More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Athe_1160 on replicon NC_012034
Organism: Anaerocellum thermophilum DSM 6725



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012034  Athe_1160  Radical SAM domain protein  100 
 
 		 341 aa  697    Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.276403  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0930  radical SAM family protein  44.37 
 
 		 338 aa  280  3e-74  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000118017  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0688  Radical SAM domain protein  43.3 
 
 		 336 aa  274  1.0000000000000001e-72  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1719  radical SAM domain-containing protein  41.98 
 
 		 354 aa  274  1.0000000000000001e-72  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.219309  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1501  radical SAM domain-containing protein  40.31 
 
 		 341 aa  268  7e-71  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.166226  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0774  ELP3 component of the RNA polymerase II complex  42.77 
 
 		 362 aa  259  5.0000000000000005e-68  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00000160735  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1971  radical SAM domain-containing protein  40 
 
 		 357 aa  249  4e-65  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.144867  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1689  radical SAM domain-containing protein  39.44 
 
 		 357 aa  247  2e-64  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0776794  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2316  radical SAM family protein  38.26 
 
 		 346 aa  239  6.999999999999999e-62  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1061  Radical SAM domain protein  38.02 
 
 		 343 aa  235  8e-61  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.8315700000000001e-19 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3151  radical SAM domain-containing protein  39.56 
 
 		 351 aa  234  2.0000000000000002e-60  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0207208  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0660  Radical SAM domain protein  42.39 
 
 		 359 aa  230  3e-59  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.142353  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1944  Radical SAM domain protein  36.33 
 
 		 374 aa  227  3e-58  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0450295  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3202  Radical SAM domain protein  37.7 
 
 		 342 aa  226  6e-58  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00235958  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1713  radical SAM domain-containing protein  42.01 
 
 		 317 aa  219  5e-56  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2227  radical SAM domain-containing protein  36.93 
 
 		 342 aa  215  9.999999999999999e-55  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.775407  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1179  radical SAM domain-containing protein  39.56 
 
 		 314 aa  215  9.999999999999999e-55  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1777  radical SAM domain-containing protein  36.54 
 
 		 352 aa  214  1.9999999999999998e-54  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.112435  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1640  radical SAM domain-containing protein  40.97 
 
 		 317 aa  212  7e-54  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1404  radical SAM protein, putative histone acetyltransferase  35.9 
 
 		 345 aa  211  2e-53  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.00000266579  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0875  radical SAM domain-containing protein  35.33 
 
 		 359 aa  206  6e-52  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0787  radical SAM domain-containing protein  41.24 
 
 		 317 aa  199  5e-50  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2238  Radical SAM domain protein  31.49 
 
 		 354 aa  181  2e-44  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2966  Radical SAM domain protein  32.37 
 
 		 344 aa  171  1e-41  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0294152  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1562  Radical SAM domain protein  32.49 
 
 		 401 aa  167  2e-40  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0515  Elongator protein 3/MiaB/NifB  34.13 
 
 		 309 aa  164  2.0000000000000002e-39  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.84475  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2540  radical SAM domain-containing protein  33.09 
 
 		 340 aa  157  2e-37  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.093156 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0182  Radical SAM domain protein  31.11 
 
 		 401 aa  149  8e-35  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.534223  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0898  ELP3 family histone acetyltransferase  31.27 
 
 		 512 aa  115  1.0000000000000001e-24  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.589047  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0804  putative radical SAM protein  34.17 
 
 		 334 aa  109  7.000000000000001e-23  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.768446  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1460  histone acetyltransferase, ELP3 family  30.22 
 
 		 473 aa  108  1e-22  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0739  radical SAM family protein  33.8 
 
 		 332 aa  108  1e-22  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.974352  normal  0.805342 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1085  histone acetyltransferase, ELP3 family  29.62 
 
 		 514 aa  108  1e-22  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.707697  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1179  radical SAM family protein  33.65 
 
 		 332 aa  108  1e-22  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.808864  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1832  ELP3 family histone acetyltransferase  34.63 
 
 		 541 aa  106  5e-22  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0082  radical SAM family protein  32.69 
 
 		 332 aa  106  5e-22  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1093  ELP3 family histone acetyltransferase  35.12 
 
 		 541 aa  105  1e-21  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.108771  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0824  ELP3 family histone acetyltransferase  34.63 
 
 		 541 aa  104  2e-21  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.318054  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1755  ELP3 family histone acetyltransferase  34.84 
 
 		 547 aa  104  2e-21  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.668163  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0279  ELP3 family histone acetyltransferase  28.47 
 
 		 563 aa  102  1e-20  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0579  ELP3 family histone acetyltransferase  30.36 
 
 		 527 aa  100  3e-20  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0612  ELP3 family histone acetyltransferase  28.26 
 
 		 459 aa  98.6  1e-19  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.125099  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1989  ELP3 family histone acetyltransferase  31.67 
 
 		 548 aa  99  1e-19  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_551  radical SAM superfamily  28.26 
 
 		 459 aa  97.8  2e-19  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0398241  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0586  ELP3 family histone acetyltransferase  28.34 
 
 		 459 aa  97.4  3e-19  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0000912711  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1293  putative radical SAM protein  30.88 
 
 		 341 aa  96.7  5e-19  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0889  ELP3 family histone acetyltransferase  32.82 
 
 		 541 aa  96.3  6e-19  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1318  ELP3 family histone acetyltransferase  26.45 
 
 		 510 aa  95.9  9e-19  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.340377 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0088  radical SAM domain-containing protein  26.02 
 
 		 477 aa  93.2  6e-18  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0202426 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1358  putative radical SAM protein  30.84 
 
 		 318 aa  91.3  2e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.161503  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0347  putative radical SAM protein  32.42 
 
 		 293 aa  89.7  7e-17  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11990  radical SAM protein, TIGR01212 family  30.17 
 
 		 318 aa  88.6  1e-16  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000013437  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0122  radical SAM domain-containing protein  24.72 
 
 		 483 aa  87.4  3e-16  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0872  histone acetyltransferase, ELP3 family  29.53 
 
 		 556 aa  87  4e-16  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0572  conserved hypothetical radical SAM protein  28.69 
 
 		 325 aa  86.7  5e-16  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2192  histone acetyltransferase, ELP3 family  27.91 
 
 		 576 aa  86.7  6e-16  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08040  histone acetyltransferase  31.16 
 
 		 598 aa  85.9  9e-16  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.584733  hitchhiker  0.0000000843356 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1565  putative radical SAM protein  35.65 
 
 		 300 aa  85.5  0.000000000000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.705687  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1167  radical SAM domain-containing protein  28.33 
 
 		 469 aa  85.5  0.000000000000001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.413437  normal  0.627812 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0760  putative radical SAM protein  31.4 
 
 		 304 aa  84.7  0.000000000000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.992819  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1418  conserved hypothetical radical SAM protein  31.87 
 
 		 312 aa  84.7  0.000000000000002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2706  histone acetyltransferase, ELP3 family  27.98 
 
 		 553 aa  82.8  0.000000000000008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3163  hypothetical protein  30.05 
 
 		 310 aa  82.4  0.000000000000009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.096251  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3477  putative radical SAM protein  27.05 
 
 		 313 aa  82.4  0.000000000000009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.143192  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0370  putative radical SAM protein  27.33 
 
 		 313 aa  82.4  0.000000000000009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2187  hypothetical protein  29.85 
 
 		 316 aa  81.6  0.00000000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000345504 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2930  histone acetyltransferase, ELP3 family  28.9 
 
 		 554 aa  81.3  0.00000000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.281817  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0651  conserved hypothetical radical SAM protein  27.59 
 
 		 318 aa  81.3  0.00000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2046  ELP3 family histone acetyltransferase  29.17 
 
 		 530 aa  81.6  0.00000000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0906  Histone acetyltransferase  25.46 
 
 		 617 aa  80.9  0.00000000000003  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.301086  normal  0.526584 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0664  hypothetical protein  29.06 
 
 		 318 aa  80.9  0.00000000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.08613e-26 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11040  histone acetyltransferase  32.84 
 
 		 666 aa  80.5  0.00000000000004  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.142131  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0260  conserved hypothetical radical SAM protein  26.18 
 
 		 307 aa  80.5  0.00000000000004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1736  hypothetical protein  25.87 
 
 		 317 aa  79.7  0.00000000000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1480  histone acetyltransferase, ELP3 family  29.73 
 
 		 585 aa  79.7  0.00000000000007  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.761791  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1304  hypothetical protein  30.96 
 
 		 520 aa  79.3  0.00000000000009  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_50848  predicted protein  27.46 
 
 		 544 aa  79  0.0000000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.104715  n/a   
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_27329  predicted protein  27.45 
 
 		 555 aa  78.6  0.0000000000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.072078  hitchhiker  0.00552121 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0964  putative radical SAM protein  26.8 
 
 		 311 aa  79  0.0000000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_42410  predicted protein  28.06 
 
 		 558 aa  78.6  0.0000000000001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0586  radical SAM family protein  28.08 
 
 		 319 aa  77.8  0.0000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1156  putative radical SAM protein  25.97 
 
 		 307 aa  78.2  0.0000000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0308267  n/a   
 
 
-
 
NC_006680  CNK00950  Pol II transcription elongation factor, putative  27.54 
 
 		 557 aa  78.2  0.0000000000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.110026  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0038  conserved hypothetical radical SAM protein  26.34 
 
 		 318 aa  78.2  0.0000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0422  putative radical SAM protein  29.36 
 
 		 303 aa  77.4  0.0000000000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3769  conserved hypothetical radical SAM protein  29.53 
 
 		 321 aa  77.4  0.0000000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0407  putative radical SAM protein  34.31 
 
 		 303 aa  77.4  0.0000000000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.145155  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2203  hypothetical protein  26.41 
 
 		 314 aa  77.8  0.0000000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0858  hypothetical protein  23.88 
 
 		 317 aa  77.8  0.0000000000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.104064  normal  0.132523 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1033  putative radical SAM protein  25 
 
 		 330 aa  76.6  0.0000000000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.247016  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2936  hypothetical protein  26.83 
 
 		 319 aa  76.6  0.0000000000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.971153  hitchhiker  0.00000000000000717489 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3853  hypothetical protein  29.53 
 
 		 311 aa  76.3  0.0000000000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000731814 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2950  putative radical SAM protein  25.21 
 
 		 322 aa  76.3  0.0000000000008  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.474173  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00929  Fe-S oxidoreductase  25.45 
 
 		 314 aa  74.3  0.000000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1872  hypothetical protein  32.37 
 
 		 319 aa  73.9  0.000000000003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.22126  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1956  ELP3 family histone acetyltransferase  29.19 
 
 		 526 aa  74.3  0.000000000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.724461 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0367  radical SAM family protein  28.29 
 
 		 305 aa  73.9  0.000000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0395363  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3661  putative radical SAM protein  26.5 
 
 		 319 aa  73.6  0.000000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0306  hypothetical protein  25 
 
 		 309 aa  73.6  0.000000000005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.216797  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004465  hypothetical protein  25.45 
 
 		 319 aa  73.6  0.000000000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>