More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccel_0688 on replicon NC_011898
Organism: Clostridium cellulolyticum H10



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011898  Ccel_0688  Radical SAM domain protein  100 
 
 		 336 aa  689    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0930  radical SAM family protein  60.37 
 
 		 338 aa  407  1.0000000000000001e-112  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000118017  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1719  radical SAM domain-containing protein  49.1 
 
 		 354 aa  323  2e-87  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.219309  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1971  radical SAM domain-containing protein  44.13 
 
 		 357 aa  294  2e-78  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.144867  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1689  radical SAM domain-containing protein  44.41 
 
 		 357 aa  293  2e-78  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0776794  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0774  ELP3 component of the RNA polymerase II complex  46.15 
 
 		 362 aa  293  4e-78  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00000160735  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1160  Radical SAM domain protein  43.3 
 
 		 341 aa  274  1.0000000000000001e-72  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.276403  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1501  radical SAM domain-containing protein  38.77 
 
 		 341 aa  266  5e-70  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.166226  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3151  radical SAM domain-containing protein  40.72 
 
 		 351 aa  258  1e-67  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0207208  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2316  radical SAM family protein  38.79 
 
 		 346 aa  255  6e-67  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1061  Radical SAM domain protein  37.07 
 
 		 343 aa  254  2.0000000000000002e-66  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.8315700000000001e-19 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0660  Radical SAM domain protein  46.13 
 
 		 359 aa  254  2.0000000000000002e-66  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.142353  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3202  Radical SAM domain protein  37.5 
 
 		 342 aa  244  9.999999999999999e-64  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00235958  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2227  radical SAM domain-containing protein  37.5 
 
 		 342 aa  240  2.9999999999999997e-62  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.775407  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1944  Radical SAM domain protein  38.61 
 
 		 374 aa  226  3e-58  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0450295  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1404  radical SAM protein, putative histone acetyltransferase  38.66 
 
 		 345 aa  223  3e-57  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.00000266579  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1777  radical SAM domain-containing protein  36.98 
 
 		 352 aa  214  9.999999999999999e-55  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.112435  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0875  radical SAM domain-containing protein  34.12 
 
 		 359 aa  207  2e-52  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1179  radical SAM domain-containing protein  39.42 
 
 		 314 aa  199  7.999999999999999e-50  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1713  radical SAM domain-containing protein  41.57 
 
 		 317 aa  195  1e-48  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1640  radical SAM domain-containing protein  36.84 
 
 		 317 aa  191  2e-47  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2238  Radical SAM domain protein  36.13 
 
 		 354 aa  183  4.0000000000000006e-45  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0787  radical SAM domain-containing protein  37.5 
 
 		 317 aa  177  2e-43  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0515  Elongator protein 3/MiaB/NifB  32.53 
 
 		 309 aa  158  1e-37  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.84475  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0182  Radical SAM domain protein  26.79 
 
 		 401 aa  155  8e-37  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.534223  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2540  radical SAM domain-containing protein  34.83 
 
 		 340 aa  153  5e-36  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.093156 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1562  Radical SAM domain protein  30.69 
 
 		 401 aa  152  1e-35  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2966  Radical SAM domain protein  32.37 
 
 		 344 aa  151  2e-35  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0294152  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1085  histone acetyltransferase, ELP3 family  29.62 
 
 		 514 aa  107  4e-22  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.707697  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0579  ELP3 family histone acetyltransferase  31.06 
 
 		 527 aa  105  1e-21  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1460  histone acetyltransferase, ELP3 family  26.47 
 
 		 473 aa  104  3e-21  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0122  radical SAM domain-containing protein  26.38 
 
 		 483 aa  100  3e-20  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1755  ELP3 family histone acetyltransferase  28.92 
 
 		 547 aa  99.4  9e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.668163  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1565  putative radical SAM protein  30.87 
 
 		 300 aa  96.7  5e-19  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.705687  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0872  histone acetyltransferase, ELP3 family  25.49 
 
 		 556 aa  95.9  9e-19  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2706  histone acetyltransferase, ELP3 family  24.31 
 
 		 553 aa  95.5  1e-18  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1293  putative radical SAM protein  31.98 
 
 		 341 aa  94  3e-18  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0898  ELP3 family histone acetyltransferase  31.67 
 
 		 512 aa  94.4  3e-18  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.589047  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1167  radical SAM domain-containing protein  25.25 
 
 		 469 aa  94  3e-18  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.413437  normal  0.627812 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0088  radical SAM domain-containing protein  26.17 
 
 		 477 aa  93.2  5e-18  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0202426 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1832  ELP3 family histone acetyltransferase  30.46 
 
 		 541 aa  92  1e-17  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1480  histone acetyltransferase, ELP3 family  26.77 
 
 		 585 aa  92  1e-17  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.761791  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0824  ELP3 family histone acetyltransferase  29.95 
 
 		 541 aa  91.3  2e-17  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.318054  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2192  histone acetyltransferase, ELP3 family  23.78 
 
 		 576 aa  90.1  5e-17  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1318  ELP3 family histone acetyltransferase  23.97 
 
 		 510 aa  90.1  5e-17  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.340377 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1989  ELP3 family histone acetyltransferase  27.71 
 
 		 548 aa  89.7  6e-17  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1093  ELP3 family histone acetyltransferase  29.95 
 
 		 541 aa  89.7  6e-17  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.108771  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0952  histone acetyltransferase, ELP3 family  30.33 
 
 		 526 aa  88.6  1e-16  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1133  ELP3 family histone acetyltransferase  27.62 
 
 		 522 aa  87.8  2e-16  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0572  conserved hypothetical radical SAM protein  29.41 
 
 		 325 aa  87.4  3e-16  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2046  ELP3 family histone acetyltransferase  26.23 
 
 		 530 aa  87  4e-16  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0586  ELP3 family histone acetyltransferase  26.03 
 
 		 459 aa  86.7  5e-16  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0000912711  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0422  putative radical SAM protein  32.17 
 
 		 303 aa  86.7  5e-16  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0407  putative radical SAM protein  32.17 
 
 		 303 aa  86.7  5e-16  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.145155  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2936  hypothetical protein  35.57 
 
 		 319 aa  85.9  9e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.971153  hitchhiker  0.00000000000000717489 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2930  histone acetyltransferase, ELP3 family  25.84 
 
 		 554 aa  85.9  9e-16  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.281817  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_551  radical SAM superfamily  26.45 
 
 		 459 aa  85.9  0.000000000000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0398241  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1179  radical SAM family protein  30.22 
 
 		 332 aa  85.1  0.000000000000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.808864  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0260  conserved hypothetical radical SAM protein  25.75 
 
 		 307 aa  84.3  0.000000000000003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0739  radical SAM family protein  30.22 
 
 		 332 aa  83.2  0.000000000000006  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.974352  normal  0.805342 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3477  putative radical SAM protein  25.75 
 
 		 313 aa  83.2  0.000000000000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.143192  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1956  ELP3 family histone acetyltransferase  30.53 
 
 		 526 aa  82.8  0.000000000000007  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.724461 
 
 
-
 
NC_002936  DET0612  ELP3 family histone acetyltransferase  26.45 
 
 		 459 aa  82.8  0.000000000000009  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.125099  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1736  hypothetical protein  27.62 
 
 		 317 aa  82.4  0.00000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02294  histone acetyltransferase, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G06140)  35.92 
 
 		 574 aa  81.3  0.00000000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0279  ELP3 family histone acetyltransferase  29.77 
 
 		 563 aa  81.6  0.00000000000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_50848  predicted protein  34.78 
 
 		 544 aa  81.3  0.00000000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.104715  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3661  putative radical SAM protein  34.04 
 
 		 319 aa  81.6  0.00000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0347  putative radical SAM protein  30.67 
 
 		 293 aa  81.6  0.00000000000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0804  putative radical SAM protein  29.57 
 
 		 334 aa  80.9  0.00000000000003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.768446  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0082  radical SAM family protein  28.44 
 
 		 332 aa  80.5  0.00000000000004  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0889  ELP3 family histone acetyltransferase  27.17 
 
 		 541 aa  79.7  0.00000000000006  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1358  putative radical SAM protein  29.75 
 
 		 318 aa  79.3  0.00000000000009  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.161503  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0586  radical SAM family protein  32.89 
 
 		 319 aa  78.2  0.0000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2960  Fe-S oxidoreductase  33.58 
 
 		 306 aa  78.2  0.0000000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.392137  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_42410  predicted protein  32.21 
 
 		 558 aa  77.8  0.0000000000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006680  CNK00950  Pol II transcription elongation factor, putative  33.1 
 
 		 557 aa  77.4  0.0000000000003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.110026  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3163  hypothetical protein  32.05 
 
 		 310 aa  77.4  0.0000000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.096251  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2952  putative radical SAM protein  27.78 
 
 		 309 aa  77  0.0000000000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.432245  normal  0.157754 
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_27329  predicted protein  29.17 
 
 		 555 aa  77  0.0000000000005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.072078  hitchhiker  0.00552121 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2203  hypothetical protein  27.42 
 
 		 314 aa  76.6  0.0000000000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4343  putative radical SAM protein  30.46 
 
 		 312 aa  76.6  0.0000000000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.122173 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1033  putative radical SAM protein  26.42 
 
 		 330 aa  76.3  0.0000000000007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.247016  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1137  putative radical SAM protein  25.93 
 
 		 309 aa  76.3  0.0000000000008  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00496914  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0664  hypothetical protein  31.65 
 
 		 318 aa  75.9  0.0000000000009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.08613e-26 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1418  conserved hypothetical radical SAM protein  32.37 
 
 		 312 aa  75.9  0.0000000000009  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08040  histone acetyltransferase  30.98 
 
 		 598 aa  75.5  0.000000000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.584733  hitchhiker  0.0000000843356 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2870  putative radical SAM protein  26.51 
 
 		 309 aa  75.5  0.000000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00453128  normal  0.0632795 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0651  conserved hypothetical radical SAM protein  30.99 
 
 		 318 aa  75.1  0.000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0531  putative radical SAM protein  29.63 
 
 		 329 aa  74.3  0.000000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.233315  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0468  radical SAM family protein  29.63 
 
 		 307 aa  74.7  0.000000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3134  hypothetical protein  26.39 
 
 		 309 aa  75.1  0.000000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000932261  normal  0.614838 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3790  hypothetical protein  30.37 
 
 		 314 aa  73.9  0.000000000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0994894  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2882  radical SAM family protein  28.29 
 
 		 311 aa  73.9  0.000000000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2563  radical SAM family protein  28.29 
 
 		 311 aa  73.9  0.000000000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3048  putative radical SAM protein  26.85 
 
 		 309 aa  74.3  0.000000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0315161  normal  0.32107 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1304  hypothetical protein  25.63 
 
 		 520 aa  73.9  0.000000000003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3632  hypothetical protein  28.89 
 
 		 317 aa  73.9  0.000000000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.197622  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1179  putative radical SAM protein  25.93 
 
 		 309 aa  73.6  0.000000000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3522  radical SAM protein, TIGR01212 family  23.22 
 
 		 309 aa  73.6  0.000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.998452  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>