223 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DehaBAV1_0586 on replicon NC_009455
Organism: Dehalococcoides sp. BAV1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002936  DET0612  ELP3 family histone acetyltransferase  92.58 
 
 		 459 aa  872    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.125099  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_551  radical SAM superfamily  92.58 
 
 		 459 aa  867    Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0398241  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0586  ELP3 family histone acetyltransferase  100 
 
 		 459 aa  941    Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0000912711  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1085  histone acetyltransferase, ELP3 family  47.65 
 
 		 514 aa  429  1e-119  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.707697  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1832  ELP3 family histone acetyltransferase  47.97 
 
 		 541 aa  419  1e-116  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1093  ELP3 family histone acetyltransferase  47.97 
 
 		 541 aa  417  9.999999999999999e-116  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.108771  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0824  ELP3 family histone acetyltransferase  47.55 
 
 		 541 aa  416  9.999999999999999e-116  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.318054  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0279  ELP3 family histone acetyltransferase  45.86 
 
 		 563 aa  408  1.0000000000000001e-112  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0889  ELP3 family histone acetyltransferase  46.06 
 
 		 541 aa  401  9.999999999999999e-111  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1318  ELP3 family histone acetyltransferase  47.79 
 
 		 510 aa  398  1e-109  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.340377 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0579  ELP3 family histone acetyltransferase  43.72 
 
 		 527 aa  392  1e-108  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0122  radical SAM domain-containing protein  46.14 
 
 		 483 aa  372  1e-102  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1460  histone acetyltransferase, ELP3 family  44.8 
 
 		 473 aa  369  1e-101  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0898  ELP3 family histone acetyltransferase  45.01 
 
 		 512 aa  370  1e-101  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.589047  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1133  ELP3 family histone acetyltransferase  45.3 
 
 		 522 aa  365  1e-100  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1304  hypothetical protein  45.15 
 
 		 520 aa  367  1e-100  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0088  radical SAM domain-containing protein  44.78 
 
 		 477 aa  365  1e-99  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0202426 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1755  ELP3 family histone acetyltransferase  44.01 
 
 		 547 aa  363  3e-99  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.668163  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1167  radical SAM domain-containing protein  44.75 
 
 		 469 aa  360  2e-98  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.413437  normal  0.627812 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0952  histone acetyltransferase, ELP3 family  46.09 
 
 		 526 aa  359  5e-98  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_27329  predicted protein  42.86 
 
 		 555 aa  354  2e-96  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.072078  hitchhiker  0.00552121 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2046  ELP3 family histone acetyltransferase  44.59 
 
 		 530 aa  353  4e-96  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2706  histone acetyltransferase, ELP3 family  43.03 
 
 		 553 aa  353  4e-96  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0872  histone acetyltransferase, ELP3 family  42.16 
 
 		 556 aa  352  8.999999999999999e-96  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_50848  predicted protein  42.22 
 
 		 544 aa  350  3e-95  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.104715  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2192  histone acetyltransferase, ELP3 family  42.71 
 
 		 576 aa  348  1e-94  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1956  ELP3 family histone acetyltransferase  43.19 
 
 		 526 aa  347  2e-94  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.724461 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1989  ELP3 family histone acetyltransferase  43 
 
 		 548 aa  345  7e-94  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_42410  predicted protein  40.6 
 
 		 558 aa  342  1e-92  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2930  histone acetyltransferase, ELP3 family  41.63 
 
 		 554 aa  334  2e-90  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.281817  n/a   
 
 
-
 
NC_006680  CNK00950  Pol II transcription elongation factor, putative  41.95 
 
 		 557 aa  332  8e-90  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.110026  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02294  histone acetyltransferase, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G06140)  41.01 
 
 		 574 aa  328  2.0000000000000001e-88  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1480  histone acetyltransferase, ELP3 family  40.73 
 
 		 585 aa  321  1.9999999999999998e-86  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.761791  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0906  Histone acetyltransferase  38.2 
 
 		 617 aa  216  8e-55  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.301086  normal  0.526584 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11040  histone acetyltransferase  37.13 
 
 		 666 aa  204  3e-51  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.142131  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08040  histone acetyltransferase  37.15 
 
 		 598 aa  198  2.0000000000000003e-49  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.584733  hitchhiker  0.0000000843356 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3151  radical SAM domain-containing protein  30.51 
 
 		 351 aa  107  5e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0207208  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1160  Radical SAM domain protein  28.34 
 
 		 341 aa  97.4  5e-19  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.276403  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1061  Radical SAM domain protein  30.04 
 
 		 343 aa  96.7  9e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.8315700000000001e-19 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1719  radical SAM domain-containing protein  27.47 
 
 		 354 aa  96.3  1e-18  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.219309  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2227  radical SAM domain-containing protein  39.55 
 
 		 342 aa  94.7  3e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.775407  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0515  Elongator protein 3/MiaB/NifB  31.82 
 
 		 309 aa  92  2e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.84475  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0774  ELP3 component of the RNA polymerase II complex  28.33 
 
 		 362 aa  92  2e-17  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00000160735  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1404  radical SAM protein, putative histone acetyltransferase  40 
 
 		 345 aa  90.5  6e-17  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.00000266579  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1689  radical SAM domain-containing protein  27.35 
 
 		 357 aa  90.5  6e-17  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0776794  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1971  radical SAM domain-containing protein  27.35 
 
 		 357 aa  89  2e-16  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.144867  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3202  Radical SAM domain protein  29.61 
 
 		 342 aa  88.2  3e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00235958  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0688  Radical SAM domain protein  26.03 
 
 		 336 aa  86.7  7e-16  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2238  Radical SAM domain protein  25.54 
 
 		 354 aa  85.1  0.000000000000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2316  radical SAM family protein  38.84 
 
 		 346 aa  84.3  0.000000000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0930  radical SAM family protein  28.7 
 
 		 338 aa  84.3  0.000000000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000118017  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1777  radical SAM domain-containing protein  25.99 
 
 		 352 aa  83.2  0.00000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.112435  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1713  radical SAM domain-containing protein  25.35 
 
 		 317 aa  80.1  0.00000000000007  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0875  radical SAM domain-containing protein  28.27 
 
 		 359 aa  79.7  0.0000000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1501  radical SAM domain-containing protein  25.65 
 
 		 341 aa  79.3  0.0000000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.166226  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1950  hypothetical protein  31.82 
 
 		 316 aa  79  0.0000000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0858  hypothetical protein  35.25 
 
 		 317 aa  77  0.0000000000006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.104064  normal  0.132523 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1179  radical SAM domain-containing protein  25.22 
 
 		 314 aa  77.4  0.0000000000006  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1033  putative radical SAM protein  32.9 
 
 		 330 aa  77  0.0000000000007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.247016  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1640  radical SAM domain-containing protein  25 
 
 		 317 aa  76.6  0.0000000000009  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0182  Radical SAM domain protein  31.55 
 
 		 401 aa  75.1  0.000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.534223  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3163  hypothetical protein  30.73 
 
 		 310 aa  74.7  0.000000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.096251  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3790  hypothetical protein  31.71 
 
 		 314 aa  73.9  0.000000000005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0994894  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1944  Radical SAM domain protein  33.33 
 
 		 374 aa  73.9  0.000000000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0450295  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3559  radical SAM protein, TIGR01212 family  31.45 
 
 		 309 aa  73.9  0.000000000006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3507  radical SAM family protein  32.08 
 
 		 309 aa  73.6  0.000000000008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3655  putative radical SAM protein  32.32 
 
 		 328 aa  73.2  0.000000000008  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0760029 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3520  radical SAM protein, TIGR01212 family  30.63 
 
 		 309 aa  72.8  0.00000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2540  radical SAM domain-containing protein  28.02 
 
 		 340 aa  72.8  0.00000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.093156 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3627  hypothetical protein  30.63 
 
 		 309 aa  72.8  0.00000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.672413 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03076  predicted Fe-S oxidoreductase  31.45 
 
 		 309 aa  72.4  0.00000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.709944  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0496  conserved hypothetical protein  31.45 
 
 		 309 aa  72.4  0.00000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03027  hypothetical protein  31.45 
 
 		 309 aa  72.4  0.00000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.828625  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0489  putative radical SAM protein  31.25 
 
 		 320 aa  72.4  0.00000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.577174 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3591  hypothetical protein  30.63 
 
 		 309 aa  72  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004465  hypothetical protein  30.52 
 
 		 319 aa  71.6  0.00000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1222  putative radical SAM protein  34.4 
 
 		 312 aa  72  0.00000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.101192  normal  0.0468931 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3689  hypothetical protein  30.63 
 
 		 309 aa  72  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3404  radical SAM family protein  31.45 
 
 		 309 aa  72.4  0.00000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4534  radical SAM protein, TIGR01212 family  31.45 
 
 		 309 aa  72.4  0.00000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3699  radical SAM family protein  31.45 
 
 		 309 aa  72.4  0.00000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1326  hypothetical protein  35.2 
 
 		 309 aa  71.2  0.00000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3522  radical SAM protein, TIGR01212 family  31.52 
 
 		 309 aa  71.2  0.00000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.998452  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3661  putative radical SAM protein  23.66 
 
 		 319 aa  71.6  0.00000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3168  conserved hypothetical radical SAM protein  31.41 
 
 		 311 aa  70.9  0.00000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.000379648  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00929  Fe-S oxidoreductase  29.87 
 
 		 314 aa  70.9  0.00000000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0660  Radical SAM domain protein  27.01 
 
 		 359 aa  70.9  0.00000000004  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.142353  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0306  hypothetical protein  37.21 
 
 		 309 aa  70.5  0.00000000006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.216797  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4343  putative radical SAM protein  33.85 
 
 		 312 aa  70.5  0.00000000006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.122173 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0175  hypothetical protein  28.74 
 
 		 317 aa  70.1  0.00000000007  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.46847  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1127  radical SAM family protein  33.82 
 
 		 327 aa  68.9  0.0000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1014  putative radical SAM protein  31.5 
 
 		 309 aa  68.9  0.0000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.531424  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0664  hypothetical protein  29.11 
 
 		 318 aa  68.9  0.0000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.08613e-26 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0300  hypothetical protein  31.01 
 
 		 309 aa  68.6  0.0000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.558235  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3632  hypothetical protein  30.52 
 
 		 317 aa  68.2  0.0000000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.197622  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2960  Fe-S oxidoreductase  31.65 
 
 		 306 aa  67.8  0.0000000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.392137  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2936  hypothetical protein  25.32 
 
 		 319 aa  67.8  0.0000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.971153  hitchhiker  0.00000000000000717489 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0468  radical SAM family protein  34.88 
 
 		 307 aa  67.8  0.0000000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0531  putative radical SAM protein  34.88 
 
 		 329 aa  67.8  0.0000000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.233315  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2952  putative radical SAM protein  34.4 
 
 		 309 aa  67.4  0.0000000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.432245  normal  0.157754 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>