124 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mboo_1956 on replicon NC_009712
Organism: Candidatus Methanoregula boonei 6A8



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007796  Mhun_1133  ELP3 family histone acetyltransferase  65.9 
 
 		 522 aa  691    Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1304  hypothetical protein  64.95 
 
 		 520 aa  705    Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2046  ELP3 family histone acetyltransferase  68.54 
 
 		 530 aa  713    Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1956  ELP3 family histone acetyltransferase  100 
 
 		 526 aa  1082    Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.724461 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0952  histone acetyltransferase, ELP3 family  70.02 
 
 		 526 aa  731    Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1755  ELP3 family histone acetyltransferase  50.19 
 
 		 547 aa  535  1e-150  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.668163  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1989  ELP3 family histone acetyltransferase  48.6 
 
 		 548 aa  520  1e-146  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0898  ELP3 family histone acetyltransferase  50.96 
 
 		 512 aa  498  1e-139  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.589047  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2930  histone acetyltransferase, ELP3 family  49.44 
 
 		 554 aa  498  1e-139  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.281817  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2706  histone acetyltransferase, ELP3 family  48.5 
 
 		 553 aa  489  1e-137  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0872  histone acetyltransferase, ELP3 family  47.94 
 
 		 556 aa  485  1e-136  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2192  histone acetyltransferase, ELP3 family  48.79 
 
 		 576 aa  481  1e-134  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1480  histone acetyltransferase, ELP3 family  46.45 
 
 		 585 aa  460  9.999999999999999e-129  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.761791  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1093  ELP3 family histone acetyltransferase  45.44 
 
 		 541 aa  453  1.0000000000000001e-126  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.108771  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1832  ELP3 family histone acetyltransferase  45.45 
 
 		 541 aa  449  1e-125  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0279  ELP3 family histone acetyltransferase  45.26 
 
 		 563 aa  448  1e-125  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0824  ELP3 family histone acetyltransferase  45.65 
 
 		 541 aa  451  1e-125  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.318054  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0889  ELP3 family histone acetyltransferase  44.2 
 
 		 541 aa  439  9.999999999999999e-123  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1085  histone acetyltransferase, ELP3 family  44.82 
 
 		 514 aa  432  1e-120  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.707697  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1460  histone acetyltransferase, ELP3 family  46.2 
 
 		 473 aa  422  1e-117  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0579  ELP3 family histone acetyltransferase  41.6 
 
 		 527 aa  407  1.0000000000000001e-112  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1318  ELP3 family histone acetyltransferase  43.86 
 
 		 510 aa  400  9.999999999999999e-111  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.340377 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02294  histone acetyltransferase, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G06140)  41.1 
 
 		 574 aa  376  1e-103  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_27329  predicted protein  39.78 
 
 		 555 aa  371  1e-101  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.072078  hitchhiker  0.00552121 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0586  ELP3 family histone acetyltransferase  44.8 
 
 		 459 aa  369  1e-101  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0000912711  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0612  ELP3 family histone acetyltransferase  43.52 
 
 		 459 aa  366  1e-100  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.125099  n/a   
 
 
-
 
NC_006680  CNK00950  Pol II transcription elongation factor, putative  40.8 
 
 		 557 aa  368  1e-100  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.110026  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0122  radical SAM domain-containing protein  43.66 
 
 		 483 aa  367  1e-100  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0088  radical SAM domain-containing protein  44.44 
 
 		 477 aa  363  4e-99  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0202426 
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_50848  predicted protein  39.37 
 
 		 544 aa  363  5.0000000000000005e-99  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.104715  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_551  radical SAM superfamily  43.31 
 
 		 459 aa  362  8e-99  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0398241  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_42410  predicted protein  37.85 
 
 		 558 aa  357  2.9999999999999997e-97  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1167  radical SAM domain-containing protein  43.92 
 
 		 469 aa  355  2e-96  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.413437  normal  0.627812 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08040  histone acetyltransferase  32.39 
 
 		 598 aa  289  7e-77  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.584733  hitchhiker  0.0000000843356 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11040  histone acetyltransferase  33.46 
 
 		 666 aa  256  7e-67  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.142131  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0906  Histone acetyltransferase  31.35 
 
 		 617 aa  249  7e-65  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.301086  normal  0.526584 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3151  radical SAM domain-containing protein  31.36 
 
 		 351 aa  103  6e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0207208  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2227  radical SAM domain-containing protein  30.65 
 
 		 342 aa  101  3e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.775407  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1404  radical SAM protein, putative histone acetyltransferase  33.86 
 
 		 345 aa  100  9e-20  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.00000266579  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1061  Radical SAM domain protein  33.71 
 
 		 343 aa  91.3  4e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.8315700000000001e-19 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2316  radical SAM family protein  30.33 
 
 		 346 aa  90.1  1e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0930  radical SAM family protein  30.46 
 
 		 338 aa  87.4  5e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000118017  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3202  Radical SAM domain protein  28.63 
 
 		 342 aa  86.3  0.000000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00235958  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0774  ELP3 component of the RNA polymerase II complex  34.62 
 
 		 362 aa  85.9  0.000000000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00000160735  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1689  radical SAM domain-containing protein  25.89 
 
 		 357 aa  85.1  0.000000000000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0776794  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0660  Radical SAM domain protein  28.65 
 
 		 359 aa  84.7  0.000000000000003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.142353  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1971  radical SAM domain-containing protein  26.21 
 
 		 357 aa  82.8  0.00000000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.144867  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1501  radical SAM domain-containing protein  36.69 
 
 		 341 aa  82.8  0.00000000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.166226  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0688  Radical SAM domain protein  30.53 
 
 		 336 aa  83.2  0.00000000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1719  radical SAM domain-containing protein  34.15 
 
 		 354 aa  81.6  0.00000000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.219309  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2238  Radical SAM domain protein  25.42 
 
 		 354 aa  79.7  0.0000000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0515  Elongator protein 3/MiaB/NifB  26.32 
 
 		 309 aa  78.6  0.0000000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.84475  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0182  Radical SAM domain protein  28.24 
 
 		 401 aa  78.2  0.0000000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.534223  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2540  radical SAM domain-containing protein  31.28 
 
 		 340 aa  77  0.0000000000007  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.093156 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0787  radical SAM domain-containing protein  28 
 
 		 317 aa  77  0.0000000000008  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1160  Radical SAM domain protein  29.19 
 
 		 341 aa  74.7  0.000000000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.276403  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1777  radical SAM domain-containing protein  30.15 
 
 		 352 aa  73.9  0.000000000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.112435  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1179  radical SAM domain-containing protein  28.18 
 
 		 314 aa  73.6  0.000000000008  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2966  Radical SAM domain protein  33.33 
 
 		 344 aa  72.8  0.00000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0294152  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1944  Radical SAM domain protein  32.62 
 
 		 374 aa  73.2  0.00000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0450295  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0875  radical SAM domain-containing protein  26.47 
 
 		 359 aa  71.6  0.00000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1640  radical SAM domain-containing protein  27.88 
 
 		 317 aa  70.9  0.00000000005  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1713  radical SAM domain-containing protein  27.27 
 
 		 317 aa  68.6  0.0000000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1562  Radical SAM domain protein  29.59 
 
 		 401 aa  68.6  0.0000000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1293  putative radical SAM protein  26.2 
 
 		 341 aa  62.8  0.00000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0804  putative radical SAM protein  28.14 
 
 		 334 aa  58.5  0.0000003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.768446  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1177  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  23.12 
 
 		 372 aa  58.5  0.0000003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0739  radical SAM family protein  27.92 
 
 		 332 aa  57.8  0.0000005  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.974352  normal  0.805342 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1179  radical SAM family protein  27.64 
 
 		 332 aa  56.2  0.000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.808864  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0082  radical SAM family protein  27.64 
 
 		 332 aa  55.8  0.000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2063  coproporphyrinogen III oxidase  26.32 
 
 		 384 aa  52  0.00002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1335  hypothetical protein  25.61 
 
 		 328 aa  52  0.00003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0087579  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1360  putative oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  32.73 
 
 		 371 aa  50.8  0.00005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.716239  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2205  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  25.85 
 
 		 484 aa  51.2  0.00005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.434843  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1170  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  29.36 
 
 		 369 aa  50.8  0.00006  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3655  putative radical SAM protein  26.59 
 
 		 328 aa  50.4  0.00007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0760029 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0572  conserved hypothetical radical SAM protein  24.47 
 
 		 325 aa  50.1  0.00009  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0754  Radical SAM domain protein  26.9 
 
 		 319 aa  50.1  0.00009  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.00145958  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0394  coproporphyrinogen III oxidase  29.33 
 
 		 393 aa  50.4  0.00009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3023  radical SAM domain-containing protein  26.26 
 
 		 386 aa  49.7  0.0001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2374  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  29.57 
 
 		 448 aa  49.7  0.0001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2110  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  37.5 
 
 		 456 aa  49.7  0.0001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.418405  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4306  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  29.36 
 
 		 375 aa  48.5  0.0003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0329595  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2487  Fe-S oxidoreductase  27.68 
 
 		 609 aa  47.8  0.0004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2882  radical SAM family protein  27.27 
 
 		 311 aa  47.8  0.0005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2563  radical SAM family protein  27.27 
 
 		 311 aa  47.8  0.0005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0003  coproporphyrinogen III oxidase  30.63 
 
 		 401 aa  47.4  0.0006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.045882 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2960  Fe-S oxidoreductase  25.61 
 
 		 306 aa  47.4  0.0007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.392137  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0165  hypothetical protein  29.14 
 
 		 347 aa  47.4  0.0007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.375388  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1010  coproporphyrinogen III oxidase  28.57 
 
 		 379 aa  47  0.0008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2440  coproporphyrinogen III oxidase  29.47 
 
 		 382 aa  47  0.0009  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000264436  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2936  hypothetical protein  22.4 
 
 		 319 aa  46.6  0.001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.971153  hitchhiker  0.00000000000000717489 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3661  putative radical SAM protein  24.26 
 
 		 319 aa  47  0.001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0760  putative radical SAM protein  23.86 
 
 		 304 aa  46.2  0.001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.992819  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1228  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  25.11 
 
 		 380 aa  47  0.001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0003  coproporphyrinogen III oxidase  27.82 
 
 		 400 aa  46.2  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.242877  hitchhiker  0.00414143 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0536  putative oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  24.11 
 
 		 578 aa  45.8  0.002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.448786  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2239  coproporphyrinogen III oxidase  25.23 
 
 		 409 aa  46.2  0.002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.167009  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1736  hypothetical protein  24.08 
 
 		 317 aa  45.8  0.002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0630  coproporphyrinogen III oxidase  26.19 
 
 		 393 aa  45.8  0.002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.824124  normal  0.0911038 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>