More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dshi_3460 on replicon NC_009952
Organism: Dinoroseobacter shibae DFL 12



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009952  Dshi_3460  coproporphyrinogen III oxidase  100 
 
 		 387 aa  793    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2661  coproporphyrinogen III oxidase  63.64 
 
 		 385 aa  519  1e-146  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.226338  normal  0.501465 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2885  coproporphyrinogen III oxidase  64.66 
 
 		 385 aa  516  1.0000000000000001e-145  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1224  coproporphyrinogen III oxidase  64.66 
 
 		 385 aa  516  1.0000000000000001e-145  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0204  coproporphyrinogen III oxidase  64.14 
 
 		 385 aa  509  1e-143  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.662433 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2870  coproporphyrinogen III oxidase  63.12 
 
 		 384 aa  502  1e-141  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0605644  normal  0.195461 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0013  coproporphyrinogen III oxidase  61.68 
 
 		 394 aa  476  1e-133  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0471  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  56.5 
 
 		 392 aa  417  9.999999999999999e-116  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.039333  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0024  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  57.03 
 
 		 398 aa  416  9.999999999999999e-116  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0304834 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4013  coproporphyrinogen III oxidase  55.7 
 
 		 387 aa  412  1e-114  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  decreased coverage  0.00338322  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0027  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  57.29 
 
 		 387 aa  409  1e-113  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.444781  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0403  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  55.82 
 
 		 405 aa  405  1.0000000000000001e-112  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.68433  normal  0.919308 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0394  coproporphyrinogen III oxidase  53.91 
 
 		 393 aa  406  1.0000000000000001e-112  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0007  coproporphyrinogen III oxidase  54.64 
 
 		 381 aa  403  1e-111  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000223665 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0436  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  55.82 
 
 		 398 aa  403  1e-111  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.355394  normal  0.414795 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0003  coproporphyrinogen III oxidase  54.17 
 
 		 400 aa  404  1e-111  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.242877  hitchhiker  0.00414143 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2155  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  53.11 
 
 		 389 aa  400  9.999999999999999e-111  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0003  coproporphyrinogen III oxidase  53.91 
 
 		 401 aa  400  9.999999999999999e-111  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.045882 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0569  coproporphyrinogen III oxidase  53.91 
 
 		 397 aa  395  1e-109  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2941  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  54.91 
 
 		 391 aa  397  1e-109  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.446219  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0330  coproporphyrinogen III oxidase  52.52 
 
 		 385 aa  394  1e-108  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.154347  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0191  coproporphyrinogen III oxidase  51.98 
 
 		 386 aa  393  1e-108  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.605644 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0185  coproporphyrinogen III oxidase  51.86 
 
 		 409 aa  390  1e-107  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.867892  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3582  putative oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  52.6 
 
 		 385 aa  387  1e-106  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0176  coproporphyrinogen III oxidase  51.33 
 
 		 385 aa  385  1e-106  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0170  coproporphyrinogen III oxidase  51.33 
 
 		 404 aa  385  1e-106  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.379163  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0184  coproporphyrinogen III oxidase  50.78 
 
 		 385 aa  386  1e-106  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0149  coproporphyrinogen III oxidase  51.46 
 
 		 386 aa  383  1e-105  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3398  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  52.93 
 
 		 402 aa  382  1e-105  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.217833 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1337  coproporphyrinogen III oxidase  49.1 
 
 		 392 aa  379  1e-104  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0423  coproporphyrinogen III oxidase  51.06 
 
 		 390 aa  377  1e-103  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0323  coproporphyrinogen III oxidase  50.8 
 
 		 386 aa  377  1e-103  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0397  coproporphyrinogen III oxidase  50.27 
 
 		 385 aa  374  1e-102  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2537  putative oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  54.26 
 
 		 399 aa  372  1e-102  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.878033 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0630  coproporphyrinogen III oxidase  51.81 
 
 		 393 aa  363  4e-99  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.824124  normal  0.0911038 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2063  coproporphyrinogen III oxidase  50.91 
 
 		 384 aa  358  9.999999999999999e-98  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1693  coproporphyrinogen III oxidase  51.19 
 
 		 382 aa  352  8e-96  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.616989  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3639  coproporphyrinogen III oxidase  53.82 
 
 		 414 aa  350  2e-95  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0258  coproporphyrinogen III oxidase  50.4 
 
 		 381 aa  345  8.999999999999999e-94  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.148807 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0173  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  49.87 
 
 		 387 aa  311  1e-83  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.43547 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3011  putative oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  44.62 
 
 		 389 aa  298  1e-79  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4026  coproporphyrinogen III oxidase  41.73 
 
 		 407 aa  277  2e-73  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.799175  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2479  coproporphyrinogen III oxidase  40.57 
 
 		 413 aa  268  2e-70  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.226119  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2282  coproporphyrinogen III oxidase  39.53 
 
 		 422 aa  267  2.9999999999999995e-70  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.485067  normal  0.946355 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1082  putative oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  37.66 
 
 		 392 aa  265  7e-70  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1980  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  41.88 
 
 		 385 aa  265  1e-69  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.958254  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2346  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase, putative  41.88 
 
 		 385 aa  265  1e-69  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2963  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  40.37 
 
 		 387 aa  262  8e-69  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  hitchhiker  0.000535992  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4974  coproporphyrinogen III oxidase  38.82 
 
 		 391 aa  262  8.999999999999999e-69  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0789  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  37.93 
 
 		 393 aa  261  1e-68  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.284669  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0850  coproporphyrinogen III oxidase  38.6 
 
 		 419 aa  259  4e-68  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.260825  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3853  coproporphyrinogen III oxidase  38.76 
 
 		 399 aa  259  7e-68  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.800608  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0479  coproporphyrinogen III oxidase  42.13 
 
 		 392 aa  259  7e-68  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1962  coproporphyrinogen III oxidase  39.53 
 
 		 422 aa  256  3e-67  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.154783  normal  0.857394 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2161  coproporphyrinogen III oxidase  39.79 
 
 		 424 aa  256  5e-67  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.0050137  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0117  putative oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  37.3 
 
 		 382 aa  253  4.0000000000000004e-66  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5101  coproporphyrinogen III oxidase  37.79 
 
 		 391 aa  251  2e-65  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.608313  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3089  coproporphyrinogen III oxidase  39.74 
 
 		 409 aa  251  2e-65  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.610477  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5151  coproporphyrinogen III oxidase  37.5 
 
 		 391 aa  251  2e-65  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.294445  normal  0.707101 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0855  coproporphyrinogen III oxidase  37.17 
 
 		 404 aa  250  3e-65  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.286896  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0528  putative oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  38.64 
 
 		 382 aa  249  5e-65  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0901  coproporphyrinogen III oxidase  38.74 
 
 		 409 aa  249  6e-65  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.482511  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0516  coproporphyrinogen III oxidase  37.43 
 
 		 404 aa  249  6e-65  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0955  coproporphyrinogen III oxidase  37.43 
 
 		 404 aa  249  6e-65  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.337282  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0995  coproporphyrinogen III oxidase  37.43 
 
 		 404 aa  249  6e-65  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.369674  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0867  coproporphyrinogen III oxidase  37.7 
 
 		 404 aa  249  7e-65  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0040  coproporphyrinogen III oxidase, anaerobic  39.05 
 
 		 384 aa  248  9e-65  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0665  coproporphyrinogen III oxidase  38.98 
 
 		 404 aa  248  1e-64  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0912478  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4103  coproporphyrinogen III oxidase  36.65 
 
 		 404 aa  244  1.9999999999999999e-63  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.274585  normal  0.294261 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2703  putative anaerobic coproporphyrinogen III oxidase oxidoreductase protein  39.07 
 
 		 417 aa  244  1.9999999999999999e-63  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2405  coproporphyrinogen III oxidase  37.01 
 
 		 404 aa  244  1.9999999999999999e-63  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5327  coproporphyrinogen III oxidase  37.6 
 
 		 401 aa  243  3e-63  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.476935 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2953  coproporphyrinogen III oxidase  37.8 
 
 		 405 aa  243  3.9999999999999997e-63  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.640184  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0068  coproporphyrinogen III oxidase  36.2 
 
 		 408 aa  242  6e-63  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2472  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  40.31 
 
 		 400 aa  242  7e-63  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1968  coproporphyrinogen III oxidase  37.8 
 
 		 405 aa  242  7e-63  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.137157  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2100  coproporphyrinogen III oxidase  37.8 
 
 		 405 aa  242  7e-63  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2644  coproporphyrinogen III oxidase  37.8 
 
 		 405 aa  242  7e-63  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0811  coproporphyrinogen III oxidase  37.8 
 
 		 405 aa  242  7e-63  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.12855  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1582  coproporphyrinogen III oxidase  38.4 
 
 		 405 aa  242  9e-63  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.229924  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3053  coproporphyrinogen III oxidase  37.53 
 
 		 405 aa  241  1e-62  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0364  coproporphyrinogen III oxidase  36.79 
 
 		 395 aa  241  1e-62  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.250524  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3019  coproporphyrinogen III oxidase  37.53 
 
 		 405 aa  241  1e-62  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.18574  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0052  coproporphyrinogen III oxidase, anaerobic  36.84 
 
 		 390 aa  241  2e-62  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0403831  normal  0.42577 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1304  putative oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  41.21 
 
 		 381 aa  241  2e-62  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1341  putative oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  35.53 
 
 		 394 aa  240  2.9999999999999997e-62  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3273  coproporphyrinogen III oxidase  38.86 
 
 		 408 aa  239  4e-62  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4159  coproporphyrinogen III oxidase  37.05 
 
 		 386 aa  239  8e-62  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2448  coproporphyrinogen III oxidase, anaerobic  38.27 
 
 		 398 aa  238  1e-61  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.403351 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0537  coproporphyrinogen III oxidase  33.85 
 
 		 386 aa  236  4e-61  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0906426  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4323  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  37.27 
 
 		 419 aa  235  9e-61  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1228  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  37.73 
 
 		 380 aa  235  1.0000000000000001e-60  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0770  coproporphyrinogen III oxidase  36.67 
 
 		 378 aa  235  1.0000000000000001e-60  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.261122  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0740  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  36.39 
 
 		 378 aa  234  2.0000000000000002e-60  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3535  coproporphyrinogen III oxidase, anaerobic  39.47 
 
 		 383 aa  234  2.0000000000000002e-60  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000160096  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1980  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  34.38 
 
 		 380 aa  234  2.0000000000000002e-60  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000000136099  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0485  coproporphyrinogen III oxidase  36.6 
 
 		 384 aa  234  2.0000000000000002e-60  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3387  coproporphyrinogen III oxidase  36.05 
 
 		 378 aa  233  3e-60  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1468  oxygen-independent coproporphyrinogen-III oxidase  35.37 
 
 		 375 aa  233  4.0000000000000004e-60  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.245191  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0710  putative oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  35.37 
 
 		 375 aa  233  4.0000000000000004e-60  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.963013  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>