More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Athe_1948 on replicon NC_012034
Organism: Anaerocellum thermophilum DSM 6725



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012034  Athe_1948  coproporphyrinogen III oxidase  100 
 
 
471 aa  969    Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1341  coproporphyrinogen III oxidase  42.93 
 
 
505 aa  327  2.0000000000000001e-88  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.996503  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1948  coproporphyrinogen III oxidase  41 
 
 
504 aa  319  7.999999999999999e-86  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0550  coproporphyrinogen III oxidase  39.19 
 
 
491 aa  301  2e-80  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.790548  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0926  coproporphyrinogen III oxidase  37.29 
 
 
495 aa  293  4e-78  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.200785  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1901  coproporphyrinogen III oxidase  36.5 
 
 
480 aa  293  5e-78  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4404  coproporphyrinogen III oxidase  37.29 
 
 
495 aa  293  5e-78  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000115186 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0964  coproporphyrinogen III oxidase  37.29 
 
 
496 aa  293  6e-78  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1445  coproporphyrinogen III oxidase  40.26 
 
 
499 aa  293  6e-78  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1051  coproporphyrinogen III oxidase  37.29 
 
 
495 aa  292  7e-78  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0831  coproporphyrinogen III oxidase  37.08 
 
 
498 aa  291  1e-77  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0778  coproporphyrinogen III oxidase  37.08 
 
 
498 aa  291  1e-77  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.798816  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0875  coproporphyrinogen III oxidase  37.08 
 
 
496 aa  291  1e-77  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.737653  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2190  coproporphyrinogen III oxidase  36.5 
 
 
480 aa  292  1e-77  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0964  coproporphyrinogen III oxidase  37.29 
 
 
495 aa  291  1e-77  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0777  coproporphyrinogen III oxidase  37.08 
 
 
498 aa  291  2e-77  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0706  coproporphyrinogen III oxidase  37.29 
 
 
495 aa  289  9e-77  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0631  coproporphyrinogen III oxidase  40.11 
 
 
501 aa  287  2.9999999999999996e-76  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000100188  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3377  coproporphyrinogen III oxidase  34.66 
 
 
509 aa  286  5.999999999999999e-76  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0778  coproporphyrinogen III oxidase  37.21 
 
 
496 aa  285  1.0000000000000001e-75  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.385529  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2881  coproporphyrinogen III oxidase  33.55 
 
 
494 aa  273  6e-72  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.969668  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3606  coproporphyrinogen III oxidase  34.78 
 
 
518 aa  247  3e-64  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1406  Coproporphyrinogen dehydrogenase  37.94 
 
 
457 aa  234  2.0000000000000002e-60  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4085  Coproporphyrinogen dehydrogenase  31.88 
 
 
468 aa  213  7e-54  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0315  coproporphyrinogen III oxidase  34.86 
 
 
438 aa  186  1.0000000000000001e-45  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1325  coproporphyrinogen III oxidase, anaerobic  30.48 
 
 
380 aa  120  4.9999999999999996e-26  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2314  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  32.47 
 
 
408 aa  119  9e-26  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0256017  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2963  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  30.89 
 
 
387 aa  116  7.999999999999999e-25  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  hitchhiker  0.000535992  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0603  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  29.1 
 
 
378 aa  116  8.999999999999998e-25  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0485  coproporphyrinogen III oxidase  26.76 
 
 
384 aa  115  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2205  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  27.71 
 
 
484 aa  114  4.0000000000000004e-24  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.434843  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1180  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  28.2 
 
 
401 aa  114  4.0000000000000004e-24  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.219055  hitchhiker  0.00393596 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1109  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  29.46 
 
 
377 aa  110  6e-23  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.298913  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2008  coproporphyrinogen III oxidase  28.75 
 
 
377 aa  110  6e-23  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1999  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  28.19 
 
 
388 aa  110  7.000000000000001e-23  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.865362  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0055  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  31.95 
 
 
365 aa  109  1e-22  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal  0.60035 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5327  coproporphyrinogen III oxidase  26.6 
 
 
401 aa  108  2e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.476935 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0068  coproporphyrinogen III oxidase  29.97 
 
 
408 aa  108  2e-22  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05040  coproporphyrinogen III oxidase  26 
 
 
384 aa  108  3e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1582  putative oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  27.27 
 
 
381 aa  107  4e-22  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.0000332518  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3535  coproporphyrinogen III oxidase, anaerobic  28.71 
 
 
383 aa  106  7e-22  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000160096  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2293  coproporphyrinogen III oxidase  29.21 
 
 
377 aa  105  1e-21  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0475  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase, putative  28.16 
 
 
376 aa  105  2e-21  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2444  putative oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  29.32 
 
 
385 aa  105  2e-21  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1304  putative oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  28.12 
 
 
381 aa  105  2e-21  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3853  coproporphyrinogen III oxidase  27.5 
 
 
399 aa  104  4e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.800608  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1363  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  27.27 
 
 
389 aa  104  4e-21  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4974  coproporphyrinogen III oxidase  26.09 
 
 
391 aa  103  9e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2082  coproporphyrinogen III oxidase  30.13 
 
 
375 aa  102  1e-20  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1228  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  28.32 
 
 
380 aa  102  1e-20  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0582  coproporphyrinogen III oxidase, anaerobic  31.19 
 
 
388 aa  102  1e-20  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4306  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  28.36 
 
 
375 aa  102  1e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0329595  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0936  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  30.04 
 
 
383 aa  101  3e-20  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3351  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  29.05 
 
 
384 aa  101  3e-20  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0536  putative oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  27.97 
 
 
578 aa  101  4e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.448786  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0537  coproporphyrinogen III oxidase  25.99 
 
 
386 aa  100  4e-20  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0906426  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0007  coproporphyrinogen III oxidase  24.92 
 
 
391 aa  100  5e-20  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.712639  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0697  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  24.08 
 
 
410 aa  99.8  9e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.504316 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0165  coproporphyrinogen oxidase (coproporphyrinogen III oxidase)  29.21 
 
 
373 aa  99.8  9e-20  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.763893  normal  0.238012 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0545  Coproporphyrinogen dehydrogenase  27.24 
 
 
404 aa  99.8  1e-19  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.693751  normal  0.412237 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0835  coproporphyrinogen III oxidase  25.2 
 
 
410 aa  99.4  1e-19  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2500  putative oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  30.15 
 
 
378 aa  99.4  1e-19  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000623828  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1468  oxygen-independent coproporphyrinogen-III oxidase  31 
 
 
375 aa  99.4  1e-19  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.245191  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0710  putative oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  31 
 
 
375 aa  99.4  1e-19  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.963013  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3387  coproporphyrinogen III oxidase  26.07 
 
 
378 aa  98.6  2e-19  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2239  coproporphyrinogen III oxidase  26.75 
 
 
409 aa  98.6  2e-19  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.167009  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2843  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  30.39 
 
 
374 aa  98.6  2e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.225724  normal  0.624237 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1980  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  28.85 
 
 
385 aa  98.2  3e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.958254  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2346  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase, putative  28.85 
 
 
385 aa  98.2  3e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1326  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  27.63 
 
 
378 aa  98.2  3e-19  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.0437214 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0078  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  27.61 
 
 
383 aa  98.2  3e-19  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1554  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  29.17 
 
 
376 aa  97.8  4e-19  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.0000769723  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2108  coproporphyrinogen III oxidase  24 
 
 
409 aa  97.8  4e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0770  coproporphyrinogen III oxidase  26.4 
 
 
378 aa  97.4  5e-19  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.261122  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4035  coproporphyrinogen III oxidase  26.07 
 
 
379 aa  97.4  5e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.023291 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07700  putative oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  25.64 
 
 
368 aa  97.4  5e-19  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.7688 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1148  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  24.28 
 
 
403 aa  97.4  5e-19  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.61254 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3612  coproporphyrinogen III oxidase  26.07 
 
 
379 aa  97.4  5e-19  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03000  coproporphyrinogen III oxidase  24.6 
 
 
373 aa  97.1  6e-19  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2010  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  27.31 
 
 
371 aa  97.1  6e-19  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3455  coproporphyrinogen III oxidase  25.74 
 
 
380 aa  96.7  8e-19  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.766268  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0766  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  26.14 
 
 
366 aa  96.7  9e-19  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0410499  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0759  coproporphyrinogen III oxidase  25.74 
 
 
378 aa  96.3  1e-18  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000573813 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3320  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  29.96 
 
 
357 aa  95.9  1e-18  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00918826  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_761  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  28.06 
 
 
378 aa  96.3  1e-18  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.0000202557  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1249  coproporphyrinogen III oxidase  26.64 
 
 
379 aa  96.3  1e-18  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1638  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  27.41 
 
 
349 aa  95.9  1e-18  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0776  putative oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  28.32 
 
 
378 aa  96.3  1e-18  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  decreased coverage  0.00749552  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3115  coproporphyrinogen III oxidase  25.74 
 
 
378 aa  96.3  1e-18  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0471  coproporphyrinogen III oxidase  24.61 
 
 
404 aa  95.1  2e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.804831 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1177  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  34.16 
 
 
372 aa  95.1  2e-18  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6524  Coproporphyrinogen dehydrogenase  29.63 
 
 
431 aa  95.1  2e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1898  coproporphyrinogen III oxidase  24.48 
 
 
426 aa  95.5  2e-18  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.133769  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2285  Coproporphyrinogen dehydrogenase  24.6 
 
 
403 aa  94.7  3e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.617284 
 
 
-
 
NC_002620  TC0322  coproporphyrinogen III oxidase  28.57 
 
 
376 aa  94.7  3e-18  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1655  putative oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  28.12 
 
 
418 aa  94.7  3e-18  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1224  putative oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  31.96 
 
 
370 aa  94.7  3e-18  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.948437  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3299  coproporphyrinogen III oxidase  25.41 
 
 
378 aa  94.7  3e-18  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0352  hypothetical protein  28.68 
 
 
375 aa  94.4  4e-18  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.332966 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2382  coproporphyrinogen III oxidase  23.66 
 
 
396 aa  94.4  4e-18  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.0342073 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>