More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swol_0774 on replicon NC_008346
Organism: Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008346  Swol_0774  ELP3 component of the RNA polymerase II complex  100 
 
 		 362 aa  743    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00000160735  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0930  radical SAM family protein  48.15 
 
 		 338 aa  325  7e-88  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000118017  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1719  radical SAM domain-containing protein  44.03 
 
 		 354 aa  315  6e-85  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.219309  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0688  Radical SAM domain protein  46.15 
 
 		 336 aa  293  4e-78  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1061  Radical SAM domain protein  40.9 
 
 		 343 aa  263  4e-69  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.8315700000000001e-19 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3151  radical SAM domain-containing protein  44.04 
 
 		 351 aa  262  8.999999999999999e-69  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0207208  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1160  Radical SAM domain protein  42.77 
 
 		 341 aa  259  5.0000000000000005e-68  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.276403  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3202  Radical SAM domain protein  41.74 
 
 		 342 aa  256  6e-67  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00235958  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2227  radical SAM domain-containing protein  40.9 
 
 		 342 aa  255  9e-67  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.775407  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2316  radical SAM family protein  41.28 
 
 		 346 aa  253  4.0000000000000004e-66  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1404  radical SAM protein, putative histone acetyltransferase  41.88 
 
 		 345 aa  246  4.9999999999999997e-64  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.00000266579  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1501  radical SAM domain-containing protein  39.82 
 
 		 341 aa  244  1.9999999999999999e-63  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.166226  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1689  radical SAM domain-containing protein  39.02 
 
 		 357 aa  244  1.9999999999999999e-63  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0776794  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1971  radical SAM domain-containing protein  38.11 
 
 		 357 aa  243  3.9999999999999997e-63  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.144867  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0660  Radical SAM domain protein  40.82 
 
 		 359 aa  238  1e-61  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.142353  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0875  radical SAM domain-containing protein  40.12 
 
 		 359 aa  238  2e-61  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1777  radical SAM domain-containing protein  40.18 
 
 		 352 aa  231  2e-59  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.112435  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1944  Radical SAM domain protein  39.29 
 
 		 374 aa  229  4e-59  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0450295  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1713  radical SAM domain-containing protein  38.87 
 
 		 317 aa  193  4e-48  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1179  radical SAM domain-containing protein  36.86 
 
 		 314 aa  188  1e-46  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1640  radical SAM domain-containing protein  37.82 
 
 		 317 aa  186  5e-46  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2966  Radical SAM domain protein  37.15 
 
 		 344 aa  170  3e-41  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0294152  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2238  Radical SAM domain protein  32.41 
 
 		 354 aa  169  6e-41  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0787  radical SAM domain-containing protein  35.05 
 
 		 317 aa  164  3e-39  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0182  Radical SAM domain protein  31.65 
 
 		 401 aa  164  3e-39  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.534223  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2540  radical SAM domain-containing protein  36.27 
 
 		 340 aa  158  1e-37  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.093156 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0515  Elongator protein 3/MiaB/NifB  36.59 
 
 		 309 aa  157  2e-37  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.84475  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1562  Radical SAM domain protein  32.27 
 
 		 401 aa  150  4e-35  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1085  histone acetyltransferase, ELP3 family  33.33 
 
 		 514 aa  109  8.000000000000001e-23  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.707697  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0122  radical SAM domain-containing protein  29.41 
 
 		 483 aa  106  6e-22  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1318  ELP3 family histone acetyltransferase  29.29 
 
 		 510 aa  102  1e-20  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.340377 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1167  radical SAM domain-containing protein  29.66 
 
 		 469 aa  100  3e-20  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.413437  normal  0.627812 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0088  radical SAM domain-containing protein  29.83 
 
 		 477 aa  100  3e-20  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0202426 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0898  ELP3 family histone acetyltransferase  39.55 
 
 		 512 aa  100  4e-20  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.589047  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_551  radical SAM superfamily  30.83 
 
 		 459 aa  100  5e-20  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0398241  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0579  ELP3 family histone acetyltransferase  29.22 
 
 		 527 aa  98.2  2e-19  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1133  ELP3 family histone acetyltransferase  28 
 
 		 522 aa  97.4  3e-19  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0612  ELP3 family histone acetyltransferase  30 
 
 		 459 aa  96.3  8e-19  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.125099  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1460  histone acetyltransferase, ELP3 family  30 
 
 		 473 aa  93.2  6e-18  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0824  ELP3 family histone acetyltransferase  29.19 
 
 		 541 aa  92.8  9e-18  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.318054  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0586  ELP3 family histone acetyltransferase  28.33 
 
 		 459 aa  92  1e-17  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0000912711  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1093  ELP3 family histone acetyltransferase  29.19 
 
 		 541 aa  91.7  2e-17  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.108771  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1832  ELP3 family histone acetyltransferase  29.89 
 
 		 541 aa  91.3  2e-17  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0952  histone acetyltransferase, ELP3 family  28.51 
 
 		 526 aa  91.3  3e-17  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1755  ELP3 family histone acetyltransferase  38.06 
 
 		 547 aa  90.1  5e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.668163  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0279  ELP3 family histone acetyltransferase  28.11 
 
 		 563 aa  90.1  6e-17  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11040  histone acetyltransferase  31.45 
 
 		 666 aa  89.7  7e-17  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.142131  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0889  ELP3 family histone acetyltransferase  28.8 
 
 		 541 aa  87.8  2e-16  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2046  ELP3 family histone acetyltransferase  27.13 
 
 		 530 aa  88.6  2e-16  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1956  ELP3 family histone acetyltransferase  34.62 
 
 		 526 aa  86.3  8e-16  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.724461 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08040  histone acetyltransferase  29.08 
 
 		 598 aa  84.3  0.000000000000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.584733  hitchhiker  0.0000000843356 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1010  coproporphyrinogen III oxidase  29.65 
 
 		 379 aa  82.8  0.00000000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0572  conserved hypothetical radical SAM protein  28.29 
 
 		 325 aa  81.6  0.00000000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2936  hypothetical protein  29.13 
 
 		 319 aa  81.3  0.00000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.971153  hitchhiker  0.00000000000000717489 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0760  putative radical SAM protein  25.65 
 
 		 304 aa  80.5  0.00000000000004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.992819  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02294  histone acetyltransferase, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G06140)  32.18 
 
 		 574 aa  79.7  0.00000000000006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_50848  predicted protein  30.46 
 
 		 544 aa  79  0.0000000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.104715  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0906  Histone acetyltransferase  29.03 
 
 		 617 aa  78.2  0.0000000000002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.301086  normal  0.526584 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1989  ELP3 family histone acetyltransferase  32.84 
 
 		 548 aa  78.2  0.0000000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1304  hypothetical protein  27.32 
 
 		 520 aa  77.8  0.0000000000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1736  hypothetical protein  26.47 
 
 		 317 aa  77.8  0.0000000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1179  radical SAM family protein  29.19 
 
 		 332 aa  77.4  0.0000000000004  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.808864  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0872  histone acetyltransferase, ELP3 family  30.6 
 
 		 556 aa  77  0.0000000000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0347  putative radical SAM protein  28.39 
 
 		 293 aa  76.6  0.0000000000006  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3661  putative radical SAM protein  27.31 
 
 		 319 aa  76.6  0.0000000000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0586  radical SAM family protein  28.63 
 
 		 319 aa  76.3  0.0000000000007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0804  putative radical SAM protein  34.65 
 
 		 334 aa  76.3  0.0000000000008  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.768446  n/a   
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_27329  predicted protein  27.15 
 
 		 555 aa  76.3  0.0000000000008  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.072078  hitchhiker  0.00552121 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2930  histone acetyltransferase, ELP3 family  29.53 
 
 		 554 aa  76.3  0.0000000000009  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.281817  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0664  hypothetical protein  28.29 
 
 		 318 aa  76.3  0.0000000000009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.08613e-26 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2192  histone acetyltransferase, ELP3 family  30.15 
 
 		 576 aa  74.7  0.000000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2203  hypothetical protein  27.45 
 
 		 314 aa  74.3  0.000000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0082  radical SAM family protein  26.77 
 
 		 332 aa  73.9  0.000000000004  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0739  radical SAM family protein  33.86 
 
 		 332 aa  73.9  0.000000000004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.974352  normal  0.805342 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0651  conserved hypothetical radical SAM protein  27.32 
 
 		 318 aa  73.9  0.000000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2706  histone acetyltransferase, ELP3 family  27.94 
 
 		 553 aa  73.9  0.000000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1358  putative radical SAM protein  27.35 
 
 		 318 aa  72.8  0.000000000008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.161503  n/a   
 
 
-
 
NC_006680  CNK00950  Pol II transcription elongation factor, putative  28.57 
 
 		 557 aa  73.2  0.000000000008  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.110026  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0944  putative oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  26.44 
 
 		 375 aa  72.8  0.000000000008  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1014  putative radical SAM protein  26.47 
 
 		 309 aa  72.8  0.000000000008  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.531424  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3655  putative radical SAM protein  24.63 
 
 		 328 aa  72.8  0.000000000009  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0760029 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1480  histone acetyltransferase, ELP3 family  29.46 
 
 		 585 aa  72.4  0.00000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.761791  normal  1 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_42410  predicted protein  28.57 
 
 		 558 aa  72  0.00000000001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0890  hypothetical protein  27.54 
 
 		 315 aa  71.6  0.00000000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.896383  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3168  conserved hypothetical radical SAM protein  28.71 
 
 		 311 aa  72  0.00000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.000379648  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4306  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  26.4 
 
 		 375 aa  71.6  0.00000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0329595  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1901  coproporphyrinogen III oxidase  26.53 
 
 		 480 aa  71.2  0.00000000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2190  coproporphyrinogen III oxidase  26.53 
 
 		 480 aa  70.1  0.00000000005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1304  putative oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  27.62 
 
 		 381 aa  70.5  0.00000000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0422  putative radical SAM protein  24.24 
 
 		 303 aa  70.1  0.00000000006  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1177  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  27.57 
 
 		 372 aa  69.7  0.00000000007  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0407  putative radical SAM protein  24.24 
 
 		 303 aa  69.7  0.00000000008  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.145155  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1872  hypothetical protein  23.94 
 
 		 319 aa  69.7  0.00000000008  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.22126  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0175  hypothetical protein  27.22 
 
 		 317 aa  69.7  0.00000000008  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.46847  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1179  putative radical SAM protein  25.84 
 
 		 309 aa  69.3  0.00000000009  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1293  putative radical SAM protein  32.26 
 
 		 341 aa  68.9  0.0000000001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3627  hypothetical protein  23.47 
 
 		 309 aa  68.9  0.0000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.672413 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3134  hypothetical protein  24.88 
 
 		 309 aa  69.3  0.0000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000932261  normal  0.614838 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3477  putative radical SAM protein  27.27 
 
 		 313 aa  69.3  0.0000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.143192  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1137  putative radical SAM protein  25.36 
 
 		 309 aa  69.3  0.0000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00496914  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>