More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aboo_1085 on replicon NC_013926
Organism: Aciduliprofundum boonei T469



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013926  Aboo_1085  histone acetyltransferase, ELP3 family  100 
 
 
514 aa  1058    Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.707697  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0279  ELP3 family histone acetyltransferase  52.05 
 
 
563 aa  542  1e-153  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1093  ELP3 family histone acetyltransferase  50.98 
 
 
541 aa  527  1e-148  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.108771  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0824  ELP3 family histone acetyltransferase  50.78 
 
 
541 aa  527  1e-148  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.318054  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1832  ELP3 family histone acetyltransferase  50.59 
 
 
541 aa  525  1e-147  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0889  ELP3 family histone acetyltransferase  50 
 
 
541 aa  517  1.0000000000000001e-145  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0898  ELP3 family histone acetyltransferase  49.14 
 
 
512 aa  499  1e-140  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.589047  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0579  ELP3 family histone acetyltransferase  46.61 
 
 
527 aa  493  9.999999999999999e-139  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1755  ELP3 family histone acetyltransferase  46.77 
 
 
547 aa  492  9.999999999999999e-139  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.668163  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1989  ELP3 family histone acetyltransferase  47.35 
 
 
548 aa  491  1e-137  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1460  histone acetyltransferase, ELP3 family  50.32 
 
 
473 aa  487  1e-136  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_42410  predicted protein  46.32 
 
 
558 aa  483  1e-135  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2192  histone acetyltransferase, ELP3 family  46.79 
 
 
576 aa  476  1e-133  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_50848  predicted protein  43.44 
 
 
544 aa  473  1e-132  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.104715  n/a   
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_27329  predicted protein  42.59 
 
 
555 aa  473  1e-132  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.072078  hitchhiker  0.00552121 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0872  histone acetyltransferase, ELP3 family  46.31 
 
 
556 aa  469  1.0000000000000001e-131  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2706  histone acetyltransferase, ELP3 family  45.72 
 
 
553 aa  469  1.0000000000000001e-131  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2046  ELP3 family histone acetyltransferase  47.31 
 
 
530 aa  469  1.0000000000000001e-131  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2930  histone acetyltransferase, ELP3 family  44.53 
 
 
554 aa  467  9.999999999999999e-131  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.281817  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1318  ELP3 family histone acetyltransferase  48.71 
 
 
510 aa  459  9.999999999999999e-129  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.340377 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1480  histone acetyltransferase, ELP3 family  45.2 
 
 
585 aa  460  9.999999999999999e-129  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.761791  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1304  hypothetical protein  46.63 
 
 
520 aa  452  1.0000000000000001e-126  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02294  histone acetyltransferase, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G06140)  43.75 
 
 
574 aa  450  1e-125  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006680  CNK00950  Pol II transcription elongation factor, putative  43.39 
 
 
557 aa  446  1.0000000000000001e-124  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.110026  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0612  ELP3 family histone acetyltransferase  48.5 
 
 
459 aa  442  1e-123  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.125099  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1133  ELP3 family histone acetyltransferase  46.43 
 
 
522 aa  442  1e-123  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0952  histone acetyltransferase, ELP3 family  44.84 
 
 
526 aa  443  1e-123  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_551  radical SAM superfamily  48.08 
 
 
459 aa  436  1e-121  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0398241  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0122  radical SAM domain-containing protein  48.39 
 
 
483 aa  438  1e-121  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1167  radical SAM domain-containing protein  48.07 
 
 
469 aa  432  1e-120  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.413437  normal  0.627812 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0586  ELP3 family histone acetyltransferase  47.65 
 
 
459 aa  429  1e-119  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0000912711  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0088  radical SAM domain-containing protein  47.52 
 
 
477 aa  425  1e-117  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0202426 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1956  ELP3 family histone acetyltransferase  44.82 
 
 
526 aa  416  9.999999999999999e-116  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.724461 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0906  Histone acetyltransferase  34.36 
 
 
617 aa  203  6e-51  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.301086  normal  0.526584 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08040  histone acetyltransferase  35.67 
 
 
598 aa  203  6e-51  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.584733  hitchhiker  0.0000000843356 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11040  histone acetyltransferase  35.47 
 
 
666 aa  195  2e-48  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.142131  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2227  radical SAM domain-containing protein  28.87 
 
 
342 aa  115  2.0000000000000002e-24  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.775407  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1404  radical SAM protein, putative histone acetyltransferase  42.66 
 
 
345 aa  115  2.0000000000000002e-24  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.00000266579  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3151  radical SAM domain-containing protein  29.34 
 
 
351 aa  112  2.0000000000000002e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0207208  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0774  ELP3 component of the RNA polymerase II complex  33.33 
 
 
362 aa  109  1e-22  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00000160735  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1061  Radical SAM domain protein  31.97 
 
 
343 aa  108  2e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.8315700000000001e-19 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1160  Radical SAM domain protein  29.62 
 
 
341 aa  108  2e-22  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.276403  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0688  Radical SAM domain protein  29.62 
 
 
336 aa  107  6e-22  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3202  Radical SAM domain protein  30.47 
 
 
342 aa  107  8e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00235958  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0930  radical SAM family protein  39.35 
 
 
338 aa  106  8e-22  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000118017  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1689  radical SAM domain-containing protein  29.46 
 
 
357 aa  106  9e-22  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0776794  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1719  radical SAM domain-containing protein  29.25 
 
 
354 aa  106  1e-21  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.219309  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1713  radical SAM domain-containing protein  36.42 
 
 
317 aa  105  3e-21  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1971  radical SAM domain-containing protein  28.96 
 
 
357 aa  105  3e-21  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.144867  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1640  radical SAM domain-containing protein  35.98 
 
 
317 aa  102  1e-20  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2316  radical SAM family protein  28.46 
 
 
346 aa  102  2e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2238  Radical SAM domain protein  29.25 
 
 
354 aa  101  4e-20  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1179  radical SAM domain-containing protein  28.44 
 
 
314 aa  98.6  2e-19  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0182  Radical SAM domain protein  31.07 
 
 
401 aa  97.8  4e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.534223  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1501  radical SAM domain-containing protein  37.5 
 
 
341 aa  96.7  9e-19  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.166226  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1777  radical SAM domain-containing protein  26.44 
 
 
352 aa  95.9  2e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.112435  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3477  putative radical SAM protein  31.18 
 
 
313 aa  95.9  2e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.143192  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0515  Elongator protein 3/MiaB/NifB  29.07 
 
 
309 aa  92.8  1e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.84475  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0038  conserved hypothetical radical SAM protein  29.57 
 
 
318 aa  91.7  3e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1944  Radical SAM domain protein  26 
 
 
374 aa  91.7  3e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0450295  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0875  radical SAM domain-containing protein  27.42 
 
 
359 aa  90.1  9e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0660  Radical SAM domain protein  26.19 
 
 
359 aa  89.4  2e-16  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.142353  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0787  radical SAM domain-containing protein  29.86 
 
 
317 aa  88.2  3e-16  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2936  hypothetical protein  28.49 
 
 
319 aa  87.4  6e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.971153  hitchhiker  0.00000000000000717489 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0586  radical SAM family protein  27.96 
 
 
319 aa  86.3  0.000000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1335  hypothetical protein  26.7 
 
 
328 aa  82.4  0.00000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0087579  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3661  putative radical SAM protein  28.49 
 
 
319 aa  81.6  0.00000000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0572  conserved hypothetical radical SAM protein  35.44 
 
 
325 aa  81.6  0.00000000000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0664  hypothetical protein  29.03 
 
 
318 aa  81.3  0.00000000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.08613e-26 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3655  putative radical SAM protein  31.82 
 
 
328 aa  80.5  0.00000000000007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0760029 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2187  hypothetical protein  28.57 
 
 
316 aa  79.7  0.0000000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  unclonable  0.000000345504 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1872  hypothetical protein  30.67 
 
 
319 aa  79.7  0.0000000000001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.22126  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3168  conserved hypothetical radical SAM protein  25.87 
 
 
311 aa  79.7  0.0000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.000379648  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0651  conserved hypothetical radical SAM protein  29.03 
 
 
318 aa  78.6  0.0000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0804  putative radical SAM protein  26.55 
 
 
334 aa  79  0.0000000000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.768446  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1358  putative radical SAM protein  31.45 
 
 
318 aa  79  0.0000000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.161503  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1736  hypothetical protein  28.75 
 
 
317 aa  78.6  0.0000000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0347  putative radical SAM protein  28.21 
 
 
293 aa  77.8  0.0000000000004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004465  hypothetical protein  26.79 
 
 
319 aa  77.4  0.0000000000006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11990  radical SAM protein, TIGR01212 family  30.95 
 
 
318 aa  77.4  0.0000000000006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000013437  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3522  radical SAM protein, TIGR01212 family  28.57 
 
 
309 aa  76.6  0.0000000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.998452  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3689  hypothetical protein  28.57 
 
 
309 aa  76.3  0.000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3591  hypothetical protein  28.57 
 
 
309 aa  76.3  0.000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0165  hypothetical protein  26.38 
 
 
347 aa  76.6  0.000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.375388  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1179  radical SAM family protein  25.27 
 
 
332 aa  76.3  0.000000000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.808864  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2966  Radical SAM domain protein  30.83 
 
 
344 aa  75.5  0.000000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0294152  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0760  putative radical SAM protein  30.23 
 
 
304 aa  75.5  0.000000000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.992819  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00929  Fe-S oxidoreductase  26.35 
 
 
314 aa  75.5  0.000000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3520  radical SAM protein, TIGR01212 family  28.57 
 
 
309 aa  75.9  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0306  hypothetical protein  28.57 
 
 
309 aa  75.9  0.000000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.216797  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3507  radical SAM family protein  29.22 
 
 
309 aa  75.5  0.000000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3627  hypothetical protein  28.57 
 
 
309 aa  75.9  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.672413 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0261  Radical SAM domain protein  27.75 
 
 
564 aa  75.9  0.000000000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2540  radical SAM domain-containing protein  28.81 
 
 
340 aa  75.9  0.000000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.093156 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2819  conserved hypothetical radical SAM protein  28.49 
 
 
372 aa  75.5  0.000000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0082  radical SAM family protein  30.57 
 
 
332 aa  75.9  0.000000000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03076  predicted Fe-S oxidoreductase  29.22 
 
 
309 aa  75.1  0.000000000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.709944  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0496  conserved hypothetical protein  29.22 
 
 
309 aa  75.1  0.000000000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3404  radical SAM family protein  29.22 
 
 
309 aa  75.1  0.000000000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3699  radical SAM family protein  29.22 
 
 
309 aa  75.1  0.000000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>