142 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpal_0952 on replicon NC_011832
Organism: Methanosphaerula palustris E1-9c



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007796  Mhun_1133  ELP3 family histone acetyltransferase  66.48 
 
 		 522 aa  695    Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1304  hypothetical protein  66.92 
 
 		 520 aa  705    Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2046  ELP3 family histone acetyltransferase  69.74 
 
 		 530 aa  694    Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0952  histone acetyltransferase, ELP3 family  100 
 
 		 526 aa  1083    Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1956  ELP3 family histone acetyltransferase  70.02 
 
 		 526 aa  707    Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.724461 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1755  ELP3 family histone acetyltransferase  51.01 
 
 		 547 aa  533  1e-150  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.668163  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1989  ELP3 family histone acetyltransferase  49.44 
 
 		 548 aa  521  1e-147  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2192  histone acetyltransferase, ELP3 family  50.97 
 
 		 576 aa  486  1e-136  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0898  ELP3 family histone acetyltransferase  51.25 
 
 		 512 aa  488  1e-136  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.589047  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0872  histone acetyltransferase, ELP3 family  48.37 
 
 		 556 aa  485  1e-136  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2706  histone acetyltransferase, ELP3 family  48.76 
 
 		 553 aa  482  1e-135  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2930  histone acetyltransferase, ELP3 family  48.69 
 
 		 554 aa  481  1e-134  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.281817  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1085  histone acetyltransferase, ELP3 family  44.84 
 
 		 514 aa  443  1e-123  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.707697  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1480  histone acetyltransferase, ELP3 family  46.98 
 
 		 585 aa  442  1e-123  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.761791  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1093  ELP3 family histone acetyltransferase  44.04 
 
 		 541 aa  440  9.999999999999999e-123  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.108771  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1832  ELP3 family histone acetyltransferase  44.04 
 
 		 541 aa  436  1e-121  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0824  ELP3 family histone acetyltransferase  43.84 
 
 		 541 aa  435  1e-121  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.318054  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0279  ELP3 family histone acetyltransferase  43.95 
 
 		 563 aa  429  1e-119  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0889  ELP3 family histone acetyltransferase  43.43 
 
 		 541 aa  422  1e-117  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1460  histone acetyltransferase, ELP3 family  45.44 
 
 		 473 aa  414  1e-114  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0579  ELP3 family histone acetyltransferase  40.11 
 
 		 527 aa  404  1e-111  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1318  ELP3 family histone acetyltransferase  43.04 
 
 		 510 aa  367  1e-100  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.340377 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_551  radical SAM superfamily  46.51 
 
 		 459 aa  363  4e-99  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0398241  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0612  ELP3 family histone acetyltransferase  46.41 
 
 		 459 aa  362  7.0000000000000005e-99  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.125099  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0586  ELP3 family histone acetyltransferase  46.09 
 
 		 459 aa  359  6e-98  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0000912711  n/a   
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_27329  predicted protein  39.74 
 
 		 555 aa  355  1e-96  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.072078  hitchhiker  0.00552121 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_42410  predicted protein  39.06 
 
 		 558 aa  352  1e-95  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_50848  predicted protein  38.29 
 
 		 544 aa  349  7e-95  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.104715  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02294  histone acetyltransferase, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G06140)  40.23 
 
 		 574 aa  347  3e-94  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006680  CNK00950  Pol II transcription elongation factor, putative  38.97 
 
 		 557 aa  346  7e-94  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.110026  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0122  radical SAM domain-containing protein  40.86 
 
 		 483 aa  336  7e-91  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0088  radical SAM domain-containing protein  41.2 
 
 		 477 aa  331  2e-89  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0202426 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1167  radical SAM domain-containing protein  41.58 
 
 		 469 aa  328  2.0000000000000001e-88  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.413437  normal  0.627812 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0906  Histone acetyltransferase  32.64 
 
 		 617 aa  268  2e-70  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.301086  normal  0.526584 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08040  histone acetyltransferase  31.49 
 
 		 598 aa  259  9e-68  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.584733  hitchhiker  0.0000000843356 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11040  histone acetyltransferase  32.34 
 
 		 666 aa  246  8e-64  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.142131  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3151  radical SAM domain-containing protein  29.84 
 
 		 351 aa  106  8e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0207208  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2227  radical SAM domain-containing protein  32.47 
 
 		 342 aa  104  4e-21  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.775407  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1061  Radical SAM domain protein  31.09 
 
 		 343 aa  100  6e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.8315700000000001e-19 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2316  radical SAM family protein  35.47 
 
 		 346 aa  99.4  1e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0930  radical SAM family protein  31.92 
 
 		 338 aa  95.5  2e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000118017  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1404  radical SAM protein, putative histone acetyltransferase  33.16 
 
 		 345 aa  94.4  5e-18  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.00000266579  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0774  ELP3 component of the RNA polymerase II complex  28.51 
 
 		 362 aa  91.3  4e-17  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00000160735  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3202  Radical SAM domain protein  30.25 
 
 		 342 aa  90.1  8e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00235958  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0688  Radical SAM domain protein  30.33 
 
 		 336 aa  88.6  3e-16  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1719  radical SAM domain-containing protein  28.23 
 
 		 354 aa  88.2  3e-16  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.219309  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1689  radical SAM domain-containing protein  24.6 
 
 		 357 aa  82.4  0.00000000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0776794  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1971  radical SAM domain-containing protein  24.76 
 
 		 357 aa  81.3  0.00000000000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.144867  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0660  Radical SAM domain protein  29.38 
 
 		 359 aa  80.5  0.00000000000006  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.142353  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0515  Elongator protein 3/MiaB/NifB  26.5 
 
 		 309 aa  77  0.0000000000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.84475  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1179  radical SAM domain-containing protein  25.65 
 
 		 314 aa  77  0.0000000000009  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0875  radical SAM domain-containing protein  28.7 
 
 		 359 aa  76.6  0.000000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0787  radical SAM domain-containing protein  28.16 
 
 		 317 aa  75.9  0.000000000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1501  radical SAM domain-containing protein  35.43 
 
 		 341 aa  73.9  0.000000000006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.166226  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1944  Radical SAM domain protein  31.72 
 
 		 374 aa  70.9  0.00000000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0450295  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1160  Radical SAM domain protein  28.11 
 
 		 341 aa  70.5  0.00000000008  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.276403  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1562  Radical SAM domain protein  31 
 
 		 401 aa  70.1  0.0000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0804  putative radical SAM protein  30.72 
 
 		 334 aa  68.9  0.0000000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.768446  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0182  Radical SAM domain protein  29.74 
 
 		 401 aa  67  0.0000000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.534223  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2540  radical SAM domain-containing protein  29.86 
 
 		 340 aa  67  0.0000000009  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.093156 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2966  Radical SAM domain protein  32.56 
 
 		 344 aa  63.9  0.000000007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0294152  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1777  radical SAM domain-containing protein  27.41 
 
 		 352 aa  63.9  0.000000007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.112435  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0739  radical SAM family protein  29.52 
 
 		 332 aa  63.5  0.000000009  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.974352  normal  0.805342 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1640  radical SAM domain-containing protein  25.45 
 
 		 317 aa  63.2  0.00000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1335  hypothetical protein  28.02 
 
 		 328 aa  62.8  0.00000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0087579  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1179  radical SAM family protein  28.31 
 
 		 332 aa  62.4  0.00000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.808864  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1713  radical SAM domain-containing protein  24.85 
 
 		 317 aa  61.6  0.00000004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2960  Fe-S oxidoreductase  29.88 
 
 		 306 aa  60.8  0.00000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.392137  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0082  radical SAM family protein  27.71 
 
 		 332 aa  60.8  0.00000006  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2238  Radical SAM domain protein  25 
 
 		 354 aa  60.1  0.00000009  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0760  putative radical SAM protein  25.57 
 
 		 304 aa  58.9  0.0000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.992819  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1872  hypothetical protein  20.82 
 
 		 319 aa  55.8  0.000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.22126  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1293  putative radical SAM protein  28.05 
 
 		 341 aa  55.5  0.000003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2936  hypothetical protein  22.92 
 
 		 319 aa  54.3  0.000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.971153  hitchhiker  0.00000000000000717489 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2080  hypothetical protein  25.26 
 
 		 316 aa  53.9  0.000007  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0165  hypothetical protein  31.88 
 
 		 347 aa  53.5  0.00001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.375388  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2374  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  30.43 
 
 		 448 aa  52.8  0.00001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2063  coproporphyrinogen III oxidase  26.85 
 
 		 384 aa  52  0.00002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1177  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  25.41 
 
 		 372 aa  52.4  0.00002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1363  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  27.66 
 
 		 389 aa  52  0.00003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3168  conserved hypothetical radical SAM protein  26.35 
 
 		 311 aa  51.2  0.00004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.000379648  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3582  putative oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  25.89 
 
 		 385 aa  50.8  0.00005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3661  putative radical SAM protein  25 
 
 		 319 aa  50.8  0.00006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1641  coproporphyrinogen III oxidase  29.25 
 
 		 374 aa  50.1  0.0001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.905653  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1675  coproporphyrinogen III oxidase  29.25 
 
 		 374 aa  50.1  0.0001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.370593  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0367  radical SAM family protein  28.22 
 
 		 305 aa  49.3  0.0002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0395363  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2882  radical SAM family protein  27.88 
 
 		 311 aa  48.5  0.0003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2563  radical SAM family protein  27.88 
 
 		 311 aa  48.5  0.0003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1360  putative oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  30.71 
 
 		 371 aa  48.5  0.0003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.716239  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1151  coproporphyrinogen III oxidase  25.17 
 
 		 374 aa  47.8  0.0005  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0038  conserved hypothetical radical SAM protein  22.56 
 
 		 318 aa  47.8  0.0005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1744  radical SAM domain-containing protein  23.78 
 
 		 380 aa  47.4  0.0007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00743194  decreased coverage  0.000183859 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3477  putative radical SAM protein  25.61 
 
 		 313 aa  47  0.0008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.143192  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2205  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  28.95 
 
 		 484 aa  47  0.0008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.434843  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0586  radical SAM family protein  23.44 
 
 		 319 aa  47  0.0009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0572  conserved hypothetical radical SAM protein  19.91 
 
 		 325 aa  47  0.0009  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0754  Radical SAM domain protein  24.31 
 
 		 319 aa  46.6  0.001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.00145958  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3023  radical SAM domain-containing protein  29.07 
 
 		 386 aa  46.2  0.001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2819  conserved hypothetical radical SAM protein  27.47 
 
 		 372 aa  46.6  0.001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4450  coproporphyrinogen III oxidase  28.57 
 
 		 378 aa  45.4  0.002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000131876  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>