More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Apre_0315 on replicon NC_013171
Organism: Anaerococcus prevotii DSM 20548



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013171  Apre_0315  coproporphyrinogen III oxidase  100 
 
 
438 aa  885    Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3606  coproporphyrinogen III oxidase  36.96 
 
 
518 aa  259  6e-68  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0831  coproporphyrinogen III oxidase  36.25 
 
 
498 aa  245  9.999999999999999e-64  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0778  coproporphyrinogen III oxidase  36.25 
 
 
498 aa  245  9.999999999999999e-64  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.798816  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0875  coproporphyrinogen III oxidase  36.25 
 
 
496 aa  245  9.999999999999999e-64  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.737653  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0964  coproporphyrinogen III oxidase  36.25 
 
 
495 aa  245  9.999999999999999e-64  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0964  coproporphyrinogen III oxidase  36.25 
 
 
496 aa  244  1.9999999999999999e-63  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0777  coproporphyrinogen III oxidase  36.25 
 
 
498 aa  244  1.9999999999999999e-63  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0926  coproporphyrinogen III oxidase  36.25 
 
 
495 aa  244  1.9999999999999999e-63  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.200785  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4404  coproporphyrinogen III oxidase  36.91 
 
 
495 aa  244  1.9999999999999999e-63  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000115186 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0706  coproporphyrinogen III oxidase  37.7 
 
 
495 aa  244  1.9999999999999999e-63  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1051  coproporphyrinogen III oxidase  36.25 
 
 
495 aa  244  3e-63  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1445  coproporphyrinogen III oxidase  36.53 
 
 
499 aa  241  2e-62  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0778  coproporphyrinogen III oxidase  36.39 
 
 
496 aa  240  4e-62  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.385529  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1948  coproporphyrinogen III oxidase  36.48 
 
 
504 aa  238  1e-61  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1341  coproporphyrinogen III oxidase  37.17 
 
 
505 aa  236  5.0000000000000005e-61  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.996503  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0631  coproporphyrinogen III oxidase  36.22 
 
 
501 aa  234  3e-60  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000100188  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0550  coproporphyrinogen III oxidase  33.48 
 
 
491 aa  226  8e-58  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.790548  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1406  Coproporphyrinogen dehydrogenase  40.22 
 
 
457 aa  223  7e-57  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1901  coproporphyrinogen III oxidase  30.25 
 
 
480 aa  217  2.9999999999999998e-55  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2190  coproporphyrinogen III oxidase  30.59 
 
 
480 aa  216  4e-55  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3377  coproporphyrinogen III oxidase  35.66 
 
 
509 aa  214  2.9999999999999995e-54  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2881  coproporphyrinogen III oxidase  33.25 
 
 
494 aa  211  2e-53  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.969668  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4085  Coproporphyrinogen dehydrogenase  34.91 
 
 
468 aa  204  3e-51  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1948  coproporphyrinogen III oxidase  34.86 
 
 
471 aa  186  9e-46  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0944  putative oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  30.58 
 
 
375 aa  125  2e-27  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1177  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  30.3 
 
 
372 aa  122  9.999999999999999e-27  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0055  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  28.29 
 
 
365 aa  122  1.9999999999999998e-26  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal  0.60035 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6524  Coproporphyrinogen dehydrogenase  33.64 
 
 
431 aa  121  1.9999999999999998e-26  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1999  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  28.34 
 
 
388 aa  116  7.999999999999999e-25  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.865362  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2008  coproporphyrinogen III oxidase  28.98 
 
 
377 aa  115  2.0000000000000002e-24  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2293  coproporphyrinogen III oxidase  29.21 
 
 
377 aa  114  3e-24  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4306  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  32.99 
 
 
375 aa  114  4.0000000000000004e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0329595  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2239  coproporphyrinogen III oxidase  32.72 
 
 
409 aa  114  4.0000000000000004e-24  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.167009  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4064  coproporphyrinogen III oxidase  28.62 
 
 
379 aa  113  7.000000000000001e-24  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.659192  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4216  coproporphyrinogen III oxidase  28.62 
 
 
379 aa  113  8.000000000000001e-24  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2357  coproporphyrinogen III oxidase, anaerobic  28.15 
 
 
466 aa  113  8.000000000000001e-24  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0972265  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4542  coproporphyrinogen III oxidase  28.62 
 
 
378 aa  113  9e-24  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.3385  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0475  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase, putative  27.49 
 
 
376 aa  112  1.0000000000000001e-23  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4168  coproporphyrinogen III oxidase  28.62 
 
 
379 aa  112  1.0000000000000001e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0038285  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0800  coproporphyrinogen III oxidase  28.62 
 
 
379 aa  112  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000109269  hitchhiker  5.6543700000000005e-18 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12400  coproporphyrinogen III oxidase, anaerobic  26.9 
 
 
426 aa  112  1.0000000000000001e-23  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  decreased coverage  0.00807664  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4450  coproporphyrinogen III oxidase  28.29 
 
 
378 aa  112  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000131876  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4339  coproporphyrinogen III oxidase  28.62 
 
 
378 aa  112  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.26628e-29 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4436  coproporphyrinogen III oxidase  28.29 
 
 
379 aa  110  4.0000000000000004e-23  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000959102  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3320  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  29.05 
 
 
357 aa  110  5e-23  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00918826  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4054  coproporphyrinogen III oxidase  28.29 
 
 
379 aa  109  1e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.749761  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1249  coproporphyrinogen III oxidase  26.9 
 
 
379 aa  109  1e-22  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1304  putative oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  26.11 
 
 
381 aa  108  1e-22  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1151  coproporphyrinogen III oxidase  29.05 
 
 
374 aa  108  2e-22  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4398  coproporphyrinogen III oxidase  27.96 
 
 
378 aa  108  2e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.601746  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2010  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  34.16 
 
 
371 aa  107  3e-22  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2215  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  24.77 
 
 
412 aa  107  4e-22  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.892548  normal  0.0148235 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3043  coproporphyrinogen III oxidase  27.96 
 
 
378 aa  107  4e-22  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000458873  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0890  coproporphyrinogen III oxidase  28.3 
 
 
376 aa  107  5e-22  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.112069  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0208  putative oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  27.39 
 
 
381 aa  106  1e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000567402  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0582  coproporphyrinogen III oxidase, anaerobic  27.52 
 
 
388 aa  105  1e-21  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13360  coproporphyrinogen III oxidase, anaerobic  25.32 
 
 
418 aa  105  2e-21  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.186133  normal  0.0883125 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1516  coproporphyrinogen III oxidase  26.01 
 
 
405 aa  105  2e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.493092  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1745  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  24.68 
 
 
405 aa  105  2e-21  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.911119 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0205  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  31.96 
 
 
380 aa  105  2e-21  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.650734  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1716  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  36.75 
 
 
384 aa  104  4e-21  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.871197  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1583  putative oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  27.53 
 
 
374 aa  103  5e-21  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1649  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  32.98 
 
 
374 aa  101  2e-20  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0144  Coproporphyrinogen dehydrogenase  31.31 
 
 
465 aa  101  2e-20  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1109  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  26.71 
 
 
377 aa  101  2e-20  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.298913  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0873  Radical SAM domain protein  27.5 
 
 
443 aa  102  2e-20  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1208  coproporphyrinogen III oxidase  24.35 
 
 
462 aa  100  4e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.710207  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3577  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  32.32 
 
 
381 aa  100  4e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1216  coproporphyrinogen III oxidase  27.1 
 
 
378 aa  100  4e-20  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3508  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  30.46 
 
 
381 aa  100  4e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.230764  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1224  putative oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  32.06 
 
 
370 aa  100  5e-20  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.948437  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1325  coproporphyrinogen III oxidase, anaerobic  26.49 
 
 
380 aa  100  7e-20  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0858  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase, putative  26.4 
 
 
378 aa  99.8  9e-20  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0560367  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0332  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  27.37 
 
 
374 aa  99.4  1e-19  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.187228  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1008  coproporphyrinogen III oxidase  25.81 
 
 
460 aa  99.4  1e-19  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2783  coproporphyrinogen III oxidase  25.16 
 
 
460 aa  99.4  1e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.682554  normal  0.601804 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0007  coproporphyrinogen III oxidase  30.52 
 
 
391 aa  99.4  1e-19  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.712639  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1092  coproporphyrinogen III oxidase  25.81 
 
 
460 aa  99.4  1e-19  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2199  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  26.09 
 
 
448 aa  98.2  2e-19  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.186673  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1180  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  26.75 
 
 
401 aa  98.6  2e-19  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.219055  hitchhiker  0.00393596 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1553  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  28.14 
 
 
423 aa  97.8  3e-19  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1429  coproporphyrinogen III oxidase  31.12 
 
 
469 aa  98.2  3e-19  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0537  coproporphyrinogen III oxidase  25.08 
 
 
386 aa  97.8  3e-19  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0906426  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1641  coproporphyrinogen III oxidase  30.57 
 
 
374 aa  98.2  3e-19  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.905653  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2382  coproporphyrinogen III oxidase  26.06 
 
 
396 aa  98.2  3e-19  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.0342073 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3351  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  25.91 
 
 
384 aa  98.2  3e-19  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1675  coproporphyrinogen III oxidase  30.57 
 
 
374 aa  98.2  3e-19  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.370593  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10300  putative oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  31.68 
 
 
372 aa  98.2  3e-19  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0541623  unclonable  0.00000000192008 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11650  coproporphyrinogen III oxidase, anaerobic  24.85 
 
 
411 aa  97.8  3e-19  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0627344  normal  0.396756 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1980  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  26.27 
 
 
380 aa  98.2  3e-19  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000000136099  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0876  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  23.57 
 
 
457 aa  97.8  4e-19  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0479  putative oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  27.66 
 
 
385 aa  97.4  4e-19  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.822373  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002450  coproporphyrinogen III oxidase, oxygen-independent  30.92 
 
 
392 aa  97.4  4e-19  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3255  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  30.14 
 
 
403 aa  97.4  4e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00582345  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3774  coproporphyrinogen III oxidase  29.02 
 
 
468 aa  97.4  4e-19  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.46395  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1162  coproporphyrinogen III oxidase  24.18 
 
 
460 aa  97.8  4e-19  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7063  coproporphyrinogen III oxidase  28.24 
 
 
408 aa  97.4  5e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.405832  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1148  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  29.95 
 
 
403 aa  97.1  5e-19  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.61254 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1108  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  25.59 
 
 
360 aa  97.4  5e-19  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>