More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smon_1406 on replicon NC_013515
Organism: Streptobacillus moniliformis DSM 12112



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013515  Smon_1406  Coproporphyrinogen dehydrogenase  100 
 
 		 457 aa  913    Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4085  Coproporphyrinogen dehydrogenase  50.98 
 
 		 468 aa  443  1e-123  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0964  coproporphyrinogen III oxidase  39.46 
 
 		 496 aa  276  8e-73  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0926  coproporphyrinogen III oxidase  39.46 
 
 		 495 aa  275  8e-73  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.200785  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0831  coproporphyrinogen III oxidase  39.46 
 
 		 498 aa  275  1.0000000000000001e-72  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0777  coproporphyrinogen III oxidase  39.46 
 
 		 498 aa  275  1.0000000000000001e-72  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0778  coproporphyrinogen III oxidase  39.46 
 
 		 498 aa  275  1.0000000000000001e-72  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.798816  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0875  coproporphyrinogen III oxidase  39.46 
 
 		 496 aa  275  1.0000000000000001e-72  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.737653  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1051  coproporphyrinogen III oxidase  39.46 
 
 		 495 aa  275  1.0000000000000001e-72  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4404  coproporphyrinogen III oxidase  39.22 
 
 		 495 aa  275  2.0000000000000002e-72  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000115186 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0964  coproporphyrinogen III oxidase  39.46 
 
 		 495 aa  275  2.0000000000000002e-72  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0631  coproporphyrinogen III oxidase  40.16 
 
 		 501 aa  273  6e-72  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000100188  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0778  coproporphyrinogen III oxidase  39.22 
 
 		 496 aa  271  1e-71  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.385529  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0706  coproporphyrinogen III oxidase  39.52 
 
 		 495 aa  272  1e-71  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1445  coproporphyrinogen III oxidase  37.68 
 
 		 499 aa  267  2.9999999999999995e-70  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3377  coproporphyrinogen III oxidase  38.27 
 
 		 509 aa  255  1.0000000000000001e-66  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1901  coproporphyrinogen III oxidase  38.38 
 
 		 480 aa  254  2.0000000000000002e-66  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2190  coproporphyrinogen III oxidase  38.38 
 
 		 480 aa  252  8.000000000000001e-66  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1948  coproporphyrinogen III oxidase  38.52 
 
 		 504 aa  252  1e-65  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1341  coproporphyrinogen III oxidase  38.56 
 
 		 505 aa  252  1e-65  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.996503  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0550  coproporphyrinogen III oxidase  38.12 
 
 		 491 aa  249  1e-64  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.790548  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3606  coproporphyrinogen III oxidase  36.78 
 
 		 518 aa  246  6e-64  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2881  coproporphyrinogen III oxidase  36.95 
 
 		 494 aa  243  6e-63  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.969668  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1948  coproporphyrinogen III oxidase  37.94 
 
 		 471 aa  234  2.0000000000000002e-60  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0315  coproporphyrinogen III oxidase  40.22 
 
 		 438 aa  223  8e-57  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1363  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  26.42 
 
 		 389 aa  112  2.0000000000000002e-23  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2008  coproporphyrinogen III oxidase  33.99 
 
 		 377 aa  112  2.0000000000000002e-23  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2293  coproporphyrinogen III oxidase  33.99 
 
 		 377 aa  110  4.0000000000000004e-23  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0055  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  27.22 
 
 		 365 aa  108  2e-22  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.60035 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0007  coproporphyrinogen III oxidase  29.21 
 
 		 391 aa  107  4e-22  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.712639  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4035  coproporphyrinogen III oxidase  27.73 
 
 		 379 aa  107  5e-22  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.023291 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1177  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  30.28 
 
 		 372 aa  106  1e-21  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4974  coproporphyrinogen III oxidase  26.67 
 
 		 391 aa  105  2e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1263  coproporphyrinogen III oxidase  23.88 
 
 		 411 aa  105  2e-21  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.0206083 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0826  coproporphyrinogen III oxidase  26.42 
 
 		 376 aa  104  3e-21  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3351  coproporphyrinogen III oxidase  27.21 
 
 		 378 aa  104  3e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.315269 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3455  coproporphyrinogen III oxidase  26.79 
 
 		 380 aa  104  3e-21  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.766268  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0143  coproporphyrinogen III oxidase  26.42 
 
 		 376 aa  104  3e-21  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000483536 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0825  coproporphyrinogen III oxidase  26.42 
 
 		 376 aa  104  3e-21  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.330416  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3612  coproporphyrinogen III oxidase  26.96 
 
 		 379 aa  104  4e-21  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02785  coproporphyrinogen III oxidase  26.91 
 
 		 378 aa  103  5e-21  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.179359  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02748  hypothetical protein  26.91 
 
 		 378 aa  103  5e-21  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.153415  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3046  putative oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  27.82 
 
 		 380 aa  103  5e-21  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.482476  normal  0.758269 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4258  coproporphyrinogen III oxidase  26.91 
 
 		 378 aa  103  5e-21  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0740  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  26.91 
 
 		 378 aa  103  6e-21  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3361  coproporphyrinogen III oxidase  26.69 
 
 		 380 aa  103  9e-21  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00679793 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3387  coproporphyrinogen III oxidase  26.91 
 
 		 378 aa  102  1e-20  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5151  coproporphyrinogen III oxidase  26.25 
 
 		 391 aa  102  1e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.294445  normal  0.707101 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3288  putative oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  27.12 
 
 		 396 aa  102  1e-20  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3097  coproporphyrinogen III oxidase  27.09 
 
 		 378 aa  102  1e-20  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000345052 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1109  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  32.85 
 
 		 377 aa  102  1e-20  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.298913  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3278  coproporphyrinogen III oxidase  26.67 
 
 		 378 aa  102  1e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.026335 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0944  putative oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  33.01 
 
 		 375 aa  101  2e-20  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3853  coproporphyrinogen III oxidase  26.96 
 
 		 399 aa  101  3e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.800608  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3343  coproporphyrinogen III oxidase  26.67 
 
 		 378 aa  101  3e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.368838 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3447  coproporphyrinogen III oxidase  26.86 
 
 		 378 aa  100  4e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.286445 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1341  putative oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  25.63 
 
 		 394 aa  100  4e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5101  coproporphyrinogen III oxidase  26.33 
 
 		 391 aa  100  5e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.608313  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1108  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  30.86 
 
 		 360 aa  100  5e-20  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2033  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  26.73 
 
 		 414 aa  100  5e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.772986 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3299  coproporphyrinogen III oxidase  26.58 
 
 		 378 aa  100  6e-20  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0755  coproporphyrinogen III oxidase  27.24 
 
 		 379 aa  100  6e-20  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3267  coproporphyrinogen III oxidase  26.67 
 
 		 378 aa  100  6e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2472  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  26.73 
 
 		 400 aa  99.8  8e-20  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3115  coproporphyrinogen III oxidase  26.58 
 
 		 378 aa  100  8e-20  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0759  coproporphyrinogen III oxidase  26.58 
 
 		 378 aa  100  8e-20  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000573813 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3018  putative oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  26.36 
 
 		 393 aa  99.8  9e-20  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5327  coproporphyrinogen III oxidase  27.93 
 
 		 401 aa  99.8  1e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.476935 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13360  coproporphyrinogen III oxidase, anaerobic  27.44 
 
 		 418 aa  99.8  1e-19  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.186133  normal  0.0883125 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3255  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  26.94 
 
 		 403 aa  99.4  1e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00582345  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1999  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  24.72 
 
 		 388 aa  99.8  1e-19  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.865362  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4159  coproporphyrinogen III oxidase  26.55 
 
 		 386 aa  99  1e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002450  coproporphyrinogen III oxidase, oxygen-independent  28.12 
 
 		 392 aa  99.4  1e-19  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3577  putative oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  23.73 
 
 		 390 aa  99.4  1e-19  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0892028  normal  0.365381 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3411  coproporphyrinogen III oxidase  25.12 
 
 		 401 aa  99  2e-19  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.102052 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0471  coproporphyrinogen III oxidase  28.57 
 
 		 404 aa  98.6  2e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.804831 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2322  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  25.42 
 
 		 388 aa  98.6  2e-19  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03584  coproporphyrinogen III oxidase  28.44 
 
 		 390 aa  99  2e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2108  coproporphyrinogen III oxidase  23.36 
 
 		 409 aa  98.2  2e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0665  coproporphyrinogen III oxidase  24.62 
 
 		 404 aa  98.2  3e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0912478  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4306  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  26.78 
 
 		 375 aa  97.8  3e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0329595  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0816  putative oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  24.52 
 
 		 396 aa  97.8  4e-19  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.847489  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0770  coproporphyrinogen III oxidase  25.58 
 
 		 378 aa  97.8  4e-19  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.261122  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0479  putative oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  27.04 
 
 		 385 aa  97.4  5e-19  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.822373  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0789  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  25.47 
 
 		 393 aa  97.1  6e-19  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.284669  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1131  putative oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  26.56 
 
 		 379 aa  96.7  9e-19  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.00230562  normal  0.548541 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1898  coproporphyrinogen III oxidase  25.66 
 
 		 426 aa  96.7  9e-19  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.133769  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1151  coproporphyrinogen III oxidase  33.71 
 
 		 374 aa  95.9  1e-18  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1148  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  25.89 
 
 		 403 aa  95.9  1e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.61254 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2285  Coproporphyrinogen dehydrogenase  27.27 
 
 		 403 aa  96.3  1e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.617284 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0485  coproporphyrinogen III oxidase  24.83 
 
 		 384 aa  95.9  1e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0855  coproporphyrinogen III oxidase  24.59 
 
 		 404 aa  95.9  1e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.286896  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1976  coproporphyrinogen III oxidase  26.51 
 
 		 409 aa  95.9  1e-18  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000234846 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5052  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase, putative  28.27 
 
 		 404 aa  95.5  2e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0867  coproporphyrinogen III oxidase  24.59 
 
 		 404 aa  95.5  2e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2082  coproporphyrinogen III oxidase  31.07 
 
 		 375 aa  95.5  2e-18  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0537  coproporphyrinogen III oxidase  28.53 
 
 		 386 aa  95.1  2e-18  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0906426  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4155  putative oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  22.86 
 
 		 416 aa  94.7  3e-18  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1188  putative oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  27.1 
 
 		 385 aa  94.4  4e-18  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0144  Coproporphyrinogen dehydrogenase  26.67 
 
 		 465 aa  94  4e-18  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>