More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_3875 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009523  RoseRS_3875  putative oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  100 
 
 
406 aa  832    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3306  putative oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  84.42 
 
 
423 aa  701    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.661128  normal  0.0726751 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3559  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  64 
 
 
393 aa  514  1.0000000000000001e-145  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1001  putative oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  51.08 
 
 
424 aa  438  9.999999999999999e-123  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0582  coproporphyrinogen III oxidase, anaerobic  43.94 
 
 
388 aa  310  4e-83  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1363  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  39.49 
 
 
389 aa  292  8e-78  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2082  coproporphyrinogen III oxidase  36.2 
 
 
375 aa  288  1e-76  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2500  putative oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  38.73 
 
 
378 aa  285  7e-76  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000623828  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4436  coproporphyrinogen III oxidase  36.84 
 
 
379 aa  273  3e-72  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000959102  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1304  putative oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  42.29 
 
 
381 aa  271  1e-71  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4216  coproporphyrinogen III oxidase  36.34 
 
 
379 aa  269  7e-71  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_761  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  38.75 
 
 
378 aa  269  7e-71  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.0000202557  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1151  coproporphyrinogen III oxidase  35.43 
 
 
374 aa  269  8e-71  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4542  coproporphyrinogen III oxidase  36.46 
 
 
378 aa  268  8.999999999999999e-71  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.3385  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4339  coproporphyrinogen III oxidase  36.46 
 
 
378 aa  268  1e-70  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.26628e-29 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4054  coproporphyrinogen III oxidase  36.34 
 
 
379 aa  267  2e-70  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.749761  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4064  coproporphyrinogen III oxidase  36.09 
 
 
379 aa  267  2.9999999999999995e-70  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.659192  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4450  coproporphyrinogen III oxidase  35.95 
 
 
378 aa  267  2.9999999999999995e-70  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000131876  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0800  coproporphyrinogen III oxidase  36.09 
 
 
379 aa  266  5.999999999999999e-70  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000109269  hitchhiker  5.6543700000000005e-18 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4398  coproporphyrinogen III oxidase  35.7 
 
 
378 aa  263  4e-69  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.601746  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1980  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  36.34 
 
 
380 aa  263  4.999999999999999e-69  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000000136099  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1325  coproporphyrinogen III oxidase, anaerobic  35.16 
 
 
380 aa  262  6.999999999999999e-69  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0858  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase, putative  38.29 
 
 
378 aa  261  1e-68  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0560367  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0776  putative oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  36.78 
 
 
378 aa  261  1e-68  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  decreased coverage  0.00749552  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4168  coproporphyrinogen III oxidase  35.59 
 
 
379 aa  260  4e-68  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0038285  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3225  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  37.04 
 
 
432 aa  258  2e-67  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000826969  normal  0.0243619 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0030  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase, putative  39 
 
 
385 aa  257  3e-67  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.949331  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3043  coproporphyrinogen III oxidase  36.46 
 
 
378 aa  256  4e-67  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000458873  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0603  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  38.23 
 
 
378 aa  252  8.000000000000001e-66  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1675  coproporphyrinogen III oxidase  35.59 
 
 
374 aa  250  3e-65  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.370593  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1641  coproporphyrinogen III oxidase  35.59 
 
 
374 aa  250  3e-65  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.905653  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2314  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  36.91 
 
 
408 aa  249  4e-65  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0256017  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3535  coproporphyrinogen III oxidase, anaerobic  39.45 
 
 
383 aa  248  1e-64  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000160096  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2008  coproporphyrinogen III oxidase  33.17 
 
 
377 aa  248  1e-64  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2293  coproporphyrinogen III oxidase  33.92 
 
 
377 aa  248  2e-64  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1109  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  32.91 
 
 
377 aa  246  4.9999999999999997e-64  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.298913  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1010  coproporphyrinogen III oxidase  38.48 
 
 
379 aa  240  2.9999999999999997e-62  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0936  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  36.23 
 
 
383 aa  238  2e-61  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4306  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  36.41 
 
 
375 aa  236  4e-61  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0329595  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0208  putative oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  38.35 
 
 
381 aa  236  7e-61  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000567402  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1249  coproporphyrinogen III oxidase  34.52 
 
 
379 aa  236  8e-61  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1148  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  41.74 
 
 
403 aa  236  8e-61  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.61254 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12830  putative oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  32.91 
 
 
385 aa  234  2.0000000000000002e-60  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.402755  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0890  coproporphyrinogen III oxidase  32.74 
 
 
376 aa  234  3e-60  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.112069  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0536  putative oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  36.2 
 
 
578 aa  231  2e-59  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.448786  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3508  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  37.34 
 
 
381 aa  230  4e-59  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.230764  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2440  coproporphyrinogen III oxidase  33.58 
 
 
382 aa  230  4e-59  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000264436  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1216  coproporphyrinogen III oxidase  32.74 
 
 
378 aa  229  5e-59  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1999  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  34.89 
 
 
388 aa  229  7e-59  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.865362  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2479  coproporphyrinogen III oxidase  37.44 
 
 
413 aa  228  1e-58  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.226119  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1108  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  31.42 
 
 
360 aa  228  1e-58  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2963  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  38.26 
 
 
387 aa  228  2e-58  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  hitchhiker  0.000535992  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3320  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  33.25 
 
 
357 aa  228  2e-58  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00918826  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5458  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  37.5 
 
 
406 aa  227  3e-58  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3577  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  36.34 
 
 
381 aa  226  6e-58  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0691  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  32.33 
 
 
380 aa  225  1e-57  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2282  coproporphyrinogen III oxidase  36.23 
 
 
422 aa  225  1e-57  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.485067  normal  0.946355 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0850  coproporphyrinogen III oxidase  36.71 
 
 
419 aa  224  2e-57  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.260825  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0867  coproporphyrinogen III oxidase  37.47 
 
 
404 aa  224  2e-57  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2687  coproporphyrinogen III oxidase  37.28 
 
 
398 aa  223  4e-57  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.992517  normal  0.224392 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2366  putative oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  36.05 
 
 
410 aa  223  4e-57  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0855  coproporphyrinogen III oxidase  37.47 
 
 
404 aa  223  4e-57  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.286896  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1228  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  34.42 
 
 
380 aa  223  6e-57  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2239  coproporphyrinogen III oxidase  37.06 
 
 
409 aa  222  9.999999999999999e-57  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.167009  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0516  coproporphyrinogen III oxidase  37.47 
 
 
404 aa  220  3.9999999999999997e-56  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0955  coproporphyrinogen III oxidase  37.47 
 
 
404 aa  220  3.9999999999999997e-56  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.337282  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2108  coproporphyrinogen III oxidase  37.22 
 
 
409 aa  220  3.9999999999999997e-56  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0995  coproporphyrinogen III oxidase  37.47 
 
 
404 aa  220  3.9999999999999997e-56  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.369674  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3351  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  34.68 
 
 
384 aa  219  5e-56  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0052  coproporphyrinogen III oxidase, anaerobic  35.1 
 
 
390 aa  219  7e-56  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0403831  normal  0.42577 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2953  coproporphyrinogen III oxidase  37.62 
 
 
405 aa  219  8.999999999999998e-56  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.640184  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2644  coproporphyrinogen III oxidase  37.62 
 
 
405 aa  218  1e-55  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2100  coproporphyrinogen III oxidase  37.62 
 
 
405 aa  218  1e-55  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1968  coproporphyrinogen III oxidase  37.62 
 
 
405 aa  218  1e-55  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.137157  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0811  coproporphyrinogen III oxidase  37.62 
 
 
405 aa  218  1e-55  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.12855  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3838  putative oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  41.86 
 
 
407 aa  218  2e-55  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.584028  hitchhiker  0.00877773 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3019  coproporphyrinogen III oxidase  37.38 
 
 
405 aa  218  2e-55  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.18574  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3053  coproporphyrinogen III oxidase  37.38 
 
 
405 aa  218  2e-55  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4103  coproporphyrinogen III oxidase  37.47 
 
 
404 aa  218  2e-55  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.274585  normal  0.294261 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1582  putative oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  32.83 
 
 
381 aa  217  2.9999999999999998e-55  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.0000332518  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1962  coproporphyrinogen III oxidase  36.17 
 
 
422 aa  216  4e-55  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.154783  normal  0.857394 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2405  coproporphyrinogen III oxidase  37.47 
 
 
404 aa  216  5e-55  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3359  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase, putative  35.43 
 
 
385 aa  216  7e-55  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2063  coproporphyrinogen III oxidase  34.64 
 
 
384 aa  214  1.9999999999999998e-54  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12840  coproporphyrinogen III oxidase, anaerobic  38.1 
 
 
422 aa  213  2.9999999999999995e-54  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2374  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  34.76 
 
 
448 aa  214  2.9999999999999995e-54  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1258  putative oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  35.82 
 
 
385 aa  213  3.9999999999999995e-54  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0161407  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1582  coproporphyrinogen III oxidase  37.13 
 
 
405 aa  213  4.9999999999999996e-54  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.229924  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7063  coproporphyrinogen III oxidase  39.3 
 
 
408 aa  213  4.9999999999999996e-54  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.405832  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1554  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  32.07 
 
 
376 aa  213  5.999999999999999e-54  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.0000769723  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2472  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  38.4 
 
 
400 aa  213  5.999999999999999e-54  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3458  putative oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  41.71 
 
 
407 aa  212  9e-54  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.99275  normal  0.352624 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1188  putative oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  35.57 
 
 
385 aa  212  9e-54  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1976  coproporphyrinogen III oxidase  36.07 
 
 
409 aa  212  1e-53  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000234846 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3018  putative oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  33.74 
 
 
393 aa  211  1e-53  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2346  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase, putative  35.14 
 
 
385 aa  211  1e-53  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1636  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  41.38 
 
 
406 aa  212  1e-53  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.234243  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1516  coproporphyrinogen III oxidase  39.03 
 
 
405 aa  211  1e-53  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.493092  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3855  coproporphyrinogen III oxidase  36.02 
 
 
394 aa  212  1e-53  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.33965  normal  0.277651 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1980  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  35.14 
 
 
385 aa  211  1e-53  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.958254  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>