223 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A1755 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007355  Mbar_A1755  ELP3 family histone acetyltransferase  100 
 
 
547 aa  1132    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.668163  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1989  ELP3 family histone acetyltransferase  67.53 
 
 
548 aa  797    Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0898  ELP3 family histone acetyltransferase  55.89 
 
 
512 aa  602  1.0000000000000001e-171  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.589047  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0872  histone acetyltransferase, ELP3 family  52.2 
 
 
556 aa  587  1e-166  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2706  histone acetyltransferase, ELP3 family  52.01 
 
 
553 aa  583  1.0000000000000001e-165  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2930  histone acetyltransferase, ELP3 family  51.82 
 
 
554 aa  583  1.0000000000000001e-165  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.281817  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2192  histone acetyltransferase, ELP3 family  53.11 
 
 
576 aa  576  1.0000000000000001e-163  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1480  histone acetyltransferase, ELP3 family  52.23 
 
 
585 aa  561  1e-158  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.761791  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1133  ELP3 family histone acetyltransferase  51.02 
 
 
522 aa  555  1e-157  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2046  ELP3 family histone acetyltransferase  53.38 
 
 
530 aa  555  1e-156  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0952  histone acetyltransferase, ELP3 family  51.01 
 
 
526 aa  533  1e-150  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1304  hypothetical protein  50.58 
 
 
520 aa  523  1e-147  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1956  ELP3 family histone acetyltransferase  50.19 
 
 
526 aa  513  1e-144  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.724461 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1093  ELP3 family histone acetyltransferase  47.4 
 
 
541 aa  507  9.999999999999999e-143  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.108771  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0824  ELP3 family histone acetyltransferase  49.11 
 
 
541 aa  503  1e-141  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.318054  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1832  ELP3 family histone acetyltransferase  49.31 
 
 
541 aa  500  1e-140  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0279  ELP3 family histone acetyltransferase  46.7 
 
 
563 aa  501  1e-140  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1085  histone acetyltransferase, ELP3 family  46.77 
 
 
514 aa  492  9.999999999999999e-139  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.707697  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0889  ELP3 family histone acetyltransferase  48.24 
 
 
541 aa  480  1e-134  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1460  histone acetyltransferase, ELP3 family  50.1 
 
 
473 aa  457  1e-127  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0579  ELP3 family histone acetyltransferase  41.73 
 
 
527 aa  442  1e-123  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1318  ELP3 family histone acetyltransferase  48.04 
 
 
510 aa  443  1e-123  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.340377 
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_50848  predicted protein  41.5 
 
 
544 aa  421  1e-116  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.104715  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_42410  predicted protein  41.49 
 
 
558 aa  418  9.999999999999999e-116  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_27329  predicted protein  41.32 
 
 
555 aa  410  1e-113  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.072078  hitchhiker  0.00552121 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0122  radical SAM domain-containing protein  46.3 
 
 
483 aa  408  1.0000000000000001e-112  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1167  radical SAM domain-containing protein  46.56 
 
 
469 aa  400  9.999999999999999e-111  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.413437  normal  0.627812 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0088  radical SAM domain-containing protein  45.82 
 
 
477 aa  402  9.999999999999999e-111  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0202426 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02294  histone acetyltransferase, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G06140)  39.32 
 
 
574 aa  395  1e-109  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006680  CNK00950  Pol II transcription elongation factor, putative  39.85 
 
 
557 aa  391  1e-107  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.110026  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0612  ELP3 family histone acetyltransferase  44.01 
 
 
459 aa  368  1e-100  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.125099  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0586  ELP3 family histone acetyltransferase  44.01 
 
 
459 aa  363  3e-99  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0000912711  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_551  radical SAM superfamily  43.69 
 
 
459 aa  362  1e-98  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0398241  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0906  Histone acetyltransferase  31.88 
 
 
617 aa  271  2.9999999999999997e-71  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.301086  normal  0.526584 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08040  histone acetyltransferase  31.41 
 
 
598 aa  269  8e-71  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.584733  hitchhiker  0.0000000843356 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11040  histone acetyltransferase  32.25 
 
 
666 aa  253  5.000000000000001e-66  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.142131  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2227  radical SAM domain-containing protein  37.76 
 
 
342 aa  105  2e-21  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.775407  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1160  Radical SAM domain protein  34.84 
 
 
341 aa  104  4e-21  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.276403  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2316  radical SAM family protein  33.67 
 
 
346 aa  100  5e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0688  Radical SAM domain protein  28.92 
 
 
336 aa  99.4  2e-19  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3151  radical SAM domain-containing protein  28.68 
 
 
351 aa  98.6  3e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0207208  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0930  radical SAM family protein  32.57 
 
 
338 aa  96.7  1e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000118017  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1404  radical SAM protein, putative histone acetyltransferase  39.57 
 
 
345 aa  95.1  3e-18  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.00000266579  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1713  radical SAM domain-containing protein  33.15 
 
 
317 aa  92.4  2e-17  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0774  ELP3 component of the RNA polymerase II complex  38.06 
 
 
362 aa  90.1  9e-17  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00000160735  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0875  radical SAM domain-containing protein  37.04 
 
 
359 aa  89  2e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1501  radical SAM domain-containing protein  38.02 
 
 
341 aa  88.6  3e-16  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.166226  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1061  Radical SAM domain protein  35.39 
 
 
343 aa  87.8  5e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.8315700000000001e-19 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1719  radical SAM domain-containing protein  34.85 
 
 
354 aa  87.4  6e-16  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.219309  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1640  radical SAM domain-containing protein  31.89 
 
 
317 aa  85.5  0.000000000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1689  radical SAM domain-containing protein  25.83 
 
 
357 aa  85.1  0.000000000000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0776794  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3202  Radical SAM domain protein  34.81 
 
 
342 aa  84.7  0.000000000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00235958  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1971  radical SAM domain-containing protein  25.83 
 
 
357 aa  83.2  0.00000000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.144867  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1944  Radical SAM domain protein  34.78 
 
 
374 aa  79  0.0000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0450295  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1335  hypothetical protein  29.61 
 
 
328 aa  78.2  0.0000000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0087579  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0760  putative radical SAM protein  27.78 
 
 
304 aa  77.4  0.0000000000006  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.992819  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0515  Elongator protein 3/MiaB/NifB  26.83 
 
 
309 aa  76.3  0.000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.84475  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1179  radical SAM domain-containing protein  29.86 
 
 
314 aa  76.3  0.000000000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0660  Radical SAM domain protein  29.38 
 
 
359 aa  75.1  0.000000000003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.142353  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2238  Radical SAM domain protein  29.27 
 
 
354 aa  75.1  0.000000000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0739  radical SAM family protein  30.57 
 
 
332 aa  74.3  0.000000000005  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.974352  normal  0.805342 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0182  Radical SAM domain protein  32 
 
 
401 aa  72.8  0.00000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.534223  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1562  Radical SAM domain protein  29.95 
 
 
401 aa  73.2  0.00000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1358  putative radical SAM protein  27.65 
 
 
318 aa  72  0.00000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.161503  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0804  putative radical SAM protein  29.94 
 
 
334 aa  72.8  0.00000000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.768446  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3477  putative radical SAM protein  28.5 
 
 
313 aa  71.6  0.00000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.143192  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0964  putative radical SAM protein  27.66 
 
 
311 aa  70.9  0.00000000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4579  putative radical SAM protein  27.7 
 
 
319 aa  70.5  0.00000000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4861  conserved hypothetical protein TIGR01212  27.7 
 
 
319 aa  70.5  0.00000000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1179  radical SAM family protein  29.3 
 
 
332 aa  70.1  0.00000000009  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.808864  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3655  putative radical SAM protein  30.3 
 
 
328 aa  70.1  0.00000000009  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0760029 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11990  radical SAM protein, TIGR01212 family  26.92 
 
 
318 aa  70.1  0.0000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000013437  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2960  Fe-S oxidoreductase  29.03 
 
 
306 aa  70.1  0.0000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.392137  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4481  Fe-S oxidoreductase  27.7 
 
 
319 aa  69.3  0.0000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0376  hypothetical protein TIGR01212  27.23 
 
 
319 aa  69.3  0.0000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0082  radical SAM family protein  28.66 
 
 
332 aa  68.9  0.0000000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4885  conserved hypothetical protein TIGR01212  27.7 
 
 
319 aa  69.3  0.0000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0664  hypothetical protein  27.19 
 
 
318 aa  67.8  0.0000000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.08613e-26 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4646  hypothetical protein  27.23 
 
 
319 aa  67.4  0.0000000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5001  hypothetical protein  27.23 
 
 
319 aa  67.4  0.0000000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0787  radical SAM domain-containing protein  27.5 
 
 
317 aa  67.4  0.0000000006  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4871  conserved hypothetical protein TIGR01212  27.23 
 
 
319 aa  67  0.0000000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0261  Radical SAM domain protein  27.78 
 
 
564 aa  67  0.0000000008  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2966  Radical SAM domain protein  30.3 
 
 
344 aa  67  0.0000000008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0294152  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2769  hypothetical protein  27.23 
 
 
320 aa  67  0.0000000008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0254774  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4499  Fe-S oxidoreductase  26.76 
 
 
319 aa  66.6  0.000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2603  radical SAM superfamily protein  25.25 
 
 
313 aa  66.6  0.000000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1611  radical SAM superfamily protein  27.85 
 
 
314 aa  66.6  0.000000001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.586759  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3559  radical SAM protein, TIGR01212 family  29.7 
 
 
309 aa  66.6  0.000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1033  putative radical SAM protein  31.48 
 
 
330 aa  66.2  0.000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.247016  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3522  radical SAM protein, TIGR01212 family  29.7 
 
 
309 aa  66.6  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.998452  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2819  conserved hypothetical radical SAM protein  31.29 
 
 
372 aa  66.6  0.000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03076  predicted Fe-S oxidoreductase  29.7 
 
 
309 aa  65.5  0.000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.709944  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0496  conserved hypothetical protein  29.7 
 
 
309 aa  65.5  0.000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3520  radical SAM protein, TIGR01212 family  29.7 
 
 
309 aa  65.9  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0489  putative radical SAM protein  29.7 
 
 
320 aa  65.5  0.000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.577174 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1777  radical SAM domain-containing protein  29.71 
 
 
352 aa  65.9  0.000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.112435  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3699  radical SAM family protein  29.7 
 
 
309 aa  65.5  0.000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3591  hypothetical protein  29.7 
 
 
309 aa  65.9  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3627  hypothetical protein  29.7 
 
 
309 aa  65.9  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.672413 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>