More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_6524 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013440  Hoch_6524  Coproporphyrinogen dehydrogenase  100 
 
 
431 aa  881    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0144  Coproporphyrinogen dehydrogenase  32.39 
 
 
465 aa  216  5.9999999999999996e-55  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12830  putative oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  29.07 
 
 
385 aa  189  1e-46  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.402755  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0115  coproporphyrinogen III oxidase  30.07 
 
 
465 aa  180  5.999999999999999e-44  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0582  coproporphyrinogen III oxidase, anaerobic  30.91 
 
 
388 aa  175  9.999999999999999e-43  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3284  coproporphyrinogen III oxidase  31.55 
 
 
510 aa  174  1.9999999999999998e-42  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2002  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  29.79 
 
 
448 aa  173  5e-42  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.55227  normal  0.313368 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2783  coproporphyrinogen III oxidase  31.81 
 
 
460 aa  172  1e-41  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.682554  normal  0.601804 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1999  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  32.96 
 
 
388 aa  172  1e-41  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.865362  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1048  coproporphyrinogen III oxidase  30.49 
 
 
471 aa  170  4e-41  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1626  putative oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  28.38 
 
 
387 aa  170  4e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.981357 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4306  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  31.71 
 
 
375 aa  169  6e-41  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0329595  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1208  coproporphyrinogen III oxidase  31.5 
 
 
462 aa  169  7e-41  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.710207  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0030  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase, putative  31.07 
 
 
385 aa  168  2e-40  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.949331  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2500  putative oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  28.42 
 
 
378 aa  168  2e-40  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000623828  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3483  coproporphyrinogen III oxidase  30 
 
 
494 aa  167  4e-40  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.331416  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0117  putative oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  29.61 
 
 
382 aa  166  5.9999999999999996e-40  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1938  coproporphyrinogen III oxidase  30 
 
 
465 aa  165  1.0000000000000001e-39  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.1825  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2483  coproporphyrinogen III oxidase  27.95 
 
 
484 aa  165  1.0000000000000001e-39  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00279185  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2893  coproporphyrinogen III oxidase  29.68 
 
 
483 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.667583  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1708  coproporphyrinogen III oxidase  29.68 
 
 
483 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.555981  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0618  coproporphyrinogen III oxidase  29.68 
 
 
481 aa  164  3e-39  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1289  coproporphyrinogen III oxidase  31.65 
 
 
473 aa  164  3e-39  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2082  coproporphyrinogen III oxidase  27.37 
 
 
375 aa  164  3e-39  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1129  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  30.48 
 
 
471 aa  163  4.0000000000000004e-39  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal  0.101804 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3774  coproporphyrinogen III oxidase  31.43 
 
 
468 aa  164  4.0000000000000004e-39  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.46395  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2818  coproporphyrinogen III oxidase  29.44 
 
 
481 aa  163  6e-39  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2440  coproporphyrinogen III oxidase  27.76 
 
 
382 aa  163  6e-39  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000264436  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2394  coproporphyrinogen III oxidase  29.44 
 
 
483 aa  162  8.000000000000001e-39  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3156  coproporphyrinogen III oxidase  29.51 
 
 
494 aa  162  9e-39  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.574693 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0208  putative oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  32.18 
 
 
381 aa  162  1e-38  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000567402  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2754  coproporphyrinogen III oxidase  29.44 
 
 
483 aa  162  1e-38  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.36773  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1582  putative oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  30.26 
 
 
381 aa  162  1e-38  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.0000332518  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2697  coproporphyrinogen III oxidase  29.44 
 
 
483 aa  162  1e-38  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1010  coproporphyrinogen III oxidase  30.89 
 
 
379 aa  161  2e-38  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4436  coproporphyrinogen III oxidase  26.46 
 
 
379 aa  161  2e-38  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000959102  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2771  coproporphyrinogen III oxidase  30.95 
 
 
487 aa  160  3e-38  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0315162 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1800  coproporphyrinogen III oxidase  30.85 
 
 
481 aa  160  3e-38  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1372  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  30.69 
 
 
478 aa  160  3e-38  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.292242  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0800  coproporphyrinogen III oxidase  26.72 
 
 
379 aa  160  5e-38  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000109269  hitchhiker  5.6543700000000005e-18 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3225  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  27.57 
 
 
432 aa  159  6e-38  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000826969  normal  0.0243619 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3306  putative oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  27.23 
 
 
423 aa  159  7e-38  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.661128  normal  0.0726751 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3043  coproporphyrinogen III oxidase  26.79 
 
 
378 aa  159  8e-38  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000458873  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1008  coproporphyrinogen III oxidase  30.25 
 
 
460 aa  159  9e-38  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3559  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  28.79 
 
 
393 aa  159  9e-38  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1092  coproporphyrinogen III oxidase  30.25 
 
 
460 aa  159  9e-38  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1325  coproporphyrinogen III oxidase, anaerobic  27.2 
 
 
380 aa  159  1e-37  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4339  coproporphyrinogen III oxidase  26.46 
 
 
378 aa  158  1e-37  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.26628e-29 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2470  coproporphyrinogen III oxidase  32.47 
 
 
476 aa  158  1e-37  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.097815 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0384  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  29.12 
 
 
457 aa  159  1e-37  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1216  coproporphyrinogen III oxidase  28.57 
 
 
378 aa  159  1e-37  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0802  coproporphyrinogen III oxidase  31.36 
 
 
463 aa  158  2e-37  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.519619  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1151  coproporphyrinogen III oxidase  26.42 
 
 
374 aa  158  2e-37  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4216  coproporphyrinogen III oxidase  26.19 
 
 
379 aa  158  2e-37  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4054  coproporphyrinogen III oxidase  26.19 
 
 
379 aa  158  2e-37  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.749761  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4542  coproporphyrinogen III oxidase  26.19 
 
 
378 aa  158  2e-37  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.3385  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2444  putative oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  32.76 
 
 
385 aa  157  3e-37  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4450  coproporphyrinogen III oxidase  25.93 
 
 
378 aa  157  3e-37  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000131876  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0019  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  29.27 
 
 
464 aa  157  3e-37  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4018  coproporphyrinogen III oxidase  30.45 
 
 
463 aa  157  4e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.809241  normal  0.669249 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2824  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  31.03 
 
 
470 aa  157  5.0000000000000005e-37  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0116483  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1082  putative oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  29.32 
 
 
392 aa  156  5.0000000000000005e-37  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3411  coproporphyrinogen III oxidase  30.38 
 
 
401 aa  157  5.0000000000000005e-37  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.102052 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2008  coproporphyrinogen III oxidase  26.51 
 
 
377 aa  156  7e-37  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0791  coproporphyrinogen III oxidase  29.95 
 
 
463 aa  156  7e-37  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.680878  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3323  coproporphyrinogen III oxidase  30.61 
 
 
489 aa  156  8e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0691  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  31.47 
 
 
380 aa  155  9e-37  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00581  coproporphyrinogen III oxidase  29.04 
 
 
463 aa  155  1e-36  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4398  coproporphyrinogen III oxidase  25.66 
 
 
378 aa  155  1e-36  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.601746  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3368  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  28.94 
 
 
457 aa  155  1e-36  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.852365  hitchhiker  0.00221589 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04915  coproporphyrinogen III oxidase  28.42 
 
 
376 aa  155  1e-36  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0884  coproporphyrinogen III oxidase  30.94 
 
 
463 aa  155  1e-36  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.599698 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3474  coproporphyrinogen III oxidase  31.23 
 
 
500 aa  155  1e-36  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1464  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  26.08 
 
 
462 aa  155  1e-36  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000299867  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2477  coproporphyrinogen III oxidase  30.66 
 
 
482 aa  154  2e-36  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.99297  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4064  coproporphyrinogen III oxidase  25.66 
 
 
379 aa  154  2e-36  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.659192  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2293  coproporphyrinogen III oxidase  27.03 
 
 
377 aa  155  2e-36  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1516  coproporphyrinogen III oxidase  31.65 
 
 
405 aa  154  2.9999999999999998e-36  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.493092  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4168  coproporphyrinogen III oxidase  25.46 
 
 
379 aa  154  2.9999999999999998e-36  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0038285  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3875  putative oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  27.34 
 
 
406 aa  154  2.9999999999999998e-36  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1228  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  29.71 
 
 
380 aa  154  2.9999999999999998e-36  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0380  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  29.43 
 
 
379 aa  154  4e-36  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.182118  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0501  coproporphyrinogen III oxidase  29.67 
 
 
460 aa  153  7e-36  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0601  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  28.1 
 
 
471 aa  152  8e-36  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2357  coproporphyrinogen III oxidase, anaerobic  28.71 
 
 
466 aa  152  8e-36  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0972265  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11650  coproporphyrinogen III oxidase, anaerobic  29.1 
 
 
411 aa  152  8.999999999999999e-36  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0627344  normal  0.396756 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1217  coproporphyrinogen III oxidase  28.62 
 
 
458 aa  152  1e-35  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1693  coproporphyrinogen III oxidase  29.49 
 
 
382 aa  152  1e-35  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.616989  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1194  coproporphyrinogen III oxidase  28.96 
 
 
421 aa  152  1e-35  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0134211 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1304  putative oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  30.81 
 
 
381 aa  152  1e-35  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3855  coproporphyrinogen III oxidase  30.38 
 
 
394 aa  152  1e-35  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.33965  normal  0.277651 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4462  coproporphyrinogen III oxidase  28.65 
 
 
435 aa  152  2e-35  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3535  coproporphyrinogen III oxidase, anaerobic  31.37 
 
 
383 aa  151  2e-35  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000160096  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0887  coproporphyrinogen III oxidase  28.74 
 
 
453 aa  151  2e-35  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  decreased coverage  0.00571678  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0435  coproporphyrinogen III oxidase  30.45 
 
 
463 aa  151  2e-35  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0914  coproporphyrinogen III oxidase  30.45 
 
 
463 aa  151  2e-35  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.652481  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0052  coproporphyrinogen III oxidase, anaerobic  27.01 
 
 
390 aa  151  2e-35  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0403831  normal  0.42577 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1237  coproporphyrinogen III oxidase  28.98 
 
 
465 aa  150  3e-35  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.828394  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0718  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  28.46 
 
 
471 aa  151  3e-35  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1148  coproporphyrinogen III oxidase  28.31 
 
 
458 aa  150  4e-35  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>