More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppro_1777 on replicon NC_008609
Organism: Pelobacter propionicus DSM 2379



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008609  Ppro_1777  radical SAM domain-containing protein  100 
 
 		 352 aa  709    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.112435  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1944  Radical SAM domain protein  48.71 
 
 		 374 aa  330  3e-89  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0450295  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2316  radical SAM family protein  50.29 
 
 		 346 aa  317  3e-85  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3151  radical SAM domain-containing protein  50 
 
 		 351 aa  313  1.9999999999999998e-84  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0207208  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3202  Radical SAM domain protein  50.97 
 
 		 342 aa  307  1.0000000000000001e-82  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00235958  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1061  Radical SAM domain protein  49.84 
 
 		 343 aa  306  2.0000000000000002e-82  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.8315700000000001e-19 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2227  radical SAM domain-containing protein  48.41 
 
 		 342 aa  305  6e-82  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.775407  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1501  radical SAM domain-containing protein  41.41 
 
 		 341 aa  239  4e-62  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.166226  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1719  radical SAM domain-containing protein  37.99 
 
 		 354 aa  233  3e-60  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.219309  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0774  ELP3 component of the RNA polymerase II complex  40.18 
 
 		 362 aa  231  1e-59  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00000160735  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0930  radical SAM family protein  36.33 
 
 		 338 aa  226  3e-58  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000118017  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0688  Radical SAM domain protein  36.98 
 
 		 336 aa  214  1.9999999999999998e-54  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1160  Radical SAM domain protein  36.54 
 
 		 341 aa  214  1.9999999999999998e-54  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.276403  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1404  radical SAM protein, putative histone acetyltransferase  41.16 
 
 		 345 aa  209  6e-53  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.00000266579  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1689  radical SAM domain-containing protein  34.47 
 
 		 357 aa  200  3.9999999999999996e-50  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0776794  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1971  radical SAM domain-containing protein  34.47 
 
 		 357 aa  198  1.0000000000000001e-49  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.144867  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0875  radical SAM domain-containing protein  37.42 
 
 		 359 aa  196  5.000000000000001e-49  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0660  Radical SAM domain protein  33.87 
 
 		 359 aa  187  3e-46  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.142353  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2238  Radical SAM domain protein  38.82 
 
 		 354 aa  186  5e-46  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1713  radical SAM domain-containing protein  38.22 
 
 		 317 aa  168  1e-40  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1179  radical SAM domain-containing protein  33.33 
 
 		 314 aa  167  2e-40  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1640  radical SAM domain-containing protein  36.67 
 
 		 317 aa  168  2e-40  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2540  radical SAM domain-containing protein  41.98 
 
 		 340 aa  162  7e-39  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.093156 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0182  Radical SAM domain protein  36.11 
 
 		 401 aa  159  8e-38  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.534223  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0787  radical SAM domain-containing protein  31.23 
 
 		 317 aa  155  7e-37  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1562  Radical SAM domain protein  33.9 
 
 		 401 aa  153  2.9999999999999998e-36  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2966  Radical SAM domain protein  37.94 
 
 		 344 aa  151  2e-35  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0294152  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0515  Elongator protein 3/MiaB/NifB  37.74 
 
 		 309 aa  145  1e-33  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.84475  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0261  Radical SAM domain protein  29.63 
 
 		 564 aa  103  7e-21  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_10143  predicted protein  37.14 
 
 		 408 aa  100  4e-20  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00183786  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1318  ELP3 family histone acetyltransferase  27.88 
 
 		 510 aa  96.3  7e-19  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.340377 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1085  histone acetyltransferase, ELP3 family  26.44 
 
 		 514 aa  95.9  1e-18  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.707697  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0579  ELP3 family histone acetyltransferase  24.74 
 
 		 527 aa  94  4e-18  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3661  putative radical SAM protein  31.19 
 
 		 319 aa  90.9  3e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2936  hypothetical protein  32 
 
 		 319 aa  90.1  5e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.971153  hitchhiker  0.00000000000000717489 
 
 
-
 
NC_002936  DET0612  ELP3 family histone acetyltransferase  28.67 
 
 		 459 aa  89.4  8e-17  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.125099  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0898  ELP3 family histone acetyltransferase  32 
 
 		 512 aa  87.8  2e-16  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.589047  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0824  ELP3 family histone acetyltransferase  27.17 
 
 		 541 aa  87.4  3e-16  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.318054  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1832  ELP3 family histone acetyltransferase  27.47 
 
 		 541 aa  87.4  3e-16  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0088  radical SAM domain-containing protein  27.14 
 
 		 477 aa  86.3  7e-16  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0202426 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1033  putative radical SAM protein  30.7 
 
 		 330 aa  86.3  8e-16  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.247016  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0586  radical SAM family protein  33.33 
 
 		 319 aa  84.7  0.000000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_551  radical SAM superfamily  26.35 
 
 		 459 aa  84.7  0.000000000000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0398241  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1093  ELP3 family histone acetyltransferase  26.63 
 
 		 541 aa  84.3  0.000000000000003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.108771  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0122  radical SAM domain-containing protein  27.24 
 
 		 483 aa  83.2  0.000000000000007  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0586  ELP3 family histone acetyltransferase  25.99 
 
 		 459 aa  83.2  0.000000000000007  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0000912711  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0872  histone acetyltransferase, ELP3 family  27.62 
 
 		 556 aa  82.4  0.00000000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0889  ELP3 family histone acetyltransferase  24.8 
 
 		 541 aa  81.6  0.00000000000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2603  radical SAM superfamily protein  28.57 
 
 		 313 aa  81.6  0.00000000000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3477  putative radical SAM protein  29.44 
 
 		 313 aa  80.9  0.00000000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.143192  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1167  radical SAM domain-containing protein  28.39 
 
 		 469 aa  81.3  0.00000000000003  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.413437  normal  0.627812 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1326  hypothetical protein  29.3 
 
 		 309 aa  80.5  0.00000000000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1989  ELP3 family histone acetyltransferase  33.83 
 
 		 548 aa  80.5  0.00000000000004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0664  hypothetical protein  29.22 
 
 		 318 aa  80.1  0.00000000000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.08613e-26 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4343  putative radical SAM protein  31.34 
 
 		 312 aa  80.1  0.00000000000006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.122173 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0651  conserved hypothetical radical SAM protein  29.03 
 
 		 318 aa  79.3  0.00000000000009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1179  radical SAM family protein  27.44 
 
 		 332 aa  78.6  0.0000000000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.808864  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3769  conserved hypothetical radical SAM protein  30.83 
 
 		 321 aa  79  0.0000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0038  conserved hypothetical radical SAM protein  28.95 
 
 		 318 aa  79  0.0000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0739  radical SAM family protein  29.36 
 
 		 332 aa  77.4  0.0000000000003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.974352  normal  0.805342 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0804  putative radical SAM protein  27.31 
 
 		 334 aa  77.8  0.0000000000003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.768446  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3134  hypothetical protein  28.43 
 
 		 309 aa  77  0.0000000000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000932261  normal  0.614838 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2063  coproporphyrinogen III oxidase  29.81 
 
 		 384 aa  77  0.0000000000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2870  putative radical SAM protein  28.37 
 
 		 309 aa  77  0.0000000000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00453128  normal  0.0632795 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3048  putative radical SAM protein  28.84 
 
 		 309 aa  76.6  0.0000000000006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0315161  normal  0.32107 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1304  putative oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  31.55 
 
 		 381 aa  76.6  0.0000000000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1014  putative radical SAM protein  28.78 
 
 		 309 aa  76.6  0.0000000000006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.531424  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1179  putative radical SAM protein  28.43 
 
 		 309 aa  76.3  0.0000000000007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1256  putative radical SAM protein  28.43 
 
 		 309 aa  76.6  0.0000000000007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0785555  normal  0.353815 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0300  hypothetical protein  27.01 
 
 		 309 aa  76.6  0.0000000000007  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.558235  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4306  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  31.66 
 
 		 375 aa  76.3  0.0000000000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0329595  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2192  histone acetyltransferase, ELP3 family  27.07 
 
 		 576 aa  76.3  0.0000000000008  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1736  hypothetical protein  25.37 
 
 		 317 aa  75.5  0.000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2187  hypothetical protein  31.86 
 
 		 316 aa  75.9  0.000000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000345504 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1137  putative radical SAM protein  27.94 
 
 		 309 aa  75.9  0.000000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00496914  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2706  histone acetyltransferase, ELP3 family  24.86 
 
 		 553 aa  75.1  0.000000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0279  ELP3 family histone acetyltransferase  24.32 
 
 		 563 aa  75.5  0.000000000001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2819  conserved hypothetical radical SAM protein  33.83 
 
 		 372 aa  75.5  0.000000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3632  hypothetical protein  27.96 
 
 		 317 aa  74.7  0.000000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.197622  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3853  hypothetical protein  30.04 
 
 		 311 aa  75.1  0.000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000731814 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3522  radical SAM protein, TIGR01212 family  27.5 
 
 		 309 aa  74.7  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.998452  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2952  putative radical SAM protein  28.37 
 
 		 309 aa  75.1  0.000000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.432245  normal  0.157754 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1223  putative radical SAM protein  27.94 
 
 		 309 aa  74.7  0.000000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.784754  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2203  hypothetical protein  28.57 
 
 		 314 aa  75.1  0.000000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0082  radical SAM family protein  28.96 
 
 		 332 aa  74.7  0.000000000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0306  hypothetical protein  26.54 
 
 		 309 aa  74.3  0.000000000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.216797  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3689  hypothetical protein  27.64 
 
 		 309 aa  73.9  0.000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0165  hypothetical protein  40.54 
 
 		 347 aa  73.6  0.000000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.375388  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3591  hypothetical protein  27.64 
 
 		 309 aa  73.9  0.000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1956  ELP3 family histone acetyltransferase  30.15 
 
 		 526 aa  73.9  0.000000000004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.724461 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3627  hypothetical protein  27.64 
 
 		 309 aa  73.6  0.000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.672413 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2357  coproporphyrinogen III oxidase, anaerobic  31.34 
 
 		 466 aa  73.6  0.000000000005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0972265  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3520  radical SAM protein, TIGR01212 family  27.64 
 
 		 309 aa  73.6  0.000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13360  coproporphyrinogen III oxidase, anaerobic  31.73 
 
 		 418 aa  73.6  0.000000000006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.186133  normal  0.0883125 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3168  conserved hypothetical radical SAM protein  35.66 
 
 		 311 aa  72.8  0.000000000008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.000379648  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3790  hypothetical protein  27.83 
 
 		 314 aa  72.8  0.000000000009  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0994894  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3163  hypothetical protein  31.98 
 
 		 310 aa  72  0.00000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.096251  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1480  histone acetyltransferase, ELP3 family  25.57 
 
 		 585 aa  71.6  0.00000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.761791  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1293  putative radical SAM protein  30.99 
 
 		 341 aa  71.6  0.00000000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1358  putative radical SAM protein  25.12 
 
 		 318 aa  71.6  0.00000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.161503  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>