185 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CNK00950 on replicon NC_006680
Organism: Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
BN001307  ANIA_02294  histone acetyltransferase, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G06140)  72.26 
 
 		 574 aa  821    Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006680  CNK00950  Pol II transcription elongation factor, putative  100 
 
 		 557 aa  1157    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.110026  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_42410  predicted protein  71.82 
 
 		 558 aa  844    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_27329  predicted protein  70.15 
 
 		 555 aa  801    Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.072078  hitchhiker  0.00552121 
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_50848  predicted protein  64.05 
 
 		 544 aa  764    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.104715  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1085  histone acetyltransferase, ELP3 family  43.39 
 
 		 514 aa  464  1e-129  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.707697  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0279  ELP3 family histone acetyltransferase  42.58 
 
 		 563 aa  435  1e-120  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0579  ELP3 family histone acetyltransferase  43.94 
 
 		 527 aa  431  1e-119  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1460  histone acetyltransferase, ELP3 family  43.87 
 
 		 473 aa  411  1e-113  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1093  ELP3 family histone acetyltransferase  40.04 
 
 		 541 aa  406  1.0000000000000001e-112  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.108771  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0824  ELP3 family histone acetyltransferase  39.85 
 
 		 541 aa  405  1.0000000000000001e-112  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.318054  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1755  ELP3 family histone acetyltransferase  40.6 
 
 		 547 aa  405  1e-111  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.668163  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1832  ELP3 family histone acetyltransferase  40.04 
 
 		 541 aa  404  1e-111  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0889  ELP3 family histone acetyltransferase  41.59 
 
 		 541 aa  404  1e-111  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1989  ELP3 family histone acetyltransferase  41.38 
 
 		 548 aa  385  1e-106  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0872  histone acetyltransferase, ELP3 family  39.15 
 
 		 556 aa  379  1e-104  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2930  histone acetyltransferase, ELP3 family  40.8 
 
 		 554 aa  382  1e-104  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.281817  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2192  histone acetyltransferase, ELP3 family  40.19 
 
 		 576 aa  378  1e-103  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2706  histone acetyltransferase, ELP3 family  38.81 
 
 		 553 aa  376  1e-103  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1318  ELP3 family histone acetyltransferase  44.12 
 
 		 510 aa  377  1e-103  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.340377 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1480  histone acetyltransferase, ELP3 family  39.49 
 
 		 585 aa  378  1e-103  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.761791  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0898  ELP3 family histone acetyltransferase  39.44 
 
 		 512 aa  370  1e-101  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.589047  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2046  ELP3 family histone acetyltransferase  39.96 
 
 		 530 aa  368  1e-100  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1956  ELP3 family histone acetyltransferase  40.04 
 
 		 526 aa  365  1e-100  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.724461 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1304  hypothetical protein  40.44 
 
 		 520 aa  363  6e-99  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0952  histone acetyltransferase, ELP3 family  39.15 
 
 		 526 aa  361  2e-98  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1133  ELP3 family histone acetyltransferase  39.85 
 
 		 522 aa  356  5e-97  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0612  ELP3 family histone acetyltransferase  42.23 
 
 		 459 aa  352  8e-96  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.125099  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0586  ELP3 family histone acetyltransferase  42.02 
 
 		 459 aa  347  4e-94  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0000912711  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_551  radical SAM superfamily  41.6 
 
 		 459 aa  346  6e-94  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0398241  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1167  radical SAM domain-containing protein  42.17 
 
 		 469 aa  345  1e-93  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.413437  normal  0.627812 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0088  radical SAM domain-containing protein  42.38 
 
 		 477 aa  345  1e-93  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0202426 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0122  radical SAM domain-containing protein  41.13 
 
 		 483 aa  340  2.9999999999999998e-92  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0906  Histone acetyltransferase  29.77 
 
 		 617 aa  244  1.9999999999999999e-63  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.301086  normal  0.526584 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11040  histone acetyltransferase  34.01 
 
 		 666 aa  194  5e-48  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.142131  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08040  histone acetyltransferase  27.27 
 
 		 598 aa  187  4e-46  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.584733  hitchhiker  0.0000000843356 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1179  radical SAM domain-containing protein  27.5 
 
 		 314 aa  84  0.000000000000006  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2316  radical SAM family protein  28.46 
 
 		 346 aa  83.6  0.000000000000008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1404  radical SAM protein, putative histone acetyltransferase  33.58 
 
 		 345 aa  82.4  0.00000000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.00000266579  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1713  radical SAM domain-containing protein  26.25 
 
 		 317 aa  79  0.0000000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1160  Radical SAM domain protein  27.54 
 
 		 341 aa  78.2  0.0000000000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.276403  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0182  Radical SAM domain protein  26.34 
 
 		 401 aa  78.2  0.0000000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.534223  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1061  Radical SAM domain protein  27.82 
 
 		 343 aa  77.8  0.0000000000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.8315700000000001e-19 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0688  Radical SAM domain protein  33.1 
 
 		 336 aa  77.4  0.0000000000006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2227  radical SAM domain-containing protein  28.11 
 
 		 342 aa  77  0.0000000000008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.775407  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1719  radical SAM domain-containing protein  27.01 
 
 		 354 aa  76.3  0.000000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.219309  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1640  radical SAM domain-containing protein  26.67 
 
 		 317 aa  76.6  0.000000000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3202  Radical SAM domain protein  27.91 
 
 		 342 aa  75.9  0.000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00235958  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2238  Radical SAM domain protein  24.79 
 
 		 354 aa  76.3  0.000000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3151  radical SAM domain-containing protein  27.35 
 
 		 351 aa  75.5  0.000000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0207208  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1944  Radical SAM domain protein  27.66 
 
 		 374 aa  73.6  0.000000000009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0450295  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0774  ELP3 component of the RNA polymerase II complex  28.74 
 
 		 362 aa  73.2  0.00000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00000160735  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0930  radical SAM family protein  25.65 
 
 		 338 aa  73.2  0.00000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000118017  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1501  radical SAM domain-containing protein  28.79 
 
 		 341 aa  71.6  0.00000000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.166226  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0875  radical SAM domain-containing protein  30.93 
 
 		 359 aa  70.5  0.00000000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2540  radical SAM domain-containing protein  27.49 
 
 		 340 aa  68.9  0.0000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.093156 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0760  putative radical SAM protein  26.9 
 
 		 304 aa  68.9  0.0000000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.992819  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1777  radical SAM domain-containing protein  23.43 
 
 		 352 aa  67  0.0000000008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.112435  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2183  putative radical SAM protein  32.45 
 
 		 351 aa  67  0.0000000008  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0515  Elongator protein 3/MiaB/NifB  26.73 
 
 		 309 aa  66.6  0.000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.84475  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2966  Radical SAM domain protein  28.95 
 
 		 344 aa  66.2  0.000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0294152  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1689  radical SAM domain-containing protein  21.97 
 
 		 357 aa  65.9  0.000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0776794  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2960  Fe-S oxidoreductase  30.19 
 
 		 306 aa  65.5  0.000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.392137  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0306  hypothetical protein  22.05 
 
 		 309 aa  65.1  0.000000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.216797  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0347  putative radical SAM protein  24.39 
 
 		 293 aa  65.1  0.000000003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004465  hypothetical protein  25 
 
 		 319 aa  64.7  0.000000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3163  hypothetical protein  29.11 
 
 		 310 aa  65.1  0.000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.096251  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1033  putative radical SAM protein  25.84 
 
 		 330 aa  64.3  0.000000006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.247016  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3168  conserved hypothetical radical SAM protein  28.66 
 
 		 311 aa  63.9  0.000000007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.000379648  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1971  radical SAM domain-containing protein  21.97 
 
 		 357 aa  63.9  0.000000007  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.144867  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1293  putative radical SAM protein  25.95 
 
 		 341 aa  63.9  0.000000007  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3627  hypothetical protein  22.29 
 
 		 309 aa  63.2  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.672413 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3520  radical SAM protein, TIGR01212 family  22.29 
 
 		 309 aa  63.2  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0300  hypothetical protein  21.54 
 
 		 309 aa  63.5  0.00000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.558235  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1137  putative radical SAM protein  27.98 
 
 		 309 aa  63.2  0.00000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00496914  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1562  Radical SAM domain protein  27.01 
 
 		 401 aa  63.2  0.00000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3655  putative radical SAM protein  21.69 
 
 		 328 aa  62.4  0.00000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0760029 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0964  putative radical SAM protein  27.55 
 
 		 311 aa  62.4  0.00000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0804  putative radical SAM protein  22.22 
 
 		 334 aa  62.4  0.00000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.768446  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3790  hypothetical protein  23.81 
 
 		 314 aa  61.2  0.00000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0994894  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3134  hypothetical protein  27.38 
 
 		 309 aa  61.2  0.00000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000932261  normal  0.614838 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1156  putative radical SAM protein  27.75 
 
 		 307 aa  61.2  0.00000005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0308267  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00929  Fe-S oxidoreductase  23.89 
 
 		 314 aa  60.8  0.00000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3689  hypothetical protein  21.69 
 
 		 309 aa  60.8  0.00000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1179  radical SAM family protein  21.71 
 
 		 332 aa  60.8  0.00000006  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.808864  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3591  hypothetical protein  21.69 
 
 		 309 aa  60.8  0.00000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0165  hypothetical protein  26.9 
 
 		 347 aa  60.8  0.00000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.375388  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1179  putative radical SAM protein  27.38 
 
 		 309 aa  60.5  0.00000008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0739  radical SAM family protein  26.54 
 
 		 332 aa  60.5  0.00000008  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.974352  normal  0.805342 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0103  putative radical SAM protein  28.83 
 
 		 304 aa  60.1  0.00000009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0139654 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1565  putative radical SAM protein  24.08 
 
 		 300 aa  60.5  0.00000009  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.705687  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3507  radical SAM family protein  21.69 
 
 		 309 aa  59.7  0.0000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3559  radical SAM protein, TIGR01212 family  21.69 
 
 		 309 aa  59.7  0.0000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1950  hypothetical protein  23.87 
 
 		 316 aa  60.1  0.0000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1223  putative radical SAM protein  27.38 
 
 		 309 aa  59.7  0.0000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.784754  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3522  radical SAM protein, TIGR01212 family  21.69 
 
 		 309 aa  60.1  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.998452  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4343  putative radical SAM protein  26.72 
 
 		 312 aa  60.1  0.0000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.122173 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0496  conserved hypothetical protein  21.69 
 
 		 309 aa  59.3  0.0000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0082  radical SAM family protein  25 
 
 		 332 aa  59.3  0.0000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3699  radical SAM family protein  21.69 
 
 		 309 aa  59.3  0.0000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>