More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dbac_2966 on replicon NC_013173
Organism: Desulfomicrobium baculatum DSM 4028



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013173  Dbac_2966  Radical SAM domain protein  100 
 
 		 344 aa  678    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0294152  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2238  Radical SAM domain protein  43.54 
 
 		 354 aa  273  4.0000000000000004e-72  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0515  Elongator protein 3/MiaB/NifB  44.08 
 
 		 309 aa  242  7.999999999999999e-63  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.84475  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1562  Radical SAM domain protein  42.58 
 
 		 401 aa  240  2e-62  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2540  radical SAM domain-containing protein  43.15 
 
 		 340 aa  225  9e-58  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.093156 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0182  Radical SAM domain protein  37.7 
 
 		 401 aa  199  3.9999999999999996e-50  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.534223  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1061  Radical SAM domain protein  38.76 
 
 		 343 aa  198  9e-50  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.8315700000000001e-19 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0875  radical SAM domain-containing protein  40 
 
 		 359 aa  195  1e-48  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3151  radical SAM domain-containing protein  39.31 
 
 		 351 aa  194  2e-48  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0207208  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0774  ELP3 component of the RNA polymerase II complex  37.77 
 
 		 362 aa  192  7e-48  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00000160735  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1160  Radical SAM domain protein  32.57 
 
 		 341 aa  192  1e-47  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.276403  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0930  radical SAM family protein  34.94 
 
 		 338 aa  191  1e-47  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000118017  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3202  Radical SAM domain protein  38.58 
 
 		 342 aa  189  7e-47  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00235958  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1719  radical SAM domain-containing protein  34.33 
 
 		 354 aa  189  8e-47  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.219309  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1713  radical SAM domain-containing protein  38.25 
 
 		 317 aa  187  2e-46  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1501  radical SAM domain-containing protein  39.33 
 
 		 341 aa  185  9e-46  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.166226  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2316  radical SAM family protein  38.99 
 
 		 346 aa  182  1e-44  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1944  Radical SAM domain protein  37.26 
 
 		 374 aa  182  1e-44  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0450295  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0688  Radical SAM domain protein  32.69 
 
 		 336 aa  179  4.999999999999999e-44  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1404  radical SAM protein, putative histone acetyltransferase  36.27 
 
 		 345 aa  179  7e-44  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.00000266579  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1777  radical SAM domain-containing protein  38.78 
 
 		 352 aa  179  8e-44  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.112435  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2227  radical SAM domain-containing protein  39.75 
 
 		 342 aa  177  2e-43  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.775407  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1689  radical SAM domain-containing protein  30.14 
 
 		 357 aa  177  2e-43  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0776794  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0660  Radical SAM domain protein  31.45 
 
 		 359 aa  177  3e-43  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.142353  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1640  radical SAM domain-containing protein  36.14 
 
 		 317 aa  177  3e-43  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1971  radical SAM domain-containing protein  30.14 
 
 		 357 aa  176  7e-43  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.144867  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1179  radical SAM domain-containing protein  28.62 
 
 		 314 aa  174  9.999999999999999e-43  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0787  radical SAM domain-containing protein  33.46 
 
 		 317 aa  157  3e-37  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1832  ELP3 family histone acetyltransferase  26.37 
 
 		 541 aa  92  1e-17  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0824  ELP3 family histone acetyltransferase  26.6 
 
 		 541 aa  92  1e-17  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.318054  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1093  ELP3 family histone acetyltransferase  25.87 
 
 		 541 aa  90.9  3e-17  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.108771  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0279  ELP3 family histone acetyltransferase  26.13 
 
 		 563 aa  90.9  3e-17  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0889  ELP3 family histone acetyltransferase  24.88 
 
 		 541 aa  86.3  7e-16  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1177  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  25.37 
 
 		 372 aa  82.4  0.000000000000009  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0475  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase, putative  29.01 
 
 		 376 aa  81.3  0.00000000000002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0122  radical SAM domain-containing protein  29.67 
 
 		 483 aa  81.3  0.00000000000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1133  ELP3 family histone acetyltransferase  29.15 
 
 		 522 aa  81.6  0.00000000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1085  histone acetyltransferase, ELP3 family  27.42 
 
 		 514 aa  81.6  0.00000000000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.707697  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0332  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  28.12 
 
 		 374 aa  80.1  0.00000000000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.187228  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0030  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase, putative  32.54 
 
 		 385 aa  80.5  0.00000000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.949331  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11040  histone acetyltransferase  31.52 
 
 		 666 aa  79.7  0.00000000000007  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.142131  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0088  radical SAM domain-containing protein  29.85 
 
 		 477 aa  79.3  0.00000000000009  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0202426 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1304  putative oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  29.02 
 
 		 381 aa  78.6  0.0000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2046  ELP3 family histone acetyltransferase  30.48 
 
 		 530 aa  77.4  0.0000000000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0579  ELP3 family histone acetyltransferase  25.89 
 
 		 527 aa  77  0.0000000000005  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0872  histone acetyltransferase, ELP3 family  25.97 
 
 		 556 aa  76.6  0.0000000000006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0222  putative oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  32.81 
 
 		 371 aa  76.3  0.0000000000007  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1318  ELP3 family histone acetyltransferase  23.71 
 
 		 510 aa  76.3  0.0000000000007  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.340377 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2785  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  33.17 
 
 		 395 aa  75.1  0.000000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.419951  normal  0.420525 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1806  putative oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  27.73 
 
 		 374 aa  75.5  0.000000000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_10143  predicted protein  31.63 
 
 		 408 aa  75.1  0.000000000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00183786  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1649  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  25.98 
 
 		 374 aa  74.7  0.000000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1167  radical SAM domain-containing protein  29.41 
 
 		 469 aa  75.1  0.000000000002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.413437  normal  0.627812 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2082  coproporphyrinogen III oxidase  22.17 
 
 		 375 aa  73.6  0.000000000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0898  ELP3 family histone acetyltransferase  33.08 
 
 		 512 aa  73.9  0.000000000004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.589047  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0485  coproporphyrinogen III oxidase  27.34 
 
 		 384 aa  73.9  0.000000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1363  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  27.09 
 
 		 389 aa  73.6  0.000000000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08040  histone acetyltransferase  33.33 
 
 		 598 aa  73.6  0.000000000005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.584733  hitchhiker  0.0000000843356 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1358  putative radical SAM protein  24.46 
 
 		 318 aa  73.6  0.000000000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.161503  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1956  ELP3 family histone acetyltransferase  33.33 
 
 		 526 aa  72.8  0.000000000007  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.724461 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0586  ELP3 family histone acetyltransferase  28.46 
 
 		 459 aa  73.2  0.000000000007  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0000912711  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05040  coproporphyrinogen III oxidase  28.82 
 
 		 384 aa  72.8  0.000000000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11650  coproporphyrinogen III oxidase, anaerobic  33.48 
 
 		 411 aa  72.8  0.000000000008  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0627344  normal  0.396756 
 
 
-
 
NC_002936  DET0612  ELP3 family histone acetyltransferase  28.06 
 
 		 459 aa  72.4  0.00000000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.125099  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3411  coproporphyrinogen III oxidase  33.17 
 
 		 401 aa  72  0.00000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.102052 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0347  putative radical SAM protein  22.56 
 
 		 293 aa  72  0.00000000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2199  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  31.9 
 
 		 448 aa  72  0.00000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.186673  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0261  Radical SAM domain protein  27.31 
 
 		 564 aa  72.4  0.00000000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1736  hypothetical protein  24.28 
 
 		 317 aa  71.6  0.00000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_551  radical SAM superfamily  28.46 
 
 		 459 aa  71.6  0.00000000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0398241  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2706  histone acetyltransferase, ELP3 family  27.17 
 
 		 553 aa  71.2  0.00000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0799  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  25.23 
 
 		 415 aa  71.6  0.00000000002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3320  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  25.13 
 
 		 357 aa  72  0.00000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00918826  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2239  coproporphyrinogen III oxidase  31.05 
 
 		 409 aa  71.2  0.00000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.167009  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0380  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  23.05 
 
 		 379 aa  71.2  0.00000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.182118  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1108  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  22.82 
 
 		 360 aa  72  0.00000000002  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12400  coproporphyrinogen III oxidase, anaerobic  33.49 
 
 		 426 aa  71.2  0.00000000003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  decreased coverage  0.00807664  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2930  histone acetyltransferase, ELP3 family  30 
 
 		 554 aa  71.2  0.00000000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.281817  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0545  Coproporphyrinogen dehydrogenase  32.11 
 
 		 404 aa  70.5  0.00000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.693751  normal  0.412237 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1980  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  30.15 
 
 		 385 aa  70.5  0.00000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.958254  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2346  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase, putative  30.15 
 
 		 385 aa  70.5  0.00000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0630  coproporphyrinogen III oxidase  27.56 
 
 		 393 aa  70.1  0.00000000005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.824124  normal  0.0911038 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4222  coproporphyrinogen III oxidase  27.51 
 
 		 413 aa  70.1  0.00000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1989  ELP3 family histone acetyltransferase  25.35 
 
 		 548 aa  70.1  0.00000000006  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11990  radical SAM protein, TIGR01212 family  22.85 
 
 		 318 aa  69.7  0.00000000007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000013437  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1304  hypothetical protein  27.93 
 
 		 520 aa  69.3  0.00000000008  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006680  CNK00950  Pol II transcription elongation factor, putative  26.13 
 
 		 557 aa  68.9  0.0000000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.110026  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2010  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  32.54 
 
 		 371 aa  68.9  0.0000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1360  putative oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  28.71 
 
 		 371 aa  69.3  0.0000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.716239  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1337  coproporphyrinogen III oxidase  21.18 
 
 		 392 aa  68.6  0.0000000001  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1716  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  35.84 
 
 		 384 aa  68.6  0.0000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.871197  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4243  coproporphyrinogen III oxidase  26.98 
 
 		 413 aa  67.8  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0572  conserved hypothetical radical SAM protein  26.91 
 
 		 325 aa  68.2  0.0000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0835  coproporphyrinogen III oxidase  30.59 
 
 		 410 aa  68.2  0.0000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2223  coproporphyrinogen III oxidase  24.69 
 
 		 396 aa  68.2  0.0000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2215  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  31.75 
 
 		 412 aa  68.2  0.0000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.892548  normal  0.0148235 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4462  coproporphyrinogen III oxidase  24.29 
 
 		 435 aa  67.8  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1841  coproporphyrinogen III oxidase  29.9 
 
 		 439 aa  68.2  0.0000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0760  putative radical SAM protein  24.81 
 
 		 304 aa  67.8  0.0000000003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.992819  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3535  coproporphyrinogen III oxidase, anaerobic  36.75 
 
 		 383 aa  67.4  0.0000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000160096  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>