More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPR_1901 on replicon NC_008262
Organism: Clostridium perfringens SM101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008261  CPF_2190  coproporphyrinogen III oxidase  99.17 
 
 
480 aa  971    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1901  coproporphyrinogen III oxidase  100 
 
 
480 aa  977    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1341  coproporphyrinogen III oxidase  48.28 
 
 
505 aa  380  1e-104  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.996503  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1948  coproporphyrinogen III oxidase  46.94 
 
 
504 aa  377  1e-103  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0550  coproporphyrinogen III oxidase  47.36 
 
 
491 aa  352  1e-95  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.790548  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3377  coproporphyrinogen III oxidase  43.35 
 
 
509 aa  343  4e-93  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1445  coproporphyrinogen III oxidase  41.37 
 
 
499 aa  337  3.9999999999999995e-91  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0631  coproporphyrinogen III oxidase  41.73 
 
 
501 aa  336  5.999999999999999e-91  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000100188  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2881  coproporphyrinogen III oxidase  41.49 
 
 
494 aa  332  1e-89  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.969668  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0706  coproporphyrinogen III oxidase  40.97 
 
 
495 aa  328  1.0000000000000001e-88  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1051  coproporphyrinogen III oxidase  39.65 
 
 
495 aa  321  1.9999999999999998e-86  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0964  coproporphyrinogen III oxidase  39.65 
 
 
496 aa  321  1.9999999999999998e-86  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4404  coproporphyrinogen III oxidase  39.65 
 
 
495 aa  321  1.9999999999999998e-86  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000115186 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0926  coproporphyrinogen III oxidase  39.65 
 
 
495 aa  321  1.9999999999999998e-86  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.200785  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0778  coproporphyrinogen III oxidase  39.9 
 
 
496 aa  320  3.9999999999999996e-86  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.385529  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0831  coproporphyrinogen III oxidase  39.39 
 
 
498 aa  319  6e-86  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0778  coproporphyrinogen III oxidase  39.39 
 
 
498 aa  319  6e-86  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.798816  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0777  coproporphyrinogen III oxidase  39.39 
 
 
498 aa  319  7e-86  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0875  coproporphyrinogen III oxidase  39.39 
 
 
496 aa  319  7e-86  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.737653  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0964  coproporphyrinogen III oxidase  39.39 
 
 
495 aa  319  7e-86  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3606  coproporphyrinogen III oxidase  38.58 
 
 
518 aa  298  1e-79  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1948  coproporphyrinogen III oxidase  36.5 
 
 
471 aa  293  6e-78  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4085  Coproporphyrinogen dehydrogenase  39.69 
 
 
468 aa  265  1e-69  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1406  Coproporphyrinogen dehydrogenase  38.38 
 
 
457 aa  254  2.0000000000000002e-66  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0315  coproporphyrinogen III oxidase  30.25 
 
 
438 aa  217  2.9999999999999998e-55  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2008  coproporphyrinogen III oxidase  31.31 
 
 
377 aa  155  2e-36  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2293  coproporphyrinogen III oxidase  31 
 
 
377 aa  154  2.9999999999999998e-36  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1325  coproporphyrinogen III oxidase, anaerobic  31.37 
 
 
380 aa  144  3e-33  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0536  putative oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  28.17 
 
 
578 aa  142  1.9999999999999998e-32  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.448786  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1177  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  35.1 
 
 
372 aa  139  8.999999999999999e-32  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0055  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  35.44 
 
 
365 aa  138  3.0000000000000003e-31  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal  0.60035 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4306  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  28.3 
 
 
375 aa  132  2.0000000000000002e-29  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0329595  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0205  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  29.47 
 
 
380 aa  129  1.0000000000000001e-28  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.650734  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3225  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  26 
 
 
432 aa  129  2.0000000000000002e-28  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000826969  normal  0.0243619 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0603  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  28.71 
 
 
378 aa  127  3e-28  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1363  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  30.8 
 
 
389 aa  127  3e-28  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4398  coproporphyrinogen III oxidase  30 
 
 
378 aa  124  3e-27  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.601746  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1010  coproporphyrinogen III oxidase  31.79 
 
 
379 aa  124  5e-27  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2374  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  24.62 
 
 
448 aa  123  9e-27  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0455  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  25.23 
 
 
391 aa  122  9.999999999999999e-27  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.664559  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1108  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  29.73 
 
 
360 aa  122  9.999999999999999e-27  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4450  coproporphyrinogen III oxidase  29.69 
 
 
378 aa  122  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000131876  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2082  coproporphyrinogen III oxidase  28.62 
 
 
375 aa  122  1.9999999999999998e-26  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0582  coproporphyrinogen III oxidase, anaerobic  27.16 
 
 
388 aa  121  1.9999999999999998e-26  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4339  coproporphyrinogen III oxidase  29.69 
 
 
378 aa  122  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.26628e-29 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2500  putative oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  27.39 
 
 
378 aa  121  3e-26  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000623828  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2440  coproporphyrinogen III oxidase  26.98 
 
 
382 aa  121  3e-26  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000264436  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1109  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  31.58 
 
 
377 aa  121  3e-26  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.298913  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1554  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  29.15 
 
 
376 aa  120  4.9999999999999996e-26  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.0000769723  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1999  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  33 
 
 
388 aa  120  6e-26  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.865362  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4542  coproporphyrinogen III oxidase  29.38 
 
 
378 aa  120  6e-26  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.3385  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1151  coproporphyrinogen III oxidase  28.8 
 
 
374 aa  120  7e-26  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4216  coproporphyrinogen III oxidase  29.38 
 
 
379 aa  120  7e-26  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4054  coproporphyrinogen III oxidase  29.38 
 
 
379 aa  120  7e-26  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.749761  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3043  coproporphyrinogen III oxidase  28.44 
 
 
378 aa  120  7e-26  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000458873  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0944  putative oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  34.31 
 
 
375 aa  119  9.999999999999999e-26  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0766  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  33.65 
 
 
366 aa  119  1.9999999999999998e-25  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0410499  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4168  coproporphyrinogen III oxidase  28.75 
 
 
379 aa  118  1.9999999999999998e-25  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0038285  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4064  coproporphyrinogen III oxidase  29.06 
 
 
379 aa  118  3e-25  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.659192  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0710  putative oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  25.77 
 
 
375 aa  117  3.9999999999999997e-25  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.963013  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1468  oxygen-independent coproporphyrinogen-III oxidase  25.77 
 
 
375 aa  117  3.9999999999999997e-25  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.245191  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0800  coproporphyrinogen III oxidase  28.75 
 
 
379 aa  117  5e-25  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000109269  hitchhiker  5.6543700000000005e-18 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1216  coproporphyrinogen III oxidase  31.71 
 
 
378 aa  116  7.999999999999999e-25  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4436  coproporphyrinogen III oxidase  28.44 
 
 
379 aa  115  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000959102  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1228  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  29.08 
 
 
380 aa  114  3e-24  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3508  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  30.95 
 
 
381 aa  114  3e-24  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.230764  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4335  putative oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  25.47 
 
 
389 aa  114  4.0000000000000004e-24  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2205  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  25.83 
 
 
484 aa  114  5e-24  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.434843  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1649  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  30.26 
 
 
374 aa  111  2.0000000000000002e-23  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1180  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  28.05 
 
 
401 aa  112  2.0000000000000002e-23  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.219055  hitchhiker  0.00393596 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1224  putative oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  33.5 
 
 
370 aa  112  2.0000000000000002e-23  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.948437  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2314  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  26.42 
 
 
408 aa  111  3e-23  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0256017  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0890  coproporphyrinogen III oxidase  30.39 
 
 
376 aa  110  5e-23  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.112069  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3535  coproporphyrinogen III oxidase, anaerobic  27.73 
 
 
383 aa  110  5e-23  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000160096  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1170  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  32.65 
 
 
369 aa  109  9.000000000000001e-23  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0144  Coproporphyrinogen dehydrogenase  29.44 
 
 
465 aa  109  1e-22  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1304  putative oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  26.75 
 
 
381 aa  109  1e-22  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1583  putative oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  25.16 
 
 
374 aa  108  2e-22  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1806  putative oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  26.91 
 
 
374 aa  108  2e-22  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1641  coproporphyrinogen III oxidase  26.2 
 
 
374 aa  108  2e-22  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.905653  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3351  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  25.63 
 
 
384 aa  108  2e-22  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3875  putative oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  24.38 
 
 
406 aa  108  2e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1675  coproporphyrinogen III oxidase  26.2 
 
 
374 aa  108  2e-22  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.370593  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3577  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  29.95 
 
 
381 aa  107  4e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3320  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  24.45 
 
 
357 aa  107  5e-22  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00918826  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4974  coproporphyrinogen III oxidase  25.71 
 
 
391 aa  107  7e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3559  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  23.36 
 
 
393 aa  106  7e-22  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1980  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  28.8 
 
 
380 aa  106  1e-21  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000000136099  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0655  coproporphyrinogen III oxidase  27.8 
 
 
444 aa  105  2e-21  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.372227  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_761  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  29.47 
 
 
378 aa  105  2e-21  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.0000202557  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2483  coproporphyrinogen III oxidase  29.15 
 
 
484 aa  105  2e-21  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00279185  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3306  putative oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  23.71 
 
 
423 aa  105  2e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.661128  normal  0.0726751 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1249  coproporphyrinogen III oxidase  31.82 
 
 
379 aa  105  2e-21  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0648  coproporphyrinogen III oxidase  27.8 
 
 
444 aa  104  3e-21  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.308464  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2633  coproporphyrinogen III oxidase  24.69 
 
 
444 aa  104  3e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3651  coproporphyrinogen III oxidase, anaerobic  25.23 
 
 
400 aa  104  4e-21  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03584  coproporphyrinogen III oxidase  25.31 
 
 
390 aa  103  5e-21  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1747  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  23.57 
 
 
467 aa  103  5e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.79617  normal  0.600328 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4462  coproporphyrinogen III oxidase  24.63 
 
 
435 aa  103  6e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0485  coproporphyrinogen III oxidase  23.55 
 
 
384 aa  103  6e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>