More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GWCH70_0631 on replicon NC_012793
Organism: Geobacillus sp. WCH70



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011658  BCAH187_A1051  coproporphyrinogen III oxidase  70.74 
 
 
495 aa  733    Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0964  coproporphyrinogen III oxidase  70.74 
 
 
496 aa  733    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0831  coproporphyrinogen III oxidase  70.74 
 
 
498 aa  735    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1445  coproporphyrinogen III oxidase  78.56 
 
 
499 aa  813    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0777  coproporphyrinogen III oxidase  70.74 
 
 
498 aa  733    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0778  coproporphyrinogen III oxidase  70.74 
 
 
498 aa  735    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.798816  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0964  coproporphyrinogen III oxidase  70.74 
 
 
495 aa  734    Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4404  coproporphyrinogen III oxidase  70.88 
 
 
495 aa  731    Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000115186 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0778  coproporphyrinogen III oxidase  71.89 
 
 
496 aa  738    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.385529  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0631  coproporphyrinogen III oxidase  100 
 
 
501 aa  1040    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000100188  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0875  coproporphyrinogen III oxidase  70.74 
 
 
496 aa  734    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.737653  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0926  coproporphyrinogen III oxidase  70.54 
 
 
495 aa  732    Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.200785  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0706  coproporphyrinogen III oxidase  71.69 
 
 
495 aa  742    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3377  coproporphyrinogen III oxidase  39.08 
 
 
509 aa  340  5e-92  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1341  coproporphyrinogen III oxidase  44.33 
 
 
505 aa  337  1.9999999999999998e-91  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.996503  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1901  coproporphyrinogen III oxidase  41.73 
 
 
480 aa  336  5.999999999999999e-91  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2190  coproporphyrinogen III oxidase  41.48 
 
 
480 aa  334  2e-90  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3606  coproporphyrinogen III oxidase  45.09 
 
 
518 aa  333  5e-90  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0550  coproporphyrinogen III oxidase  45.24 
 
 
491 aa  332  1e-89  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.790548  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1948  coproporphyrinogen III oxidase  41.85 
 
 
504 aa  324  2e-87  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2881  coproporphyrinogen III oxidase  40.6 
 
 
494 aa  320  3.9999999999999996e-86  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.969668  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4085  Coproporphyrinogen dehydrogenase  40.48 
 
 
468 aa  291  2e-77  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1948  coproporphyrinogen III oxidase  40.11 
 
 
471 aa  287  2.9999999999999996e-76  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1406  Coproporphyrinogen dehydrogenase  40.16 
 
 
457 aa  273  6e-72  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0315  coproporphyrinogen III oxidase  36.22 
 
 
438 aa  234  3e-60  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0603  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  34.41 
 
 
378 aa  154  2.9999999999999998e-36  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1109  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  33.06 
 
 
377 aa  144  5e-33  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.298913  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4306  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  34.63 
 
 
375 aa  144  5e-33  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0329595  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5327  coproporphyrinogen III oxidase  33.11 
 
 
401 aa  142  9.999999999999999e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.476935 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1325  coproporphyrinogen III oxidase, anaerobic  30.9 
 
 
380 aa  140  6e-32  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1363  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  28.04 
 
 
389 aa  139  1e-31  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2008  coproporphyrinogen III oxidase  31.08 
 
 
377 aa  133  6e-30  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2082  coproporphyrinogen III oxidase  31.33 
 
 
375 aa  133  6.999999999999999e-30  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2293  coproporphyrinogen III oxidase  29.05 
 
 
377 aa  133  7.999999999999999e-30  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0485  coproporphyrinogen III oxidase  29.55 
 
 
384 aa  132  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0055  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  30.85 
 
 
365 aa  128  2.0000000000000002e-28  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal  0.60035 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2963  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  29.9 
 
 
387 aa  127  4.0000000000000003e-28  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  hitchhiker  0.000535992  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4035  coproporphyrinogen III oxidase  30.19 
 
 
379 aa  125  1e-27  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.023291 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05040  coproporphyrinogen III oxidase  28.9 
 
 
384 aa  125  1e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03584  coproporphyrinogen III oxidase  29.51 
 
 
390 aa  125  2e-27  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0582  coproporphyrinogen III oxidase, anaerobic  30.33 
 
 
388 aa  125  2e-27  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2314  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  30.36 
 
 
408 aa  125  2e-27  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0256017  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4974  coproporphyrinogen III oxidase  29.74 
 
 
391 aa  125  2e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0770  coproporphyrinogen III oxidase  29.28 
 
 
378 aa  125  2e-27  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.261122  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0537  coproporphyrinogen III oxidase  28.71 
 
 
386 aa  124  3e-27  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0906426  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0766  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  30.34 
 
 
366 aa  123  6e-27  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0410499  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1010  coproporphyrinogen III oxidase  31.06 
 
 
379 aa  122  1.9999999999999998e-26  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0007  coproporphyrinogen III oxidase  30.74 
 
 
391 aa  122  1.9999999999999998e-26  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.712639  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2500  putative oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  30.31 
 
 
378 aa  121  3e-26  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000623828  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0364  coproporphyrinogen III oxidase  31.37 
 
 
395 aa  121  3e-26  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.250524  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3359  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase, putative  27.69 
 
 
385 aa  119  9e-26  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3455  coproporphyrinogen III oxidase  28.52 
 
 
380 aa  119  9e-26  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.766268  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002450  coproporphyrinogen III oxidase, oxygen-independent  28.85 
 
 
392 aa  119  9.999999999999999e-26  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3361  coproporphyrinogen III oxidase  28.62 
 
 
380 aa  119  9.999999999999999e-26  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00679793 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0143  coproporphyrinogen III oxidase  28.85 
 
 
376 aa  118  1.9999999999999998e-25  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000483536 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0825  coproporphyrinogen III oxidase  28.85 
 
 
376 aa  118  1.9999999999999998e-25  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.330416  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1999  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  28.17 
 
 
388 aa  119  1.9999999999999998e-25  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.865362  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0471  coproporphyrinogen III oxidase  31.63 
 
 
404 aa  118  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.804831 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0710  putative oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  28.9 
 
 
375 aa  118  1.9999999999999998e-25  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.963013  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0826  coproporphyrinogen III oxidase  28.85 
 
 
376 aa  118  1.9999999999999998e-25  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4159  coproporphyrinogen III oxidase  29.84 
 
 
386 aa  118  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1258  putative oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  27.69 
 
 
385 aa  118  1.9999999999999998e-25  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0161407  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3046  putative oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  29.26 
 
 
380 aa  119  1.9999999999999998e-25  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.482476  normal  0.758269 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1468  oxygen-independent coproporphyrinogen-III oxidase  28.9 
 
 
375 aa  118  1.9999999999999998e-25  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.245191  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1108  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  27.61 
 
 
360 aa  118  3e-25  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1228  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  29.17 
 
 
380 aa  117  3e-25  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12830  putative oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  31.1 
 
 
385 aa  118  3e-25  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.402755  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3612  coproporphyrinogen III oxidase  28.52 
 
 
379 aa  117  3e-25  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2687  putative oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  28.25 
 
 
400 aa  117  3e-25  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000667437  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1216  coproporphyrinogen III oxidase  28.77 
 
 
378 aa  117  3e-25  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0890  coproporphyrinogen III oxidase  30.24 
 
 
376 aa  117  3.9999999999999997e-25  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.112069  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2866  putative oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  28.25 
 
 
379 aa  117  3.9999999999999997e-25  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00010545  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03000  coproporphyrinogen III oxidase  27.92 
 
 
373 aa  117  3.9999999999999997e-25  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1304  putative oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  29.32 
 
 
381 aa  117  5e-25  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2601  coproporphyrinogen III oxidase  28.71 
 
 
414 aa  117  6e-25  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1226  coproporphyrinogen dehydrogenase  27.6 
 
 
378 aa  117  6e-25  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000226864  normal  0.222132 
 
 
-
 
NC_002950  PG0475  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase, putative  27.45 
 
 
376 aa  117  6.9999999999999995e-25  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3288  putative oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  27.04 
 
 
396 aa  117  6.9999999999999995e-25  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0455  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  29.52 
 
 
391 aa  116  8.999999999999998e-25  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.664559  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1187  putative oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  27.38 
 
 
385 aa  116  8.999999999999998e-25  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.454386  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0488  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  27.38 
 
 
374 aa  116  1.0000000000000001e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0536  putative oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  30.2 
 
 
578 aa  116  1.0000000000000001e-24  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.448786  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1326  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  27.92 
 
 
378 aa  115  1.0000000000000001e-24  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.0437214 
 
 
-
 
NC_002620  TC0322  coproporphyrinogen III oxidase  26.82 
 
 
376 aa  115  2.0000000000000002e-24  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_761  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  26.26 
 
 
378 aa  115  2.0000000000000002e-24  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.0000202557  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3535  coproporphyrinogen III oxidase, anaerobic  27.7 
 
 
383 aa  115  2.0000000000000002e-24  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000160096  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3505  coproporphyrinogen III oxidase  28.38 
 
 
414 aa  115  2.0000000000000002e-24  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.699164  normal  0.0919169 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0944  putative oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  29.33 
 
 
375 aa  115  2.0000000000000002e-24  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1180  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  30.38 
 
 
401 aa  115  2.0000000000000002e-24  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.219055  hitchhiker  0.00393596 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5101  coproporphyrinogen III oxidase  29.74 
 
 
391 aa  114  3e-24  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.608313  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1188  putative oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  27.08 
 
 
385 aa  115  3e-24  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3577  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  30.1 
 
 
381 aa  114  3e-24  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5151  coproporphyrinogen III oxidase  29.74 
 
 
391 aa  114  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.294445  normal  0.707101 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1976  coproporphyrinogen III oxidase  28.93 
 
 
409 aa  114  4.0000000000000004e-24  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000234846 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2375  putative oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  28.78 
 
 
374 aa  114  4.0000000000000004e-24  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.950801  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3320  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  26.87 
 
 
357 aa  114  5e-24  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00918826  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3097  coproporphyrinogen III oxidase  27.81 
 
 
378 aa  114  5e-24  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000345052 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02785  coproporphyrinogen III oxidase  28.2 
 
 
378 aa  113  7.000000000000001e-24  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.179359  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4339  coproporphyrinogen III oxidase  28.35 
 
 
378 aa  113  7.000000000000001e-24  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.26628e-29 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2239  coproporphyrinogen III oxidase  29.1 
 
 
409 aa  113  7.000000000000001e-24  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.167009  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>