical SAM domain-containing protein  41.19 
 
 		 340 aa  204  2e-51  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.093156 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0515  Elongator protein 3/MiaB/NifB  40.13 
 
 		 309 aa  200  3.9999999999999996e-50  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.84475  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1061  Radical SAM domain protein  37.8 
 
 		 343 aa  171  3e-41  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.8315700000000001e-19 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0774  ELP3 component of the RNA polymerase II complex  32.59 
 
 		 362 aa  167  2e-40  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00000160735  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0875  radical SAM domain-containing protein  38.49 
 
 		 359 aa  168  2e-40  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3202  Radical SAM domain protein  37.67 
 
 		 342 aa  166  6.9999999999999995e-40  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00235958  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0930  radical SAM family protein  27.67 
 
 		 338 aa  164  2.0000000000000002e-39  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000118017  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1777  radical SAM domain-containing protein  37.5 
 
 		 352 aa  163  6e-39  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.112435  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2966  Radical SAM domain protein  42.13 
 
 		 344 aa  162  1e-38  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0294152  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1640  radical SAM domain-containing protein  32.06 
 
 		 317 aa  159  6e-38  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0688  Radical SAM domain protein  27.1 
 
 		 336 aa  159  8e-38  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1719  radical SAM domain-containing protein  26.71 
 
 		 354 aa  159  1e-37  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.219309  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2227  radical SAM domain-containing protein  34.66 
 
 		 342 aa  159  1e-37  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.775407  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1944  Radical SAM domain protein  34.65 
 
 		 374 aa  156  7e-37  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0450295  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1713  radical SAM domain-containing protein  32.27 
 
 		 317 aa  155  9e-37  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2316  radical SAM family protein  36.3 
 
 		 346 aa  152  1e-35  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1404  radical SAM protein, putative histone acetyltransferase  33.94 
 
 		 345 aa  151  2e-35  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.00000266579  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1689  radical SAM domain-containing protein  28.87 
 
 		 357 aa  150  3e-35  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0776794  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1160  Radical SAM domain protein  31.53 
 
 		 341 aa  150  4e-35  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.276403  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0660  Radical SAM domain protein  28.01 
 
 		 359 aa  150  4e-35  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.142353  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1971  radical SAM domain-containing protein  28.87 
 
 		 357 aa  148  1.0000000000000001e-34  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.144867  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3151  radical SAM domain-containing protein  31.51 
 
 		 351 aa  149  1.0000000000000001e-34  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0207208  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1501  radical SAM domain-containing protein  32.35 
 
 		 341 aa  138  2e-31  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.166226  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0787  radical SAM domain-containing protein  26.48 
 
 		 317 aa  136  8e-31  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1179  radical SAM domain-containing protein  25.33 
 
 		 314 aa  127  3e-28  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1085  histone acetyltransferase, ELP3 family  30.8 
 
 		 514 aa  99  1e-19  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.707697  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0889  ELP3 family histone acetyltransferase  27.09 
 
 		 541 aa  95.1  2e-18  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1832  ELP3 family histone acetyltransferase  27.09 
 
 		 541 aa  94.4  3e-18  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0898  ELP3 family histone acetyltransferase  31.82 
 
 		 512 aa  90.9  3e-17  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.589047  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1093  ELP3 family histone acetyltransferase  26.69 
 
 		 541 aa  91.3  3e-17  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.108771  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0824  ELP3 family histone acetyltransferase  26.29 
 
 		 541 aa  90.5  5e-17  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.318054  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0579  ELP3 family histone acetyltransferase  26.88 
 
 		 527 aa  87  5e-16  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_27329  predicted protein  25.65 
 
 		 555 aa  85.5  0.000000000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.072078  hitchhiker  0.00552121 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11040  histone acetyltransferase  34.9 
 
 		 666 aa  83.2  0.000000000000007  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.142131  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2819  conserved hypothetical radical SAM protein  41.09 
 
 		 372 aa  83.2  0.000000000000008  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1167  radical SAM domain-containing protein  30.27 
 
 		 469 aa  83.2  0.000000000000008  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.413437  normal  0.627812 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0088  radical SAM domain-containing protein  27.89 
 
 		 477 aa  82.8  0.000000000000009  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0202426 
 
 
-
 
NC_006680  CNK00950  Pol II transcription elongation factor, putative  24.91 
 
 		 557 aa  82.4  0.00000000000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.110026  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0279  ELP3 family histone acetyltransferase  24.1 
 
 		 563 aa  82.4  0.00000000000001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1133  ELP3 family histone acetyltransferase  28.21 
 
 		 522 aa  82.4  0.00000000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1014  putative radical SAM protein  35.77 
 
 		 309 aa  81.6  0.00000000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.531424  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1318  ELP3 family histone acetyltransferase  29.86 
 
 		 510 aa  81.6  0.00000000000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.340377 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02294  histone acetyltransferase, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G06140)  26.39 
 
 		 574 aa  80.9  0.00000000000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_551  radical SAM superfamily  33.16 
 
 		 459 aa  80.9  0.00000000000004  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0398241  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_42410  predicted protein  24.91 
 
 		 558 aa  80.5  0.00000000000005  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1956  ELP3 family histone acetyltransferase  27.53 
 
 		 526 aa  79.7  0.00000000000008  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.724461 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0122  radical SAM domain-containing protein  35.06 
 
 		 483 aa  79.3  0.0000000000001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1460  histone acetyltransferase, ELP3 family  24.2 
 
 		 473 aa  79  0.0000000000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1222  putative radical SAM protein  34.15 
 
 		 312 aa  78.2  0.0000000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.101192  normal  0.0468931 
 
 
-
 
NC_002936  DET0612  ELP3 family histone acetyltransferase  32.26 
 
 		 459 aa  77.4  0.0000000000004  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.125099  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2046  ELP3 family histone acetyltransferase  32.31 
 
 		 530 aa  76.3  0.000000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1326  hypothetical protein  33.87 
 
 		 309 aa  75.5  0.000000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0586  ELP3 family histone acetyltransferase  31.55 
 
 		 459 aa  75.5  0.000000000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0000912711  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1480  histone acetyltransferase, ELP3 family  27.71 
 
 		 585 aa  75.1  0.000000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.761791  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2952  putative radical SAM protein  35.65 
 
 		 309 aa  74.3  0.000000000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.432245  normal  0.157754 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2950  putative radical SAM protein  28.66 
 
 		 322 aa  73.9  0.000000000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.474173  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1137  putative radical SAM protein  32.81 
 
 		 309 aa  73.9  0.000000000005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00496914  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1989  ELP3 family histone acetyltransferase  32.06 
 
 		 548 aa  73.6  0.000000000006  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3048  putative radical SAM protein  35.65 
 
 		 309 aa  73.2  0.000000000008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0315161  normal  0.32107 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1179  putative radical SAM protein  33.59 
 
 		 309 aa  73.2  0.000000000008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1755  ELP3 family histone acetyltransferase  32 
 
 		 547 aa  73.2  0.000000000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.668163  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2870  putative radical SAM protein  34.78 
 
 		 309 aa  72.8  0.00000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00453128  normal  0.0632795 
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_50848  predicted protein  28.03 
 
 		 544 aa  72.8  0.00000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.104715  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3838  putative oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  36 
 
 		 407 aa  71.6  0.00000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.584028  hitchhiker  0.00877773 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0858  hypothetical protein  28.98 
 
 		 317 aa  71.6  0.00000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.104064  normal  0.132523 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0175  hypothetical protein  27.89 
 
 		 317 aa  71.6  0.00000000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.46847  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0872  histone acetyltransferase, ELP3 family  25.9 
 
 		 556 aa  71.2  0.00000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1223  putative radical SAM protein  32.81 
 
 		 309 aa  70.9  0.00000000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.784754  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1256  putative radical SAM protein  32.81 
 
 		 309 aa  70.9  0.00000000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0785555  normal  0.353815 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3134  hypothetical protein  32.81 
 
 		 309 aa  70.5  0.00000000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000932261  normal  0.614838 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1033  putative radical SAM protein  34.68 
 
 		 330 aa  70.5  0.00000000006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.247016  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0261  Radical SAM domain protein  28.57 
 
 		 564 aa  70.1  0.00000000007  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1127  putative radical SAM protein  32.46 
 
 		 308 aa  69.7  0.00000000008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0121319  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0997  hypothetical protein  33.12 
 
 		 368 aa  69.7  0.00000000009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.961706  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1872  hypothetical protein  24.4 
 
 		 319 aa  69.7  0.00000000009  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.22126  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3168  conserved hypothetical radical SAM protein  29.31 
 
 		 311 aa  69.3  0.0000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.000379648  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10300  putative oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  35.45 
 
 		 372 aa  68.2  0.0000000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0541623  unclonable  0.00000000192008 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0038  conserved hypothetical radical SAM protein  33.59 
 
 		 318 aa  67.8  0.0000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0952  histone acetyltransferase, ELP3 family  27.87 
 
 		 526 aa  68.2  0.0000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1304  hypothetical protein  28.8 
 
 		 520 aa  68.2  0.0000000003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2706  histone acetyltransferase, ELP3 family  27.48 
 
 		 553 aa  68.2  0.0000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0906  Histone acetyltransferase  28.15 
 
 		 617 aa  67.4  0.0000000004  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.301086  normal  0.526584 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2882  radical SAM family protein  28.91 
 
 		 311 aa  67.4  0.0000000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2563  radical SAM family protein  28.91 
 
 		 311 aa  67.4  0.0000000004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0300  hypothetical protein  32.17 
 
 		 309 aa  66.6  0.0000000007  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.558235  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3507  radical SAM family protein  30.89 
 
 		 309 aa  66.2  0.0000000009  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1950  hypothetical protein  31.25 
 
 		 316 aa  66.2  0.000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3522  radical SAM protein, TIGR01212 family  30.08 
 
 		 309 aa  65.9  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.998452  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1156  putative radical SAM protein  27.24 
 
 		 307 aa  65.9  0.000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0308267  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03076  predicted Fe-S oxidoreductase  30.89 
 
 		 309 aa  65.5  0.000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.709944  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0496  conserved hypothetical protein  30.89 
 
 		 309 aa  65.5  0.000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0489  putative radical SAM protein  30.89 
 
 		 320 aa  65.5  0.000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.577174 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2960  Fe-S oxidoreductase  33.33 
 
 		 306 aa  65.1  0.000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.392137  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4534  radical SAM protein, TIGR01212 family  30.89 
 
 		 309 aa  65.5  0.000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0306  hypothetical protein  32.17 
 
 		 309 aa  65.5  0.000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.216797  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03027  hypothetical protein  30.89 
 
 		 309 aa  65.5  0.000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.828625  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3404  radical SAM family protein  30.89 
 
 		 309 aa  65.5  0.000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>