More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mesil_2010 on replicon NC_014212
Organism: Meiothermus silvanus DSM 9946



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014212  Mesil_2010  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  100 
 
 
371 aa  741    Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1716  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  66.76 
 
 
384 aa  473  1e-132  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.871197  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2324  putative oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  46.13 
 
 
403 aa  307  2.0000000000000002e-82  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1177  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  33.33 
 
 
372 aa  218  2e-55  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1999  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  40.5 
 
 
388 aa  216  7e-55  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.865362  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2293  coproporphyrinogen III oxidase  34.68 
 
 
377 aa  214  1.9999999999999998e-54  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2008  coproporphyrinogen III oxidase  34.41 
 
 
377 aa  214  1.9999999999999998e-54  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0582  coproporphyrinogen III oxidase, anaerobic  37.4 
 
 
388 aa  209  5e-53  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0258  coproporphyrinogen III oxidase  39.9 
 
 
381 aa  209  6e-53  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.148807 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4306  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  37.39 
 
 
375 aa  207  3e-52  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0329595  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0890  coproporphyrinogen III oxidase  36.41 
 
 
376 aa  206  5e-52  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.112069  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0691  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  37.83 
 
 
380 aa  205  9e-52  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2440  coproporphyrinogen III oxidase  36.22 
 
 
382 aa  203  3e-51  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000264436  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4013  coproporphyrinogen III oxidase  36.99 
 
 
387 aa  203  4e-51  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  decreased coverage  0.00338322  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0569  coproporphyrinogen III oxidase  39.15 
 
 
397 aa  202  5e-51  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1304  putative oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  37.37 
 
 
381 aa  200  3e-50  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1325  coproporphyrinogen III oxidase, anaerobic  31.64 
 
 
380 aa  199  5e-50  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0471  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  38.42 
 
 
392 aa  199  7.999999999999999e-50  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.039333  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1151  coproporphyrinogen III oxidase  34.68 
 
 
374 aa  198  1.0000000000000001e-49  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1216  coproporphyrinogen III oxidase  35.22 
 
 
378 aa  198  1.0000000000000001e-49  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04915  coproporphyrinogen III oxidase  32.69 
 
 
376 aa  197  2.0000000000000003e-49  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1010  coproporphyrinogen III oxidase  37.94 
 
 
379 aa  198  2.0000000000000003e-49  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1649  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  38.83 
 
 
370 aa  197  3e-49  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.797828  normal  0.0143577 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3043  coproporphyrinogen III oxidase  35.92 
 
 
378 aa  196  5.000000000000001e-49  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000458873  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1290  Coproporphyrinogen dehydrogenase  41.28 
 
 
363 aa  196  8.000000000000001e-49  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.114072  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1980  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  32.11 
 
 
380 aa  195  9e-49  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000000136099  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3535  coproporphyrinogen III oxidase, anaerobic  37.86 
 
 
383 aa  194  1e-48  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000160096  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0024  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  37.5 
 
 
398 aa  194  1e-48  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0304834 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0330  coproporphyrinogen III oxidase  36.53 
 
 
385 aa  194  2e-48  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.154347  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1249  coproporphyrinogen III oxidase  34.23 
 
 
379 aa  194  2e-48  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0436  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  37.63 
 
 
398 aa  194  2e-48  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.355394  normal  0.414795 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0423  coproporphyrinogen III oxidase  36.51 
 
 
390 aa  193  4e-48  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2785  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  34.46 
 
 
395 aa  193  5e-48  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.419951  normal  0.420525 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4450  coproporphyrinogen III oxidase  34.49 
 
 
378 aa  193  5e-48  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000131876  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1675  coproporphyrinogen III oxidase  33.06 
 
 
374 aa  193  5e-48  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.370593  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0936  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  36.02 
 
 
383 aa  193  5e-48  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1641  coproporphyrinogen III oxidase  33.06 
 
 
374 aa  193  5e-48  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.905653  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0397  coproporphyrinogen III oxidase  36.77 
 
 
385 aa  192  7e-48  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2537  putative oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  37.33 
 
 
399 aa  192  7e-48  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.878033 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0403  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  38.7 
 
 
405 aa  192  9e-48  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.68433  normal  0.919308 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1109  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  33.42 
 
 
377 aa  192  1e-47  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.298913  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12830  putative oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  33.07 
 
 
385 aa  191  1e-47  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.402755  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3460  coproporphyrinogen III oxidase  36.79 
 
 
387 aa  191  1e-47  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0003  coproporphyrinogen III oxidase  34.67 
 
 
400 aa  191  2e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.242877  hitchhiker  0.00414143 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07700  putative oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  40 
 
 
368 aa  191  2e-47  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.7688 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4542  coproporphyrinogen III oxidase  34.76 
 
 
378 aa  190  2.9999999999999997e-47  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.3385  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3559  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  34.88 
 
 
393 aa  191  2.9999999999999997e-47  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0030  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase, putative  38.96 
 
 
385 aa  190  4e-47  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.949331  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4398  coproporphyrinogen III oxidase  34.49 
 
 
378 aa  190  4e-47  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.601746  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3011  putative oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  35.81 
 
 
389 aa  190  4e-47  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0852  putative oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  31.87 
 
 
436 aa  189  7e-47  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0068  coproporphyrinogen III oxidase  36.24 
 
 
408 aa  189  9e-47  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0800  coproporphyrinogen III oxidase  33.78 
 
 
379 aa  188  1e-46  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000109269  hitchhiker  5.6543700000000005e-18 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4216  coproporphyrinogen III oxidase  34.49 
 
 
379 aa  188  1e-46  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2843  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  37.42 
 
 
374 aa  188  1e-46  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.225724  normal  0.624237 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4168  coproporphyrinogen III oxidase  34.76 
 
 
379 aa  188  1e-46  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0038285  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0394  coproporphyrinogen III oxidase  35.5 
 
 
393 aa  188  2e-46  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4054  coproporphyrinogen III oxidase  34.49 
 
 
379 aa  188  2e-46  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.749761  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4339  coproporphyrinogen III oxidase  34.49 
 
 
378 aa  187  2e-46  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.26628e-29 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1326  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  35.54 
 
 
378 aa  188  2e-46  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.0437214 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0027  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  37.83 
 
 
387 aa  188  2e-46  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.444781  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0003  coproporphyrinogen III oxidase  34.4 
 
 
401 aa  187  2e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.045882 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1363  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  33.42 
 
 
389 aa  187  2e-46  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4155  putative oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  36.87 
 
 
416 aa  187  2e-46  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4064  coproporphyrinogen III oxidase  34.22 
 
 
379 aa  187  3e-46  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.659192  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3508  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  38.58 
 
 
381 aa  187  3e-46  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.230764  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2963  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  40.6 
 
 
387 aa  187  4e-46  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  hitchhiker  0.000535992  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1187  putative oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  37.13 
 
 
385 aa  187  4e-46  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.454386  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3273  coproporphyrinogen III oxidase  39.05 
 
 
408 aa  186  4e-46  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1258  putative oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  37.13 
 
 
385 aa  186  7e-46  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0161407  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0204  coproporphyrinogen III oxidase  37.11 
 
 
385 aa  186  8e-46  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.662433 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1188  putative oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  37.16 
 
 
385 aa  186  8e-46  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4026  coproporphyrinogen III oxidase  38.72 
 
 
407 aa  184  1.0000000000000001e-45  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.799175  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4436  coproporphyrinogen III oxidase  33.24 
 
 
379 aa  185  1.0000000000000001e-45  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000959102  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1228  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  33.85 
 
 
380 aa  185  1.0000000000000001e-45  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1693  coproporphyrinogen III oxidase  40.29 
 
 
382 aa  185  1.0000000000000001e-45  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.616989  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3031  putative oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  36.67 
 
 
388 aa  185  1.0000000000000001e-45  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.472525  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0630  coproporphyrinogen III oxidase  36.57 
 
 
393 aa  184  2.0000000000000003e-45  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.824124  normal  0.0911038 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5327  coproporphyrinogen III oxidase  36.44 
 
 
401 aa  184  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.476935 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1131  putative oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  37.43 
 
 
379 aa  184  2.0000000000000003e-45  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.00230562  normal  0.548541 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3639  coproporphyrinogen III oxidase  39.31 
 
 
414 aa  184  2.0000000000000003e-45  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0007  coproporphyrinogen III oxidase  33.59 
 
 
381 aa  184  2.0000000000000003e-45  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000223665 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2483  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase, putative  36.97 
 
 
379 aa  184  2.0000000000000003e-45  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.274904  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1638  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  33.13 
 
 
349 aa  183  3e-45  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1082  putative oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  35.19 
 
 
392 aa  183  3e-45  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2382  coproporphyrinogen III oxidase  34.27 
 
 
396 aa  184  3e-45  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.0342073 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2941  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  37.91 
 
 
391 aa  183  3e-45  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.446219  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3398  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  35.37 
 
 
402 aa  183  4.0000000000000006e-45  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.217833 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0208  putative oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  39.01 
 
 
381 aa  183  4.0000000000000006e-45  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000567402  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1332  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  36.97 
 
 
388 aa  183  4.0000000000000006e-45  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.0000575717  hitchhiker  0.0000904617 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1108  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  34.59 
 
 
360 aa  183  4.0000000000000006e-45  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0013  coproporphyrinogen III oxidase  35.36 
 
 
394 aa  183  4.0000000000000006e-45  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0380  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  33.62 
 
 
379 aa  183  5.0000000000000004e-45  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.182118  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0007  coproporphyrinogen III oxidase  35.29 
 
 
391 aa  183  5.0000000000000004e-45  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.712639  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3046  putative oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  36.67 
 
 
388 aa  183  5.0000000000000004e-45  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000324324  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3189  putative oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  36.64 
 
 
388 aa  183  5.0000000000000004e-45  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000939892  normal  0.198948 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1170  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  30.9 
 
 
369 aa  182  6e-45  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4159  coproporphyrinogen III oxidase  36.51 
 
 
386 aa  182  6e-45  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3875  putative oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  35.03 
 
 
406 aa  182  7e-45  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0149  coproporphyrinogen III oxidase  33.33 
 
 
386 aa  182  8.000000000000001e-45  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>