271 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pars_0122 on replicon NC_009376
Organism: Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008701  Pisl_1167  radical SAM domain-containing protein  79.49 
 
 
469 aa  775    Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.413437  normal  0.627812 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0088  radical SAM domain-containing protein  79.96 
 
 
477 aa  793    Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0202426 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0122  radical SAM domain-containing protein  100 
 
 
483 aa  982    Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1318  ELP3 family histone acetyltransferase  62.36 
 
 
510 aa  589  1e-167  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.340377 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1460  histone acetyltransferase, ELP3 family  47.97 
 
 
473 aa  436  1e-121  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1085  histone acetyltransferase, ELP3 family  48.39 
 
 
514 aa  438  1e-121  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.707697  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1755  ELP3 family histone acetyltransferase  46.3 
 
 
547 aa  408  1.0000000000000001e-112  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.668163  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1989  ELP3 family histone acetyltransferase  45.17 
 
 
548 aa  394  1e-108  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0579  ELP3 family histone acetyltransferase  41.08 
 
 
527 aa  388  1e-106  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1093  ELP3 family histone acetyltransferase  42.43 
 
 
541 aa  379  1e-104  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.108771  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0279  ELP3 family histone acetyltransferase  42.16 
 
 
563 aa  380  1e-104  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0612  ELP3 family histone acetyltransferase  46.06 
 
 
459 aa  378  1e-103  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.125099  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0824  ELP3 family histone acetyltransferase  42.04 
 
 
541 aa  375  1e-103  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.318054  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2046  ELP3 family histone acetyltransferase  44.61 
 
 
530 aa  378  1e-103  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0586  ELP3 family histone acetyltransferase  46.14 
 
 
459 aa  372  1e-102  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0000912711  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1832  ELP3 family histone acetyltransferase  41.83 
 
 
541 aa  370  1e-101  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0889  ELP3 family histone acetyltransferase  41.15 
 
 
541 aa  367  1e-100  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0898  ELP3 family histone acetyltransferase  43.1 
 
 
512 aa  368  1e-100  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.589047  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1304  hypothetical protein  43.13 
 
 
520 aa  366  1e-100  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_551  radical SAM superfamily  45.38 
 
 
459 aa  365  1e-99  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0398241  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1956  ELP3 family histone acetyltransferase  43.66 
 
 
526 aa  353  5e-96  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.724461 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2706  histone acetyltransferase, ELP3 family  41.96 
 
 
553 aa  350  3e-95  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_27329  predicted protein  43.01 
 
 
555 aa  350  4e-95  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.072078  hitchhiker  0.00552121 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0872  histone acetyltransferase, ELP3 family  41.13 
 
 
556 aa  350  5e-95  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_42410  predicted protein  41.05 
 
 
558 aa  349  5e-95  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02294  histone acetyltransferase, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G06140)  41.08 
 
 
574 aa  349  6e-95  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1133  ELP3 family histone acetyltransferase  41.14 
 
 
522 aa  349  6e-95  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2192  histone acetyltransferase, ELP3 family  42.38 
 
 
576 aa  348  1e-94  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2930  histone acetyltransferase, ELP3 family  40.79 
 
 
554 aa  340  2.9999999999999998e-92  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.281817  n/a   
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_50848  predicted protein  41.39 
 
 
544 aa  340  4e-92  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.104715  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1480  histone acetyltransferase, ELP3 family  39.39 
 
 
585 aa  336  5.999999999999999e-91  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.761791  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0952  histone acetyltransferase, ELP3 family  40.86 
 
 
526 aa  336  5.999999999999999e-91  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006680  CNK00950  Pol II transcription elongation factor, putative  40.08 
 
 
557 aa  327  2.0000000000000001e-88  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.110026  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0906  Histone acetyltransferase  30.04 
 
 
617 aa  279  7e-74  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.301086  normal  0.526584 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08040  histone acetyltransferase  31.65 
 
 
598 aa  274  3e-72  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.584733  hitchhiker  0.0000000843356 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11040  histone acetyltransferase  35.55 
 
 
666 aa  200  6e-50  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.142131  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2227  radical SAM domain-containing protein  32.01 
 
 
342 aa  114  4.0000000000000004e-24  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.775407  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1061  Radical SAM domain protein  32.61 
 
 
343 aa  114  4.0000000000000004e-24  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.8315700000000001e-19 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3202  Radical SAM domain protein  33.09 
 
 
342 aa  110  8.000000000000001e-23  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00235958  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2316  radical SAM family protein  33.33 
 
 
346 aa  108  2e-22  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3151  radical SAM domain-containing protein  30.8 
 
 
351 aa  107  5e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0207208  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0774  ELP3 component of the RNA polymerase II complex  29.41 
 
 
362 aa  106  1e-21  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00000160735  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1689  radical SAM domain-containing protein  27.27 
 
 
357 aa  102  2e-20  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0776794  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1971  radical SAM domain-containing protein  27.27 
 
 
357 aa  100  5e-20  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.144867  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0688  Radical SAM domain protein  26.38 
 
 
336 aa  100  6e-20  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1713  radical SAM domain-containing protein  27.46 
 
 
317 aa  97.1  6e-19  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1640  radical SAM domain-containing protein  27.46 
 
 
317 aa  97.1  7e-19  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0930  radical SAM family protein  27.22 
 
 
338 aa  95.1  2e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000118017  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1719  radical SAM domain-containing protein  23.38 
 
 
354 aa  94.7  3e-18  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.219309  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1944  Radical SAM domain protein  29.75 
 
 
374 aa  92.8  1e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0450295  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1160  Radical SAM domain protein  24.72 
 
 
341 aa  87.4  5e-16  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.276403  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1404  radical SAM protein, putative histone acetyltransferase  31.7 
 
 
345 aa  87  7e-16  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.00000266579  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2183  putative radical SAM protein  34.43 
 
 
351 aa  85.9  0.000000000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2238  Radical SAM domain protein  27.27 
 
 
354 aa  84.7  0.000000000000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1501  radical SAM domain-containing protein  29.24 
 
 
341 aa  84.7  0.000000000000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.166226  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1872  hypothetical protein  28.31 
 
 
319 aa  84  0.000000000000006  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.22126  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1179  radical SAM domain-containing protein  24.35 
 
 
314 aa  83.6  0.000000000000007  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0515  Elongator protein 3/MiaB/NifB  29.9 
 
 
309 aa  83.6  0.000000000000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.84475  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0875  radical SAM domain-containing protein  27.91 
 
 
359 aa  83.6  0.000000000000008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3477  putative radical SAM protein  30.32 
 
 
313 aa  83.2  0.000000000000009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.143192  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2187  hypothetical protein  28.42 
 
 
316 aa  83.2  0.00000000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  unclonable  0.000000345504 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0660  Radical SAM domain protein  24.19 
 
 
359 aa  82.8  0.00000000000001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.142353  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1777  radical SAM domain-containing protein  27.24 
 
 
352 aa  83.2  0.00000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.112435  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0739  radical SAM family protein  27.87 
 
 
332 aa  81.6  0.00000000000003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.974352  normal  0.805342 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2540  radical SAM domain-containing protein  29.63 
 
 
340 aa  81.3  0.00000000000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.093156 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0804  putative radical SAM protein  26.78 
 
 
334 aa  81.3  0.00000000000004  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.768446  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1950  hypothetical protein  31.29 
 
 
316 aa  80.5  0.00000000000006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2819  conserved hypothetical radical SAM protein  32.42 
 
 
372 aa  79.3  0.0000000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0182  Radical SAM domain protein  35.06 
 
 
401 aa  79  0.0000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.534223  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1179  radical SAM family protein  26.23 
 
 
332 aa  79  0.0000000000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.808864  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0787  radical SAM domain-containing protein  23.95 
 
 
317 aa  79  0.0000000000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3655  putative radical SAM protein  36.51 
 
 
328 aa  78.2  0.0000000000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0760029 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1293  putative radical SAM protein  26 
 
 
341 aa  76.6  0.0000000000008  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2966  Radical SAM domain protein  36.22 
 
 
344 aa  76.6  0.0000000000008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0294152  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0175  hypothetical protein  28.28 
 
 
317 aa  76.6  0.0000000000009  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.46847  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0038  conserved hypothetical radical SAM protein  29.63 
 
 
318 aa  76.6  0.0000000000009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0082  radical SAM family protein  25.68 
 
 
332 aa  76.3  0.000000000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0306  hypothetical protein  36 
 
 
309 aa  75.9  0.000000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.216797  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2882  radical SAM family protein  26.92 
 
 
311 aa  75.5  0.000000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2563  radical SAM family protein  26.92 
 
 
311 aa  75.5  0.000000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3559  radical SAM protein, TIGR01212 family  30.61 
 
 
309 aa  74.7  0.000000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4343  putative radical SAM protein  32.86 
 
 
312 aa  74.3  0.000000000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.122173 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0300  hypothetical protein  35.2 
 
 
309 aa  74.3  0.000000000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.558235  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3522  radical SAM protein, TIGR01212 family  31.85 
 
 
309 aa  73.6  0.000000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.998452  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3507  radical SAM family protein  32.59 
 
 
309 aa  73.6  0.000000000008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1562  Radical SAM domain protein  26.85 
 
 
401 aa  73.2  0.000000000009  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03076  predicted Fe-S oxidoreductase  32.59 
 
 
309 aa  73.2  0.00000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.709944  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0496  conserved hypothetical protein  32.59 
 
 
309 aa  73.2  0.00000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3627  hypothetical protein  33.6 
 
 
309 aa  73.2  0.00000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.672413 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3689  hypothetical protein  33.6 
 
 
309 aa  73.2  0.00000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3404  radical SAM family protein  32.59 
 
 
309 aa  73.2  0.00000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3699  radical SAM family protein  32.59 
 
 
309 aa  73.2  0.00000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03027  hypothetical protein  32.59 
 
 
309 aa  73.2  0.00000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.828625  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0489  putative radical SAM protein  32.35 
 
 
320 aa  72.8  0.00000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.577174 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4534  radical SAM protein, TIGR01212 family  32.59 
 
 
309 aa  73.2  0.00000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3520  radical SAM protein, TIGR01212 family  33.6 
 
 
309 aa  73.2  0.00000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3591  hypothetical protein  33.6 
 
 
309 aa  73.2  0.00000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0260  conserved hypothetical radical SAM protein  26.9 
 
 
307 aa  72.4  0.00000000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0964  putative radical SAM protein  32.3 
 
 
311 aa  72  0.00000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2960  Fe-S oxidoreductase  28.24 
 
 
306 aa  71.6  0.00000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.392137  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>