161 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mhun_1133 on replicon NC_007796
Organism: Methanospirillum hungatei JF-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011832  Mpal_0952  histone acetyltransferase, ELP3 family  66.48 
 
 
526 aa  695    Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1133  ELP3 family histone acetyltransferase  100 
 
 
522 aa  1079    Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1304  hypothetical protein  64.47 
 
 
520 aa  683    Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2046  ELP3 family histone acetyltransferase  65.26 
 
 
530 aa  652    Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1956  ELP3 family histone acetyltransferase  65.9 
 
 
526 aa  671    Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.724461 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1755  ELP3 family histone acetyltransferase  51.02 
 
 
547 aa  555  1e-157  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.668163  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1989  ELP3 family histone acetyltransferase  50.47 
 
 
548 aa  540  9.999999999999999e-153  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0898  ELP3 family histone acetyltransferase  52.12 
 
 
512 aa  509  1e-143  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.589047  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2930  histone acetyltransferase, ELP3 family  50.74 
 
 
554 aa  508  9.999999999999999e-143  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.281817  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0872  histone acetyltransferase, ELP3 family  48.32 
 
 
556 aa  503  1e-141  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2706  histone acetyltransferase, ELP3 family  49.44 
 
 
553 aa  503  1e-141  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2192  histone acetyltransferase, ELP3 family  49.63 
 
 
576 aa  499  1e-140  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1480  histone acetyltransferase, ELP3 family  46.74 
 
 
585 aa  462  1e-129  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.761791  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1085  histone acetyltransferase, ELP3 family  46.43 
 
 
514 aa  442  1e-123  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.707697  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0279  ELP3 family histone acetyltransferase  45.63 
 
 
563 aa  434  1e-120  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1093  ELP3 family histone acetyltransferase  44.99 
 
 
541 aa  430  1e-119  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.108771  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1832  ELP3 family histone acetyltransferase  45.19 
 
 
541 aa  427  1e-118  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0824  ELP3 family histone acetyltransferase  44.99 
 
 
541 aa  427  1e-118  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.318054  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0889  ELP3 family histone acetyltransferase  44.74 
 
 
541 aa  424  1e-117  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0579  ELP3 family histone acetyltransferase  41.18 
 
 
527 aa  412  1e-114  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1460  histone acetyltransferase, ELP3 family  44.09 
 
 
473 aa  390  1e-107  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0612  ELP3 family histone acetyltransferase  45.51 
 
 
459 aa  373  1e-102  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.125099  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_551  radical SAM superfamily  45.94 
 
 
459 aa  370  1e-101  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0398241  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0586  ELP3 family histone acetyltransferase  45.3 
 
 
459 aa  365  1e-100  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0000912711  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1318  ELP3 family histone acetyltransferase  42.74 
 
 
510 aa  368  1e-100  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.340377 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_42410  predicted protein  40.46 
 
 
558 aa  359  9e-98  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_50848  predicted protein  39.23 
 
 
544 aa  352  1e-95  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.104715  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0122  radical SAM domain-containing protein  41.14 
 
 
483 aa  349  6e-95  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02294  histone acetyltransferase, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G06140)  39.6 
 
 
574 aa  347  3e-94  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006680  CNK00950  Pol II transcription elongation factor, putative  39.67 
 
 
557 aa  345  1e-93  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.110026  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0088  radical SAM domain-containing protein  41.45 
 
 
477 aa  342  7e-93  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0202426 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1167  radical SAM domain-containing protein  41.79 
 
 
469 aa  338  9.999999999999999e-92  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.413437  normal  0.627812 
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_27329  predicted protein  38.58 
 
 
555 aa  337  2.9999999999999997e-91  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.072078  hitchhiker  0.00552121 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08040  histone acetyltransferase  32.28 
 
 
598 aa  274  3e-72  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.584733  hitchhiker  0.0000000843356 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0906  Histone acetyltransferase  31.86 
 
 
617 aa  262  1e-68  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.301086  normal  0.526584 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11040  histone acetyltransferase  35.41 
 
 
666 aa  210  6e-53  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.142131  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3151  radical SAM domain-containing protein  33.91 
 
 
351 aa  108  3e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0207208  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1404  radical SAM protein, putative histone acetyltransferase  33.68 
 
 
345 aa  105  2e-21  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.00000266579  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2227  radical SAM domain-containing protein  33.97 
 
 
342 aa  104  5e-21  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.775407  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1061  Radical SAM domain protein  30.08 
 
 
343 aa  101  3e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.8315700000000001e-19 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2316  radical SAM family protein  32.1 
 
 
346 aa  99.4  1e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0774  ELP3 component of the RNA polymerase II complex  28 
 
 
362 aa  97.4  5e-19  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00000160735  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0930  radical SAM family protein  30.69 
 
 
338 aa  95.1  2e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000118017  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3202  Radical SAM domain protein  30.47 
 
 
342 aa  95.1  3e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00235958  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0688  Radical SAM domain protein  27.62 
 
 
336 aa  87.8  4e-16  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1689  radical SAM domain-containing protein  25.67 
 
 
357 aa  87  7e-16  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0776794  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0515  Elongator protein 3/MiaB/NifB  25.81 
 
 
309 aa  84.3  0.000000000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.84475  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1971  radical SAM domain-containing protein  25.67 
 
 
357 aa  84  0.000000000000006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.144867  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0660  Radical SAM domain protein  27.87 
 
 
359 aa  82.4  0.00000000000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.142353  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2966  Radical SAM domain protein  29.15 
 
 
344 aa  81.6  0.00000000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0294152  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0182  Radical SAM domain protein  28.21 
 
 
401 aa  81.6  0.00000000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.534223  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1501  radical SAM domain-containing protein  37.01 
 
 
341 aa  82  0.00000000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.166226  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1179  radical SAM domain-containing protein  26.32 
 
 
314 aa  80.9  0.00000000000005  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1562  Radical SAM domain protein  31 
 
 
401 aa  80.5  0.00000000000006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2238  Radical SAM domain protein  26.02 
 
 
354 aa  80.9  0.00000000000006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1719  radical SAM domain-containing protein  31.34 
 
 
354 aa  80.5  0.00000000000007  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.219309  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0787  radical SAM domain-containing protein  28.25 
 
 
317 aa  79.3  0.0000000000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1944  Radical SAM domain protein  35.34 
 
 
374 aa  79.7  0.0000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0450295  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0875  radical SAM domain-containing protein  29.19 
 
 
359 aa  75.9  0.000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2540  radical SAM domain-containing protein  38.17 
 
 
340 aa  75.1  0.000000000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.093156 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1160  Radical SAM domain protein  29.83 
 
 
341 aa  72.4  0.00000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.276403  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1293  putative radical SAM protein  29.17 
 
 
341 aa  70.1  0.00000000009  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0082  radical SAM family protein  29.61 
 
 
332 aa  69.7  0.0000000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1777  radical SAM domain-containing protein  32.52 
 
 
352 aa  68.2  0.0000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.112435  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0739  radical SAM family protein  29.55 
 
 
332 aa  68.2  0.0000000004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.974352  normal  0.805342 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1179  radical SAM family protein  28.49 
 
 
332 aa  67.4  0.0000000007  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.808864  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1713  radical SAM domain-containing protein  28.15 
 
 
317 aa  67.4  0.0000000007  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0804  putative radical SAM protein  28.25 
 
 
334 aa  66.6  0.000000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.768446  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2960  Fe-S oxidoreductase  29.76 
 
 
306 aa  65.5  0.000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.392137  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1640  radical SAM domain-containing protein  25.9 
 
 
317 aa  65.5  0.000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0754  Radical SAM domain protein  27.41 
 
 
319 aa  64.7  0.000000004  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.00145958  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0664  hypothetical protein  25.74 
 
 
318 aa  62  0.00000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.08613e-26 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2936  hypothetical protein  25.25 
 
 
319 aa  61.2  0.00000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.971153  hitchhiker  0.00000000000000717489 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1335  hypothetical protein  24.4 
 
 
328 aa  59.3  0.0000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0087579  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0651  conserved hypothetical radical SAM protein  25.51 
 
 
318 aa  59.3  0.0000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0572  conserved hypothetical radical SAM protein  23.3 
 
 
325 aa  58.2  0.0000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0367  radical SAM family protein  28.83 
 
 
305 aa  57  0.0000008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0395363  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0760  putative radical SAM protein  24.47 
 
 
304 aa  57  0.0000009  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.992819  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1170  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  30.47 
 
 
369 aa  56.6  0.000001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1177  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  27.07 
 
 
372 aa  56.6  0.000001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3163  hypothetical protein  27.53 
 
 
310 aa  56.2  0.000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.096251  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2063  coproporphyrinogen III oxidase  28.15 
 
 
384 aa  55.5  0.000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0630  coproporphyrinogen III oxidase  27.56 
 
 
393 aa  56.2  0.000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.824124  normal  0.0911038 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3661  putative radical SAM protein  27.22 
 
 
319 aa  55.8  0.000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2022  hypothetical protein  29.67 
 
 
338 aa  55.1  0.000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3023  radical SAM domain-containing protein  29.29 
 
 
386 aa  55.1  0.000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2205  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  28.33 
 
 
484 aa  54.7  0.000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.434843  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2374  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  32.17 
 
 
448 aa  53.9  0.000006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2819  conserved hypothetical radical SAM protein  26.53 
 
 
372 aa  53.9  0.000008  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0319  putative oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  32.52 
 
 
497 aa  53.9  0.000008  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.470107  normal  0.297438 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1360  putative oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  31.5 
 
 
371 aa  53.5  0.000009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.716239  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3168  conserved hypothetical radical SAM protein  28.21 
 
 
311 aa  53.5  0.000009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.000379648  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0603  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  26.88 
 
 
378 aa  52.8  0.00001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4117  hypothetical protein  26.15 
 
 
334 aa  53.5  0.00001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1363  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  25.75 
 
 
389 aa  53.1  0.00001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07700  putative oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  26.38 
 
 
368 aa  52.8  0.00001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.7688 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0347  putative radical SAM protein  20.75 
 
 
293 aa  52  0.00002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0455  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  27.46 
 
 
391 aa  52.8  0.00002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.664559  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0586  radical SAM family protein  23.96 
 
 
319 aa  52  0.00003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1736  hypothetical protein  22.03 
 
 
317 aa  51.6  0.00004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>