More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpet_1640 on replicon NC_009486
Organism: Thermotoga petrophila RKU-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009486  Tpet_1640  radical SAM domain-containing protein  100 
 
 		 317 aa  642    Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1713  radical SAM domain-containing protein  92.11 
 
 		 317 aa  599  1e-170  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1179  radical SAM domain-containing protein  42.35 
 
 		 314 aa  255  5e-67  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0787  radical SAM domain-containing protein  41.67 
 
 		 317 aa  243  3e-63  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1160  Radical SAM domain protein  40.97 
 
 		 341 aa  212  7e-54  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.276403  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0930  radical SAM family protein  42.65 
 
 		 338 aa  204  2e-51  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000118017  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1501  radical SAM domain-containing protein  38.08 
 
 		 341 aa  202  6e-51  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.166226  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1719  radical SAM domain-containing protein  41.22 
 
 		 354 aa  196  4.0000000000000005e-49  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.219309  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0688  Radical SAM domain protein  36.84 
 
 		 336 aa  191  1e-47  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0774  ELP3 component of the RNA polymerase II complex  37.82 
 
 		 362 aa  186  4e-46  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00000160735  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0660  Radical SAM domain protein  37.68 
 
 		 359 aa  181  1e-44  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.142353  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1404  radical SAM protein, putative histone acetyltransferase  35.51 
 
 		 345 aa  179  8e-44  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.00000266579  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2227  radical SAM domain-containing protein  35.82 
 
 		 342 aa  178  1e-43  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.775407  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2238  Radical SAM domain protein  34.7 
 
 		 354 aa  177  2e-43  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1944  Radical SAM domain protein  35.29 
 
 		 374 aa  170  2e-41  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0450295  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1061  Radical SAM domain protein  35.94 
 
 		 343 aa  170  3e-41  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.8315700000000001e-19 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1777  radical SAM domain-containing protein  36.67 
 
 		 352 aa  168  1e-40  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.112435  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1971  radical SAM domain-containing protein  37.59 
 
 		 357 aa  167  2.9999999999999998e-40  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.144867  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0875  radical SAM domain-containing protein  36.88 
 
 		 359 aa  166  4e-40  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1689  radical SAM domain-containing protein  37.23 
 
 		 357 aa  165  8e-40  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0776794  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3202  Radical SAM domain protein  33.77 
 
 		 342 aa  165  8e-40  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00235958  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3151  radical SAM domain-containing protein  36.72 
 
 		 351 aa  164  2.0000000000000002e-39  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0207208  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0182  Radical SAM domain protein  31.43 
 
 		 401 aa  155  7e-37  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.534223  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2540  radical SAM domain-containing protein  32.72 
 
 		 340 aa  154  2e-36  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.093156 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2316  radical SAM family protein  32.35 
 
 		 346 aa  152  7e-36  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1562  Radical SAM domain protein  30.15 
 
 		 401 aa  149  5e-35  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0515  Elongator protein 3/MiaB/NifB  33.98 
 
 		 309 aa  147  2.0000000000000003e-34  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.84475  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2966  Radical SAM domain protein  33.1 
 
 		 344 aa  146  4.0000000000000006e-34  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0294152  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1085  histone acetyltransferase, ELP3 family  35.98 
 
 		 514 aa  102  6e-21  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.707697  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0088  radical SAM domain-containing protein  27.91 
 
 		 477 aa  100  3e-20  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0202426 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0898  ELP3 family histone acetyltransferase  34.59 
 
 		 512 aa  99.4  8e-20  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.589047  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0122  radical SAM domain-containing protein  27.46 
 
 		 483 aa  97.1  4e-19  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1460  histone acetyltransferase, ELP3 family  30.22 
 
 		 473 aa  91.3  2e-17  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1167  radical SAM domain-containing protein  32.09 
 
 		 469 aa  89.7  6e-17  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.413437  normal  0.627812 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1318  ELP3 family histone acetyltransferase  29.76 
 
 		 510 aa  89  9e-17  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.340377 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0824  ELP3 family histone acetyltransferase  28.3 
 
 		 541 aa  88.2  2e-16  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.318054  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1832  ELP3 family histone acetyltransferase  30.27 
 
 		 541 aa  88.2  2e-16  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3477  putative radical SAM protein  27.27 
 
 		 313 aa  87.8  2e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.143192  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1093  ELP3 family histone acetyltransferase  30.29 
 
 		 541 aa  86.3  6e-16  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.108771  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1177  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  30.08 
 
 		 372 aa  85.9  9e-16  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1755  ELP3 family histone acetyltransferase  31.89 
 
 		 547 aa  85.5  0.000000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.668163  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0739  radical SAM family protein  27.83 
 
 		 332 aa  84.3  0.000000000000003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.974352  normal  0.805342 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0279  ELP3 family histone acetyltransferase  26.92 
 
 		 563 aa  82.4  0.000000000000009  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1989  ELP3 family histone acetyltransferase  31.17 
 
 		 548 aa  82.4  0.00000000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0804  putative radical SAM protein  26.05 
 
 		 334 aa  80.9  0.00000000000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.768446  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_551  radical SAM superfamily  25.35 
 
 		 459 aa  80.5  0.00000000000003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0398241  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1179  radical SAM family protein  27.87 
 
 		 332 aa  80.1  0.00000000000004  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.808864  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0082  radical SAM family protein  26.42 
 
 		 332 aa  79.3  0.00000000000007  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0612  ELP3 family histone acetyltransferase  23.86 
 
 		 459 aa  79.3  0.00000000000008  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.125099  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0586  radical SAM family protein  27.01 
 
 		 319 aa  79.3  0.00000000000009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2187  hypothetical protein  26.29 
 
 		 316 aa  78.2  0.0000000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000345504 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1293  putative radical SAM protein  25.82 
 
 		 341 aa  78.2  0.0000000000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2010  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  30.61 
 
 		 371 aa  77.8  0.0000000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02294  histone acetyltransferase, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G06140)  26.32 
 
 		 574 aa  77.8  0.0000000000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0651  conserved hypothetical radical SAM protein  27.27 
 
 		 318 aa  77.4  0.0000000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_10143  predicted protein  28.31 
 
 		 408 aa  77.4  0.0000000000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00183786  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_42410  predicted protein  25.42 
 
 		 558 aa  77.4  0.0000000000003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006680  CNK00950  Pol II transcription elongation factor, putative  25.42 
 
 		 557 aa  76.6  0.0000000000005  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.110026  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0586  ELP3 family histone acetyltransferase  25 
 
 		 459 aa  76.6  0.0000000000005  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0000912711  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0664  hypothetical protein  26.32 
 
 		 318 aa  76.3  0.0000000000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.08613e-26 
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_50848  predicted protein  24.58 
 
 		 544 aa  76.3  0.0000000000007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.104715  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0579  ELP3 family histone acetyltransferase  22.97 
 
 		 527 aa  76.3  0.0000000000007  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0261  Radical SAM domain protein  27.2 
 
 		 564 aa  75.9  0.0000000000009  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0572  conserved hypothetical radical SAM protein  27.43 
 
 		 325 aa  75.9  0.0000000000009  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2936  hypothetical protein  28.3 
 
 		 319 aa  75.9  0.000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.971153  hitchhiker  0.00000000000000717489 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0889  ELP3 family histone acetyltransferase  26.92 
 
 		 541 aa  75.5  0.000000000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1480  histone acetyltransferase, ELP3 family  25.25 
 
 		 585 aa  74.3  0.000000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.761791  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0038  conserved hypothetical radical SAM protein  23.94 
 
 		 318 aa  73.6  0.000000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1649  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  29.44 
 
 		 370 aa  73.6  0.000000000004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.797828  normal  0.0143577 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3632  hypothetical protein  29.63 
 
 		 317 aa  73.2  0.000000000005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.197622  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11040  histone acetyltransferase  29.14 
 
 		 666 aa  73.2  0.000000000005  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.142131  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1363  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  29.41 
 
 		 389 aa  72.8  0.000000000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1358  putative radical SAM protein  27.83 
 
 		 318 aa  72.8  0.000000000008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.161503  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0944  putative oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  24.88 
 
 		 375 aa  72.4  0.00000000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_27329  predicted protein  28.05 
 
 		 555 aa  71.6  0.00000000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.072078  hitchhiker  0.00552121 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1956  ELP3 family histone acetyltransferase  27.88 
 
 		 526 aa  71.2  0.00000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.724461 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0165  hypothetical protein  24.49 
 
 		 347 aa  70.5  0.00000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.375388  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08040  histone acetyltransferase  29.46 
 
 		 598 aa  70.5  0.00000000004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.584733  hitchhiker  0.0000000843356 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2357  coproporphyrinogen III oxidase, anaerobic  27.04 
 
 		 466 aa  70.1  0.00000000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0972265  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3661  putative radical SAM protein  25 
 
 		 319 aa  70.1  0.00000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1360  putative oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  27.49 
 
 		 371 aa  69.7  0.00000000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.716239  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0488  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  24.2 
 
 		 374 aa  69.3  0.00000000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0936  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  25.66 
 
 		 383 aa  68.2  0.0000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2706  histone acetyltransferase, ELP3 family  24.86 
 
 		 553 aa  68.6  0.0000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1736  hypothetical protein  25.99 
 
 		 317 aa  67.8  0.0000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1087  radical SAM family protein  26.94 
 
 		 311 aa  67.4  0.0000000003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.447962 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1176  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase, putative  32.77 
 
 		 422 aa  67.4  0.0000000003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.238058  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3655  putative radical SAM protein  23.08 
 
 		 328 aa  67  0.0000000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0760029 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4085  Coproporphyrinogen dehydrogenase  24.04 
 
 		 468 aa  67  0.0000000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2819  conserved hypothetical radical SAM protein  25.36 
 
 		 372 aa  67  0.0000000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0347  putative radical SAM protein  36.29 
 
 		 293 aa  66.6  0.0000000005  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4306  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  27.94 
 
 		 375 aa  67  0.0000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0329595  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10300  putative oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  25.96 
 
 		 372 aa  66.6  0.0000000005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0541623  unclonable  0.00000000192008 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0872  histone acetyltransferase, ELP3 family  24.28 
 
 		 556 aa  66.2  0.0000000007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2843  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  24.12 
 
 		 374 aa  66.2  0.0000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.225724  normal  0.624237 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2882  radical SAM family protein  29.19 
 
 		 311 aa  66.2  0.0000000007  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2563  radical SAM family protein  29.19 
 
 		 311 aa  66.2  0.0000000007  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3769  conserved hypothetical radical SAM protein  26.32 
 
 		 321 aa  65.5  0.000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1133  ELP3 family histone acetyltransferase  25.9 
 
 		 522 aa  65.5  0.000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2046  ELP3 family histone acetyltransferase  26.44 
 
 		 530 aa  65.5  0.000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>