More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plim_0144 on replicon NC_014148
Organism: Planctomyces limnophilus DSM 3776



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014148  Plim_0144  Coproporphyrinogen dehydrogenase  100 
 
 
465 aa  967    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6524  Coproporphyrinogen dehydrogenase  32.31 
 
 
431 aa  216  9e-55  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1626  putative oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  30.33 
 
 
387 aa  189  8e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.981357 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1325  coproporphyrinogen III oxidase, anaerobic  30.05 
 
 
380 aa  189  9e-47  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1216  coproporphyrinogen III oxidase  30.13 
 
 
378 aa  174  1.9999999999999998e-42  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0890  coproporphyrinogen III oxidase  29.12 
 
 
376 aa  168  2e-40  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.112069  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1109  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  29.23 
 
 
377 aa  167  4e-40  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.298913  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2082  coproporphyrinogen III oxidase  28.31 
 
 
375 aa  165  1.0000000000000001e-39  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0582  coproporphyrinogen III oxidase, anaerobic  28.53 
 
 
388 aa  163  6e-39  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3875  putative oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  30.99 
 
 
406 aa  163  8.000000000000001e-39  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2444  putative oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  31.01 
 
 
385 aa  161  3e-38  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2771  coproporphyrinogen III oxidase  29.11 
 
 
487 aa  160  6e-38  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0315162 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12830  putative oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  27.84 
 
 
385 aa  159  1e-37  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.402755  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1980  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  27.44 
 
 
380 aa  158  2e-37  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000000136099  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0205  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  28.27 
 
 
380 aa  158  2e-37  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.650734  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4306  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  30.03 
 
 
375 aa  157  4e-37  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0329595  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1582  putative oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  26.93 
 
 
381 aa  157  6e-37  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.0000332518  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2002  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  27.06 
 
 
448 aa  156  7e-37  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.55227  normal  0.313368 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05040  coproporphyrinogen III oxidase  30.42 
 
 
384 aa  156  9e-37  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0485  coproporphyrinogen III oxidase  30.08 
 
 
384 aa  155  1e-36  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1010  coproporphyrinogen III oxidase  29.77 
 
 
379 aa  155  1e-36  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3306  putative oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  29.61 
 
 
423 aa  154  2.9999999999999998e-36  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.661128  normal  0.0726751 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4436  coproporphyrinogen III oxidase  27.76 
 
 
379 aa  154  2.9999999999999998e-36  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000959102  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2440  coproporphyrinogen III oxidase  27.96 
 
 
382 aa  154  4e-36  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000264436  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1304  putative oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  29.56 
 
 
381 aa  153  5.9999999999999996e-36  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2603  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  25.3 
 
 
469 aa  152  1e-35  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2893  coproporphyrinogen III oxidase  27.37 
 
 
483 aa  151  2e-35  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.667583  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0618  coproporphyrinogen III oxidase  27.37 
 
 
481 aa  151  2e-35  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3559  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  28.01 
 
 
393 aa  151  2e-35  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1708  coproporphyrinogen III oxidase  27.37 
 
 
483 aa  151  2e-35  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.555981  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2394  coproporphyrinogen III oxidase  27.37 
 
 
483 aa  151  2e-35  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4974  coproporphyrinogen III oxidase  29.8 
 
 
391 aa  152  2e-35  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4269  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  26.96 
 
 
401 aa  151  3e-35  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.281837  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1999  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  33.55 
 
 
388 aa  151  3e-35  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.865362  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4393  coproporphyrinogen III oxidase  25.06 
 
 
472 aa  151  3e-35  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000149984 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3043  coproporphyrinogen III oxidase  28.23 
 
 
378 aa  151  3e-35  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000458873  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3535  coproporphyrinogen III oxidase, anaerobic  29.46 
 
 
383 aa  151  3e-35  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000160096  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1363  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  28.53 
 
 
389 aa  150  4e-35  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2374  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  26.87 
 
 
448 aa  150  4e-35  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0944  putative oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  28.4 
 
 
375 aa  150  4e-35  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2818  coproporphyrinogen III oxidase  27.11 
 
 
481 aa  149  7e-35  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2223  coproporphyrinogen III oxidase  25.9 
 
 
396 aa  149  9e-35  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1151  coproporphyrinogen III oxidase  28.34 
 
 
374 aa  149  1.0000000000000001e-34  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2697  coproporphyrinogen III oxidase  27.11 
 
 
483 aa  149  1.0000000000000001e-34  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0800  coproporphyrinogen III oxidase  27.49 
 
 
379 aa  149  1.0000000000000001e-34  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000109269  hitchhiker  5.6543700000000005e-18 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5458  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  28.57 
 
 
406 aa  148  2.0000000000000003e-34  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3828  coproporphyrinogen III oxidase  24.23 
 
 
460 aa  148  2.0000000000000003e-34  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2754  coproporphyrinogen III oxidase  27.11 
 
 
483 aa  148  2.0000000000000003e-34  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.36773  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2500  putative oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  25.91 
 
 
378 aa  147  3e-34  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000623828  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1263  coproporphyrinogen III oxidase  27.46 
 
 
411 aa  148  3e-34  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.0206083 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2472  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  29.62 
 
 
400 aa  147  4.0000000000000006e-34  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0117  putative oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  26.89 
 
 
382 aa  147  4.0000000000000006e-34  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2963  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  32.01 
 
 
387 aa  147  6e-34  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  hitchhiker  0.000535992  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4339  coproporphyrinogen III oxidase  27.22 
 
 
378 aa  146  7.0000000000000006e-34  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.26628e-29 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0488  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  26.8 
 
 
374 aa  146  7.0000000000000006e-34  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1516  coproporphyrinogen III oxidase  27.76 
 
 
405 aa  146  8.000000000000001e-34  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.493092  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4216  coproporphyrinogen III oxidase  27.22 
 
 
379 aa  146  9e-34  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2382  coproporphyrinogen III oxidase  27.78 
 
 
396 aa  146  9e-34  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.0342073 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4542  coproporphyrinogen III oxidase  27.22 
 
 
378 aa  146  1e-33  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.3385  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1800  coproporphyrinogen III oxidase  27.04 
 
 
481 aa  145  1e-33  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2785  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  33.8 
 
 
395 aa  145  1e-33  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.419951  normal  0.420525 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17330  coproporphyrinogen III oxidase, anaerobic  27.32 
 
 
389 aa  145  1e-33  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.395345  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4450  coproporphyrinogen III oxidase  27.54 
 
 
378 aa  144  2e-33  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000131876  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4779  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  25.26 
 
 
465 aa  144  2e-33  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.0897448 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0603  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  30.08 
 
 
378 aa  144  2e-33  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0718  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  28.61 
 
 
471 aa  144  2e-33  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0099  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  23.6 
 
 
465 aa  144  3e-33  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.98373 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4054  coproporphyrinogen III oxidase  27.22 
 
 
379 aa  144  3e-33  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.749761  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2108  coproporphyrinogen III oxidase  27.27 
 
 
409 aa  144  3e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3651  coproporphyrinogen III oxidase, anaerobic  30.71 
 
 
400 aa  144  3e-33  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0102  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  23.6 
 
 
465 aa  144  3e-33  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1655  putative oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  31 
 
 
418 aa  144  3e-33  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1228  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  27.63 
 
 
380 aa  144  4e-33  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3386  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  25.31 
 
 
460 aa  144  5e-33  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  hitchhiker  0.00479262  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4064  coproporphyrinogen III oxidase  26.95 
 
 
379 aa  143  6e-33  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.659192  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3411  coproporphyrinogen III oxidase  27.13 
 
 
401 aa  143  6e-33  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.102052 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0936  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  29.56 
 
 
383 aa  143  7e-33  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4398  coproporphyrinogen III oxidase  27.27 
 
 
378 aa  142  9.999999999999999e-33  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.601746  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1464  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  23.8 
 
 
462 aa  142  9.999999999999999e-33  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000299867  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2113  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  26.94 
 
 
369 aa  142  9.999999999999999e-33  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.512598  normal  0.05877 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3483  coproporphyrinogen III oxidase  26.3 
 
 
494 aa  142  9.999999999999999e-33  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.331416  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1360  putative oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  28.12 
 
 
371 aa  142  9.999999999999999e-33  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.716239  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1008  coproporphyrinogen III oxidase  25.24 
 
 
460 aa  142  9.999999999999999e-33  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1092  coproporphyrinogen III oxidase  25.24 
 
 
460 aa  142  9.999999999999999e-33  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002620  TC0322  coproporphyrinogen III oxidase  26.25 
 
 
376 aa  142  1.9999999999999998e-32  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3156  coproporphyrinogen III oxidase  26.35 
 
 
494 aa  141  1.9999999999999998e-32  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.574693 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0691  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  28.53 
 
 
380 aa  142  1.9999999999999998e-32  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1249  coproporphyrinogen III oxidase  27.73 
 
 
379 aa  141  1.9999999999999998e-32  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2601  coproporphyrinogen III oxidase  33.07 
 
 
414 aa  142  1.9999999999999998e-32  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5151  coproporphyrinogen III oxidase  30.63 
 
 
391 aa  141  3e-32  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.294445  normal  0.707101 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3284  coproporphyrinogen III oxidase  26.11 
 
 
510 aa  140  4.999999999999999e-32  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1162  coproporphyrinogen III oxidase  25.36 
 
 
460 aa  140  4.999999999999999e-32  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0384  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  28.76 
 
 
457 aa  140  6e-32  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4168  coproporphyrinogen III oxidase  26.74 
 
 
379 aa  140  6e-32  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0038285  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3505  coproporphyrinogen III oxidase  32.68 
 
 
414 aa  140  6e-32  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.699164  normal  0.0919169 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4159  coproporphyrinogen III oxidase  28.86 
 
 
386 aa  140  7e-32  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5101  coproporphyrinogen III oxidase  30.05 
 
 
391 aa  139  7e-32  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.608313  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1341  putative oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  27.88 
 
 
394 aa  140  7e-32  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2480  radical SAM domain-containing protein  25.25 
 
 
453 aa  140  7e-32  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.172452  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2783  coproporphyrinogen III oxidase  24.59 
 
 
460 aa  139  8.999999999999999e-32  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.682554  normal  0.601804 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>