263 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cmaq_1318 on replicon NC_009954
Organism: Caldivirga maquilingensis IC-167



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009954  Cmaq_1318  ELP3 family histone acetyltransferase  100 
 
 
510 aa  1042    Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.340377 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1167  radical SAM domain-containing protein  63.31 
 
 
469 aa  588  1e-167  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.413437  normal  0.627812 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0122  radical SAM domain-containing protein  62.36 
 
 
483 aa  589  1e-167  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0088  radical SAM domain-containing protein  61.49 
 
 
477 aa  578  1e-164  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0202426 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1085  histone acetyltransferase, ELP3 family  48.71 
 
 
514 aa  459  9.999999999999999e-129  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.707697  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1460  histone acetyltransferase, ELP3 family  48.38 
 
 
473 aa  446  1.0000000000000001e-124  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1755  ELP3 family histone acetyltransferase  48.04 
 
 
547 aa  443  1e-123  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.668163  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0279  ELP3 family histone acetyltransferase  44.54 
 
 
563 aa  436  1e-121  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0824  ELP3 family histone acetyltransferase  44.86 
 
 
541 aa  427  1e-118  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.318054  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1093  ELP3 family histone acetyltransferase  45.38 
 
 
541 aa  428  1e-118  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.108771  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1989  ELP3 family histone acetyltransferase  46.57 
 
 
548 aa  422  1e-117  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0898  ELP3 family histone acetyltransferase  47.62 
 
 
512 aa  423  1e-117  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.589047  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1832  ELP3 family histone acetyltransferase  44.65 
 
 
541 aa  422  1e-117  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0889  ELP3 family histone acetyltransferase  44.73 
 
 
541 aa  421  1e-116  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2046  ELP3 family histone acetyltransferase  46.19 
 
 
530 aa  415  1e-114  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0579  ELP3 family histone acetyltransferase  42.62 
 
 
527 aa  409  1e-113  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0612  ELP3 family histone acetyltransferase  48.42 
 
 
459 aa  404  1e-111  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.125099  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_551  radical SAM superfamily  48.74 
 
 
459 aa  401  9.999999999999999e-111  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0398241  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0586  ELP3 family histone acetyltransferase  47.79 
 
 
459 aa  398  1e-109  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0000912711  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1304  hypothetical protein  44.49 
 
 
520 aa  390  1e-107  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_27329  predicted protein  45.34 
 
 
555 aa  389  1e-107  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.072078  hitchhiker  0.00552121 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1956  ELP3 family histone acetyltransferase  43.86 
 
 
526 aa  385  1e-105  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.724461 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2192  histone acetyltransferase, ELP3 family  42.26 
 
 
576 aa  371  1e-101  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2706  histone acetyltransferase, ELP3 family  41.63 
 
 
553 aa  371  1e-101  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_42410  predicted protein  43.31 
 
 
558 aa  372  1e-101  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1133  ELP3 family histone acetyltransferase  42.74 
 
 
522 aa  368  1e-100  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0872  histone acetyltransferase, ELP3 family  40.59 
 
 
556 aa  366  1e-100  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0952  histone acetyltransferase, ELP3 family  43.04 
 
 
526 aa  367  1e-100  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02294  histone acetyltransferase, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G06140)  42.37 
 
 
574 aa  365  1e-99  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_50848  predicted protein  43.43 
 
 
544 aa  365  1e-99  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.104715  n/a   
 
 
-
 
NC_006680  CNK00950  Pol II transcription elongation factor, putative  43.51 
 
 
557 aa  364  2e-99  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.110026  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2930  histone acetyltransferase, ELP3 family  40.76 
 
 
554 aa  355  8.999999999999999e-97  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.281817  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1480  histone acetyltransferase, ELP3 family  39.1 
 
 
585 aa  350  3e-95  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.761791  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08040  histone acetyltransferase  30.47 
 
 
598 aa  250  4e-65  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.584733  hitchhiker  0.0000000843356 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11040  histone acetyltransferase  33.8 
 
 
666 aa  187  4e-46  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.142131  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0906  Histone acetyltransferase  30.03 
 
 
617 aa  178  2e-43  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.301086  normal  0.526584 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2227  radical SAM domain-containing protein  31.77 
 
 
342 aa  112  1.0000000000000001e-23  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.775407  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3151  radical SAM domain-containing protein  31.23 
 
 
351 aa  108  2e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0207208  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2316  radical SAM family protein  29.96 
 
 
346 aa  107  7e-22  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1061  Radical SAM domain protein  31.73 
 
 
343 aa  104  3e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.8315700000000001e-19 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1971  radical SAM domain-containing protein  27.42 
 
 
357 aa  102  2e-20  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.144867  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0774  ELP3 component of the RNA polymerase II complex  29.29 
 
 
362 aa  102  2e-20  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00000160735  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3202  Radical SAM domain protein  30.63 
 
 
342 aa  101  3e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00235958  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1689  radical SAM domain-containing protein  27.09 
 
 
357 aa  101  4e-20  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0776794  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1404  radical SAM protein, putative histone acetyltransferase  30.04 
 
 
345 aa  96.7  9e-19  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.00000266579  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1160  Radical SAM domain protein  26.45 
 
 
341 aa  95.9  1e-18  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.276403  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1777  radical SAM domain-containing protein  27.88 
 
 
352 aa  96.3  1e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.112435  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1713  radical SAM domain-containing protein  31.55 
 
 
317 aa  95.1  3e-18  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0930  radical SAM family protein  24.72 
 
 
338 aa  93.6  8e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000118017  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1719  radical SAM domain-containing protein  25.93 
 
 
354 aa  92.4  2e-17  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.219309  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2238  Radical SAM domain protein  26.67 
 
 
354 aa  92.4  2e-17  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0804  putative radical SAM protein  25.08 
 
 
334 aa  90.5  6e-17  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.768446  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0688  Radical SAM domain protein  23.97 
 
 
336 aa  90.1  9e-17  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1640  radical SAM domain-containing protein  29.76 
 
 
317 aa  89  2e-16  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1501  radical SAM domain-containing protein  25.09 
 
 
341 aa  87.4  5e-16  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.166226  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2540  radical SAM domain-containing protein  28.31 
 
 
340 aa  86.7  9e-16  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.093156 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2187  hypothetical protein  33.77 
 
 
316 aa  83.2  0.000000000000009  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  unclonable  0.000000345504 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1944  Radical SAM domain protein  26.14 
 
 
374 aa  83.2  0.00000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0450295  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3477  putative radical SAM protein  27.68 
 
 
313 aa  82  0.00000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.143192  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1179  radical SAM domain-containing protein  23.79 
 
 
314 aa  82.4  0.00000000000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0182  Radical SAM domain protein  29.86 
 
 
401 aa  81.3  0.00000000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.534223  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0875  radical SAM domain-containing protein  25.1 
 
 
359 aa  80.5  0.00000000000008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0515  Elongator protein 3/MiaB/NifB  30.22 
 
 
309 aa  79  0.0000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.84475  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0038  conserved hypothetical radical SAM protein  24.86 
 
 
318 aa  78.2  0.0000000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0306  hypothetical protein  24.52 
 
 
309 aa  77.8  0.0000000000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.216797  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2960  Fe-S oxidoreductase  29.56 
 
 
306 aa  76.6  0.000000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.392137  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1179  radical SAM family protein  23.15 
 
 
332 aa  76.3  0.000000000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.808864  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0787  radical SAM domain-containing protein  26.8 
 
 
317 aa  75.9  0.000000000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0739  radical SAM family protein  22.6 
 
 
332 aa  75.5  0.000000000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.974352  normal  0.805342 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0300  hypothetical protein  25.44 
 
 
309 aa  75.5  0.000000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.558235  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3632  hypothetical protein  27.13 
 
 
317 aa  75.9  0.000000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.197622  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0082  radical SAM family protein  24.13 
 
 
332 aa  74.3  0.000000000004  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3655  putative radical SAM protein  23.68 
 
 
328 aa  74.7  0.000000000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0760029 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1562  Radical SAM domain protein  32.7 
 
 
401 aa  73.9  0.000000000006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3627  hypothetical protein  23.59 
 
 
309 aa  72.8  0.00000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.672413 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0260  conserved hypothetical radical SAM protein  28.39 
 
 
307 aa  72.8  0.00000000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3520  radical SAM protein, TIGR01212 family  23.59 
 
 
309 aa  72.8  0.00000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3689  hypothetical protein  24.26 
 
 
309 aa  73.2  0.00000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3591  hypothetical protein  24.26 
 
 
309 aa  73.2  0.00000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2819  conserved hypothetical radical SAM protein  26.92 
 
 
372 aa  72  0.00000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2183  putative radical SAM protein  30.51 
 
 
351 aa  72  0.00000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3522  radical SAM protein, TIGR01212 family  26.88 
 
 
309 aa  72  0.00000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.998452  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1872  hypothetical protein  28.57 
 
 
319 aa  71.6  0.00000000003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.22126  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4343  putative radical SAM protein  23.08 
 
 
312 aa  71.2  0.00000000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.122173 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1033  putative radical SAM protein  26.7 
 
 
330 aa  71.2  0.00000000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.247016  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0468  radical SAM family protein  22.12 
 
 
307 aa  70.5  0.00000000007  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0531  putative radical SAM protein  22.33 
 
 
329 aa  70.5  0.00000000007  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.233315  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1950  hypothetical protein  23.67 
 
 
316 aa  70.5  0.00000000007  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3168  conserved hypothetical radical SAM protein  26.71 
 
 
311 aa  70.1  0.00000000009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.000379648  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1293  putative radical SAM protein  24.56 
 
 
341 aa  70.1  0.00000000009  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3853  hypothetical protein  27.57 
 
 
311 aa  69.7  0.0000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000731814 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1127  radical SAM family protein  28.37 
 
 
327 aa  68.6  0.0000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2936  hypothetical protein  22.61 
 
 
319 aa  68.9  0.0000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.971153  hitchhiker  0.00000000000000717489 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3163  hypothetical protein  29.59 
 
 
310 aa  68.9  0.0000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.096251  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1736  hypothetical protein  26.7 
 
 
317 aa  68.6  0.0000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3769  conserved hypothetical radical SAM protein  28.66 
 
 
321 aa  68.6  0.0000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3559  radical SAM protein, TIGR01212 family  22.49 
 
 
309 aa  68.6  0.0000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0660  Radical SAM domain protein  21.93 
 
 
359 aa  68.2  0.0000000003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.142353  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2966  Radical SAM domain protein  29.03 
 
 
344 aa  68.2  0.0000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0294152  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3790  hypothetical protein  24.52 
 
 
314 aa  68.6  0.0000000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0994894  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>