221 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccur_11040 on replicon NC_013170
Organism: Cryptobacterium curtum DSM 15641



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013170  Ccur_11040  histone acetyltransferase  100 
 
 		 666 aa  1390    Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.142131  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0906  Histone acetyltransferase  52.1 
 
 		 617 aa  637    Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.301086  normal  0.526584 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08040  histone acetyltransferase  51 
 
 		 598 aa  632  1e-180  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.584733  hitchhiker  0.0000000843356 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1480  histone acetyltransferase, ELP3 family  33.33 
 
 		 585 aa  270  8.999999999999999e-71  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.761791  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0898  ELP3 family histone acetyltransferase  33.46 
 
 		 512 aa  265  2e-69  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.589047  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0872  histone acetyltransferase, ELP3 family  33.09 
 
 		 556 aa  264  4.999999999999999e-69  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1755  ELP3 family histone acetyltransferase  32.25 
 
 		 547 aa  253  6e-66  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.668163  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2706  histone acetyltransferase, ELP3 family  32.6 
 
 		 553 aa  252  2e-65  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1304  hypothetical protein  33.58 
 
 		 520 aa  251  4e-65  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1956  ELP3 family histone acetyltransferase  32.9 
 
 		 526 aa  249  1e-64  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.724461 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2192  histone acetyltransferase, ELP3 family  32.35 
 
 		 576 aa  248  3e-64  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1989  ELP3 family histone acetyltransferase  31.59 
 
 		 548 aa  247  4e-64  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0952  histone acetyltransferase, ELP3 family  32.34 
 
 		 526 aa  246  9.999999999999999e-64  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2930  histone acetyltransferase, ELP3 family  31.81 
 
 		 554 aa  243  9e-63  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.281817  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02294  histone acetyltransferase, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G06140)  29.96 
 
 		 574 aa  237  6e-61  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_42410  predicted protein  29.17 
 
 		 558 aa  218  4e-55  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1460  histone acetyltransferase, ELP3 family  35.61 
 
 		 473 aa  214  2.9999999999999995e-54  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1133  ELP3 family histone acetyltransferase  35.41 
 
 		 522 aa  210  8e-53  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_551  radical SAM superfamily  37.68 
 
 		 459 aa  210  8e-53  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0398241  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1167  radical SAM domain-containing protein  36.26 
 
 		 469 aa  207  6e-52  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.413437  normal  0.627812 
 
 
-
 
NC_002936  DET0612  ELP3 family histone acetyltransferase  37.13 
 
 		 459 aa  204  4e-51  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.125099  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0586  ELP3 family histone acetyltransferase  37.13 
 
 		 459 aa  204  5e-51  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0000912711  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0088  radical SAM domain-containing protein  34.94 
 
 		 477 aa  201  3.9999999999999996e-50  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0202426 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0122  radical SAM domain-containing protein  35.55 
 
 		 483 aa  200  7.999999999999999e-50  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2046  ELP3 family histone acetyltransferase  31.13 
 
 		 530 aa  197  5.000000000000001e-49  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1085  histone acetyltransferase, ELP3 family  35.47 
 
 		 514 aa  195  2e-48  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.707697  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0824  ELP3 family histone acetyltransferase  35.04 
 
 		 541 aa  194  4e-48  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.318054  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1832  ELP3 family histone acetyltransferase  35.31 
 
 		 541 aa  194  5e-48  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1093  ELP3 family histone acetyltransferase  34.47 
 
 		 541 aa  191  2.9999999999999997e-47  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.108771  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0579  ELP3 family histone acetyltransferase  33.43 
 
 		 527 aa  188  3e-46  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_27329  predicted protein  37.25 
 
 		 555 aa  188  3e-46  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.072078  hitchhiker  0.00552121 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1318  ELP3 family histone acetyltransferase  33.8 
 
 		 510 aa  187  6e-46  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.340377 
 
 
-
 
NC_006680  CNK00950  Pol II transcription elongation factor, putative  34.01 
 
 		 557 aa  187  8e-46  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.110026  n/a   
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_50848  predicted protein  35.06 
 
 		 544 aa  185  2.0000000000000003e-45  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.104715  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0279  ELP3 family histone acetyltransferase  33.33 
 
 		 563 aa  179  1e-43  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0889  ELP3 family histone acetyltransferase  29.84 
 
 		 541 aa  169  2e-40  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3151  radical SAM domain-containing protein  30.99 
 
 		 351 aa  90.9  8e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0207208  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2227  radical SAM domain-containing protein  31.1 
 
 		 342 aa  89.7  1e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.775407  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0774  ELP3 component of the RNA polymerase II complex  31.45 
 
 		 362 aa  89.7  1e-16  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00000160735  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1179  radical SAM domain-containing protein  30.46 
 
 		 314 aa  85.9  0.000000000000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0182  Radical SAM domain protein  34.9 
 
 		 401 aa  83.2  0.00000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.534223  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1160  Radical SAM domain protein  32.84 
 
 		 341 aa  80.5  0.00000000000009  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.276403  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1404  radical SAM protein, putative histone acetyltransferase  23.62 
 
 		 345 aa  79.3  0.0000000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.00000266579  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1562  Radical SAM domain protein  32.24 
 
 		 401 aa  78.6  0.0000000000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1713  radical SAM domain-containing protein  31.55 
 
 		 317 aa  77.8  0.0000000000006  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2966  Radical SAM domain protein  31.79 
 
 		 344 aa  77.4  0.0000000000007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0294152  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2316  radical SAM family protein  33.13 
 
 		 346 aa  75.9  0.000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0515  Elongator protein 3/MiaB/NifB  31.58 
 
 		 309 aa  75.9  0.000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.84475  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1061  Radical SAM domain protein  27.87 
 
 		 343 aa  73.9  0.000000000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.8315700000000001e-19 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1640  radical SAM domain-containing protein  29.14 
 
 		 317 aa  73.2  0.00000000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1501  radical SAM domain-containing protein  34.62 
 
 		 341 aa  72  0.00000000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.166226  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0688  Radical SAM domain protein  29.26 
 
 		 336 aa  71.6  0.00000000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0930  radical SAM family protein  27.98 
 
 		 338 aa  71.6  0.00000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000118017  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1689  radical SAM domain-containing protein  23.18 
 
 		 357 aa  70.1  0.0000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0776794  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2238  Radical SAM domain protein  29.88 
 
 		 354 aa  70.1  0.0000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1719  radical SAM domain-containing protein  25.53 
 
 		 354 aa  69.3  0.0000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.219309  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3202  Radical SAM domain protein  27.23 
 
 		 342 aa  68.9  0.0000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00235958  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1971  radical SAM domain-containing protein  24.34 
 
 		 357 aa  68.2  0.0000000005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.144867  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0660  Radical SAM domain protein  26.73 
 
 		 359 aa  67.8  0.0000000007  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.142353  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2540  radical SAM domain-containing protein  30.77 
 
 		 340 aa  65.9  0.000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.093156 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0787  radical SAM domain-containing protein  25.42 
 
 		 317 aa  65.5  0.000000003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0997  hypothetical protein  25.47 
 
 		 368 aa  63.5  0.00000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.961706  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3632  hypothetical protein  32.73 
 
 		 317 aa  63.9  0.00000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.197622  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1177  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  28.24 
 
 		 372 aa  63.5  0.00000001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1944  Radical SAM domain protein  23.92 
 
 		 374 aa  62.8  0.00000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0450295  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1777  radical SAM domain-containing protein  30.37 
 
 		 352 aa  62.8  0.00000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.112435  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0347  putative radical SAM protein  26.26 
 
 		 293 aa  62.8  0.00000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3477  putative radical SAM protein  31.69 
 
 		 313 aa  61.6  0.00000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.143192  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1872  hypothetical protein  25 
 
 		 319 aa  60.8  0.00000007  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.22126  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0175  hypothetical protein  29.03 
 
 		 317 aa  60.8  0.00000008  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.46847  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0875  radical SAM domain-containing protein  26.7 
 
 		 359 aa  60.8  0.00000008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0835  coproporphyrinogen III oxidase  30.77 
 
 		 410 aa  60.5  0.0000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0697  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  28.77 
 
 		 410 aa  60.5  0.0000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.504316 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1335  hypothetical protein  27.22 
 
 		 328 aa  59.3  0.0000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0087579  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4343  putative radical SAM protein  30 
 
 		 312 aa  59.3  0.0000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.122173 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0858  hypothetical protein  28.76 
 
 		 317 aa  59.3  0.0000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.104064  normal  0.132523 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2108  coproporphyrinogen III oxidase  30.82 
 
 		 409 aa  58.5  0.0000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0760  putative radical SAM protein  23.67 
 
 		 304 aa  58.5  0.0000004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.992819  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2187  hypothetical protein  26.22 
 
 		 316 aa  57.4  0.0000008  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000345504 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2477  TPR domain/radical SAM/B12 binding domain-containing protein  32.73 
 
 		 864 aa  56.6  0.000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1263  coproporphyrinogen III oxidase  29.01 
 
 		 411 aa  57  0.000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.0206083 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0572  conserved hypothetical radical SAM protein  29.79 
 
 		 325 aa  55.8  0.000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1148  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  32.06 
 
 		 403 aa  55.8  0.000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.61254 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11650  coproporphyrinogen III oxidase, anaerobic  28.93 
 
 		 411 aa  55.5  0.000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0627344  normal  0.396756 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3655  putative radical SAM protein  26.74 
 
 		 328 aa  55.5  0.000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0760029 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2785  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  31.5 
 
 		 395 aa  55.1  0.000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.419951  normal  0.420525 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2882  radical SAM family protein  24.7 
 
 		 311 aa  55.1  0.000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2563  radical SAM family protein  24.7 
 
 		 311 aa  55.1  0.000004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0261  Radical SAM domain protein  23.3 
 
 		 564 aa  54.3  0.000006  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2183  putative radical SAM protein  24.74 
 
 		 351 aa  54.3  0.000007  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3255  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  31.09 
 
 		 403 aa  53.9  0.000009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00582345  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0531  putative radical SAM protein  27.67 
 
 		 329 aa  53.5  0.00001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.233315  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2819  conserved hypothetical radical SAM protein  28.47 
 
 		 372 aa  53.5  0.00001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0468  radical SAM family protein  27.67 
 
 		 307 aa  53.9  0.00001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1326  hypothetical protein  27.27 
 
 		 309 aa  52.8  0.00002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2022  hypothetical protein  28.97 
 
 		 338 aa  52.8  0.00002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3838  putative oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  31.09 
 
 		 407 aa  52.8  0.00002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.584028  hitchhiker  0.00877773 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2950  putative radical SAM protein  23.86 
 
 		 322 aa  52.8  0.00002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.474173  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0103  putative radical SAM protein  25.59 
 
 		 304 aa  52.8  0.00002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0139654 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3591  hypothetical protein  29.03 
 
 		 309 aa  52.8  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>