205 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PICST_42410 on replicon NC_009042
Organism: Scheffersomyces stipitis CBS 6054



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
BN001307  ANIA_02294  histone acetyltransferase, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G06140)  77.6 
 
 
574 aa  895    Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_50848  predicted protein  66.22 
 
 
544 aa  775    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.104715  n/a   
 
 
-
 
NC_006680  CNK00950  Pol II transcription elongation factor, putative  71.64 
 
 
557 aa  822    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.110026  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_42410  predicted protein  100 
 
 
558 aa  1162    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_27329  predicted protein  67.34 
 
 
555 aa  802    Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.072078  hitchhiker  0.00552121 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1085  histone acetyltransferase, ELP3 family  46.32 
 
 
514 aa  483  1e-135  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.707697  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0279  ELP3 family histone acetyltransferase  43.45 
 
 
563 aa  439  9.999999999999999e-123  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1460  histone acetyltransferase, ELP3 family  46.44 
 
 
473 aa  433  1e-120  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1093  ELP3 family histone acetyltransferase  41.28 
 
 
541 aa  423  1e-117  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.108771  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0824  ELP3 family histone acetyltransferase  40.92 
 
 
541 aa  420  1e-116  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.318054  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1755  ELP3 family histone acetyltransferase  41.49 
 
 
547 aa  418  9.999999999999999e-116  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.668163  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0579  ELP3 family histone acetyltransferase  41.71 
 
 
527 aa  413  1e-114  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1832  ELP3 family histone acetyltransferase  42.86 
 
 
541 aa  415  1e-114  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0889  ELP3 family histone acetyltransferase  43.26 
 
 
541 aa  412  1e-113  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0872  histone acetyltransferase, ELP3 family  42.55 
 
 
556 aa  405  1.0000000000000001e-112  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1989  ELP3 family histone acetyltransferase  42.78 
 
 
548 aa  406  1.0000000000000001e-112  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2192  histone acetyltransferase, ELP3 family  39.93 
 
 
576 aa  399  9.999999999999999e-111  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2706  histone acetyltransferase, ELP3 family  41.39 
 
 
553 aa  394  1e-108  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2930  histone acetyltransferase, ELP3 family  40.59 
 
 
554 aa  394  1e-108  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.281817  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1480  histone acetyltransferase, ELP3 family  38.7 
 
 
585 aa  394  1e-108  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.761791  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0898  ELP3 family histone acetyltransferase  41.29 
 
 
512 aa  384  1e-105  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.589047  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2046  ELP3 family histone acetyltransferase  40.4 
 
 
530 aa  374  1e-102  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1318  ELP3 family histone acetyltransferase  43.31 
 
 
510 aa  372  1e-101  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.340377 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1133  ELP3 family histone acetyltransferase  40.46 
 
 
522 aa  359  9e-98  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1304  hypothetical protein  37.92 
 
 
520 aa  357  3.9999999999999996e-97  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1167  radical SAM domain-containing protein  42.68 
 
 
469 aa  355  2e-96  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.413437  normal  0.627812 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0088  radical SAM domain-containing protein  41.42 
 
 
477 aa  352  8e-96  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0202426 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0952  histone acetyltransferase, ELP3 family  39.06 
 
 
526 aa  352  1e-95  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0122  radical SAM domain-containing protein  41.05 
 
 
483 aa  349  6e-95  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0612  ELP3 family histone acetyltransferase  41.03 
 
 
459 aa  348  2e-94  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.125099  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1956  ELP3 family histone acetyltransferase  37.85 
 
 
526 aa  345  8.999999999999999e-94  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.724461 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0586  ELP3 family histone acetyltransferase  40.6 
 
 
459 aa  342  1e-92  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0000912711  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_551  radical SAM superfamily  40.9 
 
 
459 aa  341  2e-92  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0398241  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0906  Histone acetyltransferase  29.38 
 
 
617 aa  228  3e-58  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.301086  normal  0.526584 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11040  histone acetyltransferase  29.17 
 
 
666 aa  218  2.9999999999999998e-55  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.142131  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08040  histone acetyltransferase  26.32 
 
 
598 aa  169  1e-40  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.584733  hitchhiker  0.0000000843356 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1061  Radical SAM domain protein  28.78 
 
 
343 aa  84.7  0.000000000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.8315700000000001e-19 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1179  radical SAM domain-containing protein  26.71 
 
 
314 aa  84  0.000000000000008  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1404  radical SAM protein, putative histone acetyltransferase  32.85 
 
 
345 aa  82  0.00000000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.00000266579  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2316  radical SAM family protein  29.12 
 
 
346 aa  81.6  0.00000000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2227  radical SAM domain-containing protein  26.98 
 
 
342 aa  80.1  0.00000000000009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.775407  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1713  radical SAM domain-containing protein  25.83 
 
 
317 aa  79.7  0.0000000000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3202  Radical SAM domain protein  27.97 
 
 
342 aa  79  0.0000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00235958  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1160  Radical SAM domain protein  28.06 
 
 
341 aa  78.6  0.0000000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.276403  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0688  Radical SAM domain protein  32.21 
 
 
336 aa  77.8  0.0000000000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1640  radical SAM domain-containing protein  25.42 
 
 
317 aa  77.4  0.0000000000006  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1689  radical SAM domain-containing protein  24.05 
 
 
357 aa  76.3  0.000000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0776794  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0875  radical SAM domain-containing protein  31.25 
 
 
359 aa  76.6  0.000000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0930  radical SAM family protein  31.37 
 
 
338 aa  76.6  0.000000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000118017  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0182  Radical SAM domain protein  26.34 
 
 
401 aa  75.9  0.000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.534223  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1719  radical SAM domain-containing protein  28.16 
 
 
354 aa  74.7  0.000000000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.219309  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1971  radical SAM domain-containing protein  24.05 
 
 
357 aa  74.3  0.000000000006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.144867  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1501  radical SAM domain-containing protein  28.14 
 
 
341 aa  73.6  0.00000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.166226  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0739  radical SAM family protein  31.01 
 
 
332 aa  73.2  0.00000000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.974352  normal  0.805342 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3655  putative radical SAM protein  26.51 
 
 
328 aa  72  0.00000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0760029 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0804  putative radical SAM protein  27.69 
 
 
334 aa  72.4  0.00000000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.768446  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2960  Fe-S oxidoreductase  31.79 
 
 
306 aa  71.6  0.00000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.392137  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0774  ELP3 component of the RNA polymerase II complex  28.57 
 
 
362 aa  72  0.00000000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00000160735  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0082  radical SAM family protein  29.75 
 
 
332 aa  71.6  0.00000000003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3151  radical SAM domain-containing protein  26.38 
 
 
351 aa  72  0.00000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0207208  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0347  putative radical SAM protein  29.02 
 
 
293 aa  71.2  0.00000000005  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2183  putative radical SAM protein  31.58 
 
 
351 aa  70.9  0.00000000006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1872  hypothetical protein  24.01 
 
 
319 aa  70.5  0.00000000007  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.22126  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1179  radical SAM family protein  29.11 
 
 
332 aa  70.1  0.00000000009  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.808864  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3520  radical SAM protein, TIGR01212 family  25.29 
 
 
309 aa  70.5  0.00000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3627  hypothetical protein  25.29 
 
 
309 aa  70.5  0.00000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.672413 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3790  hypothetical protein  25.88 
 
 
314 aa  70.1  0.0000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0994894  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3477  putative radical SAM protein  24.44 
 
 
313 aa  70.1  0.0000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.143192  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1944  Radical SAM domain protein  25.5 
 
 
374 aa  68.9  0.0000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0450295  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0306  hypothetical protein  25.88 
 
 
309 aa  68.9  0.0000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.216797  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1293  putative radical SAM protein  27.54 
 
 
341 aa  68.9  0.0000000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2238  Radical SAM domain protein  23.67 
 
 
354 aa  68.6  0.0000000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004465  hypothetical protein  26.06 
 
 
319 aa  68.6  0.0000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3689  hypothetical protein  24.71 
 
 
309 aa  68.2  0.0000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3591  hypothetical protein  24.71 
 
 
309 aa  68.2  0.0000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1137  putative radical SAM protein  28.99 
 
 
309 aa  68.2  0.0000000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00496914  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3507  radical SAM family protein  24.71 
 
 
309 aa  67.8  0.0000000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3134  hypothetical protein  28.99 
 
 
309 aa  67.4  0.0000000006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000932261  normal  0.614838 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1033  putative radical SAM protein  24.58 
 
 
330 aa  67.4  0.0000000006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.247016  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3522  radical SAM protein, TIGR01212 family  24.71 
 
 
309 aa  67  0.0000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.998452  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03076  predicted Fe-S oxidoreductase  24.71 
 
 
309 aa  67  0.0000000008  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.709944  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0496  conserved hypothetical protein  24.71 
 
 
309 aa  67  0.0000000008  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3699  radical SAM family protein  24.71 
 
 
309 aa  67  0.0000000008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3404  radical SAM family protein  24.71 
 
 
309 aa  67  0.0000000008  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03027  hypothetical protein  24.71 
 
 
309 aa  67  0.0000000008  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.828625  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4534  radical SAM protein, TIGR01212 family  24.71 
 
 
309 aa  67  0.0000000008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3559  radical SAM protein, TIGR01212 family  24.71 
 
 
309 aa  67  0.0000000008  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0964  putative radical SAM protein  30.91 
 
 
311 aa  67  0.0000000009  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2870  putative radical SAM protein  27.78 
 
 
309 aa  67  0.0000000009  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00453128  normal  0.0632795 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1179  putative radical SAM protein  28.99 
 
 
309 aa  67  0.0000000009  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0489  putative radical SAM protein  24.71 
 
 
320 aa  67  0.0000000009  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.577174 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1326  hypothetical protein  31.65 
 
 
309 aa  66.2  0.000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2952  putative radical SAM protein  27.78 
 
 
309 aa  66.2  0.000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.432245  normal  0.157754 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3048  putative radical SAM protein  27.78 
 
 
309 aa  66.6  0.000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0315161  normal  0.32107 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00929  Fe-S oxidoreductase  25.3 
 
 
314 aa  67  0.000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1256  putative radical SAM protein  28.99 
 
 
309 aa  65.9  0.000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0785555  normal  0.353815 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1223  putative radical SAM protein  28.99 
 
 
309 aa  65.5  0.000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.784754  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0300  hypothetical protein  24.26 
 
 
309 aa  65.5  0.000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.558235  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3163  hypothetical protein  26.51 
 
 
310 aa  64.7  0.000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.096251  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1950  hypothetical protein  24.24 
 
 
316 aa  64.7  0.000000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>