More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MmarC7_0824 on replicon NC_009637
Organism: Methanococcus maripaludis C7



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009975  MmarC6_1093  ELP3 family histone acetyltransferase  95.75 
 
 
541 aa  1070    Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.108771  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0824  ELP3 family histone acetyltransferase  100 
 
 
541 aa  1112    Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.318054  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0889  ELP3 family histone acetyltransferase  78.37 
 
 
541 aa  900    Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1832  ELP3 family histone acetyltransferase  96.12 
 
 
541 aa  1073    Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0279  ELP3 family histone acetyltransferase  70.45 
 
 
563 aa  823    Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1085  histone acetyltransferase, ELP3 family  50.78 
 
 
514 aa  527  1e-148  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.707697  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1755  ELP3 family histone acetyltransferase  49.11 
 
 
547 aa  503  1e-141  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.668163  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1989  ELP3 family histone acetyltransferase  49.21 
 
 
548 aa  496  1e-139  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2046  ELP3 family histone acetyltransferase  44.53 
 
 
530 aa  476  1e-133  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1460  histone acetyltransferase, ELP3 family  49.68 
 
 
473 aa  460  9.999999999999999e-129  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2930  histone acetyltransferase, ELP3 family  45.7 
 
 
554 aa  458  1e-127  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.281817  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0872  histone acetyltransferase, ELP3 family  44.03 
 
 
556 aa  449  1e-125  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0898  ELP3 family histone acetyltransferase  45.29 
 
 
512 aa  449  1e-125  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.589047  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2192  histone acetyltransferase, ELP3 family  44.47 
 
 
576 aa  446  1.0000000000000001e-124  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0579  ELP3 family histone acetyltransferase  43.44 
 
 
527 aa  443  1e-123  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1480  histone acetyltransferase, ELP3 family  43.89 
 
 
585 aa  442  9.999999999999999e-123  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.761791  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2706  histone acetyltransferase, ELP3 family  43.44 
 
 
553 aa  441  9.999999999999999e-123  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0952  histone acetyltransferase, ELP3 family  43.84 
 
 
526 aa  435  1e-121  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1304  hypothetical protein  45.12 
 
 
520 aa  434  1e-120  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1956  ELP3 family histone acetyltransferase  45.65 
 
 
526 aa  431  1e-119  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.724461 
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_50848  predicted protein  42.66 
 
 
544 aa  427  1e-118  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.104715  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1133  ELP3 family histone acetyltransferase  44.99 
 
 
522 aa  427  1e-118  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1318  ELP3 family histone acetyltransferase  44.86 
 
 
510 aa  427  1e-118  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.340377 
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_27329  predicted protein  40.58 
 
 
555 aa  422  1e-117  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.072078  hitchhiker  0.00552121 
 
 
-
 
NC_002936  DET0612  ELP3 family histone acetyltransferase  48.19 
 
 
459 aa  420  1e-116  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.125099  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_42410  predicted protein  40.92 
 
 
558 aa  420  1e-116  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0586  ELP3 family histone acetyltransferase  47.55 
 
 
459 aa  416  9.999999999999999e-116  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0000912711  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_551  radical SAM superfamily  47.12 
 
 
459 aa  409  1e-113  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0398241  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02294  histone acetyltransferase, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G06140)  40.11 
 
 
574 aa  407  1.0000000000000001e-112  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0088  radical SAM domain-containing protein  43.64 
 
 
477 aa  392  1e-108  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0202426 
 
 
-
 
NC_006680  CNK00950  Pol II transcription elongation factor, putative  39.85 
 
 
557 aa  389  1e-107  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.110026  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1167  radical SAM domain-containing protein  43.01 
 
 
469 aa  387  1e-106  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.413437  normal  0.627812 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0122  radical SAM domain-containing protein  42.04 
 
 
483 aa  375  1e-103  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11040  histone acetyltransferase  35.04 
 
 
666 aa  194  3e-48  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.142131  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0906  Histone acetyltransferase  32.72 
 
 
617 aa  179  1e-43  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.301086  normal  0.526584 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08040  histone acetyltransferase  29.41 
 
 
598 aa  169  9e-41  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.584733  hitchhiker  0.0000000843356 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1404  radical SAM protein, putative histone acetyltransferase  33.33 
 
 
345 aa  111  3e-23  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.00000266579  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1689  radical SAM domain-containing protein  30.59 
 
 
357 aa  105  1e-21  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0776794  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1971  radical SAM domain-containing protein  30.27 
 
 
357 aa  105  2e-21  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.144867  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1160  Radical SAM domain protein  34.63 
 
 
341 aa  104  3e-21  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.276403  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3151  radical SAM domain-containing protein  27.27 
 
 
351 aa  97.1  7e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0207208  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1713  radical SAM domain-containing protein  29.25 
 
 
317 aa  96.3  1e-18  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0515  Elongator protein 3/MiaB/NifB  28.12 
 
 
309 aa  94  7e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.84475  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2227  radical SAM domain-containing protein  28.06 
 
 
342 aa  93.6  8e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.775407  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2316  radical SAM family protein  28.63 
 
 
346 aa  93.6  8e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0774  ELP3 component of the RNA polymerase II complex  29.19 
 
 
362 aa  92.8  2e-17  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00000160735  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1501  radical SAM domain-containing protein  37.31 
 
 
341 aa  92  2e-17  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.166226  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1562  Radical SAM domain protein  27.17 
 
 
401 aa  92.4  2e-17  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2238  Radical SAM domain protein  25.1 
 
 
354 aa  91.7  3e-17  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0688  Radical SAM domain protein  29.95 
 
 
336 aa  91.3  4e-17  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0660  Radical SAM domain protein  28.92 
 
 
359 aa  91.3  4e-17  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.142353  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0182  Radical SAM domain protein  28.16 
 
 
401 aa  89.7  1e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.534223  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0930  radical SAM family protein  30.98 
 
 
338 aa  89  2e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000118017  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2966  Radical SAM domain protein  28.95 
 
 
344 aa  88.2  3e-16  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0294152  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1640  radical SAM domain-containing protein  28.3 
 
 
317 aa  88.2  4e-16  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1777  radical SAM domain-containing protein  27.17 
 
 
352 aa  87.4  5e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.112435  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1719  radical SAM domain-containing protein  31.06 
 
 
354 aa  87  7e-16  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.219309  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1061  Radical SAM domain protein  33.59 
 
 
343 aa  87  8e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.8315700000000001e-19 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1179  radical SAM domain-containing protein  27.94 
 
 
314 aa  86.3  0.000000000000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3202  Radical SAM domain protein  26.53 
 
 
342 aa  85.1  0.000000000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00235958  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0261  Radical SAM domain protein  31.18 
 
 
564 aa  85.1  0.000000000000003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0760  putative radical SAM protein  31.6 
 
 
304 aa  83.6  0.000000000000009  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.992819  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0787  radical SAM domain-containing protein  32.82 
 
 
317 aa  83.6  0.00000000000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0997  hypothetical protein  34.13 
 
 
368 aa  79.3  0.0000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.961706  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2540  radical SAM domain-containing protein  27.43 
 
 
340 aa  78.6  0.0000000000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.093156 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0804  putative radical SAM protein  31.01 
 
 
334 aa  76.3  0.000000000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.768446  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0175  hypothetical protein  28.4 
 
 
317 aa  75.1  0.000000000003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.46847  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0875  radical SAM domain-containing protein  25.97 
 
 
359 aa  75.1  0.000000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2960  Fe-S oxidoreductase  29.02 
 
 
306 aa  74.7  0.000000000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.392137  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1944  Radical SAM domain protein  25.67 
 
 
374 aa  73.6  0.000000000008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0450295  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2936  hypothetical protein  23.56 
 
 
319 aa  73.6  0.000000000009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.971153  hitchhiker  0.00000000000000717489 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0586  radical SAM family protein  25 
 
 
319 aa  73.2  0.00000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1872  hypothetical protein  25.09 
 
 
319 aa  72.8  0.00000000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.22126  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3477  putative radical SAM protein  25.39 
 
 
313 aa  72  0.00000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.143192  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0038  conserved hypothetical radical SAM protein  26.04 
 
 
318 aa  71.6  0.00000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1179  radical SAM family protein  28.48 
 
 
332 aa  70.5  0.00000000007  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.808864  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1177  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  28.47 
 
 
372 aa  70.1  0.00000000009  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0082  radical SAM family protein  28.48 
 
 
332 aa  70.1  0.00000000009  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0739  radical SAM family protein  27.85 
 
 
332 aa  69.7  0.0000000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.974352  normal  0.805342 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0754  Radical SAM domain protein  29.81 
 
 
319 aa  70.1  0.0000000001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.00145958  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3661  putative radical SAM protein  24.08 
 
 
319 aa  68.9  0.0000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2080  hypothetical protein  29.41 
 
 
316 aa  69.3  0.0000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1170  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  28.36 
 
 
369 aa  68.2  0.0000000003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3655  putative radical SAM protein  27.75 
 
 
328 aa  68.6  0.0000000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0760029 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2603  radical SAM superfamily protein  25 
 
 
313 aa  68.6  0.0000000003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3507  radical SAM family protein  27.01 
 
 
309 aa  67  0.0000000009  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03076  predicted Fe-S oxidoreductase  27.01 
 
 
309 aa  66.2  0.000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.709944  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0496  conserved hypothetical protein  27.01 
 
 
309 aa  66.2  0.000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3404  radical SAM family protein  27.01 
 
 
309 aa  66.2  0.000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03027  hypothetical protein  27.01 
 
 
309 aa  66.2  0.000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.828625  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0489  putative radical SAM protein  27.01 
 
 
320 aa  66.6  0.000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.577174 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3699  radical SAM family protein  27.01 
 
 
309 aa  66.2  0.000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2882  radical SAM family protein  30.29 
 
 
311 aa  66.6  0.000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2563  radical SAM family protein  30.29 
 
 
311 aa  66.6  0.000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4534  radical SAM protein, TIGR01212 family  27.01 
 
 
309 aa  66.2  0.000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3559  radical SAM protein, TIGR01212 family  27.08 
 
 
309 aa  66.6  0.000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0569  coproporphyrinogen III oxidase  26.12 
 
 
397 aa  65.5  0.000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00929  Fe-S oxidoreductase  29.03 
 
 
314 aa  65.5  0.000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2183  putative radical SAM protein  26.95 
 
 
351 aa  65.5  0.000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0347  putative radical SAM protein  31.9 
 
 
293 aa  65.5  0.000000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>