160 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlab_1304 on replicon NC_008942
Organism: Methanocorpusculum labreanum Z



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007796  Mhun_1133  ELP3 family histone acetyltransferase  64.47 
 
 
522 aa  683    Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1304  hypothetical protein  100 
 
 
520 aa  1080    Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2046  ELP3 family histone acetyltransferase  66 
 
 
530 aa  684    Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1956  ELP3 family histone acetyltransferase  64.95 
 
 
526 aa  687    Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.724461 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0952  histone acetyltransferase, ELP3 family  66.92 
 
 
526 aa  705    Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1755  ELP3 family histone acetyltransferase  50.58 
 
 
547 aa  523  1e-147  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.668163  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1989  ELP3 family histone acetyltransferase  49.35 
 
 
548 aa  521  1e-146  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2192  histone acetyltransferase, ELP3 family  51.73 
 
 
576 aa  495  1e-139  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2706  histone acetyltransferase, ELP3 family  49.62 
 
 
553 aa  498  1e-139  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0898  ELP3 family histone acetyltransferase  51.79 
 
 
512 aa  493  9.999999999999999e-139  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.589047  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0872  histone acetyltransferase, ELP3 family  49.04 
 
 
556 aa  494  9.999999999999999e-139  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2930  histone acetyltransferase, ELP3 family  49.16 
 
 
554 aa  478  1e-133  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.281817  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1085  histone acetyltransferase, ELP3 family  46.63 
 
 
514 aa  452  1.0000000000000001e-126  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.707697  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1480  histone acetyltransferase, ELP3 family  45.93 
 
 
585 aa  451  1e-125  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.761791  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0824  ELP3 family histone acetyltransferase  45.12 
 
 
541 aa  434  1e-120  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.318054  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1832  ELP3 family histone acetyltransferase  45.12 
 
 
541 aa  431  1e-119  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1093  ELP3 family histone acetyltransferase  44.92 
 
 
541 aa  431  1e-119  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.108771  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0279  ELP3 family histone acetyltransferase  44.83 
 
 
563 aa  426  1e-118  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0889  ELP3 family histone acetyltransferase  42.97 
 
 
541 aa  421  1e-116  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1460  histone acetyltransferase, ELP3 family  46.6 
 
 
473 aa  411  1e-113  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1318  ELP3 family histone acetyltransferase  44.49 
 
 
510 aa  390  1e-107  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.340377 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0579  ELP3 family histone acetyltransferase  39.56 
 
 
527 aa  380  1e-104  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0612  ELP3 family histone acetyltransferase  45.78 
 
 
459 aa  374  1e-102  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.125099  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0088  radical SAM domain-containing protein  43.78 
 
 
477 aa  365  1e-100  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0202426 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0122  radical SAM domain-containing protein  43.13 
 
 
483 aa  366  1e-100  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0586  ELP3 family histone acetyltransferase  45.15 
 
 
459 aa  367  1e-100  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0000912711  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_551  radical SAM superfamily  44.94 
 
 
459 aa  363  6e-99  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0398241  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02294  histone acetyltransferase, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G06140)  41.21 
 
 
574 aa  358  9.999999999999999e-98  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_42410  predicted protein  37.92 
 
 
558 aa  357  2.9999999999999997e-97  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_50848  predicted protein  39.66 
 
 
544 aa  357  2.9999999999999997e-97  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.104715  n/a   
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_27329  predicted protein  40.07 
 
 
555 aa  354  2e-96  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.072078  hitchhiker  0.00552121 
 
 
-
 
NC_006680  CNK00950  Pol II transcription elongation factor, putative  40.95 
 
 
557 aa  352  1e-95  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.110026  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1167  radical SAM domain-containing protein  42.95 
 
 
469 aa  352  1e-95  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.413437  normal  0.627812 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0906  Histone acetyltransferase  34.56 
 
 
617 aa  278  1e-73  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.301086  normal  0.526584 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08040  histone acetyltransferase  30.83 
 
 
598 aa  265  2e-69  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.584733  hitchhiker  0.0000000843356 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11040  histone acetyltransferase  33.58 
 
 
666 aa  251  3e-65  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.142131  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2227  radical SAM domain-containing protein  37.43 
 
 
342 aa  102  1e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.775407  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1061  Radical SAM domain protein  36.36 
 
 
343 aa  98.6  2e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.8315700000000001e-19 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1404  radical SAM protein, putative histone acetyltransferase  34.03 
 
 
345 aa  95.9  2e-18  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.00000266579  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3151  radical SAM domain-containing protein  34.1 
 
 
351 aa  94.4  5e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0207208  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2316  radical SAM family protein  31.3 
 
 
346 aa  92.8  1e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3202  Radical SAM domain protein  29.07 
 
 
342 aa  86.3  0.000000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00235958  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0660  Radical SAM domain protein  31.79 
 
 
359 aa  83.2  0.00000000000001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.142353  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0930  radical SAM family protein  30.34 
 
 
338 aa  81.3  0.00000000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000118017  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1719  radical SAM domain-containing protein  33.88 
 
 
354 aa  79.7  0.0000000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.219309  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0515  Elongator protein 3/MiaB/NifB  26.99 
 
 
309 aa  79  0.0000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.84475  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1160  Radical SAM domain protein  30.96 
 
 
341 aa  79.3  0.0000000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.276403  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0774  ELP3 component of the RNA polymerase II complex  27.32 
 
 
362 aa  77.8  0.0000000000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00000160735  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1562  Radical SAM domain protein  32.83 
 
 
401 aa  77.4  0.0000000000005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1501  radical SAM domain-containing protein  37.19 
 
 
341 aa  77  0.0000000000007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.166226  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0688  Radical SAM domain protein  25.63 
 
 
336 aa  73.9  0.000000000006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1944  Radical SAM domain protein  27.16 
 
 
374 aa  72.4  0.00000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0450295  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2238  Radical SAM domain protein  27.13 
 
 
354 aa  71.6  0.00000000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1293  putative radical SAM protein  33.14 
 
 
341 aa  71.2  0.00000000004  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0739  radical SAM family protein  31.61 
 
 
332 aa  69.3  0.0000000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.974352  normal  0.805342 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0082  radical SAM family protein  31.18 
 
 
332 aa  67.8  0.0000000004  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0182  Radical SAM domain protein  28.8 
 
 
401 aa  67.8  0.0000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.534223  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0787  radical SAM domain-containing protein  28.8 
 
 
317 aa  67.4  0.0000000006  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2966  Radical SAM domain protein  31.93 
 
 
344 aa  67  0.0000000007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0294152  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1713  radical SAM domain-containing protein  28.73 
 
 
317 aa  67  0.0000000008  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1689  radical SAM domain-containing protein  25.75 
 
 
357 aa  67  0.0000000009  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0776794  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0804  putative radical SAM protein  32.35 
 
 
334 aa  66.6  0.0000000009  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.768446  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1179  radical SAM family protein  30.41 
 
 
332 aa  66.2  0.000000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.808864  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1971  radical SAM domain-containing protein  25.75 
 
 
357 aa  65.5  0.000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.144867  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1179  radical SAM domain-containing protein  25.7 
 
 
314 aa  65.5  0.000000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1640  radical SAM domain-containing protein  28.73 
 
 
317 aa  64.3  0.000000005  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2960  Fe-S oxidoreductase  30.38 
 
 
306 aa  62  0.00000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.392137  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0875  radical SAM domain-containing protein  30.43 
 
 
359 aa  61.6  0.00000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0367  radical SAM family protein  29.84 
 
 
305 aa  60.8  0.00000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0395363  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3163  hypothetical protein  30.26 
 
 
310 aa  60.5  0.00000007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.096251  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1777  radical SAM domain-containing protein  30.82 
 
 
352 aa  60.5  0.00000007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.112435  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1177  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  25.16 
 
 
372 aa  56.6  0.000001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2540  radical SAM domain-containing protein  30.53 
 
 
340 aa  55.5  0.000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.093156 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3023  radical SAM domain-containing protein  30.36 
 
 
386 aa  55.8  0.000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2882  radical SAM family protein  26.32 
 
 
311 aa  54.7  0.000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2563  radical SAM family protein  26.32 
 
 
311 aa  54.7  0.000004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0760  putative radical SAM protein  24.2 
 
 
304 aa  54.7  0.000004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.992819  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2205  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  30.23 
 
 
484 aa  53.9  0.000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.434843  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4117  hypothetical protein  25.77 
 
 
334 aa  53.9  0.000007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0347  putative radical SAM protein  23.94 
 
 
293 aa  53.9  0.000008  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0165  hypothetical protein  30.6 
 
 
347 aa  53.9  0.000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.375388  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0630  coproporphyrinogen III oxidase  26.92 
 
 
393 aa  53.5  0.000009  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.824124  normal  0.0911038 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2936  hypothetical protein  24.61 
 
 
319 aa  52  0.00002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.971153  hitchhiker  0.00000000000000717489 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0407  putative radical SAM protein  28.5 
 
 
303 aa  52.4  0.00002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.145155  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0422  putative radical SAM protein  28.5 
 
 
303 aa  52.4  0.00002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3520  radical SAM protein, TIGR01212 family  23.88 
 
 
309 aa  51.6  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3627  hypothetical protein  23.88 
 
 
309 aa  51.6  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.672413 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3591  hypothetical protein  23.88 
 
 
309 aa  51.6  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1360  putative oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  27.52 
 
 
371 aa  52  0.00003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.716239  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1335  hypothetical protein  23.98 
 
 
328 aa  51.6  0.00003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0087579  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3655  putative radical SAM protein  25.25 
 
 
328 aa  52  0.00003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0760029 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3689  hypothetical protein  23.88 
 
 
309 aa  51.6  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0800  coproporphyrinogen III oxidase  31.75 
 
 
379 aa  51.2  0.00004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000109269  hitchhiker  5.6543700000000005e-18 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4436  coproporphyrinogen III oxidase  31.75 
 
 
379 aa  51.2  0.00004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000959102  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2819  conserved hypothetical radical SAM protein  28.39 
 
 
372 aa  51.2  0.00004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3559  radical SAM protein, TIGR01212 family  24.38 
 
 
309 aa  50.8  0.00006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3168  conserved hypothetical radical SAM protein  24.34 
 
 
311 aa  50.8  0.00006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.000379648  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1950  hypothetical protein  25.82 
 
 
316 aa  50.4  0.00007  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0572  conserved hypothetical radical SAM protein  22.01 
 
 
325 aa  50.4  0.00008  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4542  coproporphyrinogen III oxidase  30.95 
 
 
378 aa  50.1  0.00009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.3385  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>