More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GYMC61_1445 on replicon NC_013411
Organism: Geobacillus sp. Y412MC61



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012793  GWCH70_0631  coproporphyrinogen III oxidase  78.56 
 
 
501 aa  813    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000100188  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0964  coproporphyrinogen III oxidase  68.44 
 
 
496 aa  692    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0706  coproporphyrinogen III oxidase  66.93 
 
 
495 aa  690    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0964  coproporphyrinogen III oxidase  67.94 
 
 
495 aa  694    Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0831  coproporphyrinogen III oxidase  68.44 
 
 
498 aa  693    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0777  coproporphyrinogen III oxidase  68.44 
 
 
498 aa  692    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0778  coproporphyrinogen III oxidase  68.44 
 
 
498 aa  693    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.798816  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1445  coproporphyrinogen III oxidase  100 
 
 
499 aa  1039    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0875  coproporphyrinogen III oxidase  68.44 
 
 
496 aa  693    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.737653  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0778  coproporphyrinogen III oxidase  68.79 
 
 
496 aa  691    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.385529  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0926  coproporphyrinogen III oxidase  67.54 
 
 
495 aa  694    Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.200785  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1051  coproporphyrinogen III oxidase  67.94 
 
 
495 aa  696    Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4404  coproporphyrinogen III oxidase  67.87 
 
 
495 aa  694    Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000115186 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1341  coproporphyrinogen III oxidase  44.62 
 
 
505 aa  350  3e-95  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.996503  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1948  coproporphyrinogen III oxidase  39.09 
 
 
504 aa  342  1e-92  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2881  coproporphyrinogen III oxidase  41.65 
 
 
494 aa  340  2.9999999999999998e-92  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.969668  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3377  coproporphyrinogen III oxidase  42.21 
 
 
509 aa  337  3.9999999999999995e-91  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1901  coproporphyrinogen III oxidase  41.37 
 
 
480 aa  337  3.9999999999999995e-91  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2190  coproporphyrinogen III oxidase  41.12 
 
 
480 aa  334  2e-90  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0550  coproporphyrinogen III oxidase  44.19 
 
 
491 aa  332  1e-89  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.790548  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3606  coproporphyrinogen III oxidase  43.31 
 
 
518 aa  321  1.9999999999999998e-86  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1948  coproporphyrinogen III oxidase  40.26 
 
 
471 aa  293  6e-78  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4085  Coproporphyrinogen dehydrogenase  38.64 
 
 
468 aa  285  1.0000000000000001e-75  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1406  Coproporphyrinogen dehydrogenase  37.68 
 
 
457 aa  267  2.9999999999999995e-70  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0315  coproporphyrinogen III oxidase  36.53 
 
 
438 aa  241  2e-62  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0603  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  33.33 
 
 
378 aa  149  1.0000000000000001e-34  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1325  coproporphyrinogen III oxidase, anaerobic  31.94 
 
 
380 aa  144  3e-33  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4306  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  33.56 
 
 
375 aa  142  9.999999999999999e-33  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0329595  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5327  coproporphyrinogen III oxidase  32.46 
 
 
401 aa  142  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.476935 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2008  coproporphyrinogen III oxidase  32.21 
 
 
377 aa  141  1.9999999999999998e-32  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2293  coproporphyrinogen III oxidase  31 
 
 
377 aa  138  2e-31  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1363  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  28.4 
 
 
389 aa  138  3.0000000000000003e-31  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2082  coproporphyrinogen III oxidase  32 
 
 
375 aa  135  9.999999999999999e-31  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1109  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  29.05 
 
 
377 aa  130  5.0000000000000004e-29  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.298913  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2963  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  29.68 
 
 
387 aa  130  6e-29  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  hitchhiker  0.000535992  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0485  coproporphyrinogen III oxidase  29.87 
 
 
384 aa  129  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1258  putative oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  28.91 
 
 
385 aa  129  1.0000000000000001e-28  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0161407  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0582  coproporphyrinogen III oxidase, anaerobic  32.87 
 
 
388 aa  126  1e-27  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1187  putative oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  28.57 
 
 
385 aa  125  1e-27  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.454386  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3359  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase, putative  28.57 
 
 
385 aa  125  2e-27  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1188  putative oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  28.32 
 
 
385 aa  125  2e-27  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1326  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  28.9 
 
 
378 aa  124  3e-27  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.0437214 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2866  putative oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  28.57 
 
 
379 aa  123  8e-27  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00010545  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4035  coproporphyrinogen III oxidase  29.87 
 
 
379 aa  123  9e-27  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.023291 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0055  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  29.72 
 
 
365 aa  123  9.999999999999999e-27  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal  0.60035 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05040  coproporphyrinogen III oxidase  29.22 
 
 
384 aa  122  9.999999999999999e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2500  putative oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  30.18 
 
 
378 aa  121  3e-26  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000623828  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4974  coproporphyrinogen III oxidase  29.87 
 
 
391 aa  121  3e-26  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3535  coproporphyrinogen III oxidase, anaerobic  29.07 
 
 
383 aa  120  7e-26  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000160096  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3046  putative oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  28.88 
 
 
388 aa  120  7e-26  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000324324  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2687  putative oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  27.92 
 
 
400 aa  120  7.999999999999999e-26  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000667437  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1332  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  28.57 
 
 
388 aa  119  9.999999999999999e-26  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.0000575717  hitchhiker  0.0000904617 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_761  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  27.61 
 
 
378 aa  119  9.999999999999999e-26  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.0000202557  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2693  putative oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  28.75 
 
 
387 aa  119  9.999999999999999e-26  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3031  putative oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  28.57 
 
 
388 aa  119  1.9999999999999998e-25  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.472525  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2314  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  30.82 
 
 
408 aa  119  1.9999999999999998e-25  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0256017  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03584  coproporphyrinogen III oxidase  28.85 
 
 
390 aa  118  1.9999999999999998e-25  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3189  putative oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  28.57 
 
 
388 aa  118  1.9999999999999998e-25  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000939892  normal  0.198948 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1010  coproporphyrinogen III oxidase  31.4 
 
 
379 aa  117  3.9999999999999997e-25  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1216  coproporphyrinogen III oxidase  29.43 
 
 
378 aa  117  6.9999999999999995e-25  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12830  putative oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  30.63 
 
 
385 aa  116  7.999999999999999e-25  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.402755  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0858  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase, putative  28.12 
 
 
378 aa  115  1.0000000000000001e-24  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0560367  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0766  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  28.97 
 
 
366 aa  115  1.0000000000000001e-24  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0410499  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3046  putative oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  28.94 
 
 
380 aa  115  1.0000000000000001e-24  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.482476  normal  0.758269 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3361  coproporphyrinogen III oxidase  28.16 
 
 
380 aa  115  2.0000000000000002e-24  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00679793 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1226  coproporphyrinogen dehydrogenase  26.75 
 
 
378 aa  115  2.0000000000000002e-24  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000226864  normal  0.222132 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0364  coproporphyrinogen III oxidase  30.67 
 
 
395 aa  115  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.250524  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1228  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  28.67 
 
 
380 aa  115  2.0000000000000002e-24  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0850  coproporphyrinogen III oxidase  29.26 
 
 
419 aa  114  3e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.260825  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0007  coproporphyrinogen III oxidase  29.13 
 
 
391 aa  114  3e-24  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.712639  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2479  coproporphyrinogen III oxidase  28.48 
 
 
413 aa  114  5e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.226119  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0944  putative oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  28.15 
 
 
375 aa  113  6e-24  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3455  coproporphyrinogen III oxidase  29.43 
 
 
380 aa  113  7.000000000000001e-24  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.766268  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0537  coproporphyrinogen III oxidase  27.27 
 
 
386 aa  113  7.000000000000001e-24  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0906426  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0665  coproporphyrinogen III oxidase  27.69 
 
 
404 aa  113  7.000000000000001e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0912478  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2444  putative oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  28.21 
 
 
385 aa  113  8.000000000000001e-24  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1121  putative oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  27.92 
 
 
378 aa  113  9e-24  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.002803  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0776  putative oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  28.33 
 
 
378 aa  112  1.0000000000000001e-23  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  decreased coverage  0.00749552  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03000  coproporphyrinogen III oxidase  29.22 
 
 
373 aa  113  1.0000000000000001e-23  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0536  putative oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  29.8 
 
 
578 aa  112  1.0000000000000001e-23  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.448786  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2440  coproporphyrinogen III oxidase  30.88 
 
 
382 aa  112  1.0000000000000001e-23  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000264436  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4335  putative oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  29.6 
 
 
389 aa  112  1.0000000000000001e-23  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002450  coproporphyrinogen III oxidase, oxygen-independent  28.2 
 
 
392 aa  112  1.0000000000000001e-23  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1304  putative oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  27.49 
 
 
381 aa  112  1.0000000000000001e-23  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1180  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  28.97 
 
 
401 aa  112  1.0000000000000001e-23  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.219055  hitchhiker  0.00393596 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0770  coproporphyrinogen III oxidase  27.54 
 
 
378 aa  111  2.0000000000000002e-23  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.261122  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3612  coproporphyrinogen III oxidase  29.43 
 
 
379 aa  112  2.0000000000000002e-23  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1108  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  27.61 
 
 
360 aa  112  2.0000000000000002e-23  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0488  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  29.33 
 
 
374 aa  112  2.0000000000000002e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG0475  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase, putative  27.12 
 
 
376 aa  111  3e-23  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1980  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  30.14 
 
 
380 aa  111  3e-23  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000000136099  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0117  putative oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  27.22 
 
 
382 aa  111  3e-23  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2374  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  27.56 
 
 
448 aa  111  3e-23  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3225  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  25.75 
 
 
432 aa  111  3e-23  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000826969  normal  0.0243619 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3089  coproporphyrinogen III oxidase  26.79 
 
 
409 aa  111  3e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.610477  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3306  putative oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  30.52 
 
 
423 aa  110  4.0000000000000004e-23  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.661128  normal  0.0726751 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0068  coproporphyrinogen III oxidase  29.9 
 
 
408 aa  110  4.0000000000000004e-23  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0901  coproporphyrinogen III oxidase  26.71 
 
 
409 aa  110  4.0000000000000004e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.482511  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2239  coproporphyrinogen III oxidase  29.17 
 
 
409 aa  110  4.0000000000000004e-23  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.167009  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0545  Coproporphyrinogen dehydrogenase  34.78 
 
 
404 aa  111  4.0000000000000004e-23  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.693751  normal  0.412237 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>