231 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DET0612 on replicon NC_002936
Organism: Dehalococcoides ethenogenes 195



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002936  DET0612  ELP3 family histone acetyltransferase  100 
 
 		 459 aa  936    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.125099  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0586  ELP3 family histone acetyltransferase  92.58 
 
 		 459 aa  872    Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0000912711  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_551  radical SAM superfamily  92.81 
 
 		 459 aa  882    Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0398241  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1085  histone acetyltransferase, ELP3 family  48.5 
 
 		 514 aa  442  1e-123  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.707697  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1093  ELP3 family histone acetyltransferase  47.97 
 
 		 541 aa  421  1e-116  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.108771  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1832  ELP3 family histone acetyltransferase  47.97 
 
 		 541 aa  420  1e-116  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0824  ELP3 family histone acetyltransferase  48.19 
 
 		 541 aa  420  1e-116  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.318054  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0279  ELP3 family histone acetyltransferase  46.28 
 
 		 563 aa  415  9.999999999999999e-116  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0889  ELP3 family histone acetyltransferase  47.33 
 
 		 541 aa  412  1e-114  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1318  ELP3 family histone acetyltransferase  48.42 
 
 		 510 aa  404  1e-111  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.340377 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0579  ELP3 family histone acetyltransferase  43.97 
 
 		 527 aa  395  1e-108  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1460  histone acetyltransferase, ELP3 family  45.44 
 
 		 473 aa  379  1e-104  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0898  ELP3 family histone acetyltransferase  44.8 
 
 		 512 aa  377  1e-103  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.589047  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0122  radical SAM domain-containing protein  46.06 
 
 		 483 aa  378  1e-103  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1133  ELP3 family histone acetyltransferase  45.51 
 
 		 522 aa  373  1e-102  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1304  hypothetical protein  45.78 
 
 		 520 aa  374  1e-102  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0088  radical SAM domain-containing protein  44.87 
 
 		 477 aa  370  1e-101  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0202426 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1755  ELP3 family histone acetyltransferase  44.01 
 
 		 547 aa  368  1e-100  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.668163  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1167  radical SAM domain-containing protein  44.66 
 
 		 469 aa  365  1e-99  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.413437  normal  0.627812 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0952  histone acetyltransferase, ELP3 family  46.41 
 
 		 526 aa  362  6e-99  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_27329  predicted protein  43.25 
 
 		 555 aa  362  7.0000000000000005e-99  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.072078  hitchhiker  0.00552121 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0872  histone acetyltransferase, ELP3 family  42.36 
 
 		 556 aa  357  2.9999999999999997e-97  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2046  ELP3 family histone acetyltransferase  44.59 
 
 		 530 aa  356  5.999999999999999e-97  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_50848  predicted protein  42.4 
 
 		 544 aa  355  5.999999999999999e-97  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.104715  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2706  histone acetyltransferase, ELP3 family  42.01 
 
 		 553 aa  352  5.9999999999999994e-96  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1989  ELP3 family histone acetyltransferase  42.09 
 
 		 548 aa  348  1e-94  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_42410  predicted protein  41.03 
 
 		 558 aa  348  1e-94  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2192  histone acetyltransferase, ELP3 family  41.89 
 
 		 576 aa  346  4e-94  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1956  ELP3 family histone acetyltransferase  42.13 
 
 		 526 aa  345  8.999999999999999e-94  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.724461 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2930  histone acetyltransferase, ELP3 family  42.6 
 
 		 554 aa  344  2e-93  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.281817  n/a   
 
 
-
 
NC_006680  CNK00950  Pol II transcription elongation factor, putative  42.16 
 
 		 557 aa  337  3.9999999999999995e-91  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.110026  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02294  histone acetyltransferase, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G06140)  41.53 
 
 		 574 aa  336  5.999999999999999e-91  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1480  histone acetyltransferase, ELP3 family  40.52 
 
 		 585 aa  324  3e-87  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.761791  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08040  histone acetyltransferase  31.91 
 
 		 598 aa  221  3e-56  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.584733  hitchhiker  0.0000000843356 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0906  Histone acetyltransferase  37.12 
 
 		 617 aa  214  1.9999999999999998e-54  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.301086  normal  0.526584 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11040  histone acetyltransferase  37.13 
 
 		 666 aa  204  2e-51  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.142131  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3151  radical SAM domain-containing protein  33.33 
 
 		 351 aa  113  9e-24  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0207208  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1160  Radical SAM domain protein  28.26 
 
 		 341 aa  98.6  2e-19  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.276403  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0515  Elongator protein 3/MiaB/NifB  32.54 
 
 		 309 aa  98.2  3e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.84475  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1061  Radical SAM domain protein  30.9 
 
 		 343 aa  97.8  3e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.8315700000000001e-19 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1719  radical SAM domain-containing protein  27.9 
 
 		 354 aa  97.1  7e-19  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.219309  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0774  ELP3 component of the RNA polymerase II complex  30 
 
 		 362 aa  96.3  1e-18  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00000160735  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2227  radical SAM domain-containing protein  35.59 
 
 		 342 aa  94.4  4e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.775407  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1689  radical SAM domain-containing protein  27.78 
 
 		 357 aa  93.6  6e-18  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0776794  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1971  radical SAM domain-containing protein  27.78 
 
 		 357 aa  92  2e-17  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.144867  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3202  Radical SAM domain protein  30.47 
 
 		 342 aa  91.3  3e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00235958  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1404  radical SAM protein, putative histone acetyltransferase  37.32 
 
 		 345 aa  89.7  9e-17  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.00000266579  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1777  radical SAM domain-containing protein  28.67 
 
 		 352 aa  89.4  1e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.112435  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2316  radical SAM family protein  29.34 
 
 		 346 aa  86.7  7e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0930  radical SAM family protein  31.43 
 
 		 338 aa  84  0.000000000000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000118017  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0688  Radical SAM domain protein  26.45 
 
 		 336 aa  82.8  0.00000000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1713  radical SAM domain-containing protein  25 
 
 		 317 aa  82.4  0.00000000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3655  putative radical SAM protein  34.15 
 
 		 328 aa  81.6  0.00000000000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0760029 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1950  hypothetical protein  32.47 
 
 		 316 aa  81.3  0.00000000000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2238  Radical SAM domain protein  24.1 
 
 		 354 aa  80.5  0.00000000000006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3627  hypothetical protein  32.08 
 
 		 309 aa  80.1  0.00000000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.672413 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3520  radical SAM protein, TIGR01212 family  32.08 
 
 		 309 aa  80.1  0.00000000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1640  radical SAM domain-containing protein  23.86 
 
 		 317 aa  79.3  0.0000000000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3689  hypothetical protein  32.08 
 
 		 309 aa  79  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3591  hypothetical protein  32.08 
 
 		 309 aa  79  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0875  radical SAM domain-containing protein  28.45 
 
 		 359 aa  79  0.0000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0306  hypothetical protein  34.97 
 
 		 309 aa  78.2  0.0000000000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.216797  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1033  putative radical SAM protein  31.82 
 
 		 330 aa  78.2  0.0000000000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.247016  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3507  radical SAM family protein  32.08 
 
 		 309 aa  77.8  0.0000000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3559  radical SAM protein, TIGR01212 family  31.45 
 
 		 309 aa  77.8  0.0000000000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1501  radical SAM domain-containing protein  25.21 
 
 		 341 aa  77.4  0.0000000000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.166226  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0182  Radical SAM domain protein  32.26 
 
 		 401 aa  77.4  0.0000000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.534223  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3163  hypothetical protein  32.18 
 
 		 310 aa  77  0.0000000000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.096251  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0489  putative radical SAM protein  31.45 
 
 		 320 aa  77  0.0000000000007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.577174 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3522  radical SAM protein, TIGR01212 family  32.32 
 
 		 309 aa  77  0.0000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.998452  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03076  predicted Fe-S oxidoreductase  31.45 
 
 		 309 aa  76.6  0.0000000000008  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.709944  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0496  conserved hypothetical protein  31.45 
 
 		 309 aa  76.6  0.0000000000008  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1944  Radical SAM domain protein  33.33 
 
 		 374 aa  76.6  0.0000000000008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0450295  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4534  radical SAM protein, TIGR01212 family  31.45 
 
 		 309 aa  76.6  0.0000000000008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3404  radical SAM family protein  31.45 
 
 		 309 aa  76.6  0.0000000000008  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3699  radical SAM family protein  31.45 
 
 		 309 aa  76.6  0.0000000000008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03027  hypothetical protein  31.45 
 
 		 309 aa  76.6  0.0000000000008  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.828625  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3790  hypothetical protein  31.71 
 
 		 314 aa  76.6  0.0000000000009  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0994894  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0858  hypothetical protein  30.56 
 
 		 317 aa  76.6  0.0000000000009  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.104064  normal  0.132523 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3632  hypothetical protein  31.82 
 
 		 317 aa  75.9  0.000000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.197622  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0300  hypothetical protein  32.28 
 
 		 309 aa  76.3  0.000000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.558235  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2540  radical SAM domain-containing protein  28.63 
 
 		 340 aa  76.3  0.000000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.093156 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1127  radical SAM family protein  34.56 
 
 		 327 aa  75.1  0.000000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4343  putative radical SAM protein  34.62 
 
 		 312 aa  74.7  0.000000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.122173 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004465  hypothetical protein  30.52 
 
 		 319 aa  75.1  0.000000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1179  radical SAM domain-containing protein  24.35 
 
 		 314 aa  74.7  0.000000000004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00929  Fe-S oxidoreductase  27.27 
 
 		 314 aa  74.3  0.000000000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1326  hypothetical protein  33.79 
 
 		 309 aa  73.9  0.000000000006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0531  putative radical SAM protein  35.66 
 
 		 329 aa  73.6  0.000000000007  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.233315  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1222  putative radical SAM protein  34.4 
 
 		 312 aa  73.6  0.000000000007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.101192  normal  0.0468931 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0468  radical SAM family protein  35.94 
 
 		 307 aa  73.6  0.000000000008  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0660  Radical SAM domain protein  21.64 
 
 		 359 aa  72.4  0.00000000001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.142353  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3661  putative radical SAM protein  27.22 
 
 		 319 aa  72.4  0.00000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3168  conserved hypothetical radical SAM protein  30.77 
 
 		 311 aa  72  0.00000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.000379648  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2952  putative radical SAM protein  30.52 
 
 		 309 aa  69.7  0.00000000009  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.432245  normal  0.157754 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2960  Fe-S oxidoreductase  32.28 
 
 		 306 aa  69.3  0.0000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.392137  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3048  putative radical SAM protein  30.52 
 
 		 309 aa  69.7  0.0000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0315161  normal  0.32107 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3477  putative radical SAM protein  28.49 
 
 		 313 aa  69.3  0.0000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.143192  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1179  putative radical SAM protein  33.6 
 
 		 309 aa  69.7  0.0000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1137  putative radical SAM protein  32.8 
 
 		 309 aa  69.3  0.0000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00496914  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>