More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jden_1553 on replicon NC_013174
Organism: Jonesia denitrificans DSM 20603



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013174  Jden_1553  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  100 
 
 
423 aa  861    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13360  coproporphyrinogen III oxidase, anaerobic  63.83 
 
 
418 aa  558  1e-158  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.186133  normal  0.0883125 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2199  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  58.98 
 
 
448 aa  513  1e-144  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.186673  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2215  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  62.06 
 
 
412 aa  514  1e-144  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.892548  normal  0.0148235 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3411  coproporphyrinogen III oxidase  60.43 
 
 
401 aa  480  1e-134  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.102052 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1976  coproporphyrinogen III oxidase  56.67 
 
 
409 aa  474  1e-132  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000234846 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2239  coproporphyrinogen III oxidase  55.92 
 
 
409 aa  474  1e-132  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.167009  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1745  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  60.28 
 
 
405 aa  457  1e-127  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.911119 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5458  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  54.48 
 
 
406 aa  439  9.999999999999999e-123  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1898  coproporphyrinogen III oxidase  53.52 
 
 
426 aa  429  1e-119  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.133769  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2285  Coproporphyrinogen dehydrogenase  53.3 
 
 
403 aa  426  1e-118  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.617284 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1148  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  53.1 
 
 
403 aa  422  1e-117  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.61254 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12400  coproporphyrinogen III oxidase, anaerobic  52.76 
 
 
426 aa  421  1e-116  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  decreased coverage  0.00807664  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17330  coproporphyrinogen III oxidase, anaerobic  54.96 
 
 
389 aa  410  1e-113  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.395345  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7063  coproporphyrinogen III oxidase  52.57 
 
 
408 aa  408  1e-113  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.405832  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3838  putative oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  53.43 
 
 
407 aa  408  1.0000000000000001e-112  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.584028  hitchhiker  0.00877773 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3255  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  52.82 
 
 
403 aa  405  1.0000000000000001e-112  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00582345  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11650  coproporphyrinogen III oxidase, anaerobic  52.38 
 
 
411 aa  397  1e-109  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0627344  normal  0.396756 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3458  putative oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  52.25 
 
 
407 aa  392  1e-108  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.99275  normal  0.352624 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0852  putative oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  47.8 
 
 
436 aa  389  1e-107  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1165  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  51.63 
 
 
415 aa  388  1e-107  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.77099  normal  0.634386 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1263  coproporphyrinogen III oxidase  50.95 
 
 
411 aa  391  1e-107  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.0206083 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2108  coproporphyrinogen III oxidase  50.47 
 
 
409 aa  387  1e-106  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0781  coproporphyrinogen III oxidase, anaerobic  50.74 
 
 
400 aa  388  1e-106  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.41975  normal  0.123732 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1240  coproporphyrinogen III oxidase  50.24 
 
 
404 aa  379  1e-104  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.0000912695  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1636  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  51.89 
 
 
406 aa  376  1e-103  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.234243  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0697  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  49.05 
 
 
410 aa  374  1e-102  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.504316 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12840  coproporphyrinogen III oxidase, anaerobic  50.12 
 
 
422 aa  363  2e-99  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2687  coproporphyrinogen III oxidase  50 
 
 
398 aa  360  2e-98  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.992517  normal  0.224392 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3165  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  51.63 
 
 
401 aa  357  2.9999999999999997e-97  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0835  coproporphyrinogen III oxidase  49.16 
 
 
410 aa  352  1e-95  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0581  coproporphyrinogen III oxidase  42.64 
 
 
469 aa  350  2e-95  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.496412  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1569  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  48.93 
 
 
411 aa  349  5e-95  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0883271  normal  0.0181268 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3855  coproporphyrinogen III oxidase  48.48 
 
 
394 aa  349  5e-95  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.33965  normal  0.277651 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3473  coproporphyrinogen III oxidase  49.62 
 
 
392 aa  342  5e-93  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0588926  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3536  coproporphyrinogen III oxidase  49.62 
 
 
392 aa  342  5e-93  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.15747  normal  0.866519 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3486  coproporphyrinogen III oxidase  49.37 
 
 
392 aa  340  2.9999999999999998e-92  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2770  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  47.03 
 
 
391 aa  336  3.9999999999999995e-91  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.364803  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12413  coproporphyrinogen III oxidase  47.72 
 
 
390 aa  328  1.0000000000000001e-88  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000120339  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0603  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  38.18 
 
 
378 aa  236  6e-61  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1360  putative oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  36.43 
 
 
371 aa  230  4e-59  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.716239  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1363  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  35.61 
 
 
389 aa  229  8e-59  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0030  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase, putative  34.77 
 
 
385 aa  224  2e-57  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.949331  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3225  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  33.17 
 
 
432 aa  220  3e-56  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000826969  normal  0.0243619 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4306  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  37.39 
 
 
375 aa  220  3.9999999999999997e-56  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0329595  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2500  putative oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  34.47 
 
 
378 aa  219  8.999999999999998e-56  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000623828  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1980  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  30.81 
 
 
380 aa  218  2e-55  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000000136099  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4013  coproporphyrinogen III oxidase  34.41 
 
 
387 aa  213  5.999999999999999e-54  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  decreased coverage  0.00338322  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0691  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  36.6 
 
 
380 aa  212  1e-53  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3577  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  36.29 
 
 
381 aa  211  1e-53  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2063  coproporphyrinogen III oxidase  38.15 
 
 
384 aa  211  2e-53  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1290  Coproporphyrinogen dehydrogenase  38.5 
 
 
363 aa  211  3e-53  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.114072  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2244  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  33.25 
 
 
384 aa  211  3e-53  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1337  coproporphyrinogen III oxidase  31.93 
 
 
392 aa  211  3e-53  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0488  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  33.83 
 
 
374 aa  208  1e-52  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12830  putative oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  30.69 
 
 
385 aa  208  1e-52  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.402755  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0582  coproporphyrinogen III oxidase, anaerobic  34.28 
 
 
388 aa  207  2e-52  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0007  coproporphyrinogen III oxidase  33.42 
 
 
381 aa  208  2e-52  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000223665 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5773  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  34 
 
 
374 aa  207  2e-52  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2601  coproporphyrinogen III oxidase  32.46 
 
 
414 aa  207  4e-52  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1516  coproporphyrinogen III oxidase  34.94 
 
 
405 aa  206  5e-52  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.493092  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3505  coproporphyrinogen III oxidase  32.72 
 
 
414 aa  206  6e-52  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.699164  normal  0.0919169 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1304  putative oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  33.92 
 
 
381 aa  206  6e-52  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2374  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  34.49 
 
 
448 aa  205  1e-51  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1442  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  28.64 
 
 
368 aa  205  1e-51  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000616139  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3508  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  35.1 
 
 
381 aa  205  1e-51  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.230764  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0330  coproporphyrinogen III oxidase  35.32 
 
 
385 aa  205  1e-51  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.154347  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2661  coproporphyrinogen III oxidase  35.07 
 
 
385 aa  205  1e-51  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.226338  normal  0.501465 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0013  coproporphyrinogen III oxidase  35.25 
 
 
394 aa  204  2e-51  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1325  coproporphyrinogen III oxidase, anaerobic  30.5 
 
 
380 aa  204  3e-51  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0936  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  34.08 
 
 
383 aa  203  4e-51  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1109  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  29.73 
 
 
377 aa  203  4e-51  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.298913  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1228  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  32.91 
 
 
380 aa  203  4e-51  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0185  coproporphyrinogen III oxidase  33.97 
 
 
409 aa  203  4e-51  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.867892  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3535  coproporphyrinogen III oxidase, anaerobic  34.91 
 
 
383 aa  202  8e-51  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000160096  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3011  putative oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  35.07 
 
 
389 aa  202  8e-51  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0173  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  35.4 
 
 
387 aa  202  9.999999999999999e-51  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.43547 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1376  putative oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  29.9 
 
 
384 aa  201  1.9999999999999998e-50  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.822523  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3582  putative oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  34.11 
 
 
385 aa  201  1.9999999999999998e-50  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0003  coproporphyrinogen III oxidase  31.44 
 
 
400 aa  201  1.9999999999999998e-50  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.242877  hitchhiker  0.00414143 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2155  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  33.17 
 
 
389 aa  201  1.9999999999999998e-50  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3639  coproporphyrinogen III oxidase  35.64 
 
 
414 aa  201  1.9999999999999998e-50  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0149  coproporphyrinogen III oxidase  34.32 
 
 
386 aa  201  1.9999999999999998e-50  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0003  coproporphyrinogen III oxidase  31.46 
 
 
401 aa  201  3e-50  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.045882 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0394  coproporphyrinogen III oxidase  33 
 
 
393 aa  201  3e-50  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04915  coproporphyrinogen III oxidase  29.32 
 
 
376 aa  201  3e-50  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0630  coproporphyrinogen III oxidase  36.72 
 
 
393 aa  200  3.9999999999999996e-50  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.824124  normal  0.0911038 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2885  coproporphyrinogen III oxidase  36.6 
 
 
385 aa  200  3.9999999999999996e-50  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0397  coproporphyrinogen III oxidase  34.15 
 
 
385 aa  200  5e-50  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0170  coproporphyrinogen III oxidase  34.73 
 
 
404 aa  199  6e-50  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.379163  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1999  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  34.97 
 
 
388 aa  199  7e-50  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.865362  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0176  coproporphyrinogen III oxidase  34.73 
 
 
385 aa  199  9e-50  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3398  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  33.25 
 
 
402 aa  198  1.0000000000000001e-49  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.217833 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3460  coproporphyrinogen III oxidase  33.5 
 
 
387 aa  199  1.0000000000000001e-49  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4450  coproporphyrinogen III oxidase  29.47 
 
 
378 aa  198  1.0000000000000001e-49  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000131876  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2113  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  33.59 
 
 
369 aa  198  2.0000000000000003e-49  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.512598  normal  0.05877 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4064  coproporphyrinogen III oxidase  29.97 
 
 
379 aa  198  2.0000000000000003e-49  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.659192  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1224  coproporphyrinogen III oxidase  36.6 
 
 
385 aa  198  2.0000000000000003e-49  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4542  coproporphyrinogen III oxidase  29.97 
 
 
378 aa  197  2.0000000000000003e-49  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.3385  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4168  coproporphyrinogen III oxidase  30.25 
 
 
379 aa  197  2.0000000000000003e-49  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0038285  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>