More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene STER_1216 on replicon NC_008532
Organism: Streptococcus thermophilus LMD-9



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008532  STER_1216  coproporphyrinogen III oxidase  100 
 
 
378 aa  786    Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0890  coproporphyrinogen III oxidase  78.78 
 
 
376 aa  626  1e-178  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.112069  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1249  coproporphyrinogen III oxidase  59.26 
 
 
379 aa  478  1e-134  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2440  coproporphyrinogen III oxidase  50.66 
 
 
382 aa  373  1e-102  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000264436  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1151  coproporphyrinogen III oxidase  48.38 
 
 
374 aa  370  1e-101  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1675  coproporphyrinogen III oxidase  48.12 
 
 
374 aa  370  1e-101  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.370593  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1641  coproporphyrinogen III oxidase  48.12 
 
 
374 aa  370  1e-101  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.905653  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1010  coproporphyrinogen III oxidase  47.87 
 
 
379 aa  361  1e-98  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3043  coproporphyrinogen III oxidase  47.34 
 
 
378 aa  359  4e-98  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000458873  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4450  coproporphyrinogen III oxidase  47.34 
 
 
378 aa  359  5e-98  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000131876  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4398  coproporphyrinogen III oxidase  47.34 
 
 
378 aa  358  9.999999999999999e-98  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.601746  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0800  coproporphyrinogen III oxidase  47.07 
 
 
379 aa  357  2.9999999999999997e-97  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000109269  hitchhiker  5.6543700000000005e-18 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4339  coproporphyrinogen III oxidase  46.81 
 
 
378 aa  355  6.999999999999999e-97  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.26628e-29 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4436  coproporphyrinogen III oxidase  46.81 
 
 
379 aa  355  6.999999999999999e-97  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000959102  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4542  coproporphyrinogen III oxidase  46.81 
 
 
378 aa  355  8.999999999999999e-97  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.3385  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4216  coproporphyrinogen III oxidase  46.81 
 
 
379 aa  355  1e-96  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4054  coproporphyrinogen III oxidase  46.81 
 
 
379 aa  353  2e-96  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.749761  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4064  coproporphyrinogen III oxidase  46.54 
 
 
379 aa  353  4e-96  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.659192  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4168  coproporphyrinogen III oxidase  47.07 
 
 
379 aa  352  7e-96  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0038285  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2293  coproporphyrinogen III oxidase  40.11 
 
 
377 aa  298  1e-79  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2008  coproporphyrinogen III oxidase  39.57 
 
 
377 aa  295  7e-79  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1999  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  39.68 
 
 
388 aa  289  6e-77  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.865362  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0691  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  38.11 
 
 
380 aa  280  2e-74  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2082  coproporphyrinogen III oxidase  39.3 
 
 
375 aa  279  7e-74  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0030  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase, putative  37.6 
 
 
385 aa  270  2.9999999999999997e-71  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.949331  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0603  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  37.63 
 
 
378 aa  269  8e-71  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0582  coproporphyrinogen III oxidase, anaerobic  37.04 
 
 
388 aa  267  2e-70  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1325  coproporphyrinogen III oxidase, anaerobic  35.62 
 
 
380 aa  263  4.999999999999999e-69  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2500  putative oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  35.83 
 
 
378 aa  262  6.999999999999999e-69  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000623828  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1554  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  39.95 
 
 
376 aa  261  2e-68  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.0000769723  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3535  coproporphyrinogen III oxidase, anaerobic  36.94 
 
 
383 aa  260  3e-68  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000160096  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1228  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  35.2 
 
 
380 aa  258  1e-67  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0208  putative oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  37.11 
 
 
381 aa  258  1e-67  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000567402  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1980  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  37.27 
 
 
380 aa  258  2e-67  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000000136099  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12830  putative oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  35.64 
 
 
385 aa  256  3e-67  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.402755  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1363  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  36.81 
 
 
389 aa  254  2.0000000000000002e-66  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1516  coproporphyrinogen III oxidase  36.2 
 
 
405 aa  254  2.0000000000000002e-66  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.493092  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1177  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  37.99 
 
 
372 aa  253  4.0000000000000004e-66  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4306  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  36.34 
 
 
375 aa  252  8.000000000000001e-66  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0329595  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1304  putative oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  37.2 
 
 
381 aa  250  3e-65  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1109  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  35.53 
 
 
377 aa  250  4e-65  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.298913  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04915  coproporphyrinogen III oxidase  37.33 
 
 
376 aa  249  7e-65  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3320  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  37 
 
 
357 aa  243  3e-63  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00918826  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3018  putative oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  33.69 
 
 
393 aa  243  3e-63  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1108  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  35.75 
 
 
360 aa  244  3e-63  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1376  putative oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  36.05 
 
 
384 aa  241  2e-62  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.822523  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3508  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  35.37 
 
 
381 aa  241  2e-62  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.230764  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3577  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  35.9 
 
 
381 aa  239  5e-62  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG0475  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase, putative  35.36 
 
 
376 aa  237  3e-61  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0488  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  34.42 
 
 
374 aa  236  7e-61  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1582  putative oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  33.07 
 
 
381 aa  234  1.0000000000000001e-60  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.0000332518  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0858  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase, putative  34.29 
 
 
378 aa  234  2.0000000000000002e-60  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0560367  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1170  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  36.68 
 
 
369 aa  234  2.0000000000000002e-60  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1194  coproporphyrinogen III oxidase  35.91 
 
 
421 aa  233  3e-60  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0134211 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_761  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  33.69 
 
 
378 aa  233  4.0000000000000004e-60  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.0000202557  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1082  putative oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  34.88 
 
 
392 aa  231  1e-59  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1341  putative oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  35.81 
 
 
394 aa  231  2e-59  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0936  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  32.98 
 
 
383 aa  231  2e-59  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3582  putative oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  34.34 
 
 
385 aa  230  3e-59  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3225  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  33.33 
 
 
432 aa  230  3e-59  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000826969  normal  0.0243619 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3875  putative oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  32.74 
 
 
406 aa  229  5e-59  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2843  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  32.8 
 
 
374 aa  229  6e-59  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.225724  normal  0.624237 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3351  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  34.76 
 
 
384 aa  229  7e-59  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2223  coproporphyrinogen III oxidase  35.42 
 
 
396 aa  228  1e-58  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3559  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  33.59 
 
 
393 aa  228  1e-58  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2382  coproporphyrinogen III oxidase  31.75 
 
 
396 aa  228  2e-58  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.0342073 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2374  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  33.06 
 
 
448 aa  228  2e-58  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4462  coproporphyrinogen III oxidase  34.12 
 
 
435 aa  226  6e-58  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0776  putative oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  33.95 
 
 
378 aa  226  7e-58  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  decreased coverage  0.00749552  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2479  coproporphyrinogen III oxidase  34.45 
 
 
413 aa  224  1e-57  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.226119  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0901  coproporphyrinogen III oxidase  36.51 
 
 
409 aa  224  2e-57  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.482511  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2155  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  34.76 
 
 
389 aa  224  2e-57  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0850  coproporphyrinogen III oxidase  35.13 
 
 
419 aa  224  2e-57  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.260825  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1631  putative oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  35.36 
 
 
394 aa  223  3e-57  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.526463  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1360  putative oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  35.68 
 
 
371 aa  224  3e-57  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.716239  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2314  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  35.86 
 
 
408 aa  224  3e-57  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0256017  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2963  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  35.96 
 
 
387 aa  223  4e-57  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  hitchhiker  0.000535992  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0055  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  34.86 
 
 
365 aa  223  6e-57  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal  0.60035 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3306  putative oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  31.98 
 
 
423 aa  223  6e-57  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.661128  normal  0.0726751 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2785  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  32.05 
 
 
395 aa  222  7e-57  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.419951  normal  0.420525 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0816  putative oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  34.4 
 
 
396 aa  222  7e-57  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.847489  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1001  putative oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  30.7 
 
 
424 aa  221  1.9999999999999999e-56  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2282  coproporphyrinogen III oxidase  33.51 
 
 
422 aa  221  1.9999999999999999e-56  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.485067  normal  0.946355 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3089  coproporphyrinogen III oxidase  35.45 
 
 
409 aa  221  1.9999999999999999e-56  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.610477  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3053  coproporphyrinogen III oxidase  35.96 
 
 
405 aa  220  3e-56  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3019  coproporphyrinogen III oxidase  35.96 
 
 
405 aa  220  3e-56  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.18574  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0024  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  34.7 
 
 
398 aa  219  5e-56  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0304834 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0380  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  32.89 
 
 
379 aa  219  6e-56  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.182118  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3577  putative oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  33.86 
 
 
390 aa  219  7e-56  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0892028  normal  0.365381 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1962  coproporphyrinogen III oxidase  34.1 
 
 
422 aa  218  1e-55  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.154783  normal  0.857394 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1582  coproporphyrinogen III oxidase  35.7 
 
 
405 aa  218  1e-55  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.229924  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2953  coproporphyrinogen III oxidase  35.7 
 
 
405 aa  218  1e-55  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.640184  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2100  coproporphyrinogen III oxidase  35.7 
 
 
405 aa  218  2e-55  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2644  coproporphyrinogen III oxidase  35.7 
 
 
405 aa  218  2e-55  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0110  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase, putative  33.24 
 
 
393 aa  217  2e-55  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000543862  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1968  coproporphyrinogen III oxidase  35.7 
 
 
405 aa  218  2e-55  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.137157  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0258  coproporphyrinogen III oxidase  33.94 
 
 
381 aa  217  2e-55  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.148807 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2113  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  34.57 
 
 
369 aa  218  2e-55  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.512598  normal  0.05877 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0811  coproporphyrinogen III oxidase  35.7 
 
 
405 aa  218  2e-55  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.12855  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4155  putative oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  32.55 
 
 
416 aa  217  2e-55  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>