More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPF_2293 on replicon NC_008261
Organism: Clostridium perfringens ATCC 13124



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008261  CPF_2293  coproporphyrinogen III oxidase  100 
 
 
377 aa  758    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2008  coproporphyrinogen III oxidase  96.02 
 
 
377 aa  734    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2082  coproporphyrinogen III oxidase  46.68 
 
 
375 aa  353  2.9999999999999997e-96  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1325  coproporphyrinogen III oxidase, anaerobic  43.54 
 
 
380 aa  316  5e-85  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2440  coproporphyrinogen III oxidase  42.25 
 
 
382 aa  301  9e-81  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000264436  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1980  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  44.03 
 
 
380 aa  299  5e-80  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000000136099  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1216  coproporphyrinogen III oxidase  40.11 
 
 
378 aa  298  1e-79  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3043  coproporphyrinogen III oxidase  41.07 
 
 
378 aa  294  1e-78  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000458873  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0582  coproporphyrinogen III oxidase, anaerobic  38.87 
 
 
388 aa  294  2e-78  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2500  putative oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  39.74 
 
 
378 aa  293  3e-78  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000623828  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0603  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  37.3 
 
 
378 aa  291  1e-77  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4168  coproporphyrinogen III oxidase  40.8 
 
 
379 aa  291  2e-77  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0038285  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4436  coproporphyrinogen III oxidase  40.48 
 
 
379 aa  290  2e-77  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000959102  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0800  coproporphyrinogen III oxidase  40.74 
 
 
379 aa  289  4e-77  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000109269  hitchhiker  5.6543700000000005e-18 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4450  coproporphyrinogen III oxidase  40.8 
 
 
378 aa  289  4e-77  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000131876  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4339  coproporphyrinogen III oxidase  40.53 
 
 
378 aa  288  8e-77  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.26628e-29 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4216  coproporphyrinogen III oxidase  40.53 
 
 
379 aa  288  1e-76  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4542  coproporphyrinogen III oxidase  40.53 
 
 
378 aa  288  1e-76  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.3385  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0691  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  38.77 
 
 
380 aa  288  1e-76  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1554  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  41.01 
 
 
376 aa  287  2e-76  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.0000769723  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4054  coproporphyrinogen III oxidase  40.53 
 
 
379 aa  287  2e-76  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.749761  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4398  coproporphyrinogen III oxidase  40.53 
 
 
378 aa  286  2.9999999999999996e-76  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.601746  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3535  coproporphyrinogen III oxidase, anaerobic  36.48 
 
 
383 aa  286  5e-76  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000160096  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4306  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  38.13 
 
 
375 aa  286  5e-76  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0329595  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4064  coproporphyrinogen III oxidase  40.27 
 
 
379 aa  285  7e-76  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.659192  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2314  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  41.73 
 
 
408 aa  283  4.0000000000000003e-75  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0256017  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1010  coproporphyrinogen III oxidase  39.47 
 
 
379 aa  281  9e-75  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1641  coproporphyrinogen III oxidase  39.95 
 
 
374 aa  280  2e-74  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.905653  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1675  coproporphyrinogen III oxidase  39.95 
 
 
374 aa  280  2e-74  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.370593  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0890  coproporphyrinogen III oxidase  37.87 
 
 
376 aa  277  2e-73  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.112069  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3559  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  36.15 
 
 
393 aa  277  2e-73  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3225  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  35.68 
 
 
432 aa  275  1.0000000000000001e-72  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000826969  normal  0.0243619 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0030  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase, putative  35.25 
 
 
385 aa  273  3e-72  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.949331  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1151  coproporphyrinogen III oxidase  39.26 
 
 
374 aa  273  3e-72  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1249  coproporphyrinogen III oxidase  37.17 
 
 
379 aa  273  3e-72  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1999  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  36.46 
 
 
388 aa  271  1e-71  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.865362  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0208  putative oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  36.84 
 
 
381 aa  263  3e-69  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000567402  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1109  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  39.47 
 
 
377 aa  263  4e-69  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.298913  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3508  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  37.7 
 
 
381 aa  261  1e-68  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.230764  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1304  putative oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  36.05 
 
 
381 aa  260  3e-68  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3577  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  37.43 
 
 
381 aa  259  5.0000000000000005e-68  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3306  putative oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  33.17 
 
 
423 aa  254  1.0000000000000001e-66  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.661128  normal  0.0726751 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2223  coproporphyrinogen III oxidase  36.03 
 
 
396 aa  254  2.0000000000000002e-66  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12830  putative oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  36.9 
 
 
385 aa  253  3e-66  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.402755  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0055  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  38.46 
 
 
365 aa  253  5.000000000000001e-66  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal  0.60035 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2382  coproporphyrinogen III oxidase  33.51 
 
 
396 aa  252  6e-66  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.0342073 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1582  putative oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  36.07 
 
 
381 aa  252  6e-66  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.0000332518  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1180  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  35.81 
 
 
401 aa  251  2e-65  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.219055  hitchhiker  0.00393596 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2601  coproporphyrinogen III oxidase  37.18 
 
 
414 aa  248  9e-65  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3505  coproporphyrinogen III oxidase  37.18 
 
 
414 aa  248  1e-64  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.699164  normal  0.0919169 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3875  putative oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  33.92 
 
 
406 aa  248  2e-64  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1363  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  34.85 
 
 
389 aa  245  9e-64  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0858  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase, putative  34.57 
 
 
378 aa  245  9.999999999999999e-64  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0560367  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4269  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  34.72 
 
 
401 aa  240  2.9999999999999997e-62  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.281837  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0185  coproporphyrinogen III oxidase  33.68 
 
 
409 aa  238  1e-61  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.867892  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2374  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  33.69 
 
 
448 aa  238  2e-61  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2785  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  31.9 
 
 
395 aa  237  2e-61  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.419951  normal  0.420525 
 
 
-
 
NC_004310  BR0176  coproporphyrinogen III oxidase  33.42 
 
 
385 aa  236  6e-61  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0170  coproporphyrinogen III oxidase  33.42 
 
 
404 aa  236  6e-61  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.379163  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1228  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  32.71 
 
 
380 aa  234  2.0000000000000002e-60  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1516  coproporphyrinogen III oxidase  35.69 
 
 
405 aa  234  2.0000000000000002e-60  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.493092  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0776  putative oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  33.69 
 
 
378 aa  234  3e-60  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  decreased coverage  0.00749552  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4462  coproporphyrinogen III oxidase  33.89 
 
 
435 aa  233  5e-60  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1177  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  36.02 
 
 
372 aa  233  6e-60  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0191  coproporphyrinogen III oxidase  32.72 
 
 
386 aa  233  6e-60  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.605644 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3351  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  32.52 
 
 
384 aa  233  6e-60  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0323  coproporphyrinogen III oxidase  33.25 
 
 
386 aa  231  2e-59  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1194  coproporphyrinogen III oxidase  35.71 
 
 
421 aa  231  2e-59  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0134211 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0536  putative oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  32.09 
 
 
578 aa  229  6e-59  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.448786  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0423  coproporphyrinogen III oxidase  32.04 
 
 
390 aa  229  7e-59  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3018  putative oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  30.69 
 
 
393 aa  229  7e-59  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0149  coproporphyrinogen III oxidase  32.01 
 
 
386 aa  229  9e-59  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0475  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase, putative  34.48 
 
 
376 aa  228  1e-58  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0007  coproporphyrinogen III oxidase  32.9 
 
 
381 aa  228  1e-58  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000223665 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0436  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  31.48 
 
 
398 aa  227  2e-58  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.355394  normal  0.414795 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0110  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase, putative  32.55 
 
 
393 aa  227  2e-58  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000543862  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0184  coproporphyrinogen III oxidase  32.02 
 
 
385 aa  228  2e-58  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5052  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase, putative  33.85 
 
 
404 aa  226  5.0000000000000005e-58  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5327  coproporphyrinogen III oxidase  34.13 
 
 
401 aa  226  6e-58  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.476935 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2205  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  30.83 
 
 
484 aa  226  7e-58  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.434843  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0397  coproporphyrinogen III oxidase  31.56 
 
 
385 aa  225  8e-58  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1001  putative oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  31.33 
 
 
424 aa  225  8e-58  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1082  putative oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  35.29 
 
 
392 aa  225  9e-58  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3582  putative oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  34.15 
 
 
385 aa  224  1e-57  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0471  coproporphyrinogen III oxidase  33.33 
 
 
404 aa  225  1e-57  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.804831 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4013  coproporphyrinogen III oxidase  30.95 
 
 
387 aa  224  1e-57  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  decreased coverage  0.00338322  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0630  coproporphyrinogen III oxidase  32.96 
 
 
393 aa  225  1e-57  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.824124  normal  0.0911038 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0394  coproporphyrinogen III oxidase  31.23 
 
 
393 aa  224  1e-57  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_761  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  33.77 
 
 
378 aa  224  2e-57  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.0000202557  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1442  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  37.37 
 
 
368 aa  224  2e-57  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000616139  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0471  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  31.15 
 
 
392 aa  224  3e-57  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.039333  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0117  putative oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  34.12 
 
 
382 aa  223  3e-57  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4974  coproporphyrinogen III oxidase  32.81 
 
 
391 aa  223  4e-57  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0330  coproporphyrinogen III oxidase  31.15 
 
 
385 aa  223  4.9999999999999996e-57  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.154347  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1108  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  35.37 
 
 
360 aa  223  6e-57  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1649  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  33.69 
 
 
374 aa  223  6e-57  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2941  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  32.01 
 
 
391 aa  222  8e-57  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.446219  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0403  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  31.03 
 
 
405 aa  222  9e-57  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.68433  normal  0.919308 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0024  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  30.55 
 
 
398 aa  221  9.999999999999999e-57  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0304834 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2870  coproporphyrinogen III oxidase  33.42 
 
 
384 aa  221  1.9999999999999999e-56  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0605644  normal  0.195461 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>