More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cthe_0930 on replicon NC_009012
Organism: Clostridium thermocellum ATCC 27405



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009012  Cthe_0930  radical SAM family protein  100 
 
 		 338 aa  683    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000118017  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0688  Radical SAM domain protein  60.37 
 
 		 336 aa  407  1.0000000000000001e-112  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1719  radical SAM domain-containing protein  51.26 
 
 		 354 aa  339  4e-92  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.219309  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0774  ELP3 component of the RNA polymerase II complex  48.15 
 
 		 362 aa  325  6e-88  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00000160735  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0660  Radical SAM domain protein  49.69 
 
 		 359 aa  301  1e-80  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.142353  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1689  radical SAM domain-containing protein  46.65 
 
 		 357 aa  286  5e-76  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0776794  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1971  radical SAM domain-containing protein  46.04 
 
 		 357 aa  285  7e-76  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.144867  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1160  Radical SAM domain protein  44.37 
 
 		 341 aa  280  3e-74  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.276403  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2316  radical SAM family protein  42.09 
 
 		 346 aa  276  5e-73  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1061  Radical SAM domain protein  39.75 
 
 		 343 aa  272  5.000000000000001e-72  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.8315700000000001e-19 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1501  radical SAM domain-containing protein  37.65 
 
 		 341 aa  266  2.9999999999999995e-70  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.166226  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3202  Radical SAM domain protein  39.88 
 
 		 342 aa  266  4e-70  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00235958  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2227  radical SAM domain-containing protein  39.43 
 
 		 342 aa  263  2e-69  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.775407  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3151  radical SAM domain-containing protein  40.25 
 
 		 351 aa  254  1.0000000000000001e-66  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0207208  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1404  radical SAM protein, putative histone acetyltransferase  38.87 
 
 		 345 aa  250  3e-65  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.00000266579  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1944  Radical SAM domain protein  36.34 
 
 		 374 aa  238  2e-61  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0450295  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0875  radical SAM domain-containing protein  38.41 
 
 		 359 aa  236  5.0000000000000005e-61  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1777  radical SAM domain-containing protein  36.33 
 
 		 352 aa  226  3e-58  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.112435  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1179  radical SAM domain-containing protein  39.57 
 
 		 314 aa  208  1e-52  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1713  radical SAM domain-containing protein  42.07 
 
 		 317 aa  207  2e-52  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1640  radical SAM domain-containing protein  42.65 
 
 		 317 aa  204  2e-51  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2238  Radical SAM domain protein  33.44 
 
 		 354 aa  194  2e-48  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0787  radical SAM domain-containing protein  39.26 
 
 		 317 aa  193  3e-48  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2966  Radical SAM domain protein  31.83 
 
 		 344 aa  164  2.0000000000000002e-39  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0294152  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0182  Radical SAM domain protein  27.67 
 
 		 401 aa  163  4.0000000000000004e-39  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.534223  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1562  Radical SAM domain protein  30.03 
 
 		 401 aa  162  7e-39  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2540  radical SAM domain-containing protein  30.74 
 
 		 340 aa  150  4e-35  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.093156 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0515  Elongator protein 3/MiaB/NifB  31.25 
 
 		 309 aa  146  6e-34  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.84475  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1085  histone acetyltransferase, ELP3 family  39.35 
 
 		 514 aa  106  5e-22  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.707697  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0898  ELP3 family histone acetyltransferase  36.94 
 
 		 512 aa  100  4e-20  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.589047  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1293  putative radical SAM protein  31.67 
 
 		 341 aa  98.2  2e-19  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1755  ELP3 family histone acetyltransferase  32.57 
 
 		 547 aa  96.7  5e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.668163  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1167  radical SAM domain-containing protein  24.39 
 
 		 469 aa  96.3  7e-19  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.413437  normal  0.627812 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2046  ELP3 family histone acetyltransferase  33.15 
 
 		 530 aa  95.9  8e-19  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1133  ELP3 family histone acetyltransferase  30.69 
 
 		 522 aa  95.1  1e-18  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0952  histone acetyltransferase, ELP3 family  31.92 
 
 		 526 aa  95.5  1e-18  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0122  radical SAM domain-containing protein  27.22 
 
 		 483 aa  95.1  1e-18  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0872  histone acetyltransferase, ELP3 family  30.05 
 
 		 556 aa  94.4  3e-18  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1318  ELP3 family histone acetyltransferase  24.72 
 
 		 510 aa  93.6  4e-18  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.340377 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0579  ELP3 family histone acetyltransferase  27.6 
 
 		 527 aa  93.2  6e-18  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1179  radical SAM family protein  31.08 
 
 		 332 aa  92.8  7e-18  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.808864  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1989  ELP3 family histone acetyltransferase  36.88 
 
 		 548 aa  92  1e-17  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2706  histone acetyltransferase, ELP3 family  29.17 
 
 		 553 aa  92  1e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0279  ELP3 family histone acetyltransferase  31.52 
 
 		 563 aa  92.4  1e-17  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1460  histone acetyltransferase, ELP3 family  26.91 
 
 		 473 aa  91.3  2e-17  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1093  ELP3 family histone acetyltransferase  31.52 
 
 		 541 aa  91.7  2e-17  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.108771  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2192  histone acetyltransferase, ELP3 family  33.33 
 
 		 576 aa  90.9  3e-17  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0739  radical SAM family protein  31.22 
 
 		 332 aa  90.5  3e-17  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.974352  normal  0.805342 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0082  radical SAM family protein  30.32 
 
 		 332 aa  90.1  5e-17  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0088  radical SAM domain-containing protein  29.46 
 
 		 477 aa  89.7  6e-17  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0202426 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0824  ELP3 family histone acetyltransferase  30.98 
 
 		 541 aa  89  1e-16  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.318054  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0804  putative radical SAM protein  29.86 
 
 		 334 aa  87.8  2e-16  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.768446  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1832  ELP3 family histone acetyltransferase  30.98 
 
 		 541 aa  88.6  2e-16  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1956  ELP3 family histone acetyltransferase  30.46 
 
 		 526 aa  87.4  3e-16  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.724461 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1480  histone acetyltransferase, ELP3 family  27.35 
 
 		 585 aa  86.3  7e-16  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.761791  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2936  hypothetical protein  31.76 
 
 		 319 aa  85.5  0.000000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.971153  hitchhiker  0.00000000000000717489 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0889  ELP3 family histone acetyltransferase  33.33 
 
 		 541 aa  85.1  0.000000000000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_551  radical SAM superfamily  28.7 
 
 		 459 aa  84.7  0.000000000000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0398241  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08040  histone acetyltransferase  30.92 
 
 		 598 aa  85.1  0.000000000000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.584733  hitchhiker  0.0000000843356 
 
 
-
 
NC_002936  DET0612  ELP3 family histone acetyltransferase  31.43 
 
 		 459 aa  84  0.000000000000003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.125099  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0586  ELP3 family histone acetyltransferase  28.7 
 
 		 459 aa  84.3  0.000000000000003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0000912711  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0586  radical SAM family protein  27.83 
 
 		 319 aa  83.2  0.000000000000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2960  Fe-S oxidoreductase  34.53 
 
 		 306 aa  82.4  0.000000000000009  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.392137  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2930  histone acetyltransferase, ELP3 family  32.91 
 
 		 554 aa  82.4  0.000000000000009  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.281817  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3477  putative radical SAM protein  25.7 
 
 		 313 aa  81.3  0.00000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.143192  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1304  hypothetical protein  30.34 
 
 		 520 aa  81.3  0.00000000000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0260  conserved hypothetical radical SAM protein  26.72 
 
 		 307 aa  81.6  0.00000000000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0572  conserved hypothetical radical SAM protein  35.88 
 
 		 325 aa  79.3  0.00000000000008  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2881  coproporphyrinogen III oxidase  25.75 
 
 		 494 aa  78.2  0.0000000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.969668  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1335  hypothetical protein  24.43 
 
 		 328 aa  77.8  0.0000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0087579  n/a   
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_50848  predicted protein  33.76 
 
 		 544 aa  76.6  0.0000000000005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.104715  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3163  hypothetical protein  35 
 
 		 310 aa  76.6  0.0000000000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.096251  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1358  putative radical SAM protein  29.75 
 
 		 318 aa  76.6  0.0000000000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.161503  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1736  hypothetical protein  29.45 
 
 		 317 aa  77  0.0000000000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_42410  predicted protein  31.37 
 
 		 558 aa  76.6  0.0000000000006  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0422  putative radical SAM protein  29.41 
 
 		 303 aa  76.3  0.0000000000007  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0407  putative radical SAM protein  29.22 
 
 		 303 aa  76.3  0.0000000000007  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.145155  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0103  putative radical SAM protein  27.71 
 
 		 304 aa  76.3  0.0000000000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0139654 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3661  putative radical SAM protein  29.93 
 
 		 319 aa  76.3  0.0000000000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02294  histone acetyltransferase, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G06140)  33.8 
 
 		 574 aa  75.1  0.000000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0468  radical SAM family protein  27.97 
 
 		 307 aa  75.1  0.000000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0531  putative radical SAM protein  27.97 
 
 		 329 aa  75.1  0.000000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.233315  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2952  putative radical SAM protein  28.97 
 
 		 309 aa  73.9  0.000000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.432245  normal  0.157754 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3632  hypothetical protein  26.9 
 
 		 317 aa  73.9  0.000000000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.197622  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03076  predicted Fe-S oxidoreductase  26.21 
 
 		 309 aa  73.2  0.000000000005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.709944  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0496  conserved hypothetical protein  26.21 
 
 		 309 aa  73.2  0.000000000005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3699  radical SAM family protein  26.21 
 
 		 309 aa  73.2  0.000000000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3377  coproporphyrinogen III oxidase  26.48 
 
 		 509 aa  73.6  0.000000000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4534  radical SAM protein, TIGR01212 family  26.21 
 
 		 309 aa  73.2  0.000000000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006680  CNK00950  Pol II transcription elongation factor, putative  25.65 
 
 		 557 aa  73.6  0.000000000005  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.110026  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03027  hypothetical protein  26.21 
 
 		 309 aa  73.2  0.000000000005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.828625  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3404  radical SAM family protein  26.21 
 
 		 309 aa  73.2  0.000000000005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0489  putative radical SAM protein  26.21 
 
 		 320 aa  73.6  0.000000000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.577174 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1156  putative radical SAM protein  28.78 
 
 		 307 aa  73.6  0.000000000005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0308267  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3655  putative radical SAM protein  26.21 
 
 		 328 aa  73.2  0.000000000006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0760029 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3507  radical SAM family protein  26.21 
 
 		 309 aa  72.8  0.000000000007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1565  putative radical SAM protein  33.09 
 
 		 300 aa  72.8  0.000000000008  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.705687  n/a   
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_27329  predicted protein  31.69 
 
 		 555 aa  72.8  0.000000000008  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.072078  hitchhiker  0.00552121 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2563  radical SAM family protein  26.57 
 
 		 311 aa  72.8  0.000000000008  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0306  hypothetical protein  26.9 
 
 		 309 aa  72.8  0.000000000008  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.216797  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>